6DF9
Kaiso (ZBTB33) E535Q zinc finger DNA binding domain in complex with the specific Kaiso binding sequence (KBS)
PDBデータベースに由来する情報
| site_id | AC1 |
| 残基数 | 4 |
| 詳細 | binding site for residue ZN A 701 |
| 鎖名 | 残基 |
| A | CYS496 |
| A | CYS499 |
| A | HIS512 |
| A | HIS516 |
| site_id | AC2 |
| 残基数 | 4 |
| 詳細 | binding site for residue ZN A 702 |
| 鎖名 | 残基 |
| A | CYS524 |
| A | CYS527 |
| A | HIS540 |
| A | HIS544 |
| site_id | AC3 |
| 残基数 | 4 |
| 詳細 | binding site for residue ZN A 703 |
| 鎖名 | 残基 |
| A | CYS555 |
| A | HIS568 |
| A | HIS573 |
| A | CYS552 |
| site_id | AC4 |
| 残基数 | 6 |
| 詳細 | binding site for residue CL A 704 |
| 鎖名 | 残基 |
| A | ARG548 |
| A | ARG548 |
| A | ARG590 |
| A | ARG590 |
| A | HOH812 |
| A | HOH812 |
UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
| site_id | PS00028 |
| 残基数 | 21 |
| 詳細 | ZINC_FINGER_C2H2_1 Zinc finger C2H2 type domain signature. Civ..CkrsYvcltslrrHfni..H |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | CYS496-HIS516 | |
| A | CYS524-HIS544 | |
| A | CYS552-HIS573 |
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
| site_id | SWS_FT_FI1 |
| 残基数 | 22 |
| 詳細 | ZN_FING: C2H2-type 1 => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00042 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | TYR494-HIS516 |
| site_id | SWS_FT_FI2 |
| 残基数 | 22 |
| 詳細 | ZN_FING: C2H2-type 2 => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00042 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | TYR522-HIS544 |
| site_id | SWS_FT_FI3 |
| 残基数 | 23 |
| 詳細 | ZN_FING: C2H2-type 3 => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00042 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | TYR550-HIS573 |
| site_id | SWS_FT_FI4 |
| 残基数 | 3 |
| 詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO2) => ECO:0007744|PubMed:28112733 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | LYS539 | |
| A | LYS474 | |
| A | LYS570 |
| site_id | SWS_FT_FI5 |
| 残基数 | 3 |
| 詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO2) => ECO:0007744|PubMed:25218447, ECO:0007744|PubMed:28112733 |
| 鎖名 | 残基 | 詳細 |
| A | LYS479 | |
| A | LYS582 |
