6BVL

Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator

GO（遺伝子オントロジー）由来の情報

鎖名	GO（遺伝子オントロジー）id	名前空間	内容
A	0003924	molecular_function	GTPase activity
A	0005525	molecular_function	GTP binding
A	0007165	biological_process	signal transduction
A	0016020	cellular_component	membrane
B	0005085	molecular_function	guanyl-nucleotide exchange factor activity
B	0007264	biological_process	small GTPase-mediated signal transduction
C	0003924	molecular_function	GTPase activity
C	0005525	molecular_function	GTP binding
C	0007165	biological_process	signal transduction
C	0016020	cellular_component	membrane

PDBデータベースに由来する情報

site_id	AC1
残基数	32
詳細	binding site for residue GNP A 201

鎖名	残基
A	GLY12
A	ASP30
A	GLU31
A	TYR32
A	PRO34
A	THR35
A	GLY60
A	GLN61
A	ASN116
A	LYS117
A	ASP119
A	GLY13
A	LEU120
A	SER145
A	ALA146
A	LYS147
A	MG202
A	HOH324
A	HOH370
A	HOH376
A	HOH379
A	HOH380
A	VAL14
A	HOH403
A	HOH404
A	HOH433
A	GLY15
A	LYS16
A	SER17
A	ALA18
A	PHE28
A	VAL29

---

site_id	AC2
残基数	5
詳細	binding site for residue MG A 202

鎖名	残基
A	SER17
A	THR35
A	GNP201
A	HOH324
A	HOH370

---

site_id	AC3
残基数	9
詳細	binding site for residue EBY B 2001

鎖名	残基
B	MET878
B	ASN879
B	TYR884
B	PHE890
B	LYS898
B	GLU902
B	HOH2206
B	HOH2394
B	HOH2565

---

site_id	AC4
残基数	6
詳細	binding site for residue FMT B 2002

鎖名	残基
B	GLN566
B	MET567
B	HIS616
B	MET617
B	HOH2252
B	HOH2287

---

site_id	AC5
残基数	3
詳細	binding site for residue FMT B 2003

鎖名	残基
A	ARG128
B	ARG767
B	PRO768

---

site_id	AC6
残基数	7
詳細	binding site for residue FMT B 2004

鎖名	残基
A	GLU37
A	MET67
A	GLN70
B	ALA619
B	ARG688
B	HOH2166
B	HOH2171

---

site_id	AC7
残基数	7
詳細	binding site for residue FMT B 2005

鎖名	残基
B	GLU611
B	TYR615
B	HIS616
B	ARG647
B	TYR681
B	VAL685
B	HOH2301

---

site_id	AC8
残基数	1
詳細	binding site for residue FMT B 2006

鎖名	残基
B	TYR1031

---

site_id	AC9
残基数	5
詳細	binding site for residue GOL B 2007

鎖名	残基
B	SER793
B	ASP794
B	PRO978
B	TYR979
B	HOH2289

---

site_id	AD1
残基数	5
詳細	binding site for residue GOL B 2008

鎖名	残基
B	ARG786
B	GLU864
B	VAL1040
B	HOH2107
B	HOH2225

---

site_id	AD2
残基数	7
詳細	binding site for residue FMT C 201

鎖名	残基
B	LEU938
C	GLY15
C	LYS16
C	SER17
C	HOH304
C	HOH370
C	HOH405

---

site_id	AD3
残基数	6
詳細	binding site for residue NA C 202

鎖名	残基
C	ASN85
C	ASN86
C	THR87
C	THR124
C	HOH462
C	HOH469

---

UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報

site_id	PS00720
残基数	34
詳細	RASGEF Ras Guanine-nucleotide exchange factors domain signature. VPFfGiyLtNIlkteegnpevlkrhgkel.................INFsK

鎖名	残基	詳細
B	VAL927-LYS960

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SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

site_id	SWS_FT_FI1
残基数	5
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:16698776

鎖名	残基	詳細
C	GLY13
C	VAL29
C	ALA59
C	ASN116
C	SER145

---

site_id	SWS_FT_FI2
残基数	1
詳細	MOD_RES: N-acetylmethionine; in GTPase HRas; alternate => ECO:0000269|Ref.12

鎖名	残基	詳細
C	MET1

---

site_id	SWS_FT_FI3
残基数	1
詳細	MOD_RES: N-acetylthreonine; in GTPase HRas, N-terminally processed => ECO:0000269|Ref.12

鎖名	残基	詳細
C	THR2

---

site_id	SWS_FT_FI4
残基数	1
詳細	MOD_RES: S-nitrosocysteine => ECO:0000269|PubMed:9020151

鎖名	残基	詳細
C	CYS118

---

site_id	SWS_FT_FI5
残基数	1
詳細	CARBOHYD: (Microbial infection) O-linked (Glc) threonine; by P.sordellii toxin TcsL => ECO:0000269|PubMed:19744486, ECO:0000269|PubMed:8626575, ECO:0000269|PubMed:8626586, ECO:0000269|PubMed:9632667

鎖名	残基	詳細
C	THR35

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