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5ZNR

Crystal structure of PtSHL in complex with an H3K27me3 peptide

GO(遺伝子オントロジー)由来の情報
鎖名GO(遺伝子オントロジー)id名前空間内容
A0003682molecular_functionchromatin binding
A0046872molecular_functionmetal ion binding
B0003682molecular_functionchromatin binding
B0046872molecular_functionmetal ion binding
PDBデータベースに由来する情報
site_idAC1
残基数4
詳細binding site for residue ZN A 501
鎖名残基
ACYS142
ACYS144
AHIS165
ACYS168

site_idAC2
残基数5
詳細binding site for residue ZN A 502
鎖名残基
ACYS157
AGLY159
ACYS160
ACYS184
ACYS187

site_idAC3
残基数3
詳細binding site for residue SO4 A 503
鎖名残基
AARG60
PTHR32
PGLY34

site_idAC4
残基数3
詳細binding site for residue SO4 A 504
鎖名残基
AHIS104
ASER105
AASN108

site_idAC5
残基数2
詳細binding site for residue SO4 A 505
鎖名残基
ATYR148
AMET154

site_idAC6
残基数1
詳細binding site for residue SO4 A 506
鎖名残基
AARG137

site_idAC7
残基数4
詳細binding site for residue ZN B 501
鎖名残基
BCYS142
BCYS144
BHIS165
BCYS168

site_idAC8
残基数4
詳細binding site for residue ZN B 502
鎖名残基
BCYS157
BGLY159
BCYS160
BCYS184

site_idAC9
残基数1
詳細binding site for residue SO4 B 503
鎖名残基
BARG60

site_idAD1
残基数2
詳細binding site for residue SO4 B 504
鎖名残基
BARG75
BGLN76

site_idAD2
残基数3
詳細binding site for residue SO4 B 505
鎖名残基
BHIS104
BSER105
BASN108

site_idAD3
残基数4
詳細binding site for residue SO4 B 506
鎖名残基
BTYR148
BASP152
BLEU153
BMET154

site_idAD4
残基数2
詳細binding site for residue SO4 B 507
鎖名残基
BTYR148
BTRP163

UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
site_idPS01186
残基数16
詳細EGF_2 EGF-like domain signature 2. CkCemPYnpddlmvqC
鎖名残基詳細
ACYS142-CYS157

site_idPS01359
残基数46
詳細ZF_PHD_1 Zinc finger PHD-type signature. Ck.Cempynpddlm...................................VqCeg..Csdw.FHpaCiemsaeeakrldh................................FfCenC
鎖名残基詳細
ACYS142-CYS187

SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_idSWS_FT_FI1
残基数4
詳細SITE: Not N6-acetylated => ECO:0000269|PubMed:15598823
鎖名残基詳細
PM3L27
PLYS36
QM3L27
QLYS36

site_idSWS_FT_FI2
残基数2
詳細SITE: Required for interaction with TSK => ECO:0000269|PubMed:35298257
鎖名残基詳細
PALA31
QALA31

site_idSWS_FT_FI3
残基数2
詳細MOD_RES: N6-methyllysine; alternate => ECO:0000269|PubMed:15598823
鎖名残基詳細
PLYS23
QLYS23

site_idSWS_FT_FI4
残基数2
詳細MOD_RES: N6-methyllysine; alternate => ECO:0000269|PubMed:14712277, ECO:0000269|PubMed:15598823, ECO:0000269|PubMed:17174094, ECO:0000269|PubMed:17439305, ECO:0000269|PubMed:19503079, ECO:0000269|PubMed:24626927, ECO:0000269|PubMed:35298257
鎖名残基詳細
PM3L27
QM3L27

site_idSWS_FT_FI5
残基数2
詳細MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0000269|PubMed:14610360, ECO:0000269|PubMed:15753571
鎖名残基詳細
PSER28
QSER28

site_idSWS_FT_FI6
残基数2
詳細MOD_RES: N6-methyllysine; alternate => ECO:0000269|PubMed:15598823, ECO:0000269|PubMed:16299497
鎖名残基詳細
PLYS36
QLYS36

217705

件を2024-03-27に公開中

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