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5N6H

Structure of the membrane integral lipoprotein N-acyltransferase Lnt from E. coli

GO（遺伝子オントロジー）由来の情報

鎖名	GO（遺伝子オントロジー）id	名前空間	内容
A	0005515	molecular_function	protein binding
A	0005886	cellular_component	plasma membrane
A	0006807	biological_process	nitrogen compound metabolic process
A	0016020	cellular_component	membrane
A	0016410	molecular_function	N-acyltransferase activity
A	0016740	molecular_function	transferase activity
A	0016746	molecular_function	acyltransferase activity
A	0030288	cellular_component	outer membrane-bounded periplasmic space
A	0042158	biological_process	lipoprotein biosynthetic process
B	0005515	molecular_function	protein binding
B	0005886	cellular_component	plasma membrane
B	0006807	biological_process	nitrogen compound metabolic process
B	0016020	cellular_component	membrane
B	0016410	molecular_function	N-acyltransferase activity
B	0016740	molecular_function	transferase activity
B	0016746	molecular_function	acyltransferase activity
B	0030288	cellular_component	outer membrane-bounded periplasmic space
B	0042158	biological_process	lipoprotein biosynthetic process

PDBデータベースに由来する情報

site_id	AC1
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 601

鎖名	残基
A	ALA22
A	THR25
A	LEU26
A	TYR31
A	SER70
A	ASN73

site_id	AC2
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 602

鎖名	残基
A	PHE49
A	ASN50
A	VAL188
A	ARG13
A	ALA46
A	LEU47

site_id	AC3
残基数	5
詳細	binding site for residue OLC A 603

鎖名	残基
A	TRP121
A	ALA171
A	MET178
A	ASN191
A	VAL197

site_id	AC4
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 604

鎖名	残基
A	GLN10
A	ARG52
A	GLN55
A	ALA58
A	PHE61
A	OLC606

site_id	AC5
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 605

鎖名	残基
A	LEU131
A	VAL134
A	ASN488
A	TRP489
A	TRP492
A	GLY499

site_id	AC6
残基数	7
詳細	binding site for residue OLC A 606

鎖名	残基
A	ARG52
A	LEU54
A	LEU107
A	ARG114
A	OLC604
B	ILE211
B	GLN212

site_id	AC7
残基数	2
詳細	binding site for residue OLC A 607

鎖名	残基
A	LEU18
A	CYS62

site_id	AC8
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 608

鎖名	残基
A	VAL134
A	PHE137
A	GLU170
A	ASN488
A	TRP492
A	GOL614

site_id	AC9
残基数	1
詳細	binding site for residue OLC A 609

鎖名	残基
A	ARG485

site_id	AD1
残基数	2
詳細	binding site for residue OLC A 610

鎖名	残基
A	PHE341
B	TRP192

site_id	AD2
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC A 611

鎖名	残基
A	ALA22
A	GLY69
A	ASN73
A	TYR76
A	VAL94
A	VAL95

site_id	AD3
残基数	2
詳細	binding site for residue OLC A 612

鎖名	残基
A	ARG190
A	TRP192

site_id	AD4
残基数	1
詳細	binding site for residue GOL A 613

鎖名	残基
A	LEU143

site_id	AD5
残基数	2
詳細	binding site for residue GOL A 614

鎖名	残基
A	TRP141
A	OLC608

site_id	AD6
残基数	2
詳細	binding site for residue GOL A 615

鎖名	残基
A	ALA203
A	PHE206

site_id	AD7
残基数	5
詳細	binding site for residue GOL A 616

鎖名	残基
A	GLU239
A	LEU243
A	GLN277
A	PRO279
A	PHE280

site_id	AD8
残基数	2
詳細	binding site for residue GOL A 617

鎖名	残基
A	GLN10
A	ARG11

site_id	AD9
残基数	6
詳細	binding site for residue GOL A 618

鎖名	残基
A	GLY258
A	LYS259
A	SER261
A	LYS291
A	GLY292
A	SER293

site_id	AE1
残基数	4
詳細	binding site for residue OLC B 601

鎖名	残基
B	ALA22
B	LEU26
B	TYR31
B	SER70

site_id	AE2
残基数	8
詳細	binding site for residue OLC B 602

鎖名	残基
A	PRO86
A	PRO88
A	VAL89
B	THR120
B	TRP121
B	LEU122
B	ALA125
B	GOL610

site_id	AE3
残基数	7
詳細	binding site for residue OLC B 603

鎖名	残基
B	ILE7
B	ARG13
B	PHE20
B	ALA46
B	LEU47
B	PHE49
B	ASN50

site_id	AE4
残基数	6
詳細	binding site for residue OLC B 604

鎖名	残基
B	GLU394
B	ASP398
B	TRP489
B	TRP492
B	ALA496
B	GLY499

site_id	AE5
残基数	4
詳細	binding site for residue OLC B 605

鎖名	残基
B	TYR210
B	ILE211
B	GLN212
A	LEU54

site_id	AE6
残基数	4
詳細	binding site for residue OLC B 606

鎖名	残基
B	ASP32
B	VAL33
B	TRP34
B	PRO35

site_id	AE7
残基数	2
詳細	binding site for residue GOL B 607

鎖名	残基
B	PHE137
B	TRP141

site_id	AE8
残基数	3
詳細	binding site for residue GOL B 608

鎖名	残基
B	TRP141
B	LEU143
B	GOL609

site_id	AE9
残基数	3
詳細	binding site for residue GOL B 609

鎖名	残基
B	LEU143
B	PRO346
B	GOL608

site_id	AF1
残基数	3
詳細	binding site for residue GOL B 610

鎖名	残基
B	THR120
B	TRP121
B	OLC602

site_id	AF2
残基数	2
詳細	binding site for residue GOL B 611

鎖名	残基
B	ARG114
B	LEU354

site_id	AF3
残基数	4
詳細	binding site for residue GOL B 612

鎖名	残基
B	GLY258
B	LYS259
B	GLY292
B	ASN378

SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

site_id	SWS_FT_FI1
残基数	36
詳細	TOPO_DOM: Cytoplasmic => ECO:0000269\|PubMed:28675161, ECO:0000269\|PubMed:28885614

鎖名	残基	詳細
A	MET1-ARG9
A	PHE49-ARG52
A	PRO117-THR120
A	ARG190-ASN191
A	GLN509-LYS512
B	MET1-ARG9
B	PHE49-ARG52
B	PRO117-THR120
B	ARG190-ASN191
B	GLN509-LYS512

site_id	SWS_FT_FI2
残基数	306
詳細	TRANSMEM: Helical => ECO:0000269\|PubMed:28675161

鎖名	残基	詳細
A	GLN10-ALA27
A	TRP34-THR48
A	PRO53-PHE68
A	GLY87-TRP116
A	TRP121-TRP141
A	VAL169-LYS189
A	TRP192-TYR210
A	ASN488-ARG508
B	GLN10-ALA27
B	TRP34-THR48
B	PRO53-PHE68
B	GLY87-TRP116
B	TRP121-TRP141
B	VAL169-LYS189
B	TRP192-TYR210
B	ASN488-ARG508

site_id	SWS_FT_FI3
残基数	648
詳細	TOPO_DOM: Periplasmic => ECO:0000269\|PubMed:28675161, ECO:0000269\|PubMed:28885614

鎖名	残基	詳細
A	PHE28-VAL33
A	GLY69-PRO86
A	VAL142-GLY168
A	ILE211-GLY487
B	PHE28-VAL33
B	GLY69-PRO86
B	VAL142-GLY168
B	ILE211-GLY487

site_id	SWS_FT_FI4
残基数	2
詳細	ACT_SITE: Proton acceptor => ECO:0000255\|HAMAP-Rule:MF_01148, ECO:0000305\|PubMed:28675161

鎖名	残基	詳細
A	GLU267
B	GLU267

site_id	SWS_FT_FI5
残基数	2
詳細	ACT_SITE: ACT_SITE => ECO:0000255\|HAMAP-Rule:MF_01148, ECO:0000305\|PubMed:28675161

鎖名	残基	詳細
A	LYS335
B	LYS335

site_id	SWS_FT_FI6
残基数	2
詳細	ACT_SITE: Nucleophile => ECO:0000255\|HAMAP-Rule:MF_01148, ECO:0000305\|PubMed:28675161

鎖名	残基	詳細
A	CYS387
B	CYS387

218500

件を2024-04-17に公開中

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