4CRD

Creating novel F1 inhibitors through fragment based lead generation and structure aided drug design

GO（遺伝子オントロジー）由来の情報

鎖名	GO（遺伝子オントロジー）id	名前空間	内容
A	0004252	molecular_function	serine-type endopeptidase activity
A	0006508	biological_process	proteolysis

PDBデータベースに由来する情報

site_id	AC1
残基数	21
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE OTJ A 1244

鎖名	残基
A	ARG37
A	ASP194
A	SER195
A	SER214
A	TRP215
A	GLY216
A	GLY218
A	CYS219
A	GLY226
A	VAL227
A	TYR228
A	HIS38
A	HOH2013
A	HOH2057
A	LEU39
A	ASN113
A	ILE151
A	ASP189
A	CYS191
A	LYS192
A	GLY193

---

site_id	AC2
残基数	6
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 1245

鎖名	残基
A	LYS127
A	LYS127
A	LYS127
A	ARG130
A	ARG130
A	ARG130

---

site_id	AC3
残基数	3
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 1246

鎖名	残基
A	TYR184
A	ARG185
A	GLU186

---

site_id	AC4
残基数	3
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 1247

鎖名	残基
A	ASN131
A	ASN131
A	ASN131

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UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報

site_id	PS00134
残基数	6
詳細	TRYPSIN_HIS Serine proteases, trypsin family, histidine active site. LTAAHC

鎖名	残基	詳細
A	LEU53-CYS58

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site_id	PS00135
残基数	12
詳細	TRYPSIN_SER Serine proteases, trypsin family, serine active site. DAckGDSGGPLS

鎖名	残基	詳細
A	ASP189-SER198

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SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

site_id	SWS_FT_FI1
残基数	3
詳細	ACT_SITE: Charge relay system

鎖名	残基	詳細
A	HIS57
A	ASP102
A	SER195

---

site_id	SWS_FT_FI2
残基数	1
詳細	BINDING:

鎖名	残基	詳細
A	LYS170

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site_id	SWS_FT_FI3
残基数	1
詳細	CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) (complex) asparagine => ECO:0000269|PubMed:16335952, ECO:0000269|PubMed:19159218, ECO:0000269|PubMed:25092234

鎖名	残基	詳細
A	ASN73

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site_id	SWS_FT_FI4
残基数	1
詳細	CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) (complex) asparagine => ECO:0000269|PubMed:16335952, ECO:0000269|PubMed:19159218, ECO:0000269|PubMed:1998667, ECO:0000269|PubMed:25092234

鎖名	残基	詳細
A	ASN113

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