3PTA
Crystal structure of human DNMT1(646-1600) in complex with DNA
GO(遺伝子オントロジー)由来の情報
PDBデータベースに由来する情報
site_id | AC1 |
残基数 | 16 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE SAH A 1601 |
鎖名 | 残基 |
A | PHE1145 |
A | CYS1191 |
A | PRO1225 |
A | LEU1247 |
A | GLU1266 |
A | ASN1578 |
A | ALA1579 |
A | VAL1580 |
A | SER1146 |
A | GLY1147 |
A | GLY1150 |
A | LEU1151 |
A | GLU1168 |
A | MET1169 |
A | TRP1170 |
A | GLU1189 |
site_id | AC2 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ZN A 1 |
鎖名 | 残基 |
A | CYS1476 |
A | CYS1478 |
A | CYS1485 |
A | HIS1502 |
site_id | AC3 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ZN A 2 |
鎖名 | 残基 |
A | CYS653 |
A | CYS656 |
A | CYS659 |
A | CYS691 |
site_id | AC4 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ZN A 3 |
鎖名 | 残基 |
A | HIS793 |
A | CYS820 |
A | CYS893 |
A | CYS896 |
site_id | AC5 |
残基数 | 5 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ZN A 5 |
鎖名 | 残基 |
A | CYS664 |
A | CYS667 |
A | CYS670 |
A | CYS686 |
A | GLN687 |
UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_id | SWS_FT_FI1 |
残基数 | 46 |
詳細 | ZN_FING: CXXC-type => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00509 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ASN646-PRO692 |
site_id | SWS_FT_FI2 |
残基数 | 1 |
詳細 | ACT_SITE: |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | CYS1226 |
site_id | SWS_FT_FI3 |
残基数 | 8 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00509 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | CYS653 | |
A | CYS656 | |
A | CYS659 | |
A | CYS667 | |
A | CYS670 | |
A | CYS686 | |
A | CYS691 | |
A | CYS664 |
site_id | SWS_FT_FI4 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000250|UniProtKB:P13864 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | SER1146 | |
A | GLY1150 | |
A | ASP1190 | |
A | VAL1580 |
site_id | SWS_FT_FI5 |
残基数 | 3 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:21163962, ECO:0007744|PDB:3PTA |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | CYS1191 | |
A | ASN1578 | |
A | GLU1168 |
site_id | SWS_FT_FI6 |
残基数 | 1 |
詳細 | MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0007744|PubMed:17081983, ECO:0007744|PubMed:20068231, ECO:0007744|PubMed:21406692, ECO:0007744|PubMed:23186163 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | SER714 |
site_id | SWS_FT_FI7 |
残基数 | 1 |
詳細 | MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0007744|PubMed:18220336 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | SER732 |
site_id | SWS_FT_FI8 |
残基数 | 8 |
詳細 | MOD_RES: N6-acetyllysine => ECO:0000269|PubMed:21947282 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS891 | |
A | LYS957 | |
A | LYS961 | |
A | LYS975 | |
A | LYS1054 | |
A | LYS1349 | |
A | LYS1415 | |
A | LYS749 |
site_id | SWS_FT_FI9 |
残基数 | 1 |
詳細 | MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0007744|PubMed:23186163 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | SER878 |
site_id | SWS_FT_FI10 |
残基数 | 3 |
詳細 | MOD_RES: N6-acetyllysine => ECO:0000269|PubMed:21947282, ECO:0007744|PubMed:19608861 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS1113 | |
A | LYS1115 | |
A | LYS1111 |
site_id | SWS_FT_FI11 |
残基数 | 1 |
詳細 | MOD_RES: N6-acetyllysine; by EHMT2 => ECO:0000269|PubMed:21947282 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS1117 |
site_id | SWS_FT_FI12 |
残基数 | 2 |
詳細 | MOD_RES: N6-acetyllysine => ECO:0000250|UniProtKB:P13864 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | LYS1121 | |
A | LYS1119 |