1Q5W
Ubiquitin Recognition by Npl4 Zinc-Fingers
PDBデータベースに由来する情報
site_id | AC1 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ZN A 32 |
鎖名 | 残基 |
A | CYS9 |
A | CYS12 |
A | CYS23 |
A | CYS26 |
UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_id | SWS_FT_FI1 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Interacts with activating enzyme |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | ARG154 | |
B | ARG172 |
site_id | SWS_FT_FI2 |
残基数 | 1 |
詳細 | SITE: Essential for function |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | HIS168 |
site_id | SWS_FT_FI3 |
残基数 | 1 |
詳細 | MOD_RES: Phosphoserine; by PINK1 => ECO:0000269|PubMed:24660806, ECO:0000269|PubMed:24751536, ECO:0000269|PubMed:24784582, ECO:0000269|PubMed:25527291 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | SER165 |
site_id | SWS_FT_FI4 |
残基数 | 1 |
詳細 | MOD_RES: (Microbial infection) ADP-ribosylthreonine => ECO:0000269|PubMed:32330457 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | THR166 |
site_id | SWS_FT_FI5 |
残基数 | 1 |
詳細 | MOD_RES: ADP-ribosylglycine => ECO:0000269|PubMed:28525742 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | GLY176 |
site_id | SWS_FT_FI6 |
残基数 | 1 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16443603 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS106 |
site_id | SWS_FT_FI7 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Gly-Lys) (interchain with K-? in acceptor proteins) |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | GLY176 |
site_id | SWS_FT_FI8 |
残基数 | 2 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16443603, ECO:0000269|PubMed:16543144 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS148 | |
B | LYS111 |
site_id | SWS_FT_FI9 |
残基数 | 1 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000305|PubMed:15466860 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS127 |
site_id | SWS_FT_FI10 |
残基数 | 1 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16543144, ECO:0000269|PubMed:25752573, ECO:0000269|PubMed:25752577, ECO:0000269|PubMed:34239127 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS129 |
site_id | SWS_FT_FI11 |
残基数 | 1 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:25752577 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS133 |
site_id | SWS_FT_FI12 |
残基数 | 1 |
詳細 | CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000269|PubMed:16543144, ECO:0000269|PubMed:18719106 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | LYS163 |