1H15
X-ray crystal structure of HLA-DRA1*0101/DRB5*0101 complexed with a peptide from Epstein Barr Virus DNA polymerase
GO(遺伝子オントロジー)由来の情報
鎖名 | GO(遺伝子オントロジー)id | 名前空間 | 内容 |
A | 0006955 | biological_process | immune response |
A | 0016020 | cellular_component | membrane |
A | 0019882 | biological_process | antigen processing and presentation |
A | 0042613 | cellular_component | MHC class II protein complex |
B | 0006955 | biological_process | immune response |
B | 0016020 | cellular_component | membrane |
B | 0019882 | biological_process | antigen processing and presentation |
B | 0042613 | cellular_component | MHC class II protein complex |
D | 0006955 | biological_process | immune response |
D | 0016020 | cellular_component | membrane |
D | 0019882 | biological_process | antigen processing and presentation |
D | 0042613 | cellular_component | MHC class II protein complex |
E | 0006955 | biological_process | immune response |
E | 0016020 | cellular_component | membrane |
E | 0019882 | biological_process | antigen processing and presentation |
E | 0042613 | cellular_component | MHC class II protein complex |
UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報
site_id | PS00290 |
残基数 | 7 |
詳細 | IG_MHC Immunoglobulins and major histocompatibility complex proteins signature. YTCQVEH |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | TYR171-HIS177 | |
A | TYR161-HIS167 |
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_id | SWS_FT_FI1 |
残基数 | 2 |
詳細 | CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000269|PubMed:19159218 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | ASN19 | |
E | ASN19 |
site_id | SWS_FT_FI2 |
残基数 | 4 |
詳細 | SITE: Self-peptide antigen => ECO:0000269|PubMed:31619516 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | GLY49 | |
A | ALA52 | |
D | GLY49 | |
D | ALA52 |
site_id | SWS_FT_FI3 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Self- and pathogen-derived peptide antigen => ECO:0000269|PubMed:21115828, ECO:0000269|PubMed:8145819 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | PHE51 | |
D | PHE51 |
site_id | SWS_FT_FI4 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Self- and pathogen-derived peptide antigen => ECO:0000269|PubMed:17583734, ECO:0000269|PubMed:21115828, ECO:0000269|PubMed:31619516, ECO:0000269|PubMed:8145819 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
D | SER53 | |
A | SER53 |
site_id | SWS_FT_FI5 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Pathogen-derived peptide antigen => ECO:0000269|PubMed:23260142, ECO:0007744|PDB:4GBX |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | GLU55 | |
D | GLU55 |
site_id | SWS_FT_FI6 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Self- and pathogen-derived peptide antigen => ECO:0000269|PubMed:17583734, ECO:0000269|PubMed:21115828, ECO:0000269|PubMed:23260142, ECO:0000269|PubMed:31619516, ECO:0000269|PubMed:8145819, ECO:0007744|PDB:4GBX |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ASN62 | |
D | ASN62 |
site_id | SWS_FT_FI7 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Pathogen-derived peptide antigen => ECO:0000269|PubMed:17583734, ECO:0000269|PubMed:21115828, ECO:0000269|PubMed:23260142, ECO:0000269|PubMed:8145819, ECO:0007744|PDB:4FQX, ECO:0007744|PDB:4GBX |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ASN69 | |
D | ASN69 |
site_id | SWS_FT_FI8 |
残基数 | 2 |
詳細 | SITE: Self- and pathogen-derived peptide antigen => ECO:0000269|PubMed:17583734, ECO:0000269|PubMed:23260142, ECO:0000269|PubMed:31619516, ECO:0000269|PubMed:8145819, ECO:0007744|PDB:4FQX, ECO:0007744|PDB:4GBX |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ARG76 | |
D | ARG76 |
site_id | SWS_FT_FI9 |
残基数 | 4 |
詳細 | CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000269|PubMed:19159218, ECO:0000269|PubMed:7477400 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ASN78 | |
A | ASN118 | |
D | ASN78 | |
D | ASN118 |