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Yorodumi- PDB-1p5w: The structures of host range controlling regions of the capsids o... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1p5w | ||||||
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Title | The structures of host range controlling regions of the capsids of canine and feline parvoviruses and mutants | ||||||
Components |
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Keywords | Virus/DNA / parvovirade / canine parvovirus / Icosahedral virus / Virus-DNA COMPLEX | ||||||
Function / homology | Function and homology information permeabilization of host organelle membrane involved in viral entry into host cell / symbiont entry into host cell via permeabilization of inner membrane / microtubule-dependent intracellular transport of viral material towards nucleus / adhesion receptor-mediated virion attachment to host cell / T=1 icosahedral viral capsid / viral penetration into host nucleus / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / entry receptor-mediated virion attachment to host cell / host cell nucleus / structural molecule activity / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Canine parvovirus | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3.3 Å | ||||||
Authors | Agbandje-McKenna, M. / Govindasamy, L. | ||||||
Citation | Journal: J.Virol. / Year: 2003 Title: Structures of host range-controlling regions of the capsids of canine and feline parvoviruses and mutants. Authors: Govindasamy, L. / Hueffer, K. / Parrish, C.R. / Agbandje-McKenna, M. #1: Journal: Science / Year: 1991 Title: The three-dimensional structure of canine parvovirus and its functional implications Authors: Tsao, J. / Chapman, M.S. / Agbandje, M. / Keller, W. / Smith, K. / Wu, H. / Luo, M. / Smith, T.J. / Rossmann, M.G. / Compans, R.W. / Parrish, C.R. #2: Journal: Acta Crystallogr.,Sect.B / Year: 1992 Title: Structure determination of monoclinic canine parvovirus Authors: Tsao, J. / Chapman, M.S. / Wu, H. / Agbandje, M. / Keller, W. / Rossmann, M.G. #3: Journal: J.Mol.Biol. / Year: 1993 Title: The canine parvovirus empty capsid structure Authors: Wu, H. / Rossmann, M.G. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1p5w.cif.gz | 137.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb1p5w.ent.gz | 106.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1p5w.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/p5/1p5w ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/p5/1p5w | HTTPS FTP |
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-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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6 |
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Hermann–Mauguin notation: 532 / Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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