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Yorodumi- PDB-1lp3: The Atomic Structure of Adeno-Associated Virus (AAV-2), a Vector ... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1lp3 | ||||||
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Title | The Atomic Structure of Adeno-Associated Virus (AAV-2), a Vector for Human Gene Therapy | ||||||
Components | AAV-2 capsid protein | ||||||
Keywords | VIRUS / capsid / single-stranded / DNA / beta-barrel / parvovirus / satellite / human / Icosahedral virus | ||||||
Function / homology | Function and homology information permeabilization of host organelle membrane involved in viral entry into host cell / symbiont entry into host cell via permeabilization of inner membrane / host cell nucleolus / T=1 icosahedral viral capsid / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / structural molecule activity / virion attachment to host cell Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Adeno-associated virus - 2 | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / Molecular replacement at 15A, then phase extension by symmetry averaging / Resolution: 3 Å | ||||||
Authors | Xie, Q. / Bu, W. / Bhatia, S. / Hare, J. / Somasundaram, T. / Azzi, A. / Chapman, M.S. | ||||||
Citation | Journal: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / Year: 2002 Title: The atomic structure of adeno-associated virus (AAV-2), a vector for human gene therapy. Authors: Xie, Q. / Bu, W. / Bhatia, S. / Hare, J. / Somasundaram, T. / Azzi, A. / Chapman, M.S. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1lp3.cif.gz | 125.3 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb1lp3.ent.gz | 95.6 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1lp3.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lp/1lp3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lp/1lp3 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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1 |
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2 |
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3 |
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4 |
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5 |
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6 | x 60 x 60
| x 60||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Hermann–Mauguin notation: 532 / Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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