+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1dnv | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | PARVOVIRUS (DENSOVIRUS) FROM GALLERIA MELLONELLA | |||||||||
Components | GALLERIA MELLONELLA DENSOVIRUS CAPSID PROTEIN | |||||||||
Keywords | VIRUS / PARVOVIRUS / DENSOVIRUS / CAPSID PROTEIN / VIRAL CAPSID / Icosahedral virus | |||||||||
Function / homology | Function and homology information permeabilization of host organelle membrane involved in viral entry into host cell / symbiont entry into host cell via permeabilization of inner membrane / T=1 icosahedral viral capsid / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / structural molecule activity / virion attachment to host cell Similarity search - Function | |||||||||
Biological species | Galleria mellonella densovirus | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT, NCS SYMMETRY AVERAGING / Resolution: 3.6 Å | |||||||||
Authors | Simpson, A.A. / Chipmann, P.R. / Baker, T.S. / Tijssen, P. / Rossmann, M.G. | |||||||||
Citation | Journal: Structure / Year: 1998 Title: The structure of an insect parvovirus (Galleria mellonella densovirus) at 3.7 A resolution. Authors: Simpson, A.A. / Chipman, P.R. / Baker, T.S. / Tijssen, P. / Rossmann, M.G. #1: Journal: Structure / Year: 1998 Title: Functional Implications of the Structure of the Murine Parvovirus, Minute Virus of Mice Authors: Agbandje-McKenna, M. / Llamas-Saiz, A.L. / Wang, F. / Tattersall, P. / Rossmann, M.G. #2: Journal: Semin.Virol. / Year: 1995 Title: Densonucleosis Viruses Constitute an Increasingly Diversified Subfamily within the Parvoviruses Authors: Tijssen, P. / Bergoin, M. #3: Journal: Virology / Year: 1993 Title: Structure, Sequence, and Function Correlations Among Parvoviruses Authors: Chapman, M.S. / Rossmann, M.G. #4: Journal: Proteins / Year: 1993 Title: Structure Determination of Feline Panleukopenia Virus Empty Particles Authors: Agbandje, M. / McKenna, R. / Rossmann, M.G. / Strassheim, M.L. / Parrish, C.R. #5: Journal: Science / Year: 1991 Title: The Three-Dimensional Structure of Canine Parvovirus and its Functional Implications Authors: Tsao, J. / Chapman, M.S. / Agbandje, M. / Keller, W. / Smith, K. / Wu, H. / Luo, M. / Smith, T.J. / Rossmann, M.G. / Compans, R.W. / Parrish, C.R. | |||||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1dnv.cif.gz | 100.1 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb1dnv.ent.gz | 77.1 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1dnv.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dn/1dnv ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dn/1dnv | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
Similar structure data |
---|
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| x 6|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 |
| x 30|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Symmetry | Point symmetry: (Hermann–Mauguin notation: 532 / Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
|