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万見生物種
- EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報 -

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キーワード検索の結果

検索 (キーワード: Homo sapiens)の結果全7件を表示しています

名称EMDBPDBSASBDB
Homo sapiens (ヒト)11964676620
Homo sapiens embryonic kidney cells (ヒト)000
Homo sapiens environmental sample (ヒト)110
Homo sapiens neanderthalensis (ヒト)040
Homo sapiens subsp. 'Denisova' (ヒト)000
Homo sapiens/Mus musculus xenograft (ヒト)020
Homo sapiens x Mus musculus hybrid cell line (ヒト)030

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生物種情報

名称Homo sapiens
和名 *1ヒト
名称 *2Homo sapiens
その他の名称 *2GenBank一般名: human / その他: Homo sapiens Linnaeus, 1758
構造データでの名称Human / Homo sapien / Hek293t ...Human / Homo sapien / Hek293t / Homo sapiens HEK293-T / Egfr / Homo sapience / Omo sapiens
NCBI Taxonomy ID9606
系統 *2細胞生物 > 真核生物 > オピストコンタ > 動物 > 真正後生動物 > 左右相称動物 > 後口動物 > 脊索動物 > 有頭動物 > 脊椎動物 > 顎口上綱 > Teleostomi > Euteleostomi > 肉鰭類 > Dipnotetrapodomorpha > 四肢動物 > 有羊膜類 > 哺乳類 > 獣亜綱 > 真獣下綱 > 北方真獣類 > 真主齧上目 > 霊長目 > 直鼻亜目 > 真猿型下目 > 狭鼻小目 > ヒト上科 > ヒト科 > ヒト亜科 > ヒト属
ウィキペディアウィキペディア - ヒト: ヒト（人、英: human）とは、広義にはヒト亜族（Hominina）に属する動物の総称であり、狭義には現生の（現在生息している）人類（学名 : Homo sapiens）、ホモ・サピエンス・サピエンス（ホモサピエンスサピエンス、Homo sapiens sapiens）を指す。人間（にんげん）ともいわれる...
コメントヒト / human
出典*1: DBCLSメタ用語集-翻訳用テーブル-学名と和名の対応 ライフサイエンス統合データベースプロジェクト
*2: NCBI Taxonomy

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万見生物種について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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