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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7boz | ||||||
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タイトル | N-teminal of mature bacteriophage T7 tail fiber protein gp17 | ||||||
要素 | N-teminal of mature bacteriophage T7 tail fiber protein gp17 | ||||||
キーワード | STRUCTURAL PROTEIN (タンパク質) / phage (ファージ) / portal / protein (タンパク質) / mature | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 virus tail, fiber / adhesion receptor-mediated virion attachment to host cell / symbiont entry into host cell / virion attachment to host cell / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia phage T7 (ファージ) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.8 Å | ||||||
データ登録者 | Chen, W.Y. / Xiao, H. | ||||||
資金援助 | 1件
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引用 | ジャーナル: Protein Cell / 年: 2020 タイトル: Structural changes of a bacteriophage upon DNA packaging and maturation. 著者: Wenyuan Chen / Hao Xiao / Xurong Wang / Shuanglin Song / Zhen Han / Xiaowu Li / Fan Yang / Li Wang / Jingdong Song / Hongrong Liu / Lingpeng Cheng / | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7boz.cif.gz | 493.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7boz.ent.gz | 363.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7boz.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bo/7boz ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bo/7boz | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 61641.875 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia phage T7 (ファージ) / 遺伝子: 17 / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: P03748 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: N-teminal of mature bacteriophage T7 tail fiber protein gp17 タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: Escherichia phage T7 (ファージ) |
緩衝液 | pH: 7 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: NITROGEN |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TECNAI ARCTICA |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 200 kV / 照射モード: FLOOD BEAM |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy |
撮影 | 電子線照射量: 24 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k) |
-解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
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3次元再構成 | 解像度: 3.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 55212 / 対称性のタイプ: POINT |