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- PDB-5xti: Cryo-EM architecture of human respiratory chain megacomplex-I2III2IV2 -

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データベース: PDB / ID: 5xti
タイトルCryo-EM architecture of human respiratory chain megacomplex-I2III2IV2
構成要素
  • (Cytochrome b-c1 complex subunit ...) x 9
  • (Cytochrome c oxidase subunit ...シトクロムcオキシダーゼ) x 13
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit ...) x 12
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit ...) x 11
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit ...) x 2
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein ...) x 3
  • (NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein ...) x 7
  • (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain ...) x 7
  • Acyl carrier protein, mitochondrial
  • Cytochrome bシトクロムb
  • Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial
  • NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
キーワードOXIDOREDUCTASE/ELECTRON TRANSPORT / Homo sapiens (ホモ・サピエンス) / Oxidoreductase (酸化還元酵素) / Respiratory (呼吸器) / OXIDOREDUCTASE-ELECTRON TRANSPORT complex
機能・相同性Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 superfamily / Cytochrome c oxidase, subunit VIIa superfamily / Cytochrome c oxidase, subunit VIa superfamily / NAD(P)-binding domain superfamily / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain superfamily / Thioredoxin-like superfamily / Cytochrome b/b6, C-terminal domain superfamily ...Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 superfamily / Cytochrome c oxidase, subunit VIIa superfamily / Cytochrome c oxidase, subunit VIa superfamily / NAD(P)-binding domain superfamily / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain superfamily / Thioredoxin-like superfamily / Cytochrome b/b6, C-terminal domain superfamily / 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily / Cytochrome c oxidase subunit III-like superfamily / Cytochrome c oxidase subunit 2, C-terminal / Cytochrome c oxidase, subunit VIb superfamily / Cytochrome c oxidase subunit III domain / Cytochrome c oxidase subunit I domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / Deoxynucleoside kinase domain / シトクロムb / Single alpha-helix domain superfamily / [NiFe]-hydrogenase, large subunit / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / Cytochrome b/b6-like domain superfamily / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2 / Cytochrome c oxidase, subunit 8 superfamily / Cytochrome c oxidase subunit VIIc superfamily / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit / NADHデヒドロゲナーゼ / Cytochrome C oxidase subunit II, periplasmic domain / Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I / Cytochrome b/b6/petB / Cytochrome b(C-terminal)/b6/petD / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D superfamily / NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit, FMN-binding domain superfamily / Cytochrome c oxidase subunit IV superfamily / NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit, iron-sulphur binding domain superfamily / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, transmembrane domain superfamily / Cytochrome c oxidase, subunit Vb superfamily / Cytochrome c oxidase-like, subunit I superfamily / Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain superfamily / Cytochrome c-like domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / ACP-like superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 superfamily / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / Proton-conducting membrane transporter / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / Di-haem cytochrome, transmembrane / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8kDa, N-terminal / Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Rieske iron-sulphur protein / Cytochrome c oxidase, subunit II / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Cytochrome c oxidase, subunit III, 4-helical bundle / Cytochrome c oxidase subunit IV / NADH:ubiquinone oxidoreductase, MNLL subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / Peptidase M16, N-terminal / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain / NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit, FMN-binding domain / NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit / Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like / Globular protein, non-globular alpha/beta subunit / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / CHCH / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / Cytochrome c oxidase subunit III / Soluble ligand binding domain / Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain / Cytochrome c oxidase, subunit I, copper-binding site / Cytochrome C oxidase, subunit VIIB domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal / Cytochrome c oxidase, subunit Vb, zinc binding site / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit, iron-sulphur binding domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding / Zinc finger, CHCC-type / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / Cytochrome c oxidase, subunit VIa, conserved site
機能・相同性情報
試料の由来Homo sapiens (ヒト)
Bos taurus (ウシ)
実験手法電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 17.4 Å 分解能
データ登録者Gu, J. / Wu, M. / Yang, M.
引用ジャーナル: Cell / : 2017
タイトル: Architecture of Human Mitochondrial Respiratory Megacomplex IIIIIV.
著者: Runyu Guo / Shuai Zong / Meng Wu / Jinke Gu / Maojun Yang
要旨: The respiratory megacomplex represents the highest-order assembly of respiratory chain complexes, and it allows mitochondria to respond to energy-requiring conditions. To understand its architecture, ...The respiratory megacomplex represents the highest-order assembly of respiratory chain complexes, and it allows mitochondria to respond to energy-requiring conditions. To understand its architecture, we examined the human respiratory chain megacomplex-IIIIIV (MCIIIIIV) with 140 subunits and a subset of associated cofactors using cryo-electron microscopy. The MCIIIIIV forms a circular structure with the dimeric CIII located in the center, where it is surrounded by two copies each of CI and CIV. Two cytochrome c (Cyt.c) molecules are positioned to accept electrons on the surface of the c state CIII dimer. Analyses indicate that CII could insert into the gaps between CI and CIV to form a closed ring, which we termed the electron transport chain supercomplex. The structure not only reveals the precise assignment of individual subunits of human CI and CIII, but also enables future in-depth analysis of the electron transport chain as a whole.
構造検証レポート
簡易版詳細版構造検証レポートについて
日付登録: 2017年6月19日 / 公開: 2017年9月13日
改定日付Data content typeGroupCategoryItemProviderタイプ
1.02017年9月13日Structure modelrepositoryInitial release
1.12017年12月6日Structure modelData processing / Database referencescitation / em_software_citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _em_software.name

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  • マップデータ: EMDB-6776
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MolmilJmol/JSmol

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集合体

登録構造単位
A: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
B: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
C: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
E: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
F: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
G: Acyl carrier protein, mitochondrial
H: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
I: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
J: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
K: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
L: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
M: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
N: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
O: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
P: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
Q: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
S: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
T: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
U: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
V: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
W: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
X: Acyl carrier protein, mitochondrial
Y: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
Z: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
a: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
b: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
c: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
d: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
e: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
f: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
g: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
h: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
i: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
j: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
k: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
l: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
m: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
n: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
o: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
p: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
r: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
s: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
u: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
v: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
w: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
x: Cytochrome c oxidase subunit 1
y: Cytochrome c oxidase subunit 2
z: Cytochrome c oxidase subunit 3
0: Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial
1: Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial
2: Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial
3: Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial
4: Cytochrome c oxidase subunit 6B1
5: Cytochrome c oxidase subunit 6C
6: Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial
7: Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial
8: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial
9: Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial
AA: Cytochrome b-c1 complex subunit 8
AB: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
AC: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
AD: Cytochrome b-c1 complex subunit 9
AE: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial
AF: Cytochrome b-c1 complex subunit 7
AG: Cytochrome b-c1 complex subunit 10
AH: Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial
AJ: Cytochrome b
AK: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
AL: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial
AN: Cytochrome b-c1 complex subunit 8
AO: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
AP: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
AQ: Cytochrome b-c1 complex subunit 9
AR: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial
AS: Cytochrome b-c1 complex subunit 7
AT: Cytochrome b-c1 complex subunit 10
AU: Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial
AV: Cytochrome b
AW: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
AY: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial
BA: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
BB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
BC: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
BE: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
BF: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
BG: Acyl carrier protein, mitochondrial
BH: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
BI: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
BJ: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
BK: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
BL: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
BM: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
BN: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
BO: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
BP: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
BQ: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
BS: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
BT: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
BU: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
BV: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
BW: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
BX: Acyl carrier protein, mitochondrial
BY: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
BZ: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
Ba: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
Bb: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
Bc: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
Bd: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
Be: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
Bf: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
Bg: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
Bh: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
Bi: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
Bj: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
Bk: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
Bl: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
Bm: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
Bn: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
Bo: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
Bp: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
Br: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
Bs: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
Bu: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
Bv: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
Bw: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
Bx: Cytochrome c oxidase subunit 1
By: Cytochrome c oxidase subunit 2
Bz: Cytochrome c oxidase subunit 3
B0: Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial
B1: Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial
B2: Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial
B3: Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial
B4: Cytochrome c oxidase subunit 6B1
B5: Cytochrome c oxidase subunit 6C
B6: Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial
B7: Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial
B8: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial
B9: Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)2,828,803238
ポリマ-2,756,873138
非ポリマ-71,929100
0
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: gel filtration
タイプ名称対称操作
identity operation1_5551

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構成要素

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NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein ... , 3種, 6分子 ABAKBKOBO

#1: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / Complex I-51kD / CI-51kD / NADH dehydrogenase flavoprotein 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit


分子量: 47323.938 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 27-457 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: P49821, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型), NADHデヒドロゲナーゼ
#10: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / Complex I-9kD / CI-9kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 9 kDa subunit / Renal carcinoma antigen NY-REN-4


分子量: 3900.312 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 74-106 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P56181
#14: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit


分子量: 23430.881 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 36-247 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: P19404, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型), NADHデヒドロゲナーゼ

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein ... , 7種, 14分子 BBBCBCLBLPBPQBQTBThBh

#2: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / Complex I-23kD / CI-23kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 23 kDa subunit / TYKY subunit


分子量: 20314.037 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: O00217, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型), NADHデヒドロゲナーゼ
#3: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / Complex I-20kD / CI-20kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit / PSST subunit


分子量: 17887.928 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 58-213 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: O75251, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型), NADHデヒドロゲナーゼ
#11: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / Complex I-18 kDa / CI-18 kDa / Complex I-AQDQ / CI-AQDQ / NADH-ubiquinone oxidoreductase 18 kDa subunit


分子量: 13721.598 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 58-175 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43181
#15: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / Complex I-30kD / CI-30kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 30 kDa subunit


分子量: 24432.656 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 43-250 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: O75489, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型), NADHデヒドロゲナーゼ
#16: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial / Complex I-49kD / CI-49kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit


分子量: 49236.480 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: O75306, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型), NADHデヒドロゲナーゼ
#18: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Complex I-13kD-A / CI-13kD-A / NADH-ubiquinone oxidoreductase 13 kDa-A subunit


分子量: 10578.848 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 29-123 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O75380
#31: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / Complex I-15 kDa / CI-15 kDa / NADH-ubiquinone oxidoreductase 15 kDa subunit


分子量: 12314.254 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 2-105 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43920

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit ... , 12種, 24分子 EBEFBFHBHIBIJBJNBNSBSUBUVBVWBWuBuwBw

#4: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / Complex I-B14 / CI-B14 / LYR motif-containing protein 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B14 subunit


分子量: 13758.070 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 42-154 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P56556
#5: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / Complex I-B8 / CI-B8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B8 subunit


分子量: 9535.905 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 14-96 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43678
#7: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / Complex I subunit B13 / Complex I-13kD-B / CI-13kD-B / NADH-ubiquinone oxidoreductase 13 kDa-B subunit


分子量: 13119.208 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 5-116 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16718
#8: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / Complex I-B14.5a / CI-B14.5a / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a


分子量: 12282.051 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 4-113 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95182
#9: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / Complex I-39kD / CI-39kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 39 kDa subunit


分子量: 38387.594 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 40-376 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16795
#13: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / 13 kDa differentiation-associated protein / Complex I-B17.2 / CIB17.2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B17.2


分子量: 16880.068 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 2-144 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9UI09
#17: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / Complex I-MWFE / CI-MWFE / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit


分子量: 8084.391 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O15239
#19: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / Complex I-B9 / CI-B9 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B9 subunit


分子量: 9156.602 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95167
#20: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / Complex I-B14.7 / CI-B14.7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B14.7


分子量: 14736.853 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q86Y39
#21: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / Cell death regulatory protein GRIM-19 / Complex I-B16.6 / CI-B16.6 / Gene associated with retinoic and interferon-induced mortality 19 protein / Gene associated with retinoic and IFN-induced mortality 19 protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase B16.6 subunit


分子量: 16132.570 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 7-144 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P0J0
#42: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / Complex I-19kD / CI-19kD / Complex I-PGIV / CI-PGIV / NADH-ubiquinone oxidoreductase 19 kDa subunit


分子量: 19853.736 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 4-172 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P51970
#44: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / Complex I-42kD / CI-42kD / NADH-ubiquinone oxidoreductase 42 kDa subunit


分子量: 37200.270 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95299

+
タンパク質・ペプチド , 4種, 10分子 GXBGBXMBMAHAUAJAV

#6: タンパク質・ペプチド
Acyl carrier protein, mitochondrial / ACP / CI-SDAP / NADH-ubiquinone oxidoreductase 9.6 kDa subunit


分子量: 9845.247 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP RESIDUES 72-196 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O14561
#12: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / Complex I-75kD / CI-75kD


分子量: 75471.484 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 30-716 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: P28331, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型), NADHデヒドロゲナーゼ
#65: タンパク質・ペプチド Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial / / Complex III subunit 4 / Complex III subunit IV / Cytochrome b-c1 complex subunit 4 / Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex cytochrome c1 subunit / Cytochrome c-1


分子量: 27388.395 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P08574
#66: タンパク質・ペプチド Cytochrome b / シトクロムb / Complex III subunit 3 / Complex III subunit III / Cytochrome b-c1 complex subunit 3 / Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex cytochrome b subunit


分子量: 42543.016 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 2-479 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P00156

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit ... , 11種, 22分子 YBYZBZaBabBbcBcdBdeBenBnoBopBpvBv

#22: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial / Complex I-AGGG / CI-AGGG / NADH-ubiquinone oxidoreductase AGGG subunit


分子量: 7468.270 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 39-97 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95178
#23: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / Complex I-B12 / CI-B12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit


分子量: 9261.605 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 10-89 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43676
#24: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial / Complex I-SGDH / CI-SGDH / NADH-ubiquinone oxidoreductase SGDH subunit


分子量: 16573.160 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 52-189 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43674
#25: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / Complex I-B17 / CI-B17 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B17 subunit


分子量: 15008.635 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 3-126 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95139
#26: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / Complex I-ASHI / CI-ASHI / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit


分子量: 18267.562 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 34-186 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95169
#27: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / Complex I-PDSW / CI-PDSW / NADH-ubiquinone oxidoreductase PDSW subunit


分子量: 20721.650 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 1-171 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O96000
#28: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / Complex I-ESSS / CI-ESSS / NADH-ubiquinone oxidoreductase ESSS subunit / Neuronal protein 17.3 / p17.3


分子量: 11494.942 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 54-150 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NX14
#37: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / Complex I-MNLL / CI-MNLL / NADH-ubiquinone oxidoreductase MNLL subunit


分子量: 6741.883 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 3-58 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O75438
#38: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / Complex I-B15 / CI-B15 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B15 subunit


分子量: 15100.399 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95168
#39: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / Complex I-B22 / CI-B22 / LYR motif-containing protein 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B22 subunit


分子量: 21189.141 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 8-179 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y6M9
#43: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / Cell adhesion protein SQM1 / Complex I-B18 / CI-B18 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit


分子量: 14997.401 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 3-124 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P17568

+
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit ... , 2種, 4分子 fBfgBg

#29: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / Complex I-KFYI / CI-KFYI / NADH-ubiquinone oxidoreductase KFYI subunit


分子量: 5704.602 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 28-74 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43677
#30: タンパク質・ペプチド NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / Complex I-B14.5b / CI-B14.5b / Human lung cancer oncogene 1 protein / HLC-1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5b


分子量: 14209.521 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O95298

+
NADH-ubiquinone oxidoreductase chain ... , 7種, 14分子 iBijBjkBklBlmBmrBrsBs

#32: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2


分子量: 39007.656 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: Q4GRX1, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
#33: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3


分子量: 13147.871 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 1-115 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: B9EE38, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
#34: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L


分子量: 10702.086 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 1-97 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: V9JN72, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
#35: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5


分子量: 67096.023 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: X5BVZ3, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
#36: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6


分子量: 18660.979 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: Q8HAX7, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
#40: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4


分子量: 51689.688 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: B2XJG5, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
#41: タンパク質・ペプチド NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1


分子量: 35621.215 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: H9PGF0, NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)

+
Cytochrome c oxidase subunit ... , 13種, 26分子 xBxyByzBz0B01B12B23B34B45B56B67B78B89B9

#45: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 1 / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide I


分子量: 57065.844 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00396, シトクロムcオキシダーゼ
#46: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 2 / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide II


分子量: 26040.393 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P68530
#47: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 3 / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide III


分子量: 29957.627 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00415
#48: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide IV / Cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1 / COX IV-1


分子量: 16913.367 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 26-169 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00423
#49: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide Va


分子量: 12453.081 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00426
#50: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide VIa / Cytochrome c oxidase polypeptide Vb


分子量: 10684.038 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00428
#51: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide VIa-heart / COXVIAH / Cytochrome c oxidase polypeptide VIb


分子量: 9452.687 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 13-96 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P07471
#52: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 6B1 / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide VII / Cytochrome c oxidase subunit AED / Cytochrome c oxidase subunit VIb isoform 1 / COX VIb-1


分子量: 8925.979 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 12-86 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00429
#53: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 6C / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide VIc / Cytochrome c oxidase subunit STA


分子量: 8494.982 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P04038
#54: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase subunit VIIIc / VIIIC / Cytochrome c oxidase subunit VIIa-heart / Cytochrome c oxidase subunit VIIa-H / Cytochrome c oxidase subunit VIIa-muscle / Cytochrome c oxidase subunit VIIa-M


分子量: 6286.220 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 22-77 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P07470
#55: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide VIIb / IHQ


分子量: 5442.168 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 30-78 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P13183
#56: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide VIIIA / Cytochrome c oxidase polypeptide VIIc


分子量: 5449.396 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00430
#57: タンパク質・ペプチド Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial / シトクロムcオキシダーゼ / Cytochrome c oxidase polypeptide VIII-heart / Cytochrome c oxidase subunit 8-1 / Cytochrome c oxidase subunit 8H / IX / VIIIb


分子量: 4738.523 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 25-67 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P10175

+
Cytochrome b-c1 complex subunit ... , 9種, 18分子 AAANABAOACAPADAQAEARAFASAGATAKAWALAY

#58: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / Complex III subunit 8 / Complex III subunit VIII / Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 9.5 kDa protein / Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C


分子量: 9791.181 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O14949
#59: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial / Complex III subunit 5 / Cytochrome b-c1 complex subunit 5 / Rieske iron-sulfur protein / RISP / Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit


分子量: 5893.814 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 1-57 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: P47985, ユビキノール-シトクロムcレダクターゼ
#60: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial / Complex III subunit 5 / Cytochrome b-c1 complex subunit 5 / Rieske iron-sulfur protein / RISP / Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit


分子量: 21645.578 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
参照: UniProt: P47985, ユビキノール-シトクロムcレダクターゼ
#61: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Complex III subunit 9 / Complex III subunit X / Cytochrome c1 non-heme 7 kDa protein / Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2 kDa protein


分子量: 7189.299 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9UDW1
#62: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial / Complex III subunit 6 / Complex III subunit VIII / Cytochrome c1 non-heme 11 kDa protein / Mitochondrial hinge protein / Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 11 kDa protein


分子量: 8861.742 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 18-91 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P07919
#63: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Complex III subunit 7 / Complex III subunit VII / QP-C / Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein


分子量: 13037.842 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 6-111 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P14927
#64: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Complex III subunit 10 / Complex III subunit XI / Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 6.4 kDa protein


分子量: 5958.912 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 2-52 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O14957
#67: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial / Complex III subunit 2 / Core protein II / Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2


分子量: 44946.582 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP RESIDUES 35-453 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P22695
#68: タンパク質・ペプチド Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial / Complex III subunit 1 / Core protein I / Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1


分子量: 49181.430 Da / 分子数: 2 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P31930

+
非ポリマー , 14種, 100分子

#69: 化合物
ChemComp-SF4 / IRON/SULFUR CLUSTER


分子量: 351.640 Da / 分子数: 12 / : Fe4S4
#70: 化合物 ChemComp-FMN / FLAVIN MONONUCLEOTIDE / RIBOFLAVIN MONOPHOSPHATE


分子量: 456.344 Da / 分子数: 2 / : C17H21N4O9P / フラビンモノヌクレオチド
#71: 化合物...
ChemComp-PLX / (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL


分子量: 767.132 Da / 分子数: 21 / : C42H89NO8P
#72: 化合物
ChemComp-8Q1 / S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate / S-dodecanoyl-4'-phosphopantetheine


分子量: 540.651 Da / 分子数: 4 / : C23H45N2O8PS
#73: 化合物 ChemComp-NDP / NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE


分子量: 745.421 Da / 分子数: 2 / : C21H30N7O17P3
#74: 化合物
ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER


分子量: 175.820 Da / 分子数: 6 / : Fe2S2
#75: 化合物
ChemComp-CDL / CARDIOLIPIN / DIPHOSPHATIDYL GLYCEROL / BIS-(1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHO)-1',3'-SN-GLYCEROL


分子量: 1464.043 Da / 分子数: 19 / : C81H156O17P2 / Cardiolipin / コメント: リン脂質 *YM
#76: 化合物
ChemComp-PEE / 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine / DOPE


分子量: 749.073 Da / 分子数: 14 / : C41H83NO8P / Discrete optimized protein energy / コメント: DOPE (リン脂質) *YM
#77: 化合物
ChemComp-CU / COPPER (II) ION


分子量: 63.546 Da / 分子数: 6 / : Cu /
#78: 化合物 ChemComp-MG / MAGNESIUM ION


分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / : Mg / マグネシウム
#79: 化合物
ChemComp-HEA / HEME-A


分子量: 852.837 Da / 分子数: 4 / : C49H56FeN4O6 / Heme A
#80: 化合物 ChemComp-ZN / ZINC ION


分子量: 65.409 Da / 分子数: 2 / : Zn / 亜鉛
#81: 化合物 ChemComp-HEC / HEME C


分子量: 618.503 Da / 分子数: 2 / : C34H34FeN4O4 / Heme C
#82: 化合物
ChemComp-HEM / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / HEME


分子量: 616.487 Da / 分子数: 4 / : C34H32FeN4O4 / ヘム

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実験情報

-
実験

実験実験手法: 電子顕微鏡法
EM実験試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法

-
試料調製

構成要素名称: Human respiratory chain megacomplex-I2III2IV2 / タイプ: COMPLEX
Entity ID: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68
由来: NATURAL
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
緩衝液pH: 7.4
試料包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
急速凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡撮影

実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡顕微鏡モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: OTHER
電子レンズモード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影電子線照射量: 1.25 e/Å2
フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)

-
解析

EMソフトウェア
ID名称バージョンカテゴリ
1EMAN2.1particle selection
2AutoEMation2.0image acquisition
4CTFFIND3.0CTF correction
7Coot0.8.2model fitting
9RELION1.4initial Euler assignment
10RELION1.4final Euler assignment
12RELION1.43D reconstruction
13PHENIX1.11.1model refinement
CTF補正タイプ: NONE
対称性点対称性: C1
3次元再構成分解能: 17.4 Å / 分解能の評価方法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 8600 / 対称性のタイプ: POINT

+
万見について

-
お知らせ

-
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。詳細は下記のリンクをご覧ください。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク: wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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2017年6月16日: Omokage検索で絞り込み

Omokage検索で絞り込み

  • Omokage検索の結果をキーワードとデータベースの種類で絞り込むことができるようになりました。

関連情報: Omokage検索

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2016年9月15日: 新しくなったEM Navigatorと万見

新しくなったEM Navigatorと万見

  • EM Navigatorと万見を刷新しました

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見

新しいEM Navigatorと万見

  • これまで開発版として公開していたEM Navigatorと万見が、9月15日から正式版となります。
  • 現行版も「旧版」としてしばらく公開を継続します。

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点 / EM Navigator / 万見 (Yorodumi)

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2016年4月13日: Omokage検索が速くなりました

Omokage検索が速くなりました

  • データアクセスプロセスを見直し、計算時間をこれまでの半分程度に短縮しました。
  • これまで以上に、生体分子の「カタチの類似性」をお楽しみください!

関連情報: Omokage検索

すべてのお知らせ

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報: EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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