PDB-5luq: Crystal Structure of Human DNA-dependent Protein Kinase Catalytic...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5luq

タイトル

Crystal Structure of Human DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit (DNA-PKcs)

要素

C-terminal fragment of KU80 (KU80ct194)
DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit

キーワード

TRANSFERASE (転移酵素) /

DNA-PKcs (DNA依存性プロテインキナーゼ触媒サブユニット) /

Kinase (キナーゼ) /

DNA repair (DNA修復) /

NHEJ (非相同末端結合) / double strand break repair /

HEAT repeat (HEATリピート)

機能・相同性

機能・相同性情報

positive regulation of platelet formation / T cell receptor V(D)J recombination / pro-B cell differentiation / small-subunit processome assembly / positive regulation of lymphocyte differentiation / DNA-dependent protein kinase activity / histone H2AXS139 kinase activity / DNA-dependent protein kinase complex / immature B cell differentiation / DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex ...positive regulation of platelet formation / T cell receptor V(D)J recombination / pro-B cell differentiation / small-subunit processome assembly / positive regulation of lymphocyte differentiation / DNA-dependent protein kinase activity / histone H2AXS139 kinase activity / DNA-dependent protein kinase complex / immature B cell differentiation / DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex / immunoglobulin V(D)J recombination /

nonhomologous end joining complex / regulation of smooth muscle cell proliferation / double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining / Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA / regulation of epithelial cell proliferation / IRF3-mediated induction of type I IFN / telomere capping / U3 snoRNA binding / regulation of hematopoietic stem cell differentiation / maturation of 5.8S rRNA / T cell lineage commitment / negative regulation of cGAS/STING signaling pathway / B cell lineage commitment / positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining / ectopic germ cell programmed cell death /

somitogenesis / mitotic G1 DNA damage checkpoint signaling /

telomere maintenance / activation of innate immune response / small-subunit processome / negative regulation of protein phosphorylation / positive regulation of erythrocyte differentiation / positive regulation of translation /

デオキシリボ核酸 / response to gamma radiation / Nonhomologous End-Joining (NHEJ) /

brain development / peptidyl-threonine phosphorylation / protein modification process / protein destabilization /

regulation of circadian rhythm / double-strand break repair via nonhomologous end joining / cellular response to insulin stimulus / rhythmic process / intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage / double-strand break repair / E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins / T cell differentiation in thymus /

heart development /

double-stranded DNA binding / peptidyl-serine phosphorylation /

transcription regulator complex / RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding /

chromosome, telomeric region /

non-specific serine/threonine protein kinase /

protein kinase activity / positive regulation of apoptotic process / protein domain specific binding /

protein phosphorylation / protein serine kinase activity /

自然免疫系 / protein serine/threonine kinase activity / DNA damage response /

クロマチン /

核小体 / negative regulation of apoptotic process /

enzyme binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / protein-containing complex /

RNA binding /

核質 /

ATP binding /

生体膜 /

細胞核 /

細胞質基質
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 4.3 Å

データ登録者

Sibanda, B.L. / Chirgadze, D.Y. / Ascher, D.B. / Blundell, T.L.

資金援助

英国, 1件

引用

ジャーナル: Science / 年: 2017
タイトル: DNA-PKcs structure suggests an allosteric mechanism modulating DNA double-strand break repair.
著者: Sibanda, B.L. / Chirgadze, D.Y. / Ascher, D.B. / Blundell, T.L.

履歴

登録	2016年9月9日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2017年2月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年3月1日	Group: Database references
改定 1.2	2018年3月28日	Group: Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / entity_src_nat Item: _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain ..._entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name / _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain / _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant / _entity_src_nat.common_name

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5luq.cif.gz	3 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5luq.ent.gz	2.6 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5luq.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lu/5luq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lu/5luq	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	6zh6-d 6zfp-d 4425 11216 7k17-1 6zh8-d 5w1r-d 22622 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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登録構造単位

A: DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit

K: C-terminal fragment of KU80 (KU80ct194)

B: DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit

S: C-terminal fragment of KU80 (KU80ct194)

972 kDa, 4 ポリマー
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1

A: DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit

K: C-terminal fragment of KU80 (KU80ct194)

ソフトウェアが定義した集合体
486 kDa, 2 ポリマー
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2

B: DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit

S: C-terminal fragment of KU80 (KU80ct194)

ソフトウェアが定義した集合体
486 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	169.120, 132.640, 296.590
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 105.53, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit / DNA-PKcs / DNPK1 / p460 分子量: 469618.969 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 細胞株: HeLa 参照: UniProt: P78527, non-specific serine/threonine protein kinase
#2: タンパク質	C-terminal fragment of KU80 (KU80ct194) 分子量: 16621.318 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / プラスミド: pGAT3 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌)

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 2

-
試料調製

結晶

ID	マシュー密度 (Å³/Da)	溶媒含有率 (%)
1	3.27	62
2	3.27	62

結晶化

温度 (K)	Crystal-ID	手法	詳細	PH範囲
293	1	蒸気拡散法, ハンギングドロップ法	0.1 M Bis-Tris, 200 mM NaCl, 30% glycerol, 10 mM EDTA, 18% PEG 8000	6.2-6.7
293	2	蒸気拡散法, ハンギングドロップ法	0.1 M Bis-Tris, 200 mM NaCl, 30% glycerol, 10 mM EDTA, 8% PEG 8000	6.2-6.7

-
データ収集

回折

ID	平均測定温度 (K)	Crystal-ID
1	100	1
2	100	2

放射光源

由来	サイト	ビームライン	ID	波長 (Å)
シンクロトロン	ESRF	ID29	1	0.9791
シンクロトロン	ESRF	ID23-1	2	0.9791

検出器

タイプ	ID	検出器	日付
DECTRIS PILATUS 6M-F	1	PIXEL	2012年5月23日
DECTRIS PILATUS 6M-F	2	PIXEL	2011年6月25日

放射

ID	プロトコル	単色(M)・ラウエ(L)	散乱光タイプ	Wavelength-ID
1	SINGLE WAVELENGTH	M	x-ray	1
2	SINGLE WAVELENGTH	M	x-ray	2

放射波長

ID	波長 (Å)	相対比
1	0.97915	1
2	0.9791	1

反射

解像度: 4.3→49.92 Å / Num. obs: 84530 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 35.2 % / R_merge(I) obs: 0.16 / Net I/σ(I): 15.4

反射シェル

解像度: 4.3→4.41 Å / 冗長度: 13.1 % / R_merge(I) obs: 0.936 / Mean I/σ(I) obs: 2.4 / % possible all: 99.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10_2155: ???)	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 4.3→49.92 Å / SU ML: 1.12 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0 / 位相誤差: 55.75

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.437	1978	2.34 %
R_work	0.3862	-	-
obs	0.3874	84530	97.81 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 4.3→49.92 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	59694	0	0	0	59694

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	60886
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.542	82328
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.868	37258
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.068	9336
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.011	10524

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
4.3-4.4075	0.4411	134	0.4466	5463	X-RAY DIFFRACTION	91
4.4075-4.5266	0.4963	135	0.4432	5631	X-RAY DIFFRACTION	95
4.5266-4.6597	0.5077	140	0.4477	5752	X-RAY DIFFRACTION	96
4.6597-4.81	0.5102	140	0.458	5782	X-RAY DIFFRACTION	97
4.81-4.9818	0.4783	142	0.4617	5842	X-RAY DIFFRACTION	97
4.9818-5.181	0.4999	135	0.4535	5859	X-RAY DIFFRACTION	98
5.181-5.4166	0.5099	145	0.4549	5943	X-RAY DIFFRACTION	99
5.4166-5.7018	0.5191	140	0.4605	5941	X-RAY DIFFRACTION	99
5.7018-6.0584	0.4567	134	0.4628	6007	X-RAY DIFFRACTION	99
6.0584-6.5253	0.5304	147	0.4571	5986	X-RAY DIFFRACTION	100
6.5253-7.1802	0.4666	142	0.4413	6008	X-RAY DIFFRACTION	100
7.1802-8.2152	0.4546	144	0.3883	6061	X-RAY DIFFRACTION	100
8.2152-10.3352	0.3607	148	0.2844	6087	X-RAY DIFFRACTION	100
10.3352-49.9234	0.3788	152	0.3318	6190	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.6182	-0.2092	0.3796	0.2659	-0.1376	0.3206	-0.1841	-0.8431	-0.5397	1.1482	0.5762	-0.0335	0.5243	-0.0831	0.1665	2.0213	0.8059	-0.4009	2.1286	-0.6683	1.3029	39.0522	-30.5557	88.0704
2	0.0973	-0.0661	-0.111	0.0463	0.0636	0.1204	-0.1299	-0.1555	0.1683	0.1241	0.129	0.1446	0.1578	0.3468	0.1361	1.8937	1.1563	0.5539	3.6237	-1.3805	0.7496	55.5157	-13.8908	99.6993
3	0.2189	-0.1099	0.0042	0.1601	0.1918	0.2904	-0.0857	-0.9782	0.7312	0.579	-0.0831	-0.8395	1.3429	-0.346	0.0004	2.4516	0.698	-0.1767	3.102	-0.3451	1.675	79.7448	-13.7805	88.2267
4	0.078	-0.0716	0.0842	0.0486	-0.0726	0.0401	-0.4432	-0.8084	-0.2967	0.332	0.1017	-1.0906	0.3227	-0.4255	-0.0005	2.4453	0.6522	-0.6748	2.3025	-0.1327	2.348	82.2607	-10.5758	64.6066
5	0.874	0.042	-0.0642	0.7074	0.6442	3.1195	-1.0263	0.2321	-0.0243	0.0923	0.0427	0.3462	1.1901	-0.7267	-1.834	1.2852	0.3899	0.5314	0.6917	0.1826	1.0809	68.71	-7.9233	47.8809
6	0.3307	0.0321	0.085	0.2741	-0.4058	0.4225	-0.2779	0.7832	-0.4249	-0.7115	0.3614	0.6246	0.8064	-0.7527	0.1914	1.7276	-0.4314	-0.2726	0.0567	0.3863	0.8533	70.227	-7.739	33.4802
7	0.1937	-0.0649	-0.1689	-0.0102	0.0667	0.102	-0.0362	0.5042	0.3042	0.4236	-0.3428	0.3406	-0.4922	0.1871	0.0002	1.4674	0.3607	0.2777	2.0707	0.7673	2.4366	64.9794	10.359	34.0397
8	0.4658	-0.0047	-0.0194	0.3123	0.0539	0.3443	0.5151	-0.0682	0.2089	0.6203	0.434	0.265	0.7814	-0.7858	0.7608	0.4858	1.2441	1.0196	3.9521	-0.3994	0.9681	44.2615	7.2171	30.1705
9	0.2092	-0.087	-0.2503	0.0398	0.1403	0.2727	1.748	0.0826	0.3087	-0.2194	0.5562	0.0924	0.3277	-0.3576	0.0103	2.3198	0.3939	-0.5798	4.1617	-0.7459	3.1419	24.2336	-19.674	7.6635
10	0.2061	-0.3008	-0.3005	0.2456	0.1464	0.119	-0.2156	-1.802	-0.3048	0.6789	0.9616	-0.2693	0.4463	0.7204	0.1211	1.2705	-0.5507	0.3053	2.6428	1.0695	1.4371	43.0167	-20.1238	7.947
11	0.375	-0.361	-0.2807	0.579	0.4232	0.3355	0.0192	0.0554	-0.3618	-0.1273	0.2035	-0.7348	-0.3664	0.0645	0.0689	-1.2366	-0.9493	2.1277	2.6592	1.2546	0.0071	66.99	-7.4949	-3.9255
12	0.1926	0.1326	-0.2022	0.0267	-0.0937	0.1838	-0.9011	0.4694	0.5804	0.6682	-0.0083	-1.4966	-0.7466	0.303	0.0001	2.1595	0.4189	-0.0192	2.1957	0.436	2.5096	82.6046	16.0866	-2.604
13	0.0209	-0.0923	0.0159	0.0323	-0.0993	0.0595	-1.0659	-0.3831	-0.0733	0.2997	-0.527	-0.9962	0.7551	0.6952	-0.0013	1.9592	-0.2427	-0.2033	2.0279	0.5342	3.2703	88.7074	17.2333	13.3704
14	0.0814	0.0642	0.1683	0.1465	0.0564	0.1409	-0.3382	-1.7727	0.6051	0.4749	1.0076	0.0046	0.5467	0.3521	0.0009	2.8533	0.0613	-0.2983	1.5566	-0.4417	2.566	96.9016	17.2069	37.3366
15	0.7283	-0.853	0.5101	0.8461	0.3816	0.7682	-0.2545	-0.6649	-0.376	1.4751	1.1229	0.2415	0.9988	-0.7287	0.9871	-0.8607	1.4988	-1.0285	-0.0785	0.6743	0.2446	103.4733	-13.2837	51.2569
16	0.0028	0.0155	-0.0086	0.1516	-0.122	0.1335	0.0646	0.1432	0.0961	-0.1025	-0.1802	0.4397	0.1314	0.0109	0.0812	1.9148	0.9567	0.253	1.8249	0.6233	1.8315	87.4149	-17.6282	42.3351
17	0.0845	-0.2101	-0.0764	0.2804	0.3052	-0.05	0.4815	0.0114	0.3535	0.0986	-0.1952	-0.5929	0.6323	0.6395	-0.7379	0.7116	0.1529	-0.1506	0.1186	-0.4422	1.0522	95.9667	-44.892	51.3078
18	0.378	0.3935	0.0074	0.3421	-0.4084	0.9256	0.6648	-0.7144	-0.0623	0.3271	-0.012	-0.1333	0.2542	0.2559	0.0004	1.7815	0.3063	0.1268	1.5813	-0.2813	1.8022	65.7711	-66.7094	54.8756
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20	0.0396	-0.1157	0.0792	0.2729	-0.0209	0.2205	-0.1722	0.4713	0.0343	-0.3894	0.0983	0.7621	0.1869	-0.2335	0.0143	1.163	-1.5404	0.0892	3.0997	1.5197	2.8442	17.1989	-32.3659	25.5646
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64	0.3391	-0.1296	-0.1256	0.2007	0.0395	0.1066	0.4134	0.7308	-0.1464	0.1738	-1.2834	0.0855	0.0646	-0.0753	-0.0004	2.1647	0.0576	0.1255	2.6519	-0.4867	3.154	26.027	2.8246	130.2669
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67	0.0787	-0.0557	0.07	-0.072	0.0034	0.0247	0.0426	0.5409	-1.1703	0.1345	0.3229	0.0517	0.9068	0.0995	-0.0001	1.165	-0.5928	-0.4926	1.9647	0.2567	2.1859	29.6286	24.7898	126.3898
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72	0.02	-0.0009	-0.0153	0.0125	-0.0133	0.0166	-0.0682	-0.2894	0.002	0.0962	0.0883	0.0977	-0.0266	0.0223	-0.0001	2.0564	0.202	0.5673	2.9576	0.2462	2.8007	89.2903	-81.0468	44.2304
73	0.0173	0.0267	-0.001	0.0018	-0.001	0.0128	-0.3055	0.1901	0.0105	-0.7557	-0.6386	-0.3083	-0.204	0.1358	0.002	2.2622	0.1168	1.3026	2.8472	0.3167	3.4317	-19.2682	97.9106	101.5621
74	0.0262	0.0338	0.0094	0.0292	0.0041	0.0142	-0.0079	-0.1336	-0.218	0.3585	-0.2813	-0.2734	-0.2366	-0.2769	0.0003	1.1203	-0.0725	-0.1335	1.5366	-0.4353	1.6912	-39.7248	99.4018	55.9924

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain 'A' and resid 10 through 144)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain 'A' and resid 145 through 236)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain 'A' and resid 237 through 379)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain 'A' and resid 380 through 471)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain 'A' and resid 472 through 542)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain 'A' and resid 543 through 630)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain 'A' and resid 631 through 722)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain 'A' and resid 723 through 878)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain 'A' and resid 879 through 904)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain 'A' and resid 905 through 1045)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain 'A' and resid 1046 through 1180)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain 'A' and resid 1213 through 1308)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain 'A' and resid 1323 through 1420)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain 'A' and resid 1421 through 1526)
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17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain 'A' and resid 1856 through 1975)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain 'A' and resid 1976 through 2310)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain 'A' and resid 2311 through 2514)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain 'A' and resid 2515 through 2576)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain 'A' and resid 2602 through 2665)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain 'A' and resid 2774 through 2802)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain 'A' and resid 2803 through 2943)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain 'A' and resid 2944 through 3006)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(chain 'A' and resid 3008 through 3095)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(chain 'A' and resid 3096 through 3199)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(chain 'A' and resid 3227 through 3314)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(chain 'A' and resid 3315 through 3405)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(chain 'A' and resid 3406 through 3576)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(chain 'A' and resid 3577 through 3680)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(chain 'A' and resid 3681 through 3755)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(chain 'A' and resid 3756 through 3808)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(chain 'A' and resid 3809 through 3894)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(chain 'A' and resid 3895 through 3972)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(chain 'A' and resid 3973 through 4128)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(chain 'B' and resid 10 through 144)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(chain 'B' and resid 145 through 236)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(chain 'B' and resid 237 through 379)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	(chain 'B' and resid 380 through 471)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	(chain 'B' and resid 472 through 542)
41	X-RAY DIFFRACTION	41	(chain 'B' and resid 543 through 630)
42	X-RAY DIFFRACTION	42	(chain 'B' and resid 631 through 722)
43	X-RAY DIFFRACTION	43	(chain 'B' and resid 723 through 878)
44	X-RAY DIFFRACTION	44	(chain 'B' and resid 879 through 904)
45	X-RAY DIFFRACTION	45	(chain 'B' and resid 905 through 1045)
46	X-RAY DIFFRACTION	46	(chain 'B' and resid 1046 through 1180)
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49	X-RAY DIFFRACTION	49	(chain 'B' and resid 1421 through 1526)
50	X-RAY DIFFRACTION	50	(chain 'B' and resid 1548 through 1763)
51	X-RAY DIFFRACTION	51	(chain 'B' and resid 1787 through 1822)
52	X-RAY DIFFRACTION	52	(chain 'B' and resid 1856 through 1975)
53	X-RAY DIFFRACTION	53	(chain 'B' and resid 1976 through 2310)
54	X-RAY DIFFRACTION	54	(chain 'B' and resid 2311 through 2514)
55	X-RAY DIFFRACTION	55	(chain 'B' and resid 2515 through 2576)
56	X-RAY DIFFRACTION	56	(chain 'B' and resid 2602 through 2665)
57	X-RAY DIFFRACTION	57	(chain 'B' and resid 2774 through 2802)
58	X-RAY DIFFRACTION	58	(chain 'B' and resid 2803 through 2943)
59	X-RAY DIFFRACTION	59	(chain 'B' and resid 2944 through 3006)
60	X-RAY DIFFRACTION	60	(chain 'B' and resid 3008 through 3095)
61	X-RAY DIFFRACTION	61	(chain 'B' and resid 3096 through 3199)
62	X-RAY DIFFRACTION	62	(chain 'B' and resid 3227 through 3314)
63	X-RAY DIFFRACTION	63	(chain 'B' and resid 3315 through 3405)
64	X-RAY DIFFRACTION	64	(chain 'B' and resid 3406 through 3576)
65	X-RAY DIFFRACTION	65	(chain 'B' and resid 3577 through 3680)
66	X-RAY DIFFRACTION	66	(chain 'B' and resid 3681 through 3755)
67	X-RAY DIFFRACTION	67	(chain 'B' and resid 3756 through 3808)
68	X-RAY DIFFRACTION	68	(chain 'B' and resid 3809 through 3894)
69	X-RAY DIFFRACTION	69	(chain 'B' and resid 3895 through 3972)
70	X-RAY DIFFRACTION	70	(chain 'B' and resid 3973 through 4128)
71	X-RAY DIFFRACTION	71	(chain 'K' and resid 101 through 133)
72	X-RAY DIFFRACTION	72	(chain 'K' and resid 201 through 221)
73	X-RAY DIFFRACTION	73	(chain 'S' and resid 101 through 133)
74	X-RAY DIFFRACTION	74	(chain 'S' and resid 201 through 221)

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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