登録情報 データベース : PDB / ID : 5h41 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of 1,2-beta-oligoglucan phosphorylase from Lachnoclostridium phytofermentans in complex with sophorose, isofagomine, sulfate ion 要素Uncharacterized protein 詳細 キーワード TRANSFERASE (転移酵素) / beta-1 / 2-glucan / glycoside phosphorylase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
transferase activity / carbohydrate metabolic process 類似検索 - 分子機能 : / : / Glycoside phosphorylase supersandwich domain / Glycoside phosphorylase C-terminal domain / Glycosyl hydrolase 36, catalytic domain / Glycosyl hydrolase 36 superfamily, catalytic domain / Six-hairpin glycosidase-like superfamily / Six-hairpin glycosidase superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性 5-HYDROXYMETHYL-3,4-DIHYDROXYPIPERIDINE / Uncharacterized protein 類似検索 - 構成要素生物種 Clostridium phytofermentans ISDg (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2 Å 詳細データ登録者 Nakajima, M. / Tanaka, N. / Furukawa, N. / Nihira, T. / Kodutsumi, Y. / Takahashi, Y. / Sugimoto, N. / Miyanaga, A. / Fushinobu, S. / Taguchi, H. / Nakai, H. 引用ジャーナル : Sci Rep / 年 : 2017タイトル : Mechanistic insight into the substrate specificity of 1,2-beta-oligoglucan phosphorylase from Lachnoclostridium phytofermentans著者 : Nakajima, M. / Tanaka, N. / Furukawa, N. / Nihira, T. / Kodutsumi, Y. / Takahashi, Y. / Sugimoto, N. / Miyanaga, A. / Fushinobu, S. / Taguchi, H. / Nakai, H. 履歴 登録 2016年10月28日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2017年3月1日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2020年2月26日 Group : Data collection / カテゴリ : chem_comp / diffrn_sourceItem : _chem_comp.type / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site改定 2.0 2020年7月29日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年11月8日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
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