PDB-5b4w: Crystal structure of Plexin inhibitor complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5b4w

タイトル

Crystal structure of Plexin inhibitor complex

要素

Plexin-B1
Synthesized cyclic peptide

キーワード

SIGNALING PROTEIN /

Plexin / Inhibitor

機能・相同性

機能・相同性情報

semaphorin receptor binding / semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance / negative regulation of osteoblast proliferation /

inhibitory synapse assembly / semaphorin receptor complex / semaphorin receptor activity / negative regulation of cell adhesion / RHOD GTPase cycle / Sema4D induced cell migration and growth-cone collapse / GTPase activating protein binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)
unidentified (未定義)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.6 Å

データ登録者

Matsunaga, Y. / Kitago, Y. / Arimori, T. / Takagi, J.

資金援助

日本, 1件

引用

ジャーナル: Cell Chem Biol / 年: 2016
タイトル: Allosteric Inhibition of a Semaphorin 4D Receptor Plexin B1 by a High-Affinity Macrocyclic Peptide
著者: Matsunaga, Y. / Bashiruddin, N.K. / Kitago, Y. / Takagi, J. / Suga, H.

履歴

登録	2016年4月19日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2016年12月28日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2020年2月26日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp / diffrn_source Item: _chem_comp.type / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site
改定 1.2	2020年7月29日	Group: Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _entity.pdbx_description ..._chem_comp.name / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_role 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.3	2023年11月8日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.4	2023年11月15日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5b4w.cif.gz	1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5b4w.ent.gz	884.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5b4w.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b4/5b4w ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b4/5b4w	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3ol2S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1ukc-2 3gw9-4 4g7g-2 4y0m-2 5dvr-d 2z3j-d 3vvr-d 2wx2-1 3t3s-3 5e0e-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#134 - 2011年2月インテグリン (Integrin) 類似性 (2) #126 - 2010年6月上皮成長因子 (Epidermal Growth Factor) 類似性 (1) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (1) #122 - 2010年2月エンハンセオソーム (Enhanceosome) 類似性 (2) #148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (2)

登録構造単位

A: Plexin-B1

B: Plexin-B1

C: Plexin-B1

D: Plexin-B1

E: Plexin-B1

F: Plexin-B1

G: Synthesized cyclic peptide

H: Synthesized cyclic peptide

I: Synthesized cyclic peptide

J: Synthesized cyclic peptide

K: Synthesized cyclic peptide

L: Synthesized cyclic peptide

ヘテロ分子

385 kDa, 12 ポリマー
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1

A: Plexin-B1

G: Synthesized cyclic peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
64.2 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Plexin-B1

H: Synthesized cyclic peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
64.4 kDa, 2 ポリマー
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3

C: Plexin-B1

I: Synthesized cyclic peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
64.2 kDa, 2 ポリマー
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4

D: Plexin-B1

J: Synthesized cyclic peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
64.2 kDa, 2 ポリマー
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5

E: Plexin-B1

K: Synthesized cyclic peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
64.2 kDa, 2 ポリマー
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6

F: Plexin-B1

L: Synthesized cyclic peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
64.2 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	92.426, 217.924, 106.475
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 115.30, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質

Plexin-B1 / Semaphorin receptor SEP

分子量: 61933.488 Da / 分子数: 6 / 断片: UNP residues 20-535 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PLXNB1, KIAA0407, PLXN5, SEP / プラスミド: pcDNA3.1 / 細胞株 (発現宿主): HEK293S GnT1- / 発現宿主:

Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O43157

#2: タンパク質・ペプチド

Synthesized cyclic peptide

分子量: 2019.380 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) unidentified (未定義)

#3: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン /

N-アセチルグルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#4: 水

ChemComp-HOH / water /

水

分子量: 18.015 Da / 分子数: 48 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

配列の詳細

These residues are signal peptide

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.53 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.32 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.2 / 詳細: 0.1M tri-sodium citrate, 13% PEG 8000

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SPring-8 / ビームライン: BL32XU / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: RAYONIX MX225HE / 検出器: CCD / 日付: 2014年7月3日 / 詳細: KB mirror
放射	モノクロメーター: Mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.6→50 Å / Num. obs: 116573 / % possible obs: 97.2 % / 冗長度: 3 % / B_iso Wilson estimate: 58.7 Å² / CC_1/2: 0.57 / R_merge(I) obs: 0.15 / Net I/σ(I): 10
反射シェル	解像度: 2.6→2.64 Å / 冗長度: 2.3 % / R_merge(I) obs: 0.737 / Mean I/σ(I) obs: 1.21 / % possible all: 88.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(dev_2341: ???)	精密化
DENZO		データ収集
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER	2.5.5	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3OL2

3ol2

解像度: 2.6→40.805 Å / SU ML: 0.4 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 29.67 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2653	5686	5.02 %	Random selection
R_work	0.2245	-	-	-
obs	0.2266	113157	97.11 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.6→40.805 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	21089	0	98	48	21235

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	21750
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.014	29741
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.293	12984
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.055	3327
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	3933

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.6-2.6296	0.3561	162	0.3211	3157	X-RAY DIFFRACTION	86
2.6296-2.6605	0.3566	186	0.3104	3311	X-RAY DIFFRACTION	90
2.6605-2.6929	0.341	172	0.3078	3373	X-RAY DIFFRACTION	92
2.6929-2.727	0.3477	173	0.2973	3433	X-RAY DIFFRACTION	92
2.727-2.7629	0.3703	183	0.2951	3448	X-RAY DIFFRACTION	94
2.7629-2.8007	0.3275	188	0.2964	3474	X-RAY DIFFRACTION	94
2.8007-2.8407	0.3091	184	0.2952	3474	X-RAY DIFFRACTION	95
2.8407-2.8831	0.3212	165	0.2814	3582	X-RAY DIFFRACTION	96
2.8831-2.9282	0.2972	183	0.281	3499	X-RAY DIFFRACTION	96
2.9282-2.9762	0.3697	195	0.2742	3603	X-RAY DIFFRACTION	97
2.9762-3.0275	0.3047	190	0.2717	3553	X-RAY DIFFRACTION	97
3.0275-3.0825	0.3588	184	0.2738	3639	X-RAY DIFFRACTION	98
3.0825-3.1418	0.3184	171	0.2721	3641	X-RAY DIFFRACTION	98
3.1418-3.2059	0.3273	192	0.2634	3614	X-RAY DIFFRACTION	98
3.2059-3.2755	0.3184	198	0.2476	3631	X-RAY DIFFRACTION	99
3.2755-3.3517	0.2782	202	0.2467	3640	X-RAY DIFFRACTION	99
3.3517-3.4355	0.2844	195	0.237	3670	X-RAY DIFFRACTION	99
3.4355-3.5283	0.2602	193	0.2254	3630	X-RAY DIFFRACTION	99
3.5283-3.6321	0.2817	188	0.2217	3646	X-RAY DIFFRACTION	99
3.6321-3.7492	0.2682	193	0.2101	3649	X-RAY DIFFRACTION	99
3.7492-3.8831	0.2355	183	0.2103	3667	X-RAY DIFFRACTION	99
3.8831-4.0385	0.2385	211	0.211	3657	X-RAY DIFFRACTION	99
4.0385-4.2221	0.2408	201	0.1933	3671	X-RAY DIFFRACTION	99
4.2221-4.4444	0.2282	194	0.1746	3683	X-RAY DIFFRACTION	99
4.4444-4.7225	0.1912	205	0.1695	3624	X-RAY DIFFRACTION	99
4.7225-5.0865	0.1974	202	0.1754	3710	X-RAY DIFFRACTION	100
5.0865-5.5972	0.2547	198	0.1944	3667	X-RAY DIFFRACTION	100
5.5972-6.4045	0.2462	209	0.2178	3678	X-RAY DIFFRACTION	100
6.4045-8.0588	0.2684	197	0.2119	3712	X-RAY DIFFRACTION	100
8.0588-40.81	0.2459	189	0.2221	3735	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.7627	-0.2608	0.1621	0.406	0.1801	1.7797	-0.0104	-0.2233	-0.0201	0.1575	0.0359	-0.0153	0.0973	-0.0836	-0.092	0.3152	0.0754	-0.0381	0.4514	-0.0143	0.3338	108.6351	-37.721	81.4437
2	0.7567	-0.0169	0.4385	0.7246	-0.1105	1.8175	0.0296	0.0121	-0.084	0.0148	-0.0038	0.0165	0.0952	-0.1075	-0.0956	0.2171	0.0643	-0.0437	0.3541	-0.032	0.3673	95.2681	-35.12	34.9478
3	1.5141	0.0015	-0.2813	0.7812	0.1508	1.886	0.1271	0.159	0.0337	-0.0235	-0.1071	-0.0104	-0.2518	-0.0639	-0.0867	0.4383	-0.0124	0.1169	0.2378	0.0115	0.3166	79.4865	4.0981	28.2936
4	1.0471	-0.2217	-0.6384	0.8471	0.256	1.9379	0.0256	-0.0829	-0.1103	0.1626	-0.0646	0.1284	-0.3114	-0.6365	-0.0637	0.5813	0.0859	0.1819	0.6165	0.0125	0.3807	51.7432	5.3371	67.7011
5	0.8285	0.1154	0.6669	0.7652	0.0043	1.6471	0.1043	-0.0279	-0.0367	0.2315	0.0954	-0.0938	0.3606	0.3058	-0.0854	0.4433	0.1171	-0.0835	0.3952	-0.1125	0.4123	142.5361	-61.4032	47.905
6	0.7733	0.2619	0.0889	1.4213	-0.6526	1.0898	0.1903	0.0612	0.4633	0.0578	-0.2406	-0.0196	-0.4751	0.4355	-0.0998	0.4531	-0.1706	0.0784	0.639	-0.0678	0.6601	148.3117	-30.5051	26.1891
7	0.6161	-0.3664	0.2585	0.825	0.3369	1.9245	0.221	0.2689	-0.212	-0.2185	-0.0879	0.1903	0.4398	0.0911	-0.0226	0.6571	0.1184	-0.1831	0.3511	-0.1459	0.4778	121.5588	-70.14	4.9775
8	1.3237	-0.4964	0.1672	1.1361	0.9086	1.0392	-0.1074	0.1548	-0.1407	-0.2663	0.0865	0.3296	-0.0563	-0.0136	-0.101	0.3187	0.1219	-0.0411	0.6599	0.0191	0.4289	87.8347	-36.6565	64.6973
9	0.4924	-0.4954	0.3457	0.9752	0.0005	0.4923	0.0738	0.071	0.1662	0.2912	0.124	-0.2922	-0.1004	0.3673	-0.114	0.362	0.098	-0.0359	0.5228	-0.0815	0.4205	113.6183	-27.5501	52.8947
10	1.1202	-0.0764	0.1024	1.3299	-0.1675	1.2407	-0.1019	-0.2452	-0.1833	0.4605	0.133	-0.0135	-0.2319	-0.0507	-0.0901	0.4587	-0.0292	0.1003	0.3182	-0.0244	0.3826	79.7378	5.9015	55.0235
11	1.4241	-0.2423	0.312	1.3723	0.2321	1.3471	0.0537	0.354	-0.0298	-0.3118	0.1482	-0.0078	-0.3534	-0.529	-0.0906	0.6547	0.1725	0.1553	0.7632	0.0146	0.3869	53.7268	11.695	41.969
12	1.5161	-0.1126	0.0873	0.9316	-0.3275	1.0841	0.105	0.434	0.0863	-0.0705	-0.0617	0.0416	-0.0545	0.0838	-0.073	0.3704	-0.0175	-0.0076	0.3977	-0.089	0.3157	135.8777	-50.9732	24.1341
13	1.2419	-0.4734	-0.6603	0.6038	0.137	1.1751	0.0092	-0.0873	-0.3179	0.1139	0.2098	-0.0217	0.3647	0.3541	-0.1215	0.8028	0.2266	-0.1796	0.3647	-0.2055	0.5794	136.1798	-80.7534	24.7975
14	8.7751	-2.1797	4.9274	5.3453	-0.4487	3.4925	-0.4558	0.256	1.5819	0.5713	0.1436	-1.1348	0.0786	0.0576	0.337	0.8315	-0.0497	-0.1132	0.6715	0.1205	0.6119	106.027	-53.1092	64.3387
15	0.6388	-0.5474	0.3103	1.1703	-0.8103	1.4267	0.1368	0.1811	-0.0266	-0.0659	0.0003	-0.0105	0.0557	-0.0095	-0.0957	0.488	0.0209	-0.2088	0.6843	0.0075	0.6999	101.7429	-31.8429	29.7109
16	4.8646	3.2194	4.4155	2.5774	2.8091	4.0364	-0.2992	-0.2431	0.2557	-0.5661	0.0379	0.0408	-0.8412	-0.6587	0.3345	0.6927	0.068	0.0483	0.5515	0.0664	0.6306	70.0995	-12.1865	41.8394
17	8.799	6.2969	4.3054	2	2	2	0.6032	0.6558	0.8783	0.4487	-1.8965	-1.1543	0.4202	1.415	1.3158	0.714	0.0103	0.3201	1.0303	-0.1464	0.9868	55.8137	-10.8802	51.5652
18	4.512	3.0545	-3.4888	3.4351	-1.5936	2	-0.4384	-0.4913	-0.5759	-1.0161	-0.311	-0.5846	1.5589	0.4204	0.7317	0.7169	0.1439	-0.122	0.5022	0.0502	0.6232	120.7557	-61.5029	40.6748
19	5.9343	-3.8371	5.2194	4.2995	-0.5169	9.0819	0.0024	0.3032	0.4092	0.0155	-0.1497	-0.4549	0.2319	-0.0667	0.1703	0.848	-0.1017	-0.3375	0.4496	-0.0464	0.6902	114.2575	-69.8987	27.1401

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 26:481 )	A	26 - 481
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN B AND RESID 26:481 )	B	26 - 481
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN C AND RESID 26:481 )	C	26 - 481
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN D AND RESID 24:481 )	D	24 - 481
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN E AND RESID 26:482 )	E	26 - 482
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN E AND RESID 483:528 )	E	483 - 528
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN F AND RESID 26:481 )	F	26 - 481
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN G AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	G	0 - 16
9	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN G AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	G	17
10	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN H AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	H	0 - 16
11	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN H AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	H	17
12	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN I AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	I	0 - 16
13	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN I AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	I	17
14	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN J AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	J	0 - 16
15	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN J AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	J	17
16	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN K AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	K	0 - 16
17	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN K AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	K	17
18	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN L AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	L	0 - 16
19	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN L AND ( RESID 0:16 OR RESID 17:17 ) )	L	17
20	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN A AND RESID 601:601 )	A	601
21	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN B AND RESID 601:602 )	B	601 - 602
22	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN C AND RESID 601:601 )	C	601
23	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN D AND RESID 601:601 )	D	601
24	X-RAY DIFFRACTION	18	( CHAIN E AND RESID 601:601 )	E	601
25	X-RAY DIFFRACTION	19	( CHAIN F AND RESID 601:601 )	F	601

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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