登録情報 データベース : PDB / ID : 4zcf 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structural basis of asymmetric DNA methylation and ATP-triggered long-range diffusion by EcoP15I 要素(Restriction endonuclease EcoP15I, ...) x 2 DNA 20-mer AATCATAGTCTACTGCTGTA DNA 20-mer ATACAGCAGTAGACTATGAT 詳細キーワード Hydrolase-DNA complex / Hydrolase/DNA / ATP motor / DNA methyltransferase (DNAメチルトランスフェラーゼ) / Asymmetric DNA methylation機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
N-methyltransferase activity / Damメチラーゼ / site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific) activity / endonuclease activity / DNA binding / ATP binding 類似検索 - 分子機能 Type III R-M EcoP15I, C-terminal / Type III R-M EcoP15I C-terminal domain / Endonuclease domain / N4/N6-methyltransferase, Type III restriction-modification enzyme EcoPI Mod subunit-like / DNA methylase N-4/N-6 / DNA methylase / N-6 Adenine-specific DNA methylases signature. / DNA methylase, N-6 adenine-specific, conserved site / Helicase/UvrB, N-terminal / Type III restriction enzyme, res subunit ... Type III R-M EcoP15I, C-terminal / Type III R-M EcoP15I C-terminal domain / Endonuclease domain / N4/N6-methyltransferase, Type III restriction-modification enzyme EcoPI Mod subunit-like / DNA methylase N-4/N-6 / DNA methylase / N-6 Adenine-specific DNA methylases signature. / DNA methylase, N-6 adenine-specific, conserved site / Helicase/UvrB, N-terminal / Type III restriction enzyme, res subunit / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase 類似検索 - ドメイン・相同性 アデニル酸 / : / デオキシリボ核酸 / DNA (> 10) / DNAメチルトランスフェラーゼ / Restriction endonuclease EcoP15I, restriction subunit 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 多重同系置換 / 解像度 : 2.6 Å 詳細データ登録者 Gupta, Y.K. / Chan, S.H. / Xu, S.Y. / Aggarwal, A.K. 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) R01 GM111507 米国
引用ジャーナル : Nat Commun / 年 : 2015タイトル : Structural basis of asymmetric DNA methylation and ATP-triggered long-range diffusion by EcoP15I.著者 : Gupta, Y.K. / Chan, S.H. / Xu, S.Y. / Aggarwal, A.K. 履歴 登録 2015年4月15日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2015年7月29日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年9月20日 Group : Author supporting evidence / Derived calculations / Source and taxonomyカテゴリ : entity_src_gen / pdbx_audit_support ... entity_src_gen / pdbx_audit_support / pdbx_entity_src_syn / pdbx_struct_oper_list Item : _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_audit_support.funding_organization ... _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation 改定 1.2 2019年12月25日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 2.0 2021年1月20日 Group : Derived calculations / Polymer sequenceカテゴリ : entity_poly / pdbx_struct_conn_angle / struct_connItem : _entity_poly.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id ... _entity_poly.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 改定 2.1 2024年3月6日 Group : Data collection / Database references / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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