- PDB-4xo7: Crystal structure of human 3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase t... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4xo7
タイトル
Crystal structure of human 3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase type 3 in complex with NADP+, 5alpha-androstan-3,17-dione and (3beta, 5alpha)-3-hydroxyandrostan-17-one
モノクロメーター: DIAMOND (111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97931 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.75→25 Å / Num. obs: 66677 / % possible obs: 99.3 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.6 % / Net I/σ(I): 9.4
反射 シェル
解像度: 1.75→1.84 Å / 冗長度: 3.4 % / Rmerge(I) obs: 0.26 / Mean I/σ(I) obs: 4.2 / % possible all: 97
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
MOSFLM
データ削減
SCALA
データスケーリング
PHASES
位相決定
REFMAC
5.6.0117
精密化
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.75→25 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.955 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.934 / SU B: 2.019 / SU ML: 0.066 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / ESU R: 0.108 / ESU R Free: 0.109 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.205
3382
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.162
-
-
-
obs
0.164
63276
99.2 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK