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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2n5h | ||||||
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タイトル | PltL-holo | ||||||
要素 | Peptidyl carrier protein PltL | ||||||
キーワード | TRANSPORT PROTEIN (運搬体タンパク質) / peptidyl carrier protein / pyoluteorin / PltL / pyrrole (ピロール) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Pseudomonas protegens (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
データ登録者 | Jaremko, M.J. / Lee, D.J. / Burkart, M.D. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2015 タイトル: Structure and Substrate Sequestration in the Pyoluteorin Type II Peptidyl Carrier Protein PltL. 著者: Jaremko, M.J. / Lee, D.J. / Opella, S.J. / Burkart, M.D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2n5h.cif.gz | 577.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2n5h.ent.gz | 487.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2n5h.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/n5/2n5h ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/n5/2n5h | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10312.802 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Pseudomonas protegens (バクテリア) 株: Pf-5 / ATCC BAA-477 / 遺伝子: pltL, PFL_2786 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q4KCZ1 |
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#2: 化合物 | ChemComp-PNS / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 50 mM potassium phosphate, 5 mM TCEP, 0.1 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | pH: 7.4 / 圧: ambient / 温度: 298.15 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |