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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kuf | ||||||
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タイトル | NMR structure of the PASTA domain 3 and 4 of Mycobacterium tuberculosis of PknB | ||||||
要素 | Serine/threonine-protein kinase pknB | ||||||
キーワード | TRANSFERASE (転移酵素) / kinase (キナーゼ) / external domain (領域 (解析学)) / signaling / STPK / resuscitation (蘇生) / Serine/threonine-protein kinase | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of growth rate / acetyltransferase activator activity / negative regulation of catalytic activity / negative regulation of fatty acid biosynthetic process / response to host immune response / positive regulation of catalytic activity / positive regulation of DNA binding / peptidoglycan biosynthetic process / protein serine/threonine/tyrosine kinase activity / peptidoglycan-based cell wall ...negative regulation of growth rate / acetyltransferase activator activity / negative regulation of catalytic activity / negative regulation of fatty acid biosynthetic process / response to host immune response / positive regulation of catalytic activity / positive regulation of DNA binding / peptidoglycan biosynthetic process / protein serine/threonine/tyrosine kinase activity / peptidoglycan-based cell wall / negative regulation of protein binding / manganese ion binding / regulation of cell shape / protein autophosphorylation / membrane => GO:0016020 / non-specific serine/threonine protein kinase / protein kinase activity / protein phosphorylation / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / ATP binding / identical protein binding / metal ion binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mycobacterium tuberculosis (結核菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / restrained molecular dynamics in a hydrated environment | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
データ登録者 | Barthe, P. / Mukamolova, G. / Roumestand, C. / Cohen-Gonsaud, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2010 タイトル: The structure of PknB extracellular PASTA domain from mycobacterium tuberculosis suggests a ligand-dependent kinase activation 著者: Barthe, P. / Mukamolova, G.V. / Roumestand, C. / Cohen-Gonsaud, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2kuf.cif.gz | 1.3 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2kuf.ent.gz | 1.1 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2kuf.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ku/2kuf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ku/2kuf | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14648.311 Da / 分子数: 1 / 断片: PASTA domains 3 and 4, RESIDUES 491-626 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis (結核菌) 株: H37Rv / 遺伝子: Rv0014c / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: P0A5S4, UniProt: P9WI81*PLUS, non-specific serine/threonine protein kinase |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 4.6 / 圧: ambient / 温度: 283 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software | 名称: CNS / バージョン: 1.2 / 分類: 精密化 |
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精密化 | 手法: restrained molecular dynamics in a hydrated environment ソフトェア番号: 1 / 詳細: like RECOORD database |
代表構造 | 選択基準: lowest energy |
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 30 / 登録したコンフォーマーの数: 30 / 代表コンフォーマー: 1 |