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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1scu | ||||||
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURE OF SUCCINYL-COA SYNTHETASE FROM ESCHERICHIA COLI AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 |
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キーワード | LIGASE (ATP-BINDING) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 succinate-CoA ligase complex / succinate-CoA ligase complex (ADP-forming) / succinate-CoA ligase (GDP-forming) activity / succinyl-CoA metabolic process / succinate-CoA ligase (ADP-forming) / succinate-CoA ligase (ADP-forming) activity / クエン酸回路 / nucleotide binding / magnesium ion binding / ATP binding ...succinate-CoA ligase complex / succinate-CoA ligase complex (ADP-forming) / succinate-CoA ligase (GDP-forming) activity / succinyl-CoA metabolic process / succinate-CoA ligase (ADP-forming) / succinate-CoA ligase (ADP-forming) activity / クエン酸回路 / nucleotide binding / magnesium ion binding / ATP binding / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Wolodko, W.T. / Fraser, M.E. / James, M.N.G. / Bridger, W.A. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1994 タイトル: The crystal structure of succinyl-CoA synthetase from Escherichia coli at 2.5-A resolution. 著者: Wolodko, W.T. / Fraser, M.E. / James, M.N. / Bridger, W.A. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1984 タイトル: Crystallization of Succinyl-Coa Synthetase from Escherichia Coli 著者: Wolodko, W.T. / James, M.N.G. / Bridger, W.A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1scu.cif.gz | 257.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1scu.ent.gz | 213.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1scu.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/1scu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/1scu | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 121 / 2: CIS PROLINE - PRO B 42 / 3: CIS PROLINE - PRO B 200 / 4: CIS PROLINE - PRO D 121 / 5: CIS PROLINE - PRO E 42 / 6: CIS PROLINE - PRO E 200 7: RESIDUE 246 OF EACH ALPHA SUBUNIT IS A PHOSPHORYLATED HISTIDINE. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 29758.213 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: P07459, UniProt: P0AGE9*PLUS, succinate-CoA ligase (ADP-forming) #2: タンパク質 | 分子量: 41438.496 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A836, succinate-CoA ligase (ADP-forming) #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | AMINO-TERMINAL ANALYSIS OF THE ALPHA SUBUNIT INDICATES THAT THE FIRST RESIDUE IS A SERINE (W. A. ...AMINO-TERMINAL ANALYSIS OF THE ALPHA SUBUNIT INDICATES THAT THE FIRST RESIDUE IS A SERINE (W. A. BRIDGE, ENZYMES, 3RD ED. 10, 581-606 (1974)). IN THE GENE SEQUENCING | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.41 Å3/Da / 溶媒含有率: 63.93 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 21 ℃ / pH: 7.3 / 手法: microdialysis / 詳細: Wolodko, W.T., (1984) J. Biol. Chem., 259, 5316. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→100 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→100 Å
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拘束条件 |
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