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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fe3 | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN BRAIN FATTY ACID BINDING PROTEIN OLEIC ACID | ||||||
要素 | FATTY ACID-BINDING PROTEIN, BRAIN | ||||||
キーワード | LIPID BINDING PROTEIN / OA / BLBP / LIPID-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 NOTCH3 Intracellular Domain Regulates Transcription / Triglyceride catabolism / fatty acid transport / epithelial cell proliferation / fatty acid binding / nervous system development / negative regulation of cell population proliferation / lipid binding / 細胞核 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.8 Å | ||||||
データ登録者 | Balendiran, G.K. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2000 タイトル: Crystal structure and thermodynamic analysis of human brain fatty acid-binding protein. 著者: Balendiran, G.K. / Schnutgen, F. / Scapin, G. / Borchers, T. / Xhong, N. / Lim, K. / Godbout, R. / Spener, F. / Sacchettini, J.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1fe3.cif.gz | 37.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1fe3.ent.gz | 25.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1fe3.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fe/1fe3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fe/1fe3 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14776.702 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O15540 |
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#2: 化合物 | ChemComp-OLA / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 4 Å3/Da / 溶媒含有率: 69.22 % | |||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP | |||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 8.5 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 由来: 回転陽極 |
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検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→20 Å / Num. all: 11489 / Num. obs: 11489 / % possible obs: 82.5 % / Rsym value: 0.072 |
反射 | *PLUS 最低解像度: 15 Å / Num. obs: 5444 / Num. measured all: 11489 / Rmerge(I) obs: 0.072 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.8→15 Å
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→15 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.8 Å / 最低解像度: 20 Å / Rfactor obs: 0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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