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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cwn | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF PORCINE ALDEHYDE REDUCTASE HOLOENZYME | ||||||
要素 | ALDEHYDE REDUCTASEアルドースレダクターゼ | ||||||
キーワード | OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / TIM-BARREL (TIMバレル) / NADP (ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 グルクロン酸レダクターゼ / グルクロノラクトンレダクターゼ / glucuronolactone reductase activity / methylglyoxal reductase (NADPH) (acetol producing) activity / D-glucuronate catabolic process / alcohol dehydrogenase (NADP+) / aldehyde catabolic process / cellular detoxification of aldehyde / L-glucuronate reductase activity / glycerol dehydrogenase [NADP+] activity ...グルクロン酸レダクターゼ / グルクロノラクトンレダクターゼ / glucuronolactone reductase activity / methylglyoxal reductase (NADPH) (acetol producing) activity / D-glucuronate catabolic process / alcohol dehydrogenase (NADP+) / aldehyde catabolic process / cellular detoxification of aldehyde / L-glucuronate reductase activity / glycerol dehydrogenase [NADP+] activity / D/L-glyceraldehyde reductase / L-ascorbic acid biosynthetic process / アリルアルコールデヒドロゲナーゼ / allyl-alcohol dehydrogenase activity / aldose reductase (NADPH) activity / lipid metabolic process / apical plasma membrane / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Sus scrofa (ブタ) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 2 Å | ||||||
データ登録者 | El-Kabbani, O. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Pept.Lett. / 年: 1996 タイトル: Crystal structure of porcine aldehyde reductase at 2.0 angstrom resolution: Modeling an inhibitor in the active site of the enzyme. 著者: ElKabbani, O. / Carper, D.A. / McGowan, M.H. / Ginell, S.L. #1: ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1995 タイトル: Structure of Porcine Aldehyde Reductase Holoenzyme 著者: El-Kabbani, O. / Judge, K. / Ginell, S.L. / Myles, D.A. / Delucas, L.J. / Flynn, T.G. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1cwn.cif.gz | 25.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1cwn.ent.gz | 12.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1cwn.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cw/1cwn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cw/1cwn | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36452.691 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 器官: KIDNEY腎臓 / 組織: MEDULLA, CORTEX / 参照: UniProt: P50578, alcohol dehydrogenase (NADP+) |
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#2: 化合物 | ChemComp-NAP / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.18 Å3/Da / 溶媒含有率: 45 % |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 108 K |
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放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X8C / 波長: 1.00615 |
検出器 | 検出器: CCD / 日付: 1995年6月15日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.00615 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 21648 / % possible obs: 92 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 1.9 % / Rmerge(I) obs: 0.03 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→6 Å / σ(F): 4 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 16.2 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.22 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→6 Å
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拘束条件 |
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