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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bks | |||||||||
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タイトル | TRYPTOPHAN SYNTHASE (E.C.4.2.1.20) FROM SALMONELLA TYPHIMURIUM | |||||||||
要素 | (TRYPTOPHAN SYNTHASEトリプトファン合成酵素) x 2 | |||||||||
キーワード | LYASE (リアーゼ) / MULTIENZYME COMPLEX / TIM BARREL (TIMバレル) / PYRIDOXAL PHOSPHATE (ピリドキサールリン酸) | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 トリプトファン合成酵素 / tryptophan synthase activity / tryptophan biosynthetic process / identical protein binding / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Salmonella typhimurium (サルモネラ菌) | |||||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.2 Å | |||||||||
データ登録者 | Hyde, C.C. | |||||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1996 タイトル: Exchange of K+ or Cs+ for Na+ induces local and long-range changes in the three-dimensional structure of the tryptophan synthase alpha2beta2 complex. 著者: Rhee, S. / Parris, K.D. / Ahmed, S.A. / Miles, E.W. / Davies, D.R. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1997 タイトル: Crystal Structures of a Mutant (Betak87T) Tryptophan Synthase Alpha2Beta2 Complex with Ligands Bound to the Active Sites of the Alpha-and Beta-Subunits Reveal Ligand-Induced Conformational Changes 著者: Rhee, S. / Parris, K.D. / Hyde, C.C. / Ahmed, S.A. / Miles, E.W. / Davies, D.R. #2: ジャーナル: Bio/Technology / 年: 1990 タイトル: The Tryptophan Synthase Multienzyme Complex: Exploring Structure-Function Relationships with X-Ray Crystallography and Mutagenesis 著者: Hyde, C.C. / Miles, E.W. #3: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1988 タイトル: Three-Dimensional Structure of the Tryptophan Synthase Alpha 2 Beta 2 Multienzyme Complex from Salmonella Typhimurium 著者: Hyde, C.C. / Ahmed, S.A. / Padlan, E.A. / Miles, E.W. / Davies, D.R. #4: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1985 タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Crystallographic Data of the Tryptophan Synthase Alpha 2 Beta 2 Complex from Salmonella Typhimurium 著者: Ahmed, S.A. / Miles, E.W. / Davies, D.R. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bks.cif.gz | 137 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bks.ent.gz | 109.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bks.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bk/1bks ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bk/1bks | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 28698.797 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: STRUCTURE OF WILD TYPE, HOLO-ENZYME 由来: (組換発現) Salmonella typhimurium (サルモネラ菌) 株: TB2211 / 遺伝子: TRPA/TRPB/TRPC / プラスミド: PSTH8 / 遺伝子 (発現宿主): TRPA/TRPB/TRPC / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): DEFICIENT IN TRP EDCBA / 参照: UniProt: P00929, トリプトファン合成酵素 |
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#2: タンパク質 | 分子量: 42988.996 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: STRUCTURE OF WILD TYPE, HOLO-ENZYME 由来: (組換発現) Salmonella typhimurium (サルモネラ菌) 株: TB2211 / 遺伝子: TRPA/TRPB/TRPC / プラスミド: PSTH8 / 遺伝子 (発現宿主): TRPA/TRPB/TRPC / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): DEFICIENT IN TRP EDCBA / 参照: UniProt: P0A2K1, トリプトファン合成酵素 |
#3: 化合物 | ChemComp-NA / |
#4: 化合物 | ChemComp-PLP / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.7 Å3/Da / 溶媒含有率: 54 % |
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結晶化 | pH: 7.8 / 詳細: pH 7.8 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 300 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1996年10月1日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: NI FILTER / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2.2 Å |
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 開始モデル: 1WSY 1wsy 最高解像度: 2.2 Å 詳細: THE AUTHORS OF THIS ENTRY HAVE NOT PROVIDED REFINEMENT DETAILS. | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.2 Å
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