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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aif | ||||||
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タイトル | ANTI-IDIOTYPIC FAB 409.5.3 (IGG2A) FAB FROM MOUSE | ||||||
要素 |
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キーワード | IMMUNOGLOBULIN (抗体) / C REGION (抗体) / V REGION (抗体) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.9 Å | ||||||
データ登録者 | Ban, N. / Escobar, C. / Hasel, K. / Day, J. / Greenwood, A. / McPherson, A. | ||||||
引用 | ジャーナル: FASEB J. / 年: 1995 タイトル: Structure of an anti-idiotypic Fab against feline peritonitis virus-neutralizing antibody and a comparison with the complexed Fab. 著者: Ban, N. / Escobar, C. / Hasel, K.W. / Day, J. / Greenwood, A. / McPherson, A. #1: ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1994 タイトル: Crystal Structure of an Idiotype-Anti-Idiotype Fab Complex 著者: Ban, N. / Escobar, C. / Garcia, R. / Hasel, K. / Day, J. / Greenwood, A. / McPherson, A. #2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1993 タイトル: Preliminary Crystallographic Study of a Complex between an Fab of a Monoclonal Feline Peritonitis Virus Neutralizing Antibody and its Anti-Idiotypic Fab 著者: Ban, N. / Escobar, C. / Day, J. / Greenwood, A. / McPherson, A. #3: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1991 タイトル: Characterization of Crystals of an Fab Fragment of a Murine Monoclonal Antibody 著者: Ban, N. / Escobar, C. / Day, J. / Greenwood, A. / Larson, S. / McPherson, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1aif.cif.gz | 168.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1aif.ent.gz | 140.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1aif.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ai/1aif ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ai/1aif | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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2 |
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単位格子 |
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-要素
#1: 抗体 | 分子量: 23560.805 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Mus musculus (ハツカネズミ) / 参照: UniProt: P01837 #2: 抗体 | 分子量: 23812.816 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Mus musculus (ハツカネズミ) / 参照: GenBank: 1042226 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.44 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.57 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 4 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Observed criterion σ(I): 3 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.9 Å / 最低解像度: 20 Å / Num. obs: 18603 / % possible obs: 94 % / Num. measured all: 74745 |
-解析
ソフトウェア | 名称: X-PLOR / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.9→20 Å / σ(F): 3 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→20 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Num. reflection obs: 16482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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