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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1acb | ||||||
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タイトル | CRYSTAL AND MOLECULAR STRUCTURE OF THE BOVINE ALPHA-CHYMOTRYPSIN-EGLIN C COMPLEX AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 |
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キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / SERINE PROTEASE (セリンプロテアーゼ) / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 キモトリプシン / serpin family protein binding / serine protease inhibitor complex / 消化 / serine-type endopeptidase inhibitor activity / response to wounding / serine-type endopeptidase activity / タンパク質分解 / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bos taurus (ウシ) Hirudo medicinalis (医用ビル) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2 Å | ||||||
データ登録者 | Bolognesi, M. / Frigerio, F. / Coda, A. / Pugliese, L. / Lionetti, C. / Menegatti, E. / Amiconi, G. / Schnebli, H.P. / Ascenzi, P. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1992 タイトル: Crystal and molecular structure of the bovine alpha-chymotrypsin-eglin c complex at 2.0 A resolution. 著者: Frigerio, F. / Coda, A. / Pugliese, L. / Lionetti, C. / Menegatti, E. / Amiconi, G. / Schnebli, H.P. / Ascenzi, P. / Bolognesi, M. #1: ジャーナル: J.Mol.Recog. / 年: 1990 タイトル: X-Ray Crystal Structure of the Bovine Alpha-Chymotrypsin(Slash)Eglin C Complex at 2.6 Angstroms Resolution 著者: Bolognesi, M. / Pugliese, L. / Gatti, G. / Frigerio, F. / Coda, A. / Antolini, L. / Schnebli, H.P. / Menegatti, E. / Amiconi, G. / Ascenzi, P. #2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1989 タイトル: Preliminary Crystallographic Data on the Complex of Bovine Alpha-Chymotrypsin with the Recombinant Proteinase Inhibitor Eglin C from Hirudo Medicinalis 著者: Pugliese, L. / Gatti, G. / Bolognesi, M. / Coda, A. / Menegatti, E. / Schnebli, H.P. / Ascenzi, P. / Amiconi, G. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE SHEETS PRESENTED AS *CH1* AND *CH2* ON SHEET RECORDS BELOW ARE ACTUALLY SIX-STRANDED BETA- ...SHEET THE SHEETS PRESENTED AS *CH1* AND *CH2* ON SHEET RECORDS BELOW ARE ACTUALLY SIX-STRANDED BETA-BARRELS. THIS IS REPRESENTED BY SEVEN-STRANDED SHEETS IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1acb.cif.gz | 69.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1acb.ent.gz | 55 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1acb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ac/1acb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ac/1acb | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES WITH POOR ELECTRON DENSITY: SER E 77, GLU E 78, ARG E 145, ALA E 149, ASN E 150, ARG E 154, GLN E 239, LYS I 8, HIS I 28, TYR I 49, ASN I 50. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25686.037 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00766, キモトリプシン | ||
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#2: タンパク質 | 分子量: 8100.011 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Hirudo medicinalis (医用ビル) / 参照: UniProt: P01051 | ||
#3: 水 | ChemComp-HOH / | ||
構成要素の詳細 | EGLIN C IS BOUND NON-COVALENTLY配列の詳細 | RESIDUES THR I 1, GLU I 2, PHE I 3, GLY I 4, SER I 5, GLU I 6, AND LEU I 7 OF EGLIN C HAVE BEEN ...RESIDUES THR I 1, GLU I 2, PHE I 3, GLY I 4, SER I 5, GLU I 6, AND LEU I 7 OF EGLIN C HAVE BEEN PROTEOLYTI | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.68 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.5 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: referred to J.Mol.Biol. 208.511-513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 11 Å / Num. obs: 16841 / Observed criterion σ(I): 5 / Num. measured all: 31318 / Rmerge(I) obs: 0.04 |
-解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2→11 Å / Rfactor obs: 0.167 / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→11 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 11 Å / Num. reflection all: 16833 / σ(F): 0 / Rfactor all: 0.167 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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