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- EMDB-9239: Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-9239
タイトルRabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state)
マップデータPostprocessed map
試料
  • 複合体: Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2
    • RNA: x 5種
    • タンパク質・ペプチド: x 77種
  • リガンド: x 2種
機能・相同性
機能・相同性情報


maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / cytosolic ribosome / large ribosomal subunit / 5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / 翻訳 (生物学) / ribonucleoprotein complex ...maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / cytosolic ribosome / large ribosomal subunit / 5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / 翻訳 (生物学) / ribonucleoprotein complex / 核小体 / RNA binding / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Interferon-related developmental regulator, C-terminal / Interferon-related developmental regulator, N-terminal / Interferon-related developmental regulator / Interferon-related protein conserved region / Interferon-related developmental regulator (IFRD) / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein S12e signature. / metallochaperone-like domain ...Interferon-related developmental regulator, C-terminal / Interferon-related developmental regulator, N-terminal / Interferon-related developmental regulator / Interferon-related protein conserved region / Interferon-related developmental regulator (IFRD) / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein S12e signature. / metallochaperone-like domain / TRASH domain / 40S Ribosomal protein S10 / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L1 signature. / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein L39e, conserved site / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein L6e signature. / Ribosomal protein L30e signature 1. / Ribosomal protein L30e signature 2. / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein L36e signature. / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal Protein L6, KOW domain / Ribosomal protein L6, conserved site-2 / Ribosomal protein L7, eukaryotic / Ribosomal protein L30, N-terminal / Ribosomal L30 N-terminal domain / Ribosomal protein S6e signature. / Ribosomal protein L30/YlxQ / Ribosomal protein L35Ae signature. / Ribosomal protein L39e / Ribosomal protein L39e domain superfamily / Ribosomal protein L6e / 60S ribosomal protein L6E / Ribosomal L39 protein / Ribosomal protein S28e signature. / 60S ribosomal protein L4, C-terminal domain / 60S ribosomal protein L4 C-terminal domain / Ribosomal protein L31e signature. / Ribosomal protein L14e domain / Ribosomal protein L14 / Ribosomal protein L5 eukaryotic/L18 archaeal / Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18 / Ribosomal protein L32e, conserved site / Ribosomal protein L32e signature. / Ribosomal protein L14 / Ribosomal protein L6 signature 2. / Ribosomal protein L14, KOW motif / Ribosomal protein L4/L1e, eukaryotic/archaeal, conserved site / Ribosomal protein L1e signature. / Ribosomal protein L15e signature. / Ribosomal protein L21e signature. / Ribosomal protein L4, eukaryotic and archaeal type / Ribosomal protein L22/L17, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L7, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L7/L30 / Ribosomal protein L37e signature. / Ribosomal protein L24e-related / Ribosomal protein L24e/L24 superfamily / Ribosomal protein L24e / Ribosomal protein L32e / Ribosomal protein L32e superfamily / Ribosomal protein L32 / Ribosomal_L32e / Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 / Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family / 50S ribosomal protein L30e-like / Ubiquitin domain signature. / Ribosomal protein L30, conserved site / Ribosomal protein L30 signature. / Armadillo-like helical / Ribosomal protein S14 signature. / Ribosomal protein L5 signature. / Ribosomal protein L29 signature. / Ribosomal protein S19 signature. / Ribosomal protein L6, alpha-beta domain / Ribosomal protein L6 / Ribosomal protein L6, alpha-beta domain superfamily / Ribosomal protein S7 signature. / Ribosomal protein L6 / Ribosomal protein L15 signature. / Ribosomal protein S17 signature. / Ribosomal protein S13 signature. / Ribosomal protein S13 family profile. / Ribosomal protein S8 signature. / Ribosomal protein S4 signature. / Ribosomal protein S15 signature. / S4 RNA-binding domain profile. / Ribosomal protein L14 signature. / Ubiquitin domain profile.
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 ...Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / 60S ribosomal protein L6 / Large ribosomal subunit protein uL1 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Small ribosomal subunit protein eS7 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein eL15 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS25 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Plectin/eS10 N-terminal domain-containing protein / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein eL36 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Ribosomal protein L32 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL27 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Ribosomal protein L32 / Large ribosomal subunit protein eL28 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Large ribosomal subunit protein eL14 / Large ribosomal subunit protein eL37
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / Rabbit (ウサギ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.4 Å
データ登録者Brown A / Baird MR / Yip MCJ / Murray J / Shao S
引用ジャーナル: Elife / 年: 2018
タイトル: Structures of translationally inactive mammalian ribosomes.
著者: Alan Brown / Matthew R Baird / Matthew Cj Yip / Jason Murray / Sichen Shao /
要旨: The cellular levels and activities of ribosomes directly regulate gene expression during numerous physiological processes. The mechanisms that globally repress translation are incompletely understood. ...The cellular levels and activities of ribosomes directly regulate gene expression during numerous physiological processes. The mechanisms that globally repress translation are incompletely understood. Here, we use electron cryomicroscopy to analyze inactive ribosomes isolated from mammalian reticulocytes, the penultimate stage of red blood cell differentiation. We identify two types of ribosomes that are translationally repressed by protein interactions. The first comprises ribosomes sequestered with elongation factor 2 (eEF2) by SERPINE mRNA binding protein 1 (SERBP1) occupying the ribosomal mRNA entrance channel. The second type are translationally repressed by a novel ribosome-binding protein, interferon-related developmental regulator 2 (IFRD2), which spans the P and E sites and inserts a C-terminal helix into the mRNA exit channel to preclude translation. IFRD2 binds ribosomes with a tRNA occupying a noncanonical binding site, the 'Z site', on the ribosome. These structures provide functional insights into how ribosomal interactions may suppress translation to regulate gene expression.
履歴
登録2018年10月19日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年11月21日-
マップ公開2018年11月21日-
更新2019年5月15日-
現状2019年5月15日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.1
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_9239.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_9239.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Postprocessed map
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.34 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.1 / ムービー #1: 0.1
最小 - 最大-0.62213045 - 1.0179954
平均 (標準偏差)0.001612937 (±0.030140102)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 536.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.341.341.34
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z536.000536.000536.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ240240240
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS400400400
D min/max/mean-0.6221.0180.002

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添付データ

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追加マップ: Pre-postprocessed map

ファイルemd_9239_additional.map
注釈Pre-postprocessed map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map 1

ファイルemd_9239_half_map_1.map
注釈Half map 1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map 2

ファイルemd_9239_half_map_2.map
注釈Half map 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2

全体名称: Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2
要素
  • 複合体: Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2
    • RNA: Z-site tRNA
    • RNA: 28S rRNA28S ribosomal RNA
    • RNA: 5S rRNA5SリボソームRNA
    • RNA: 5.8S rRNA5.8SリボソームRNA
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 60S Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L26
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L40
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L41
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10a
    • タンパク質・ペプチド: Interferon-related developmental regulator 2
    • RNA: 18S rRNA18S ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein SAリボソームタンパク質SA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4, X isoformリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27a
    • タンパク質・ペプチド: Receptor of activated protein C kinase 1
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2

超分子名称: Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#82
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / 細胞中の位置: cytoplasm

+
分子 #1: Z-site tRNA

分子名称: Z-site tRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.102275 KDa
配列文字列:
GCCCGGAUAG CUCAGCUGUA GAGCAUCAGA CUUUUAAUCU GAGGGUCCAG GGUUCAAGUC CCUGUUCGGG CGCCA

+
分子 #2: 28S rRNA

分子名称: 28S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 1.167366125 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ACUCCCCGGC GCCGGGGGGC CCAAGUCCUU CUGAUCGAGG CCCAGCCCGU GGACGGUGUG AG(B9B)CCGGU A GCGGCCCCCG GCGCGCCGGG CCCGGGUCUU CCCGGAGUCG GGUUGCUUGG GAAUGCAGCC CAAAGCGGGU GGUAAACUC CAUCUAAGGC UAAAUACCGG CACGAGACCG AUAGUCAACA AGUACCGUAA (OMG)GGAAAGUUG AAAAGAACUU UGAAG (A2M)GAG AGUUCAAGAG GGCGUGAAAC CGUUAAGAGG UAAACGGGUG GGGUCCGCGC AGUCCGCCCG GAGGAUUCAA CC CGGCGGC GCGGUCCGGC CGUGCCGGCG GGGCGGAUCU CCCGCUCCCG UCGGCGGGGG ACCGCCCCCC GGCCGGCGAC CGG CCGCCG CCGGGCGCAU UUCCACCGCG GCGGUGCGCC GCGACCGGCU CCGGGACGGC U(2MG)GGAAGGCC CCGGCGGGGA AGGUGGCCC GGGGGCCCCG GGUGUUACAG CCCCGCCCCG GCAGCAGCAG CUCGCCGAAU CCCGGGGCCG AGGGAGCGAG A CCCGUGCC GCCGCGCUCU CCCCCCUGGG GGGGCCGGGC CACCCCUCCC ACGGCGCGAC CGCUGGGGCG GACUGUCCAG UG CGCCCCG GGCGGGUCGC GCCGUCGGGC CCGGGGGGCC ACGCGUCCCC CGCGAGCGCA CGGGGUCGGC GGCGAUGUCG GCU ACCCAC CCGACCC(OMG)UC UUG(1MA)AAC(A2M)CG GACCAAGGAG UCUAACACG(P4U) GCGCGAGUCG GGGGCUAC G AAAGCCGCCG UGGCGCAAUG AAGGUGAAGG CCGGCGGCGC GCCGCCGGCC GAGGUGGGAU CCCGAGGCCU UCCAGUCCG CCGAGGG(B8Q)GC ACCACCGGCC CGUCUCGCCC GCCGCGCCGG GGAGGUGGAG CACGAGCGCA CGUGUUAG(2MG)A CC C(OMG)A(A2M)AGA UGGUGA(A2M)CUA UGCCUGGGCA GGGCGAAGCC AGAGGAAACU CUGGUG(B9B)AGG UCCG (PSU)AGCG GUCCUGACGU GCGAAUCG(7MG)U CGUCCGACCU GGGUAUAG(OMG)G GCGAAAGACU AAUCGAACCA UCU AGUAGC UGG(I4U)UCCCUC CAAAGUUUCC C(PSU)CAGGA(PSU)AG CUGGCGCUCU CCGCAGUUUU AUCCGGUAAA GC GAAUGAU UAGAGGUCUU GGGGCCGAAA CGAUCUCAAC CUAUUCUCAA ACUUUAAAU(E7G) GGUAAGAAGC CCGGCUCGC UGGUGUGGAG CCGGGCGUGG AAUGCGAGUG CCUAGUGGGC CAC(B8H)UUUGG(UR3) AAGC(A2M)GAACU GGCGCU (OMG)CG GGAUGAACCG AACGCCGGGU UAA(P7G)GCGCCC GAUGCCGACG CUCAUCAGAC CCCAGAAAAG GUGUUGGUU GAUAUAGACA GCAGGAUGGU GGCCAUGGAA GUCGGAAUCC GCUAAGGAGU GUGUAACAAC UCACCUGCCG AAUCAACUAG CCCUGAAAA UGGAUG(OMG)CGC UGGAGCGUCG GGCCCAUACC CGGCCGUCGC UGGCAGUCGG CAGAGCGAGA AAGAGAG UG GCGCGGACGC UACGCCGCGA CGAGUAGGAG GGCCGCUGCG (E7G)UGAGCCUUG AAGCCUAGGG CGCGGGCCCG GGUG GAGCC GCCGCAGGUG CAGAUCUUGG UGGUAGU(A2M)(OMG)(OMC) AAAUAUUCAA ACGA(B8W)AACUU UGAAGGCCG AAGUGG(A2M)GAA GGGUUCCAUG UGAACAG(OMC)A(OMG) UUGAACAUGG GUCAGUCGGU CCUGAGAGAU GGGCGAGC G CCGUUCCGAA GGGACGGGCG AUGGCCUCCG UUGCCCUCAG CCGA(PSU)CGAAA GGGAGUCG(7MG)G UUCAGAUCCC C GAAUCCGG AGUGGCGGAG AUGGGCGCCG CGAGGCGUCC AGUGCGGUAA CGCGACCGAU CCCGGAGAAG CCGGCGGGAG CC CCGGGGA GAGUUCUCUU UUCUUUGUGA AGGGCAGGGC GCCCUGGAAU GGGUUCGCCC CGAGAGAGGG GCCCGUGCCU UGG AAAGCG UCGCGGUUCC GGCGGCGUCC GGUGAGCUCU CGCUGGCCCU UGAAAAUCCG GGG(B9B)AGAGGG UGUAAAUCUC GC(OMG)CCGGGC CGUACC(B9H)AUA UCCGCAGCAG GUCU(OMC)CAAGG UGAACAGCCU CUGGCAUGUU GGAACAAUG UAGGUAAGGG AAGUCGGCAA GC(OMC)GGAUCCG UAACUUCGGG AUAAGGAUUG GCUCUAAGGG CUGGCAGCCG ACUUAG AAC UGGUGCGGAC CAGGGGAAUC CGACUGUUUA AUUAAAACAA AGCAUCGCGA AGGCCCGCGG CGGGUGUUGA CGCGAUG UG AUUUCUGCC(OMC) AGUGCUCUGA AUG(PSU)CA(A2M)AGU G(A2M)AGAAA(PSU)UC AAUGAAGCGC GGGUAAAC G GCGGGAGUAA C(B8H)A(PSU)GACUCU CUUAAGGUAG C(5MC)AA(A2M)UGCCU C(OMG)UCAUCUAA UUAGUGACG CGCAUGAAUG GAUGA(A2M)CGAG AUUCCCACUG UCCCUACCUA CUAUCCAGCG AAACCAC(A2M)G(OMC) CAAGGGAA C G(P7G)GCUUGG(OMC)G GAAUCAGC(B8K)G (BGH)GAAAGAAGA (OMC)CCUGUUGAG CUUGACUCUA GUCUGGCAC GGUGAAGAGA CAUGAGAAGU GUAGAAUAAG UGGGAGGCCG CCGGUGAAAU ACCACUACUC UGAUCGUUUU UUCACUGACC CGG(5MU)GAGGC GGGGGGGCGA GCCGGGCUCU CGCUUCUGGC GCCAA(B8W)CGCC CGGCCGGCCG GGCGCGACCC GCU CCGGGG ACAGUGCCAG GUGGG(B8W)AGUU UGAC(I4U)G(OMG)GGC GGUACACCUG UCAAACGGUA (6MZ)CGCAGGU G UCCUAAGGCG AGCUCAGGGA GGACAGAAAC CUCCCGUGGA GCAGAAGGGC AAAAGCUCGC UUGA(PSU)CU(B8H)GA U UUUCAG(OMU)A CGAAUACAGA CCGUGAAAGC GGGGCCU(5MC)AC GAUCCUUCUG ACCUUUU(E6G)GG UUUUAAGCAG GA(OMG)(MHG)UGUCA GAAAAGUUAC CACAGGGAUA ACUGGC(PSU)UGU GGCGGCCA(1MA)G CGUUCAUAGC GACGU CGCU UUUUGA(PSU)CCU U(5MC)GA(PSU)GUCGG CUCUUCCUAU CAUUGU(B8W)AAG CAGAAUU(B8T)AC CAAGCG UU(OMG) GAUUG(PSU)UCAC CCACUAAUAG GGAACGUG(A2M)G CUGG(B8W)(UR3)(PSU)UAG A(OMC)CGUCGUG AGACAG(7MG)UUA GUUUUACCCU (M7A)CUGAUG(A2M)UG UGUUGUUGCC AUGGUAAUCC UGC(UR3)CAGUAC GAGA GGAAC CGCAGGU(OMU)CA (OMG)ACAU(PSU)UGGU GUA(PSU)(OMG)UGCUU GGCUGAGGAG CCAAUGGGGC GAAGC UAC(B8T) AUCUGUGGGA UUAUGACU(B8K)A ACGCCUCUAA GUCAGAAUCC CGCCCAGGCG GAACGAUAGC GCCGGAGC C UCGGUUGGCC UCGGAUAGCC GGUCCCCCGC CGGGGUCCGG U(OMG)C(2MG)GAGAGC CCUUCGUCCC GGGAAACGGG G CGGCCGGA AAGGGGGCCG CCCUCUCGCC CGUCACGCAC CGCACGUUCG UGGGGAACCU GGCGCUAAAC CAUUCGUAGA CG ACCUGCU UCUGGGUCGG GGUUUCGUAC GUAGCAGAGC AGCUGCUGCG AUCUAUUGAA AGUCAGCCCU CGACACAAGG GUU UGU

+
分子 #3: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 38.691914 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U

+
分子 #4: 5.8S rRNA

分子名称: 5.8S rRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 48.559699 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGG(OMU)GGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGC AGG UUGAUCAUCG ACACUUCGAA CGCACUUGCG GCCCCGGGUU CCUCCCGGGG CUACGCCUGU CUGAGCGUCG CU

+
分子 #49: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 49 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 548.638062 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAU(A2M)UGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGU ACA GUGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGU(OMU)CC(PSU) U(OMU)GGUCGCUC GUACUUGGAU AACUG UGGU A(A2M) ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAU(A2M)UGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGU ACA GUGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGU(OMU)CC(PSU) U(OMU)GGUCGCUC GUACUUGGAU AACUG UGGU A(A2M)UUCUAG(A2M)G CUAAUA(OMC)AUG CCGACGGGCG CUGACCCCCU UCGCGGGGGG GAUGCGUGCA UUUA UCAGU GGUGACUCUA GAUAACCUCG GGCCGAUCGC ACGCCCGGCG GCGACGACCC AUUCGAACGU CUGCCCUAUC AACUU UCGA UGGUAGUCGC CGUGCCUACC AUGGUGACCA CGGGUGACGG GGAAUCAGGG UUCGAUUCCG GAGAGGGAGC CUGAGA AAC GGCUACCACA UCCAAGGAAG GCAGCAGGCG CGC(A2M)AAUUAC CCACUCCCGA CCCGGGGA(OMG)G UAGUGA (OMC)GA AAAAUAACAA UACAGGACUC UUUCGAGGCC CUGUAAUUGG AAUGAGUC(E3C)A CUUUAAAUCC UUUAACGAG GAUCCAUUGG AGGGCAAGUC UGG(PSU)GCCAGC AGCCGCGGUA AUUCCAGCUC CAAUA(OMG)CGUA UAUUAAAGUU GC UGCAGUU (A2M)AAAAGCUCG UAGUU(OMG)GAUC UUGGGAGCGG CCGUCCCCUG CUCGGCGCCG GCCCGAAGCG UUUAC UUUG AAAAAA(5MU)UAG AGUG(PSU)(PSU)CAAA GCAGGCCGCC UGGAUACCGC AGCUAGGAAU AAUGGAAUAG GACC GCGGU UCUAUUUUGU UGGUUUUCGG AACUGAGGCC AUGAUUAAGA GGGACGGCCG GGGGCAUUCG UAUUGCGCCG CUAGA GGUG AAAUUCUUGG ACCGGCGCAA GACGGACCAG AGCGAAAGCA UUUGCCAAGA AUGUUUUCAU UAAUCAAGA(A2M) CG AAAGUCG GAGGUUCGAA GACGAUCAGA UACCGUCGUA GUUCCGACCA (PSU)AAACGAUGC CGACUGGCGA UGCGGCGGC GUUAUUCCCA UGACCCGCCG GGCAGCUUCC GGGAAACCAA AGUCUUUGGG UUCCGGGGGG AGUAUGGUUG CAAAGCUGAA ACUUAAAGG AAUUGACGGA AGGGCACCAC (B8Q)AGGAGUGGA GCCUGCGGCU UAAU(PSU)UGAC(B8N) CAACACGGG AAACCUCACC CGGCCCGGAC ACGGACAGGA UUGACAGAUU GAUAGCUCUU UCUCGAUUCC GUGGGUGGUG GUGCAUGGC (4AC)GUUCUUAGU UGGUGGAGCG AUUUGUCUGG UUAAUUC(5MC)GA UAACGAACGA GACUCUGGCA UGCUAACUAG UU ACGCGAC CCCGGUCGGC GUAACUUCUU AGAGGGACAA GUGGCGUUCA GCCACCCGAG AUUGAGCAAU AACAGGUCUG UGA UGCCCU UAGAUGUCCG GGGCUGCACG CGCGCUACAC UGACUGGCUC AGCGUGUGCC UACCCUACGC CGGCAGGCGC GGGU AACCC GUUGAACCCC AUUCGUGAUG GGGAUCGGGG AUUGCAAUUA UUCCCCAUGA ACGAGGAAUU CCCAGUAAGU GCGGG UCAU AAGCUUGCGU UGAUU(A2M)AGUC CCUGCCCUUU GUACACACCG (OMC)CCGUCG(OMC)UA CUACCGAUUG GAUG GUUUA GUGAGGCCCU CGGAUCGGCC CCGCCGGGGU GCCCUGGCGG AGCGCUGAGA AGACGGUCGA ACUUG(M7A)CUAU C UAGAGGAA GUAAAAGUCG (UR3)A(6MZ)CAAGGUU UC(4AC)GUAGGUG (MA6)(MA6)CCUGCGGA AGGAUCAUUA

+
分子 #5: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.998613 KDa
配列文字列: GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV ...文字列:
GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV AGGGRIDKPI LKAGRAYHKY KAKRNCWPRV RGVAMNPVEH PFGGGNHQHI GKPSTIRRDA PAGRKVGLIA AR RTGRLRG T

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 45.119812 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR ...文字列:
SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR LLPLRQKKAH LMEIQVNGGT VAEKLDWARE RLEQQVPVSQ VFGQDEMIDV IGVTKGKGYK GVTSRWHTKK LP RKTHRGL RKVACIGAWH PARVAFSVAR AGQKGYHHRT EINKKIYKIG QGYLIKDGKL IKNNASTDYD LSDKSINPLG GFV HYGEVT NDFVMLKGCV VGTKKRVLTL RKSLLVQTKR RALEKIDLKF IDTTSKFGHG RFQTVEEKKA FMGPLKKD

+
分子 #7: 60S ribosomal protein L4

分子名称: 60S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 41.114434 KDa
配列文字列: ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL ...文字列:
ACARPLISVY SEKGESSGKN VTLPAVFKAP IRPDIVNFVH TNLRKNNRQP YAVSELAGHQ TSAESWGTGR AVARIPRVRG GGTHRSGQG AFGNMCRGGR MFAPTKTWRR WHRRVNTTQK RYAICSALAA SALPALVMSK GHRIEEVPEL PLVVEDKVEG Y KKTKEAVL LLKKLKAWND IKKVYASQRM RAGKGKMRNR RRIQRRGPCV IYNEDNGIVK AFRNIPGITL LNVTKLNILK LA PGGHVGR FCIWTESAFR KLDDLYGTWR KAASLKSNYN LPMHKMLNTD LSRILKSPEI QRALRAPRKK IHRRVLKKNP LKN LRIMLK LNPYA(MLZ)TMRR NTILRQARNH KLRVERAAAA LAAKSD

+
分子 #8: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 34.077391 KDa
配列文字列: FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG ...文字列:
FVKVVKNKAY FKRYQVKFRR RREGKTDYYA RKRLVIQDKN KYNTPKYRMI VRVTNRDIIC QIAYARIEGD MIVCAAYAHE LPKYGVKVG LTNYAAAYCT GLLLARRLLN RFGMDKIYEG QVEVTGDEYN VESIDGQPGA FTCYLDAGLA RTTTGNKVFG A LKGAVDGG LSIPHSTKRF PGYDSESKEF NAEVHRKHIM GQNVADYMRY LMEEDEDAYK KQFSQYIKNN VTPDMMEEMY KK AHAAIRE NPVYEKKPKR EVKKKRWNRP KMSLAQKKDR VAQKKASFLR AQERAA

+
分子 #9: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 33.028336 KDa
配列文字列: MAGEKAPAAK PDATKKSPAK KADHARGKAK KKTLAEKKPK KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKRE KVLATVTKPV GGDKNGGTRV VKLRKMPRYY PTEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR H RGKRVVFL ...文字列:
MAGEKAPAAK PDATKKSPAK KADHARGKAK KKTLAEKKPK KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKRE KVLATVTKPV GGDKNGGTRV VKLRKMPRYY PTEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR H RGKRVVFL KQLSSGLLLV TGPLSLNRVP LRRTHQKFVI ATSTKIDISG VKIPKHLTDA YFKKKKLRKP RHQEGEIFDT EK EKYEITE QRKVDQKAVD SQILPKIKAV PQLQGYLRSV FALTNGVYPH KLVF

+
分子 #10: 60S ribosomal protein L7

分子名称: 60S ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.658754 KDa
配列文字列: NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN TLIARSLGKY N IICMEDLI ...文字列:
NFAELKIKRL RKKFAQKMLR KARRKLIYEK AKHYHKEYRQ MYRTEIRMAR MARKAGNFYV PAEPKLAFVI RIRGINGVSP KVRKVLQLL RLRQIFNGTF VKLNKASINM LRIVEPYIAW GYPNLKSVNE LIYKRGYGKI NKKRIALTDN TLIARSLGKY N IICMEDLI HEIYTVGKHF KEANNFLWPF KLSSPRGGMK KKTTHFVEGG DAGNREDQIN RLIRRMN

+
分子 #11: 60S ribosomal protein L7a

分子名称: 60S ribosomal protein L7a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 36.221516 KDa
配列文字列: MSSYRLGYCM KEERHNLVLC LWSQSPGILN SKCLWPFTNI HLLVGALPRE GAGGAWGGGR SEQLPTCSTT HHDFTWDKKV VNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET K QEKKQRLL ...文字列:
MSSYRLGYCM KEERHNLVLC LWSQSPGILN SKCLWPFTNI HLLVGALPRE GAGGAWGGGR SEQLPTCSTT HHDFTWDKKV VNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET K QEKKQRLL ARAEKKAAGK GDVPTKRPPV LRAGVNTVTT LVENKKAQLV VIAHDVDPIE LVVFLPALCR KMGVPYCILK GK ARLGRLV HRKTCTTVAF TQVNSEDKGA LAKLVEAIRT NYNDRYDEIR RHWGGNVLGP KSVARIAKLE KAKAKELATK LG

+
分子 #12: 60S ribosomal protein L9

分子名称: 60S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.627215 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QA

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.643057 KDa
配列文字列: MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDAK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCG HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKSC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSIR TKLQNKEHVV EALRRAKFKF P GRQKIHIS ...文字列:
MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDAK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCG HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKSC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSIR TKLQNKEHVV EALRRAKFKF P GRQKIHIS KKWGFTKFNA DEFEDMVAEK RLIPDGCGVK YIPNRGPLDK WRALHS

+
分子 #14: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 19.399498 KDa
配列文字列:
KENPMRELRI RKLCLNICVG ESGDRLTRAA KVLEQLTGQT PVFSKARYTV RSFGIRRNEK IAVHCTVRGA KAEEILEKGL KVREYELRK NNFSDTGNFG FGIQEHIDLG IKYDPSIGIY GLDFYVVLGR PGFSIADKKR RTGCIGAKHR ISKEEAMRWF Q QKYDGIIL PG

+
分子 #15: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.200525 KDa
配列文字列: APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA AGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI ...文字列:
APSRNGMILK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA RARRIAPRPA AGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLVLFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPIRNV F KKEKARVI TEEEKNFKAF ASLRMARANA RLFGIRAKRA KEAAEQDVEK KK

+
分子 #16: 60S ribosomal protein L14

分子名称: 60S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.217355 KDa
配列文字列:
VFRRFVEVGR VAYVSFGPHA GKLVAIVDVI DQNRALVDGP CTRVRRQAMP FKCMQLTDFI LKFPHSARQK YVRKAWEKAD INTKWAATR WAKKIEARER KAKMTDFDRY KVMKAKKMRN RIIKNEVKKL QRAALLKAS

+
分子 #17: 60S Ribosomal protein L15

分子名称: 60S Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.076088 KDa
配列文字列: GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR ...文字列:
GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR KSRGLGKGHK FHHTIGGSRR AAWRRRNTLQ LHRYR

+
分子 #18: 60S ribosomal protein L13a

分子名称: 60S ribosomal protein L13a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 23.144859 KDa
配列文字列: QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK ...文字列:
QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK QLMRLRKQAE KNVEKKISKF TDVLKTHGLL V

+
分子 #19: 60S ribosomal protein L17

分子名称: 60S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.758678 KDa
配列文字列:
VRYSLDPENP TKSCKSRGSN LRVHFKNTRE TAQAIKGMHI RKATKYLKDV TLKKQCVPFR RYNGGVGRCA QAKQWGWTQG RWPKKSAEF LLHMLKNAES NAELKGLDVD SLVIEHIQVN KAPKMRRRTY RAHGRINPYM SSPCHIEMIL TEKE

+
分子 #20: 60S ribosomal protein L18

分子名称: 60S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.568492 KDa
配列文字列:
GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQVVLKRL FMSRTNRPPL SLSRMIRKMK LPGRENKTAV VVGTVTDDV RVQEVPKLKV CALRVTSRAR SRILKAGGKI LTFDQLALDS PKGRGTVLLS GPRKGREVYR HFGKAPGTPH S HTKPYVRS KGRKFERARG RRASRGYKN

+
分子 #21: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.613033 KDa
配列文字列:
SMLRLQKRLA SSVLRCGKKK VWLDPNETNE IANANSRQQI RKLIKDGLII RKPVTVHSRA RCRKNTLARR KGRHMGIGKR KGTANARMP EKVTWMRRMR ILRRLLRRYR ESKKIDRHMY HSLYLKVKGN VFKNKRILME HIHKLKADKA RKKLLADQAE A RRSKTKEA RKRREERLQA KK

+
分子 #22: 60S ribosomal protein L18a

分子名称: 60S ribosomal protein L18a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 20.827561 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRCLPTP KCRTPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LKKMKKSSGE IVYCGQVFEK SPLRVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTAGAVTQC YRDMGARHRA RAHSIQIMKV EEIAASKCRR PAVKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF

+
分子 #23: 60S ribosomal protein L21

分子名称: 60S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 18.478791 KDa
配列文字列:
TNTKGKRRGT RYMFSRPFRK HGVVPLATYM RIYKKGDIVD IKGMGTVQKG MPHKCYHGKT GRVYNVTQHA VGIVVNKQVK GKILAKRIN VRIEHIKHSK SRDSFLKRVK ENDQKKKEAK EKGTWVQLKR QPAPPREAHF VRTNGKEPEL LEPIPYEFMA

+
分子 #24: 60S ribosomal protein L22

分子名称: 60S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.495275 KDa
配列文字列:
QLLKFTLDCT HPVEDGIMDA ANFEQFLQER IKVNGKAGNL GGGVVSLERS KSKITVTSEV PFSKRYLKYL TKKYLKKNNL RDWLRVVAN TKESYELRYF

+
分子 #25: 60S ribosomal protein L23

分子名称: 60S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.972425 KDa
配列文字列:
SGAKFRISLG LPVGAVINCA DNTGAKNLYI ISVKGIKGRL NRLPAAGVGD MVMATVKKGK PELRKKVHPA VVIRQRKSYR RKDGVFLYF EDNAGVIVNN KGEMKGSAIT GPVAKECADL WPRIASNAGS IA

+
分子 #26: 60S ribosomal protein L24

分子名称: 60S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.825111 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEIQKK RTRRAVKFQR AITGASLAD IMAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QASKKTAMAA AKAPTKAAPK QKIVKPVKVS APRVGGKR

+
分子 #27: 60S ribosomal protein L23a

分子名称: 60S ribosomal protein L23a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.727181 KDa
配列文字列:
KIRTSPTFRR PKTLRLRRQP KYPRKSAPRR NKLDHYAIIK FPLTTESAMK KIEDNNTLVF IVDVKANKHQ IKQAVKKLYD IDVAKVNTL IRPDGEKKAY VRLAPDYDAL DVANKIGII

+
分子 #28: 60S ribosomal protein L26

分子名称: 60S ribosomal protein L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.891787 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGK

+
分子 #29: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.704635 KDa
配列文字列:
GKFMKPGKVV LVLAGRYSGR KAVIVKNIDD GTSDRPYSHA LVAGIDRYPR KVTAAMGKKK IAKRSKIKSF VKVYNYNHLM PTRYSVDIP LDKTVVNKDV FRDPALKRKA RREAKVKFEE RYKTGKNKWF FQKLRF

+
分子 #30: 60S ribosomal protein L27a

分子名称: 60S ribosomal protein L27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.489363 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGMHHH RINFDKYHPG YFGKVGMRHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRVNA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKGV GGACVLVA

+
分子 #31: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 26.708707 KDa
配列文字列: MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGLKKMQAN NAKAMAARAE AIKALVKPKE VKPTIPKGV SRKLHRLAYI AHPKLGRRAR ARIARGLRLS RPQTKAKAKT EPQIKGKVKA QIKAQAQAQI KSKGKGKAQA E TKPKAQAE ...文字列:
MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGLKKMQAN NAKAMAARAE AIKALVKPKE VKPTIPKGV SRKLHRLAYI AHPKLGRRAR ARIARGLRLS RPQTKAKAKT EPQIKGKVKA QIKAQAQAQI KSKGKGKAQA E TKPKAQAE TKPKAQAQAK PKAQAQGKPK AQAQGKPKAQ AQAKPKAQAQ AKPKAQAQTK PKAQATPAAP VPAQAPPKGA QP PAKAP

+
分子 #32: 60S ribosomal protein L30

分子名称: 60S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.914756 KDa
配列文字列:
SLESINSRLQ LVMKSGKYVL GYKQSLKMIR QGKAKLVILA NNCPALRKSE IEYYAMLAKT GVHHYSGNNI ELGTACGKYY RVCTLSIID PGDSDIIRS

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L31

分子名称: 60S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.635694 KDa
配列文字列:
NEVVTREYTI NIHKRIHGVG FKKRAPRALK EIRKFAMKEM GTPDVRIDTR LNKAVWAKGI RNVPYRIRVR LSRKRNEDED SPNKLYTLV TYVPVTTFKN LQTVNVDE

+
分子 #34: 60S ribosomal protein L32

分子名称: 60S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.022021 KDa
配列文字列:
AALRPLVKPK IVKKRTKKFI RHQSDRYVKI KRNWRKPRGI DNRVRRRFKG QILMPNIGYG SNKKTKHMLP SGFRKFLVHN VKELEVLLM CNKSYCAEIA HNVSSKNRKA IVERAAQLAI RVTNPNARL

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L35a

分子名称: 60S ribosomal protein L35a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.449612 KDa
配列文字列:
SGRLWCKAIF AGYKRGLRNQ REHTALLKIE GVYARDETEF YLGKRCAYVY KAKNNTVTPG GKPNKTRVIW GKVTRAHGNS GMVRAKFRS NLPAKAIGHR IRVMLYPSRI

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L34

分子名称: 60S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.994621 KDa
配列文字列:
VQRLTYRRRL SYNTASNKTR LSRTPGNRIV YLYTKKVGKA PKSACGVCPG RLRGVRAVRP KVLMRLSKTK KHVSRAYGGS MCAKCVRDR IKRAFLIEEQ KIVVKVLKAQ AQSQK

+
分子 #37: 60S ribosomal protein L35

分子名称: 60S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.435403 KDa
配列文字列:
AKIKARDLRG KKKEELLKQL DDLKVELSQL RVAKVTGGAA SKLSKIRVVR KSIARVLTVI NQTQKENLRK FYKGKKYKPL DLRPKKTRA MRRRLNKHEE SLKTKKQQRK ERLYPLRKYA VKA

+
分子 #38: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.888371 KDa
配列文字列:
ALRYPMAVGL NKGHKVTKNV SKPRHSRRRG RLTKHTKFVR DMIREVCGFA PYERRAMELL KVSKDKRALK FIKKRVGTHI RAKRKREEL SSVLAAMRKA AAK

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L37

分子名称: 60S ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.090891 KDa
配列文字列:
TKGTSSFGKR RNKTHTLCRR CGSKAYHLQK STCGKCGYPA KRKRKYNWSA KAKRRNTTGT GRMRHLKIVY RRFRHGFREG TTPKPK

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.107752 KDa
配列文字列:
PRKIEEIKDF LLTARRKDAK SVKIKKNKDN VKFKVRCSRY LYTLVITDKE KAEKLKQSLP PGLAVKELK

+
分子 #41: 60S ribosomal protein L39

分子名称: 60S ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.324579 KDa
配列文字列:
SSHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIWMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

+
分子 #42: 60S ribosomal protein L40

分子名称: 60S ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.212593 KDa
配列文字列:
IIEPSLRQLA QKYNCDKMIC R(MLZ)CYARLHPR AVNCRKKKCG HTNNLRPKKK VK

+
分子 #43: 60S ribosomal protein L41

分子名称: 60S ribosomal protein L41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

+
分子 #44: 60S ribosomal protein L36a

分子名称: 60S ribosomal protein L36a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 12.070474 KDa
配列文字列:
VNVPKTRRTF CKKCGKHQPH KVTQYKKGKD SLYAQGKRRY DRKQSGYGGQ TKPIFRKKAK TTKKIVLRLE CVEPNCRSKR MLAIKRCKH FELGGDKKRK GQVI

+
分子 #45: 60S ribosomal protein L37a

分子名称: 60S ribosomal protein L37a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 10.168153 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIV GKYGTRYGAS LRKMVKKIEI SQHAKYTCSF CGKTKMKRRA VGIWHCGSCM KTVAGGAWTY NTTSAVTVKS AIRRLKELK DQ

+
分子 #46: 60S ribosomal protein L28

分子名称: 60S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.220686 KDa
配列文字列:
SAHLQWMVVR NCSSFLIKRN KQTYSTEPNN LKARNSFRYN GLIHRKTVGV EPAADGKGVV VVMKRRSGQR KPATSYVRTT INKNARATL SSIRHMIRKN KYHPDLRMAA IRRASAILRS QKPVM

+
分子 #47: 60S ribosomal protein L10a

分子名称: 60S ribosomal protein L10a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 23.599887 KDa
配列文字列: VSRDTLYEAV REVLHGNQRK RRKFLETVEL QISLKNYDPQ KDKRFSGTVR LKSTPRPKFS VCVLGDQQHC DEAKAVDIPH MDIEALKKL NKNKKLVKKL AKKYDAFLAS ESLIKQIPRI LGPGLNKAGK FPSLLTHNEN MVAKVDEVKS TIKFQMKKVL C LAVAVGHV ...文字列:
VSRDTLYEAV REVLHGNQRK RRKFLETVEL QISLKNYDPQ KDKRFSGTVR LKSTPRPKFS VCVLGDQQHC DEAKAVDIPH MDIEALKKL NKNKKLVKKL AKKYDAFLAS ESLIKQIPRI LGPGLNKAGK FPSLLTHNEN MVAKVDEVKS TIKFQMKKVL C LAVAVGHV KMTDDELVYN IHLAVNFLVS LLKKNWQNVR ALYIKSTM

+
分子 #48: Interferon-related developmental regulator 2

分子名称: Interferon-related developmental regulator 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 47.827254 KDa
配列文字列: MPRARKGNTP RKGGQRRGGG ARSSAQADSG SSEDEAASEA RSTTSECPSL LSTTAEDSLG GDTVDEQGPQ EDLEEKLKEY VDGLTDKSA KTRQGALESL RLALASRLLP DFLLERRFTL ADALEKCLKK GKGEEQALAA AVLGLLCVQL GPGPKGEELF H SLQPLLLS ...文字列:
MPRARKGNTP RKGGQRRGGG ARSSAQADSG SSEDEAASEA RSTTSECPSL LSTTAEDSLG GDTVDEQGPQ EDLEEKLKEY VDGLTDKSA KTRQGALESL RLALASRLLP DFLLERRFTL ADALEKCLKK GKGEEQALAA AVLGLLCVQL GPGPKGEELF H SLQPLLLS VLSDSTASPA ARLHCASALG LGCYVAAADV QDLVSCLACL EGVFSRSCGT GSSTSHVAPA SLHGVCCAAL QA WALLLTI CPSAHISHIL DRQLPRLPQL LSSESVNLRI AAGETIALLF ELARDLEEDF VYEDMEALCS TLRTLATDSN KYR AKADRR RQRSTFRAVL HYVEGGECEE ETVRFGLEVL YVDSWARHRV YTSFKEALGS GLHHHLQNNE LLRDIFGLGP VLVL DATAL KACKISRFEK HLYNAAAFKA RTKARSRVRD KRADIL

+
分子 #50: 40S ribosomal protein SA

分子名称: 40S ribosomal protein SA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.361861 KDa
配列文字列: SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH ...文字列:
SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQTAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH SVGLMWWMLA REVLRMRGTI SREHPWEVMP DLYFYRDPEE IEKEEQAAA

+
分子 #51: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.759145 KDa
配列文字列: VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL ...文字列:
VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITED VQGKNCLTNF HGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ QVRQIRKKMM EIMTREVQTN D LKEVVNKL IPDSIGKDIE KACQSIYPLH DVFVRKVKML KKPKFELGKL MELHG

+
分子 #52: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.441846 KDa
配列文字列: KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ...文字列:
KEWLPVTKLG RLVKDMKIKS LEEIYLFSLP IKESEIIDFF LGASLKDEVL KIMPVQKQTR AGQRTRFKAF VAIGDYNGHV GLGVKCSKE VATAIRGAII LAKLSIVPVR RGYWGNKIGK PHTVPCKVTG RCGSVLVRLI PAPRGTGIVS APVPKKLLMM A GIDDCYTS ARGCTATLGN FAKATFDAIS KTYSYLTPDL WKETVFTKSP YQEFTDHLVK THT

+
分子 #53: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 25.215586 KDa
配列文字列: MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列:
MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKDEIL PTTPISEQKG

+
分子 #54: 40S ribosomal protein S4, X isoform

分子名称: 40S ribosomal protein S4, X isoform / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 29.523674 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI TDFIKFDTGN LCMVTGGANL GRIGVITNRE RHPGSFDVVH VKDANGNSFA TRLSNIFVIG KGNKPWISLP RG KGIRLTI AEERDKRLAA KQSSG

+
分子 #55: 40S ribosomal protein S5

分子名称: 40S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 22.913453 KDa
配列文字列: MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT ...文字列:
MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT IAECLADELI NAAKGSSNSY AIKKKDELER VAKSNR

+
分子 #56: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 27.471535 KDa
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSL

+
分子 #57: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 22.168914 KDa
配列文字列: MFSSSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELNITAAKE IEVGGGRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTAVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD GSRLIKVHLD K AQQNNVEH ...文字列:
MFSSSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELNITAAKE IEVGGGRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTAVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD GSRLIKVHLD K AQQNNVEH KVETFSGVYK KLTGKDVNFE FPEFQL

+
分子 #58: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 24.003012 KDa
配列文字列: GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG ...文字列:
GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG KLLACIASRP GQCGRADGYV LEGKELEFYL RKIKARKG

+
分子 #59: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 21.649633 KDa
配列文字列:
PVARSWVCRK TYVTPRRPFE KSRLDQELKL IGEYGLRNKR EVWRVKFTLA KIRKAARELL TLDEKDPRRL FEGNALLRRL VRIGVLDEG KMKLDYILGL KIEDFLERRL QTQVFKLGLA KSIHHARVLI RQRHIRVRKQ VVNIPSFIVR LDSQKHIDFS L RSPYGGGR PGRVKRKNAK KGQGGAG

+
分子 #60: 40S ribosomal protein S10

分子名称: 40S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.529682 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRR

+
分子 #61: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 18.468826 KDa
配列文字列:
MADIQTERAY QKQPTIFQNK KRVLLGETGK EKLPRYYKNI GLGFKTPKEA IEGTYIDKKC PFTGNVSIRG RILSGVVTKM KMQRTIVIR RDYLHYIRKY NRFEKRHKNM SVHLSPCFRD VQIGDIVTVG ECRPLSKTVR FNVLKVTKAA GTKKQFQKF

+
分子 #62: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 13.048244 KDa
配列文字列:
VNTALQEVLK TALIHDGLAR GIREAAKALD KRQAHLCVLA SNCDEPMYVK LVEALCAEHQ INLIKVDDNK KLGEWVGLCK IDREGKPRK VVGCSCVVVK DYGKESQAKD VIEEYFKC

+
分子 #63: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 17.057113 KDa
配列文字列:
GRMHAPGKGL SQSALPYRRS VPTWLKLTSD DVKEQIYKLA KKGLTPSQIG VILRDSHGVA QVRFVTGNKI LRILKSKGLA PDLPEDLYH LIKKAVAVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYK TKRVLPPNWK YESSTASALV

+
分子 #64: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.544659 KDa
配列文字列:
SLGPQVAEGE NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQRC KELGITALHI KLRATGGNR TKTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRRL

+
分子 #65: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.246854 KDa
配列文字列:
FRKFTYRGVD LDQLLDMSYE QLMQLYSARQ RRRLSRGLRR KQHSLLKRLR KAKKEAPPME KPEVVKTHLR DMIILPEMVG SMVGVYNGK TFNQVEIKPE MIGHYLGEFS ITYKPVKHGR P

+
分子 #66: 40S ribosomal protein S16

分子名称: 40S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.032804 KDa
配列文字列:
GPLQSVQVFG RKKTATAVAH CKRGNGLIKV NGRPLEMIEP RTLQYKLLEP VLLLGKERFA GVDIRVRVKG GGHVAQIYAI RQSISKALV AYYQKYVDEA SKKEIKDILI QYDRTLLVAD PRRCESKKFG GPGARARYQK SYR

+
分子 #67: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.250714 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKK AARVIIEKYY TRLGNDFHTN KRVCEEIAII PSKKLRNKIA GYVTHLMKRI QRGPVRGISI KLQEEERERR DNYVPEVSA LDQEIIEVDP DTKEMLKLLD FGSLSNLQVT QPTVGMNFKT PRG

+
分子 #68: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 16.898648 KDa
配列文字列:
SLVIPEKFQH ILRVLNTNID GRRKIAFAIT AIKGVGRRYA HVVLRKADID LTKRAGELTE DEVERVITIM QNPRQYKIPD WFLNRQKDV KDGKYSQVLA NGLDNKLRED LERLKKIRAH RGLRHFWGLR VRGQHTKTTG RRGRT

+
分子 #69: 40S ribosomal protein S19

分子名称: 40S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.611003 KDa
配列文字列:
GVTVKDVNQQ EFVRALAAFL KKSGKLKVPE WVDTVKLAKH KELAPYDENW FYTRAASTAR HLYLRGGAGV GSMTKIYGGR QRNGVMPSH FSRGSKSVAR RVLQALEGLK MVEKDQDGGR KLTPQGQRDL DRIAGQVAAA KK

+
分子 #70: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.395489 KDa
配列文字列:
HRIRITLTSR NVKSLEKVCA DLIRGAKEKN LKVKGPVRMP TKTLRITTRK TPCGEGSKTW DRFQMRIHKR LIDLHSPSEI VKQITSISI EPGVEVEVTI A

+
分子 #71: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 9.124389 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KNF

+
分子 #72: 40S ribosomal protein S15a

分子名称: 40S ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.734357 KDa
配列文字列:
VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFDV QLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

+
分子 #73: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 15.626392 KDa
配列文字列:
GKCRGLRTAR KLRSHRRDQK WHDKQYKKAH LGTALKANPF GGASHAKGIV LEKVGVEAKQ PNSAIRKCVR VQLIKNGKKI TAFVPNDGC LNFIEENDEV LVAGFGRKGH AVGDIPGVRF KVVKVANVSL LALYKGKKER PR

+
分子 #74: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 14.432125 KDa
配列文字列:
TVTIRTRKFM TNRLLQRKQM VIDVLHPGKA TVPKTEIREK LAKMYKTTPD VIFVFGFRTH FGGGKTTGFG MIYDSLDYAK KNEPKHRLA RHGLYEKKKT SRKQRKERKN RMKKVRGTAK ANVGA

+
分子 #75: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 8.526119 KDa
配列文字列:
RDKLNNLVLF DKATYDKLCK EVPNYKLITP AVVSERLKIR GSLARAALQE LLSKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKG

+
分子 #76: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 11.645794 KDa
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCARCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEASVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPPPR FR

+
分子 #77: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 9.34899 KDa
配列文字列:
PLAKDLLHPS PEEEKRKHKK KRLVQSPNSY FMDVKCPGCY KITTVFSHAQ TVVLCVGCST VLCQPTGGKA RLTEGCSFRR KQH

+
分子 #78: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 7.007069 KDa
配列文字列:
QPIKLARVTK VLGRTGSQGQ CTQVRVEFMD DTSRSIIRNV KGPVREGDVL TLLESEREAR RL

+
分子 #79: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.559625 KDa
配列文字列:
GHQQLYWSHP RKFGQGSRSC RVCSNRHGLI RKYGLNMCRQ CFRQYAKDIG FIKLD

+
分子 #80: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 6.317539 KDa
配列文字列:
SLARVGKVRG QTLKVAKQEK KKKRTGRAKR RMQYNRRFVN VVPTFGKKKG PNANS

+
分子 #81: 40S ribosomal protein S27a

分子名称: 40S ribosomal protein S27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 7.98644 KDa
配列文字列:
KSYTTPKKNK HKRKKVKLAV LKYYKVDENG KISRLRRECP SDECGAGVFM ASHFDRHYCG KCCLTYCF

+
分子 #82: Receptor of activated protein C kinase 1

分子名称: Receptor of activated protein C kinase 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rabbit (ウサギ)
分子量理論値: 34.669113 KDa
配列文字列: TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG ...文字列:
TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG WDKLVKVWNL ANCKLKTNHI GHTGYLNTVT VSPDGSLCAS GGKDGQAMLW DLNEGKHLYT LDGGDIINAL CF SPNRYWL CAATGPSIKI WDLEGKIIVD ELKQEVISTS SKAEPPQCTS LAWSADGQTL FAGYTDNLVR VWQVTI

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分子 #83: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 83 / コピー数: 297 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #84: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 84 / コピー数: 8 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.4
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 5.0 nm
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-17 / 平均露光時間: 1.1 sec. / 平均電子線量: 40.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

CTF補正ソフトウェア - 名称: Gctf
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

4129

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.0)
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.0) / 使用した粒子像数: 74031
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

5lzv

精密化空間: REAL / プロトコル: OTHER
得られたモデル

PDB-6mtc:
Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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