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- EMDB-4525: Human post-catalytic spliceosome (P complex) stalled with DHX8 K5... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4525
タイトルHuman post-catalytic spliceosome (P complex) stalled with DHX8 K594A mutant, overall map
マップデータHuman post-catalytic spliceosome (P complex) stalled with DHX8 K594A mutant, overall map
試料
  • 複合体: Human post-catalytic P complex spliceosome
    • 複合体: Human post-catalytic P complex spliceosome
      • RNA: x 3種
      • タンパク質・ペプチド: x 38種
    • 複合体: ATP-dependent RNA helicase DHX8
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
    • 複合体: MINX introns and exons
      • RNA: x 2種
  • リガンド: x 6種
機能・相同性
機能・相同性情報


second spliceosomal transesterification activity / exon-exon junction subcomplex mago-y14 / negative regulation of selenocysteine incorporation / regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / spliceosomal complex disassembly / cellular response to selenite ion / selenocysteine insertion sequence binding / exon-exon junction complex / pre-mRNA 3'-splice site binding / snRNP binding ...second spliceosomal transesterification activity / exon-exon junction subcomplex mago-y14 / negative regulation of selenocysteine incorporation / regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / spliceosomal complex disassembly / cellular response to selenite ion / selenocysteine insertion sequence binding / exon-exon junction complex / pre-mRNA 3'-splice site binding / snRNP binding / granulocyte differentiation / U2 snRNP binding / post-mRNA release spliceosomal complex / U7 snRNA binding / histone pre-mRNA DCP binding / regulation of retinoic acid receptor signaling pathway / U7 snRNP / negative regulation of toll-like receptor signaling pathway / 3'-5' RNA helicase activity / regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission / histone pre-mRNA 3'end processing complex / alternative mRNA splicing, via spliceosome / renal system process / cis assembly of pre-catalytic spliceosome / generation of catalytic spliceosome for first transesterification step / negative regulation of excitatory postsynaptic potential / endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / regulation of vitamin D receptor signaling pathway / Z-decay: degradation of maternal mRNAs by zygotically expressed factors / SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs / SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs / negative regulation of interleukin-8 production / regulation of mRNA processing / negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway / spliceosome conformational change to release U4 (or U4atac) and U1 (or U11) / Deadenylation of mRNA / embryonic brain development / protein methylation / U12-type spliceosomal complex / methylosome / negative regulation of phosphorylation / 7-methylguanosine cap hypermethylation / pre-mRNA binding / negative regulation of interferon-beta production / nuclear retinoic acid receptor binding / U2-type catalytic step 1 spliceosome / pICln-Sm protein complex / U1 snRNP binding / RNA splicing, via transesterification reactions / Prp19 complex / poly(A) binding / positive regulation of androgen receptor activity / spliceosomal tri-snRNP complex / small nuclear ribonucleoprotein complex / M-decay: degradation of maternal mRNAs by maternally stored factors / P granule / RNA stem-loop binding / sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex / ATP-dependent activity, acting on RNA / SMN-Sm protein complex / mRNA 3'-end processing / mRNA cis splicing, via spliceosome / U2-type spliceosomal complex / telomerase RNA binding / embryonic cranial skeleton morphogenesis / telomerase holoenzyme complex / positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome / U2-type precatalytic spliceosome / regulation of mRNA splicing, via spliceosome / C2H2 zinc finger domain binding / U2-type prespliceosome assembly / commitment complex / U2-type catalytic step 2 spliceosome / U4 snRNP / positive regulation by host of viral transcription / Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript / positive regulation of vitamin D receptor signaling pathway / U2 snRNP / Notch binding / nuclear vitamin D receptor binding / RNA Polymerase II Transcription Termination / Regulation of gene expression in late stage (branching morphogenesis) pancreatic bud precursor cells / U1 snRNP / RUNX3 regulates NOTCH signaling / positive regulation of alpha-beta T cell differentiation / U2-type prespliceosome / NOTCH4 Intracellular Domain Regulates Transcription / K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / ubiquitin-ubiquitin ligase activity / exploration behavior / WD40-repeat domain binding / NOTCH3 Intracellular Domain Regulates Transcription / positive regulation of neurogenesis / lipid biosynthetic process / precatalytic spliceosome / regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome / hematopoietic stem cell proliferation / nuclear androgen receptor binding / cyclosporin A binding
類似検索 - 分子機能
Sde2, N-terminal ubiquitin domain / Silencing defective 2 N-terminal ubiquitin domain / NF-kappa-B-activating protein, C-terminal / NF-kappa-B-activating protein / NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain / NF-kappa-B-activating protein / Protein FAM32A / Cactin, central domain / Cactin, C-terminal / FAM32A ...Sde2, N-terminal ubiquitin domain / Silencing defective 2 N-terminal ubiquitin domain / NF-kappa-B-activating protein, C-terminal / NF-kappa-B-activating protein / NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain / NF-kappa-B-activating protein / Protein FAM32A / Cactin, central domain / Cactin, C-terminal / FAM32A / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / Conserved mid region of cactin / PRKR-interacting protein 1 / Protein of unknown function (DUF1168) / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 domain / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / Pre-mRNA splicing Prp18-interacting factor / DHX8/ Prp22, DEXH-box helicase domain / Mago nashi protein / RNA-binding motif protein 8 / RBM8, RNA recognition motif / Mago nashi superfamily / Mago nashi protein / : / : / : / : / Intron-binding protein aquarius, beta-barrel / Intron-binding protein aquarius insert domain / : / Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / Breast carcinoma amplified sequence 2 (BCAS2) / CWF11 family / Intron-binding protein aquarius, N-terminal / Intron-binding protein aquarius N-terminal / : / Replication stress response SDE2 C-terminal / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / mRNA splicing factor SYF2 / SYF2 splicing factor / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', RNA recognition motif 2 / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', RNA recognition motif 1 / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin A-like / mRNA splicing factor Cwf21 domain / cwf21 domain / Pre-mRNA-processing factor 17 / : / STL11, N-terminal / Pre-mRNA-splicing factor 19 / Pre-mRNA-processing factor 19 / Prp19/Pso4-like / : / U-box domain / DNA2/NAM7 helicase, helicase domain / DNA2/NAM7-like helicase / AAA domain / WD repeat Prp46/PLRG1-like / BUD31/G10-related, conserved site / : / : / G10 protein signature 1. / G10 protein signature 2. / SKI-interacting protein SKIP, SNW domain / SKI-interacting protein, SKIP / SKIP/SNW domain / Myb-like DNA-binding domain / Pre-mRNA-splicing factor Cwf15/Cwc15 / HAT (Half-A-TPR) repeat / Cwf15/Cwc15 cell cycle control protein / Small ribonucleoprotein associated, SmB/SmN / Pre-mRNA-splicing factor Cwc2/Slt11 / G10 protein / Pre-mRNA-splicing factor BUD31 / Pre-mRNA splicing factor component Cdc5p/Cef1, C-terminal / pre-mRNA splicing factor component / Initiation factor eIF-4 gamma, MA3 / MA3 domain / MI domain profile. / Domain in DAP-5, eIF4G, MA-3 and other proteins. / Small nuclear ribonucleoprotein D1 / MIF4G domain / Spt5 C-terminal domain / Spt5 C-terminal nonapeptide repeat binding Spt4 / U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal / occurring C-terminal to leucine-rich repeats / U-box domain profile. / ロイシンリッチリピート / Modified RING finger domain / Pre-mRNA-splicing factor Syf1-like / Brr2, N-terminal helicase PWI domain / : / N-terminal helicase PWI domain / Pre-mRNA-splicing helicase BRR2 plug domain / Middle domain of eukaryotic initiation factor 4G (eIF4G) / MIF4G-like, type 3 / U-box domain / Snu114, GTP-binding domain / Sec63 Brl domain / Zinc finger, CCCH-type superfamily / 116kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, N-terminal
類似検索 - ドメイン・相同性
Pleiotropic regulator 1 / RNA helicase aquarius / Pre-mRNA-processing factor 17 / U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase / Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / Pre-mRNA-splicing factor SYF2 / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' / U2 small nuclear ribonucleoprotein A' / Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ...Pleiotropic regulator 1 / RNA helicase aquarius / Pre-mRNA-processing factor 17 / U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase / Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / Pre-mRNA-splicing factor SYF2 / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' / U2 small nuclear ribonucleoprotein A' / Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' / Eukaryotic initiation factor 4A-III / Protein BUD31 homolog / Small nuclear ribonucleoprotein E / Small nuclear ribonucleoprotein F / Small nuclear ribonucleoprotein G / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 / SNW domain-containing protein 1 / ATP-dependent RNA helicase DHX8 / 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component / Splicing regulator SDE2 / Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 / NF-kappa-B-activating protein / Splicing factor Cactin / Protein mago nashi homolog 2 / U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein / Cell division cycle 5-like protein / Crooked neck-like protein 1 / PRKR-interacting protein 1 / Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog / Pre-mRNA-splicing factor SYF1 / Pre-mRNA-splicing factor RBM22 / Spliceosome-associated protein CWC15 homolog / Pre-mRNA-processing factor 19 / Serine/arginine repetitive matrix protein 2 / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 / Protein FAM32A / RNA-binding protein 8A
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / Human adenovirus 2 (ヒトアデノウイルス) / Human (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å
データ登録者Fica SM / Oubridge C / Wilkinson ME / Newman AJ / Nagai K
資金援助 英国, 2件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_U105184330 英国
European Research CouncilAdG-693087-SPLICE3D
引用ジャーナル: Science / 年: 2019
タイトル: A human postcatalytic spliceosome structure reveals essential roles of metazoan factors for exon ligation.
著者: Sebastian M Fica / Chris Oubridge / Max E Wilkinson / Andrew J Newman / Kiyoshi Nagai /
要旨: During exon ligation, the spliceosome recognizes the 3'-splice site (3'SS) of precursor messenger RNA (pre-mRNA) through non-Watson-Crick pairing with the 5'SS and the branch adenosine, in a ...During exon ligation, the spliceosome recognizes the 3'-splice site (3'SS) of precursor messenger RNA (pre-mRNA) through non-Watson-Crick pairing with the 5'SS and the branch adenosine, in a conformation stabilized by Prp18 and Prp8. Here we present the 3.3-angstrom cryo-electron microscopy structure of a human postcatalytic spliceosome just after exon ligation. The 3'SS docks at the active site through conserved RNA interactions in the absence of Prp18. Unexpectedly, the metazoan-specific FAM32A directly bridges the 5'-exon and intron 3'SS of pre-mRNA and promotes exon ligation, as shown by functional assays. CACTIN, SDE2, and NKAP-factors implicated in alternative splicing-further stabilize the catalytic conformation of the spliceosome during exon ligation. Together these four proteins act as exon ligation factors. Our study reveals how the human spliceosome has co-opted additional proteins to modulate a conserved RNA-based mechanism for 3'SS selection and to potentially fine-tune alternative splicing at the exon ligation stage.
履歴
登録2019年1月3日-
ヘッダ(付随情報) 公開2019年2月20日-
マップ公開2019年2月20日-
更新2020年10月7日-
現状2020年10月7日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4525.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4525.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 262.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Human post-catalytic spliceosome (P complex) stalled with DHX8 K594A mutant, overall map
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.2 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.024 / ムービー #1: 0.024
最小 - 最大-0.10098974 - 0.17720254
平均 (標準偏差)0.00007733217 (±0.0050888886)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ410410410
Spacing410410410
セルA=B=C: 492.00003 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.21.21.2
M x/y/z410410410
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z492.000492.000492.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ364364364
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS410410410
D min/max/mean-0.1010.1770.000

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Human post-catalytic P complex spliceosome

全体名称: Human post-catalytic P complex spliceosome
要素
  • 複合体: Human post-catalytic P complex spliceosome
    • 複合体: Human post-catalytic P complex spliceosome
      • RNA: U2 snRNA
      • RNA: U5 snRNA
      • RNA: U6 snRNA
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic initiation factor 4A-III
      • タンパク質・ペプチド: RNA-binding protein 8A
      • タンパク質・ペプチド: Protein mago nashi homolog 2
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-processing-splicing factor 8
      • タンパク質・ペプチド: U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase
      • タンパク質・ペプチド: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
      • タンパク質・ペプチド: PRKR-interacting protein 1
      • タンパク質・ペプチド: Cactin
      • タンパク質・ペプチド: Protein FAM32A
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog
      • タンパク質・ペプチド: Pleiotropic regulator 1
      • タンパク質・ペプチド: SNW domain-containing protein 1
      • タンパク質・ペプチド: Protein BUD31 homolog
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor RBM22
      • タンパク質・ペプチド: U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein
      • タンパク質・ペプチド: Cell division cycle 5-like protein
      • タンパク質・ペプチド: Spliceosome-associated protein CWC15 homolog
      • タンパク質・ペプチド: Serine/arginine repetitive matrix protein 2
      • タンパク質・ペプチド: Crooked neck-like protein 1
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SYF1
      • タンパク質・ペプチド: Intron-binding protein aquarius
      • タンパク質・ペプチド: U2 small nuclear ribonucleoprotein A'
      • タンパク質・ペプチド: U2 small nuclear ribonucleoprotein B''
      • タンパク質・ペプチド: NF-kappa-B-activating protein
      • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B'
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SLU7
      • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3
      • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein E
      • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein F
      • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein G
      • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1
      • タンパク質・ペプチド: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1
      • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-processing factor 17
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SPF27
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-processing factor 19
      • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SYF2
      • タンパク質・ペプチド: Replication stress response regulator SDE2
    • 複合体: ATP-dependent RNA helicase DHX8
      • タンパク質・ペプチド: ATP-dependent RNA helicase DHX8
    • 複合体: MINX introns and exons
      • RNA: Ligated exons: MINX mRNA
      • RNA: Intron lariat: MINX RNA
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: POTASSIUM IONカリウム
  • リガンド: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
  • リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATEグアノシン三リン酸
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATEフィチン酸

+
超分子 #1: Human post-catalytic P complex spliceosome

超分子名称: Human post-catalytic P complex spliceosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#44
分子量理論値: 3.0 MDa

+
超分子 #2: Human post-catalytic P complex spliceosome

超分子名称: Human post-catalytic P complex spliceosome / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#10, #12-#14, #16-#26, #28-#44
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #3: ATP-dependent RNA helicase DHX8

超分子名称: ATP-dependent RNA helicase DHX8 / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #27
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

+
超分子 #4: MINX introns and exons

超分子名称: MINX introns and exons / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #11, #15
由来(天然)生物種: Human adenovirus 2 (ヒトアデノウイルス)
組換発現生物種: synthetic construct (人工物)

+
分子 #1: U2 snRNA

分子名称: U2 snRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 60.459621 KDa
配列文字列: AUCGCUUCUC GGCCUUUUGG CUAAGAUCAA GUGUAGUAUC UGUUCUUAUC AGUUUAAUAU CUGAUACGUC CUCUAUCCGA GGACAAUAU AUUAAAAGAU UUUUGGAACU CAGGGAGAUG GAAUAGGAGC UUGCUCCGUC CACUCCACGC AUCGACCUGG U AUUGCAGU ...文字列:
AUCGCUUCUC GGCCUUUUGG CUAAGAUCAA GUGUAGUAUC UGUUCUUAUC AGUUUAAUAU CUGAUACGUC CUCUAUCCGA GGACAAUAU AUUAAAAGAU UUUUGGAACU CAGGGAGAUG GAAUAGGAGC UUGCUCCGUC CACUCCACGC AUCGACCUGG U AUUGCAGU ACCUCCAGGA ACGGUGCACC C

+
分子 #2: U5 snRNA

分子名称: U5 snRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 36.908668 KDa
配列文字列:
AUACUCUGGU UUCUCUUCAG AUCGCAUAAA UCUUUCGCCU UUUACUAAAG AUUUCCGUGG AGAGGAACAA CUCUGAGUCU UAACCCAAU UUUUUGAGCC UUGCCUUGGC AAGGCUA

+
分子 #3: U6 snRNA

分子名称: U6 snRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 34.09827 KDa
配列文字列:
GUGCUCGCUU CGGCAGCACA UAUACUAAAA UUGGAACGAU ACAGAGAAGA UUAGCAUGGC CCCUGCGCAA GGAUGACACG CAAAUUCGU GAAGCGUUCC AUAUUUU

+
分子 #11: Ligated exons: MINX mRNA

分子名称: Ligated exons: MINX mRNA / タイプ: rna / ID: 11 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Human adenovirus 2 (ヒトアデノウイルス)
分子量理論値: 4.4377 KDa
配列文字列:
GGCCUCCGAA CGCU

+
分子 #15: Intron lariat: MINX RNA

分子名称: Intron lariat: MINX RNA / タイプ: rna / ID: 15 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Human adenovirus 2 (ヒトアデノウイルス)
分子量理論値: 27.772039 KDa
配列文字列: GUAAGAGCCU AGCAUGUAGA A(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N) ...文字列:
GUAAGAGCCU AGCAUGUAGA A(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N) (N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N)(N) (N)(N)UGAUGAUG UCAUACUUAU CCU(N)(N)(N)(N)(N) (N) (N)(N)(N)CAG

+
分子 #4: Eukaryotic initiation factor 4A-III

分子名称: Eukaryotic initiation factor 4A-III / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 44.691359 KDa
配列文字列: DMTKVEFETS EEVDVTPTFD TMGLREDLLR GIYAYGFEKP SAIQQRAIKQ IIKGRDVIAQ SQSGTGKTAT FSISVLQCLD IQVRETQAL ILAPTRELAV QIQKGLLALG DYMNVQCHAC IGGTNVGEDI RKLDYGQHVV AGTPGRVFDM IRRRSLRTRA I KMLVLDEA ...文字列:
DMTKVEFETS EEVDVTPTFD TMGLREDLLR GIYAYGFEKP SAIQQRAIKQ IIKGRDVIAQ SQSGTGKTAT FSISVLQCLD IQVRETQAL ILAPTRELAV QIQKGLLALG DYMNVQCHAC IGGTNVGEDI RKLDYGQHVV AGTPGRVFDM IRRRSLRTRA I KMLVLDEA DEMLNKGFKE QIYDVYRYLP PATQVVLISA TLPHEILEMT NKFMTDPIRI LVKRDELTLE GIKQFFVAVE RE EWKFDTL CDLYDTLTIT QAVIFCNTKR KVDWLTEKMR EANFTVSSMH GDMPQKERES IMKEFRSGAS RVLISTDVWA RGL DVPQVS LIINYDLPNN RELYIHRIGR SGRYGRKGVA INFVKNDDIR ILRDIEQYYS TQIDEMPMNV ADLI

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分子 #5: RNA-binding protein 8A

分子名称: RNA-binding protein 8A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 10.370526 KDa
配列文字列:
PGPQRSVEGW ILFVTGVHEE ATEEDIHDKF AEYGEIKNIH LNLDRRTGYL KGYTLVEYET YKEAQAAMEG LNGQDLMGQP ISVDWCFVR GP

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分子 #6: Protein mago nashi homolog 2

分子名称: Protein mago nashi homolog 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 16.929314 KDa
配列文字列:
SDFYLRYYVG HKGKFGHEFL EFEFRPDGKL RYANNSNYKN DVMIRKEAYV HKSVMEELKR IIDDSEITKE DDALWPPPDR VGRQELEIV IGDEHISFTT SKIGSLIDVN QSKDPEGLRV FYYLVQDLKC LVFSLIGLHF KIKPI

+
分子 #7: Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

分子名称: Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 273.97425 KDa
配列文字列: MAGVFPYRGP GNPVPGPLAP LPDYMSEEKL QEKARKWQQL QAKRYAEKRK FGFVDAQKED MPPEHVRKII RDHGDMTNRK FRHDKRVYL GALKYMPHAV LKLLENMPMP WEQIRDVPVL YHITGAISFV NEIPWVIEPV YISQWGSMWI MMRREKRDRR H FKRMRFPP ...文字列:
MAGVFPYRGP GNPVPGPLAP LPDYMSEEKL QEKARKWQQL QAKRYAEKRK FGFVDAQKED MPPEHVRKII RDHGDMTNRK FRHDKRVYL GALKYMPHAV LKLLENMPMP WEQIRDVPVL YHITGAISFV NEIPWVIEPV YISQWGSMWI MMRREKRDRR H FKRMRFPP FDDEEPPLDY ADNILDVEPL EAIQLELDPE EDAPVLDWFY DHQPLRDSRK YVNGSTYQRW QFTLPMMSTL YR LANQLLT DLVDDNYFYL FDLKAFFTSK ALNMAIPGGP KFEPLVRDIN LQDEDWNEFN DINKIIIRQP IRTEYKIAFP YLY NNLPHH VHLTWYHTPN VVFIKTEDPD LPAFYFDPLI NPISHRHSVK SQEPLPDDDE EFELPEFVEP FLKDTPLYTD NTAN GIALL WAPRPFNLRS GRTRRALDIP LVKNWYREHC PAGQPVKVRV SYQKLLKYYV LNALKHRPPK AQKKRYLFRS FKATK FFQS TKLDWVEVGL QVCRQGYNML NLLIHRKNLN YLHLDYNFNL KPVKTLTTKE RKKSRFGNAF HLCREVLRLT KLVVDS HVQ YRLGNVDAFQ LADGLQYIFA HVGQLTGMYR YKYKLMRQIR MCKDLKHLIY YRFNTGPVGK GPGCGFWAAG WRVWLFF MR GITPLLERWL GNLLARQFEG RHSKGVAKTV TKQRVESHFD LELRAAVMHD ILDMMPEGIK QNKARTILQH LSEAWRCW K ANIPWKVPGL PTPIENMILR YVKAKADWWT NTAHYNRERI RRGATVDKTV CKKNLGRLTR LYLKAEQERQ HNYLKDGPY ITAEEAVAVY TTTVHWLESR RFSPIPFPPL SYKHDTKLLI LALERLKEAY SVKSRLNQSQ REELGLIEQA YDNPHEALSR IKRHLLTQR AFKEVGIEFM DLYSHLVPVY DVEPLEKITD AYLDQYLWYE ADKRRLFPPW IKPADTEPPP LLVYKWCQGI N NLQDVWET SEGECNVMLE SRFEKMYEKI DLTLLNRLLR LIVDHNIADY MTAKNNVVIN YKDMNHTNSY GIIRGLQFAS FI VQYYGLV MDLLVLGLHR ASEMAGPPQM PNDFLSFQDI ATEAAHPIRL FCRYIDRIHI FFRFTADEAR DLIQRYLTEH PDP NNENIV GYNNKKCWPR DARMRLMKHD VNLGRAVFWD IKNRLPRSVT TVQWENSFVS VYSKDNPNLL FNMCGFECRI LPKC RTSYE EFTHKDGVWN LQNEVTKERT AQCFLRVDDE SMQRFHNRVR QILMASGSTT FTKIVNKWNT ALIGLMTYFR EAVVN TQEL LDLLVKCENK IQTRIKIGLN SKMPSRFPPV VFYTPKELGG LGMLSMGHVL IPQSDLRWSK QTDVGITHFR SGMSHE EDQ LIPNLYRYIQ PWESEFIDSQ RVWAEYALKR QEAIAQNRRL TLEDLEDSWD RGIPRINTLF QKDRHTLAYD KGWRVRT DF KQYQVLKQNP FWWTHQRHDG KLWNLNNYRT DMIQALGGVE GILEHTLFKG TYFPTWEGLF WEKASGFEES MKWKKLTN A QRSGLNQIPN RRFTLWWSPT INRANVYVGF QVQLDLTGIF MHGKIPTLKI SLIQIFRAHL WQKIHESIVM DLCQVFDQE LDALEIETVQ KETIHPRKSY KMNSSCADIL LFASYKWNVS RPSLLADSKD VMDSTTTQKY WIDIQLRWGD YDSHDIERYA RAKFLDYTT DNMSIYPSPT GVLIAIDLAY NLHSAYGNWF PGSKPLIQQA MAKIMKANPA LYVLRERIRK GLQLYSSEPT E PYLSSQNY GELFSNQIIW FVDDTNVYRV TIHKTFEGNL TTKPINGAIF IFNPRTGQLF LKIIHTSVWA GQKRLGQLAK WK TAEEVAA LIRSLPVEEQ PKQIIVTRKG MLDPLEVHLL DFPNIVIKGS ELQLPFQACL KVEKFGDLIL KATEPQMVLF NLY DDWLKT ISSYTAFSRL ILILRALHVN NDRAKVILKP DKTTITEPHH IWPTLTDEEW IKVEVQLKDL ILADYGKKNN VNVA SLTQS EIRDIILGME ISAPSQQRQQ IAEIEKQTKE QSQLTATQTR TVNKHGDEII TSTTSNYETQ TFSSKTEWRV RAISA ANLH LRTNHIYVSS DDIKETGYTY ILPKNVLKKF ICISDLRAQI AGYLYGVSPP DNPQVKEIRC IVMVPQWGTH QTVHLP GQL PQHEYLKEME PLGWIHTQPN ESPQLSPQDV TTHAKIMADN PSWDGEKTII ITCSFTPGSC TLTAYKLTPS GYEWGRQ NT DKGNNPKGYL PSHYERVQML LSDRFLGFFM VPAQSSWNYN FMGVRHDPNM KYELQLANPK EFYHEVHRPS HFLNFALL Q EGEVYSADRE DLYA

+
分子 #8: U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase

分子名称: U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 197.053984 KDa
配列文字列: APRQVLDLED LVFTQGSHFM ANKRCQLPDG SFRRQRKGYE EVHVPALKPK PFGSEEQLLP VEKLPKYAQA GFEGFKTLNR IQSKLYRAA LETDENLLLC APTGAGKTNV ALMCMLREIG KHINMDGTIN VDDFKIIYIA PMRSLVQEMV GSFGKRLATY G ITVAELTG ...文字列:
APRQVLDLED LVFTQGSHFM ANKRCQLPDG SFRRQRKGYE EVHVPALKPK PFGSEEQLLP VEKLPKYAQA GFEGFKTLNR IQSKLYRAA LETDENLLLC APTGAGKTNV ALMCMLREIG KHINMDGTIN VDDFKIIYIA PMRSLVQEMV GSFGKRLATY G ITVAELTG DHQLCKEEIS ATQIIVCTPE KWDIITRKGG ERTYTQLVRL IILDEIHLLH DDRGPVLEAL VARAIRNIEM TQ EDVRLIG LSATLPNYED VATFLRVDPA KGLFYFDNSF RPVPLEQTYV GITEKKAIKR FQIMNEIVYE KIMEHAGKNQ VLV FVHSRK ETGKTARAIR DMCLEKDTLG LFLREGSAST EVLRTEAEQC KNLELKDLLP YGFAIHHAGM TRVDRTLVED LFAD KHIQV LVSTATLAWG VNLPAHTVII KGTQVYSPEK GRWTELGALD ILQMLGRAGR PQYDTKGEGI LITSHGELQY YLSLL NQQL PIESQMVSKL PDMLNAEIVL GNVQNAKDAV NWLGYAYLYI RMLRSPTLYG ISHDDLKGDP LLDQRRLDLV HTAALM LDK NNLVKYDKKT GNFQVTELGR IASHYYITND TVQTYNQLLK PTLSEIELFR VFSLSSEFKN ITVREEEKLE LQKLLER VP IPVKESIEEP SAKINVLLQA FISQLKLEGF ALMADMVYVT QSAGRLMRAI FEIVLNRGWA QLTDKTLNLC KMIDKRMW Q SMCPLRQFRK LPEEVVKKIE KKNFPFERLY DLNHNEIGEL IRMPKMGKTI HKYVHLFPKL ELSVHLQPIT RSTLKVELT ITPDFQWDEK VHGSSEAFWI LVEDVDSEVI LHHEYFLLKA KYAQDEHLIT FFVPVFEPLP PQYFIRVVSD RWLSCETQLP VSFRHLILP EKYPPPTELL DLQPLPVSAL RNSAFESLYQ DKFPFFNPIQ TQVFNTVYNS DDNVFVGAPT GSGKTICAEF A ILRMLLQS SEGRCVYITP MEALAEQVYM DWYEKFQDRL NKKVVLLTGE TSTDLKLLGK GNIIISTPEK WDILSRRWKQ RK NVQNINL FVVDEVHLIG GENGPVLEVI CSRMRYISSQ IERPIRIVAL SSSLSNAKDV AHWLGCSATS TFNFHPNVRP VPL ELHIQG FNISHTQTRL LSMAKPVYHA ITKHSPKKPV IVFVPSRKQT RLTAIDILTT CAADIQRQRF LHCTEKDLIP YLEK LSDST LKETLLNGVG YLHEGLSPME RRLVEQLFSS GAIQVVVASR SLCWGMNVAA HLVIIMDTQY YNGKIHAYVD YPIYD VLQM VGHANRPLQD DEGRCVIMCQ GSKKDFFKKF LYEPLPVESH LDHCMHDHFN AEIVTKTIEN KQDAVDYLTW TFLYRR MTQ NPNYYNLQGI SHRHLSDHLS ELVEQTLSDL EQSKCISIED EMDVAPLNLG MIAAYYYINY TTIELFSMSL NAKTKVR GL IEIISNAAEY ENIPIRHHED NLLRQLAQKV PHKLNNPKFN DPHVKTNLLL QAHLSRMQLS AELQSDTEEI LSKAIRLI Q ACVDVLSSNG WLSPALAAME LAQMVTQAMW SKDSYLKQLP HFTSEHIKRC TDKGVESVFD IMEMEDEERN ALLQLTDSQ IADVARFCNR YPNIELSYEV VDKDSIRSGG PVVVLVQLER EEEVTGPVIA PLFPQKREEG WWVVIGDAKS NSLISIKRLT LQQKAKVKL DFVAPATGAH NYTLYFMSDA YMGCDQEYKF SVD

+
分子 #9: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

分子名称: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 101.231938 KDa
配列文字列: EVVLHEDKKY YPTAEEVYGP EVETIVQEED TQPLTEPIIK PVKTKKFTLM EQTLPVTVYE MDFLADLMDN SELIRNVTLC GHLHHGKTC FVDCLIEQTH PEIRKRYDQD LCYTDILFTE QERGVGIKST PVTVVLPDTK GKSYLFNIMD TPGHVNFSDE V TAGLRISD ...文字列:
EVVLHEDKKY YPTAEEVYGP EVETIVQEED TQPLTEPIIK PVKTKKFTLM EQTLPVTVYE MDFLADLMDN SELIRNVTLC GHLHHGKTC FVDCLIEQTH PEIRKRYDQD LCYTDILFTE QERGVGIKST PVTVVLPDTK GKSYLFNIMD TPGHVNFSDE V TAGLRISD GVVLFIDAAE GVMLNTERLI KHAVQERLAV TVCINKIDRL ILELKLPPTD AYYKLRHIVD EVNGLISMYS TD ENLILSP LLGNVCFSSS QYSICFTLGS FAKIYADTFG DINYQEFAKR LWGDIYFNPK TRKFTKKAPT SSSQRSFVEF ILE PLYKIL AQVVGDVDTS LPRTLDELGI HLTKEELKLN IRPLLRLVCK KFFGEFTGFV DMCVQHIPSP KVGAKPKIEH TYTG GVDSD LGEAMSDCDP DGPLMCHTTK MYSTDDGVQF HAFGRVLSGT IHAGQPVKVL GENYTLEDEE DSQICTVGRL WISVA RYHI EVNRVPAGNW VLIEGVDQPI VKTATITEPR GNEEAQIFRP LKFNTTSVIK IAVEPVNPSE LPKMLDGLRK VNKSYP SLT TKVEESGEHV ILGTGELYLD CVMHDLRKMY SEIDIKVADP VVTFCETVVE TSSLKCFAET PNKKNKITMI AEPLEKG LA EDIENEVVQI TWNRKKLGEF FQTKYDWDLL AARSIWAFGP DATGPNILVD DTLPSEVDKA LLGSVKDSIV QGFQWGTR E GPLCDELIRN VKFKILDAVV AQEPLHRGGG QIIPTARRVV YSAFLMATPR LMEPYYFVEV QAPADCVSAV YTVLARRRG HVTQDAPIPG SPLYTIKAFI PAIDSFGFET DLRTHTQGQA FSLSVFHHWQ IVPGDPLDKS IVIRPLEPQP APHLAREFMI KTRRRKGLS EDVSIKFFDD

+
分子 #10: PRKR-interacting protein 1

分子名称: PRKR-interacting protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 14.476882 KDa
配列文字列:
TLVIPKNAAE EQKLKLERLM KNPDKAVPIP EKMSEWAPRP PPEFVRDVMG SSAGAGSGEF HVYRHLRRRE YQRQDYMDAM AEKQKLDAE FQKRLEKNKI AAEEQTAKRR KKRQKLKEKK LLAK

+
分子 #12: Cactin

分子名称: Cactin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 15.210249 KDa
配列文字列:
KYRPRKPRFF NRVHTGFAWN KYNQTHYDFD NPPPKIVQGY KFNIFYPDLI DKRSTPEYFL EACADNKDFA ILRFHAGPPY EDIAFKIVN REWEYSHRHG FRCQFANGIF QLWFHFKRYR YRR

+
分子 #13: Protein FAM32A

分子名称: Protein FAM32A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 7.269374 KDa
配列文字列:
RGLDKRTPAQ AAFEKMQEKR QMERILKKAS KTHKQRVEDF NRHLDTLTEH YDIPKVSWTK

+
分子 #14: Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 105.646578 KDa
配列文字列: MKSSVAQIKP SSGHDRRENL NSYQRNSSPE DRYEEQERSP RDRDYFDYSR SDYEHSRRGR SYDSSMESRN RDREKRRERE RDTDRKRSR KSPSPGRRNP ETSVTQSSSA QDEPATKKKK DELDPLLTRT GGAYIPPAKL RMMQEQITDK NSLAYQRMSW E ALKKSING ...文字列:
MKSSVAQIKP SSGHDRRENL NSYQRNSSPE DRYEEQERSP RDRDYFDYSR SDYEHSRRGR SYDSSMESRN RDREKRRERE RDTDRKRSR KSPSPGRRNP ETSVTQSSSA QDEPATKKKK DELDPLLTRT GGAYIPPAKL RMMQEQITDK NSLAYQRMSW E ALKKSING LINKVNISNI SIIIQELLQE NIVRGRGLLS RSVLQAQSAS PIFTHVYAAL VAIINSKFPQ IGELILKRLI LN FRKGYRR NDKQLCLTAS KFVAHLINQN VAHEVLCLEM LTLLLERPTD DSVEVAIGFL KECGLKLTQV SPRGINAIFE RLR NILHES EIDKRVQYMI EVMFAVRKDG FKDHPIILEG LDLVEEDDQF THMLPLEDDY NPEDVLNVFK MDPNFMENEE KYKA IKKEI LDEGDTDSNT DQDAGSSEED EEEEEEEGEE DEEGQKVTIH DKTEINLVSF RRTIYLAIQS SLDFEECAHK LLKME FPES QTKELCNMIL DCCAQQRTYE KFFGLLAGRF CMLKKEYMES FEGIFKEQYD TIHRLETNKL RNVAKMFAHL LYTDSL PWS VLECIKLSEE TTTSSSRIFV KIFFQELCEY MGLPKLNARL KDETLQPFFE GLLPRDNPRN TRFAINFFTS IGLGGLT DE LREHLKNTPK VIVAQKPDVE QNKSSPSSSS SASSSSESDS SDSDSDSSDS SSESSSEESD SSSISSHSSA SANDVRKK G HGKTRSKEVD KLIRNQQTND RKQKERRQEH GHQETRTERE RRSEKHRDQN SSGSNWRDPI TKYTSDKDVP SERNNYSRV ANDRDQEMHI DLENKHGDPK KKRGERRNSF SENEKHTHRI KDSENFRRKD RSKSKEMNRK HSGSRSDEDR YQNGAERRWE KSSRYSEQS RESKKNQDRR REKSPAKQK

+
分子 #16: Pleiotropic regulator 1

分子名称: Pleiotropic regulator 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 35.782395 KDa
配列文字列: MPKPQWHPPW KLYRVISGHL GWVRCIAVEP GNQWFVTGSA DRTIKIWDLA SGKLKLSLTG HISTVRGVIV STRSPYLFSC GEDKQVKCW DLEYNKVIRH YHGHLSAVYG LDLHPTIDVL VTCSRDSTAR IWDVRTKASV HTLSGHTNAV ATVRCQAAEP Q IITGSHDT ...文字列:
MPKPQWHPPW KLYRVISGHL GWVRCIAVEP GNQWFVTGSA DRTIKIWDLA SGKLKLSLTG HISTVRGVIV STRSPYLFSC GEDKQVKCW DLEYNKVIRH YHGHLSAVYG LDLHPTIDVL VTCSRDSTAR IWDVRTKASV HTLSGHTNAV ATVRCQAAEP Q IITGSHDT TIRLWDLVAG KTRVTLTNHK KSVRAVVLHP RHYTFASGSP DNIKQWKFPD GSFIQNLSGH NAIINTLTVN SD GVLVSGA DNGTMHLWDW RTGYNFQRVH AAVQPGSLDS ESGIFACAFD QSESRLLTAE ADKTIKVYRE DDTATEETHP VSW

+
分子 #17: SNW domain-containing protein 1

分子名称: SNW domain-containing protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 33.819922 KDa
配列文字列: PPPYGYRKGW IPRLLEDFGD GGAFPEIHVA QYPLDMGRKK KMSNALAIQV DSEGKIKYDA IARQGQSKDK VIYSKYTDLV PKEVMNADD PDLQRPDEEA IKEITEKTRV ALEKSVSQKV AAAMPVRAAD KLAPAQYIRY TPSQQGVAFN SGAKQRVIRM V EMQKDPME ...文字列:
PPPYGYRKGW IPRLLEDFGD GGAFPEIHVA QYPLDMGRKK KMSNALAIQV DSEGKIKYDA IARQGQSKDK VIYSKYTDLV PKEVMNADD PDLQRPDEEA IKEITEKTRV ALEKSVSQKV AAAMPVRAAD KLAPAQYIRY TPSQQGVAFN SGAKQRVIRM V EMQKDPME PPRFKINKKI PRGPP(SEP)PPAP VMH(SEP)PSRKMT VKEQQEWKIP PCISNWKNAK GYTIPLDKRL AADG RGLQT VHINENFAKL AEALYIADRK AREAVEMRAQ VERKMAQKEK EKHEEKLREM AQKARERR

+
分子 #18: Protein BUD31 homolog

分子名称: Protein BUD31 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 17.03285 KDa
配列文字列:
MPKVKRSRKA PPDGWELIEP TLDELDQKMR EAETEPHEGK RKVESLWPIF RIHHQKTRYI FDLFYKRKAI SRELYEYCIK EGYADKNLI AKWKKQGYEN LCCLRCIQTR DTNFGTNCIC RVPKSKLEVG RIIECTHCGC RGCSG

+
分子 #19: Pre-mRNA-splicing factor RBM22

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor RBM22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 33.156129 KDa
配列文字列: ADFPILCQTC LGENPYIRMT KEKYGKECKI CARPFTVFRW CPGVRMRFKK TEVCQTCSKL KNVCQTCLLD LEYGLPIQVR DAGLSFKDD MPKSDVNKEY YTQNMEREIS NSDGTRPVGM LGKATSAAAA LLKLARTTPY YKRNRPHICS FWVKGECKRG E ECPYRHEK ...文字列:
ADFPILCQTC LGENPYIRMT KEKYGKECKI CARPFTVFRW CPGVRMRFKK TEVCQTCSKL KNVCQTCLLD LEYGLPIQVR DAGLSFKDD MPKSDVNKEY YTQNMEREIS NSDGTRPVGM LGKATSAAAA LLKLARTTPY YKRNRPHICS FWVKGECKRG E ECPYRHEK PTDPDDPLAD QNIKDRYYGI NDPVADKLLK RASTMPRLDP PEDKTITTLY VGGLGDTITE TDLRNHFYQF GE IRTITVV QRQQCAFIQF ATRQAAEVAA EKSFNKLIVN GRRLNVKWGR SQ

+
分子 #20: U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein

分子名称: U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 34.09241 KDa
配列文字列: RCSSLQPIML LSGHEGEVYC CKFHPNGSTL ASAGFDRLIL LWNVYGDCDN YATLKGHSGA VMELHYNTDG SMLFSASTDK TVAVWDSET GERVKRLKGH TSFVNSCYPA RRGPQLVCTG SDDGTVKLWD IRKKAAIQTF QNTYQVLAVT FNDTSDQIIS G GIDNDIKV ...文字列:
RCSSLQPIML LSGHEGEVYC CKFHPNGSTL ASAGFDRLIL LWNVYGDCDN YATLKGHSGA VMELHYNTDG SMLFSASTDK TVAVWDSET GERVKRLKGH TSFVNSCYPA RRGPQLVCTG SDDGTVKLWD IRKKAAIQTF QNTYQVLAVT FNDTSDQIIS G GIDNDIKV WDLRQNKLTY TMRGHADSVT GLSLSSEGSY LLSNAMDNTV RVWDVRPFAP KERCVKIFQG NVHNFEKNLL RC SWSPDGS KIAAGSADRF VYVWDTTSRR ILYKLPGHAG SINEVAFHPD EPIIISASSD KRLYMGEIQ

+
分子 #21: Cell division cycle 5-like protein

分子名称: Cell division cycle 5-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 92.406883 KDa
配列文字列: MPRIMIKGGV WRNTEDEILK AAVMKYGKNQ WSRIASLLHR KSAKQCKARW YEWLDPSIKK TEWSREEEEK LLHLAKLMPT QWRTIAPII GRTAAQCLEH YEFLLDKAAQ RDNEEETTDD PRKLKPGEID PNPETKPARP DPIDMDEDEL EMLSEARARL A NTQGKKAK ...文字列:
MPRIMIKGGV WRNTEDEILK AAVMKYGKNQ WSRIASLLHR KSAKQCKARW YEWLDPSIKK TEWSREEEEK LLHLAKLMPT QWRTIAPII GRTAAQCLEH YEFLLDKAAQ RDNEEETTDD PRKLKPGEID PNPETKPARP DPIDMDEDEL EMLSEARARL A NTQGKKAK RKAREKQLEE ARRLAALQKR RELRAAGIEI QKKRKRKRGV DYNAEIPFEK KPALGFYDTS EENYQALDAD FR KLRQQDL DGELRSEKEG RDRKKDKQHL KRKKESDLPS AILQTSGVSE FTKKRSKLVL PAPQISDAEL QEVVKVGQAS EIA RQTAEE SGITNSASST LLSEYNVTNN SVALRTPRTP ASQDRILQEA QNLMALTNVD TPLKGGLNTP LHESDFSGVT PQRQ VVQTP NTVLSTPFRT PSNGAEGLTP RSGTTPKPVI NSTPGRTPLR DKLNINPEDG MADYSDPSYV KQMERESREH LRLGL LGLP APKNDFEIVL PENAEKELEE REIDDTYIED AADVDARKQA IRDAERVKEM KRMHKAVQKD LPRPSEVNET ILRPLN VEP PLTDLQKSEE LIKKEMITML HYDLLHHPYE PSGNKKGKTV GFGTNNSEHI TYLEHNPYEK FSKEELKKAQ DVLVQEM EV VKQGMSHGEL SSEAYNQVWE ECYSQVLYLP GQSRYTRANL ASKKDRIESL EKRLEINRGH MTTEAKRAAK MEKKMKIL L GGYQSRAMGL MKQLNDLWDQ IEQAHLELRT FEELKKHEDS AIPRRLECLK EDVQRQQERE KELQHRYADL LLEKETLKS KF

+
分子 #22: Spliceosome-associated protein CWC15 homolog

分子名称: Spliceosome-associated protein CWC15 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 26.674447 KDa
配列文字列: MTTAARPTFE PARGGRGKGE GDLSQLSKQY SSRDLPSHTK IKYRQTTQDA PEEVRNRDFR RELEERERAA AREKNRDRPT REHTTSSSV SKKPRLDQIP AANLDADDPL TDEEDEDFEE ESDDDDTAAL LAELEKIKKE RAEEQARKEQ EQKAEEERIR M ENILSGNP ...文字列:
MTTAARPTFE PARGGRGKGE GDLSQLSKQY SSRDLPSHTK IKYRQTTQDA PEEVRNRDFR RELEERERAA AREKNRDRPT REHTTSSSV SKKPRLDQIP AANLDADDPL TDEEDEDFEE ESDDDDTAAL LAELEKIKKE RAEEQARKEQ EQKAEEERIR M ENILSGNP LLNLTGPSQP QANFKVKRRW DDDVVFKNCA KGVDDQKKDK RFVNDTLRSE FHKKFMEKYI K

+
分子 #23: Serine/arginine repetitive matrix protein 2

分子名称: Serine/arginine repetitive matrix protein 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 2.767128 KDa
配列文字列:
MYNGIGLPTP RGSGTNGYVQ RNLSLV

+
分子 #24: Crooked neck-like protein 1

分子名称: Crooked neck-like protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 100.610008 KDa
配列文字列: MTATVENLTF QKDTLGNAVD KNTSRLELRS YSLAGRHGST EPLVLAWSSQ FRRLTWGCAL DALHRSPCVA ASQHGVTHLI RSSRTPHST RCRKEDAQPG HHGNGAASVT AQARGQRSVL QVPLPVPRSC LFSESFVVSV SSQSRFLASV PGTGVQRSTA A DMAASTAA ...文字列:
MTATVENLTF QKDTLGNAVD KNTSRLELRS YSLAGRHGST EPLVLAWSSQ FRRLTWGCAL DALHRSPCVA ASQHGVTHLI RSSRTPHST RCRKEDAQPG HHGNGAASVT AQARGQRSVL QVPLPVPRSC LFSESFVVSV SSQSRFLASV PGTGVQRSTA A DMAASTAA GKQRIPKVAK VKNKAPAEVQ ITAEQLLREA KERELELLPP PPQQKITDEE ELNDYKLRKR KTFEDNIRKN RT VISNWIK YAQWEESLKE IQRARSIYER ALDVDYRNIT LWLKYAEMEM KNRQVNHARN IWDRAITTLP RVNQFWYKYT YME EMLGNV AGARQVFERW MEWQPEEQAW HSYINFELRY KEVDRARTIY ERFVLVHPDV KNWIKYARFE EKHAYFAHAR KVYE RAVEF FGDEHMDEHL YVAFAKFEEN QKEFERVRVI YKYALDRISK QDAQELFKNY TIFEKKFGDR RGIEDIIVSK RRFQY EEEV KANPHNYDAW FDYLRLVESD AEAEAVREVY ERAIANVPPI QEKRHWKRYI YLWINYALYE ELEAKDPERT RQVYQA SLE LIPHKKFTFA KMWILYAQFE IRQKNLSLAR RALGTSIGKC PKNKLFKVYI ELELQLREFD RCRKLYEKFL EFGPENC TS WIKFAELETI LGDIDRARAI YELAISQPRL DMPEVLWKSY IDFEIEQEET ERTRNLYRRL LQRTQHVKVW ISFAQFEL S SGKEGSLTKC RQIYEEANKT MRNCEEKEER LMLLESWRSF EEEFGTASDK ERVDKLMPEK VKKRRKVQTD DGSDAGWEE YFDYIFPEDA ANQPNLKLLA MAKLWKKQQQ EKEDAEHHPD EDVDESES

+
分子 #25: Pre-mRNA-splicing factor SYF1

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SYF1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 100.148711 KDa
配列文字列: MVVMARLSRP ERPDLVFEEE DLPYEEEIMR NQFSVKCWLR YIEFKQGAPK PRLNQLYERA LKLLPCSYKL WYRYLKARRA QVKHRCVTD PAYEDVNNCH ERAFVFMHKM PRLWLDYCQF LMDQGRVTHT RRTFDRALRA LPITQHSRIW PLYLRFLRSH P LPETAVRG ...文字列:
MVVMARLSRP ERPDLVFEEE DLPYEEEIMR NQFSVKCWLR YIEFKQGAPK PRLNQLYERA LKLLPCSYKL WYRYLKARRA QVKHRCVTD PAYEDVNNCH ERAFVFMHKM PRLWLDYCQF LMDQGRVTHT RRTFDRALRA LPITQHSRIW PLYLRFLRSH P LPETAVRG YRRFLKLSPE SAEEYIEYLK SSDRLDEAAQ RLATVVNDER FVSKAGKSNY QLWHELCDLI SQNPDKVQSL NV DAIIRGG LTRFTDQLGK LWCSLADYYI RSGHFEKARD VYEEAIRTVM TVRDFTQVFD SYAQFEESMI AAKMETASEL GRE EEDDVD LELRLARFEQ LISRRPLLLN SVLLRQNPHH VHEWHKRVAL HQGRPREIIN TYTEAVQTVD PFKATGKPHT LWVA FAKFY EDNGQLDDAR VILEKATKVN FKQVDDLASV WCQCGELELR HENYDEALRL LRKATALPAR RAEYFDGSEP VQNRV YKSL KVWSMLADLE ESLGTFQSTK AVYDRILDLR IATPQIVINY AMFLEEHKYF EESFKAYERG ISLFKWPNVS DIWSTY LTK FIARYGGRKL ERARDLFEQA LDGCPPKYAK TLYLLYAQLE EEWGLARHAM AVYERATRAV EPAQQYDMFN IYIKRAA EI YGVTHTRGIY QKAIEVLSDE HAREMCLRFA DMECKLGEID RARAIYSFCS QICDPRTTGA FWQTWKDFEV RHGNEDTI K EMLRIRRSVQ ATYNTQVNFM ASQMLKVSGS ATGTVSDLAP GQSGMDDMKL LEQRAEQLAA EAERDQPLRA QSKILFVRS DASREELAEL AQQVNPEEIQ LGEDEDEDEM DLEPNEVRLE QQSVPAAVFG SLKED

+
分子 #26: Intron-binding protein aquarius

分子名称: Intron-binding protein aquarius / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 171.502453 KDa
配列文字列: MAAPAQPKKI VAPTVSQINA EFVTQLACKY WAPHIKKKSP FDIKVIEDIY EKEIVKSRFA IRKIMLLEFS QYLENYLWMN YSPEVSSKA YLMSICCMVN EKFRENVPAW EIFKKKPDHF PFFFKHILKA ALAETDGEFS LHEQTVLLLF LDHCFNSLEV D LIRSQVQQ ...文字列:
MAAPAQPKKI VAPTVSQINA EFVTQLACKY WAPHIKKKSP FDIKVIEDIY EKEIVKSRFA IRKIMLLEFS QYLENYLWMN YSPEVSSKA YLMSICCMVN EKFRENVPAW EIFKKKPDHF PFFFKHILKA ALAETDGEFS LHEQTVLLLF LDHCFNSLEV D LIRSQVQQ LISLPMWMGL QLARLELELK KTPKLRKFWN LIKKNDEKMD PEAREQAYQE RRFLSQLIQK FISVLKSVPL SE PVTMDKV HYCERFIELM IDLEALLPTR RWFNTILDDS HLLVHCYLSN LVRREEDGHL FSQLLDMLKF YTGFEINDQT GNA LTENEM TTIHYDRITS LQRAAFAHFP ELYDFALSNV AEVDTRESLV KFFGPLSSNT LHQVASYLCL LPTLPKNEDT TFDK EFLLE LLVSRHERRI SQIQQLNQMP LYPTEKIIWD ENIVPTEYYS GEGCLALPKL NLQFLTLHDY LLRNFNLFRL ESTYE IRQD IEDSVSRMKP WQSEYGGVVF GGWARMAQPI VAFTVVEVAK PNIGENWPTR VRADVTINLN VRDHIKDEWE GLRKHD VCF LITVRPTKPY GTKFDRRRPF IEQVGLVYVR GCEIQGMLDD KGRVIEDGPE PRPNLRGESR TFRVFLDPNQ YQQDMTN TI QNGAEDVYET FNIIMRRKPK ENNFKAVLET IRNLMNTDCV VPDWLHDIIL GYGDPSSAHY SKMPNQIATL DFNDTFLS I EHLKASFPGH NVKVTVEDPA LQIPPFRITF PVRSGKGKKR KDADVEDEDT EEAKTLIVEP HVIPNRGPYP YNQPKRNTI QFTHTQIEAI RAGMQPGLTM VVGPPGTGKT DVAVQIISNI YHNFPEQRTL IVTHSNQALN QLFEKIMALD IDERHLLRLG HGEEELETE KDFSRYGRVN YVLARRIELL EEVKRLQKSL GVPGDASYTC ETAGYFFLYQ VMSRWEEYIS KVKNKGSTLP D VTEVSTFF PFHEYFANAP QPIFKGRSYE EDMEIAEGCF RHIKKIFTQL EEFRASELLR SGLDRSKYLL VKEAKIIAMT CT HAALKRH DLVKLGFKYD NILMEEAAQI LEIETFIPLL LQNPQDGFSR LKRWIMIGDH HQLPPVIKNM AFQKYSNMEQ SLF TRFVRV GVPTVDLDAQ GRARASLCNL YNWRYKNLGN LPHVQLLPEF STANAGLLYD FQLINVEDFQ GVGESEPNPY FYQN LGEAE YVVALFMYMC LLGYPADKIS ILTTYNGQKH LIRDIINRRC GNNPLIGRPN KVTTVDRFQG QQNDYILLSL VRTRA VGHL RDVRRLVVAM SRARLGLYIF ARVSLFQNCF ELTPAFSQLT ARPLHLHIIP TEPFPTTRKN GERPSHEVQI IKNMPQ MAN FVYNMYMHLI QTTHHYHQTL LQLPPAMVEE GEEVQNQETE LETEEEAMTV QADIIPSPTD TSCRQETPAF QTDTTPS ET GATSTPEAIP ALSETTPTVV GAVSAPAEAN TPQDATSAPE ETK

+
分子 #27: ATP-dependent RNA helicase DHX8

分子名称: ATP-dependent RNA helicase DHX8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 139.522312 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: MAVAVAMAGA LIGSEPGPAE ELAKLEYLSL VSKVCTELDN HLGINDKDLA EFVISLAEKN TTFDTFKASL VKNGAEFTDS LISNLLRLI QTMRPPAKPS TSKDPVVKPK TEKEKLKELF PVLCQPDNPS VRTMLDEDDV KVAVDVLKEL EALMPSAAGQ E KQRDAEHR ...文字列:
MAVAVAMAGA LIGSEPGPAE ELAKLEYLSL VSKVCTELDN HLGINDKDLA EFVISLAEKN TTFDTFKASL VKNGAEFTDS LISNLLRLI QTMRPPAKPS TSKDPVVKPK TEKEKLKELF PVLCQPDNPS VRTMLDEDDV KVAVDVLKEL EALMPSAAGQ E KQRDAEHR DRTKKKKRSR SRDRNRDRDR DRERNRDRDH KRRHRSRSRS RSRTRERNKV KSRYRSRSRS QSPPKDRKDR DK YGERNLD RWRDKHVDRP PPEEPTIGDI YNGKVTSIMQ FGCFVQLEGL RKRWEGLVHI SELRREGRVA NVADVVSKGQ RVK VKVLSF TGTKTSLSMK DVDQETGEDL NPNRRRNLVG ETNEETSMRN PDRPTHLSLV SAPEVEDDSL ERKRLTRISD PEKW EIKQM IAANVLSKEE FPDFDEETGI LPKVDDEEDE DLEIELVEEE PPFLRGHTKQ SMDMSPIKIV KNPDGSLSQA AMMQS ALAK ERRELKQAQR EAEMDSIPMG LNKHWVDPLP DAEGRQIAAN MRGIGMMPND IPEWKKHAFG GNKASYGKKT QMSILE QRE SLPIYKLKEQ LVQAVHDNQI LIVIGETGSG KTTQITQYLA EAGYTSRGKI GCTQPRRVAA MSVAKRVSEE FGCCLGQ EV GYTIRFEDCT SPETVIKYMT DGMLLRECLI DPDLTQYAII MLDEAHERTI HTDVLFGLLK KTVQKRQDMK LIVTSATL D AVKFSQYFYE APIFTIPGRT YPVEILYTKE PETDYLDASL ITVMQIHLTE PPGDILVFLT GQEEIDTACE ILYERMKSL GPDVPELIIL PVYSALPSEM QTRIFDPAPP GSRKVVIATN IAETSLTIDG IYYVVDPGFV KQKVYNSKTG IDQLVVTPIS QAQAKQRAG RAGRTGPGKC YRLYTERAYR DEMLTTNVPE IQRTNLASTV LSLKAMGIND LLSFDFMDAP PMETLITAME Q LYTLGALD DEGLLTRLGR RMAEFPLEPM LCKMLIMSVH LGCSEEMLTI VSMLSVQNVF YRPKDKQALA DQKKAKFHQT EG DHLTLLA VYNSWKNNKF SNPWCYENFI QARSLRRAQD IRKQMLGIMD RHKLDVVSCG KSTVRVQKAI CSGFFRNAAK KDP QEGYRT LIDQQVVYIH PSSALFNRQP EWVVYHELVL TTKEYMREVT TIDPRWLVEF APAFFKVSDP TKLSKQKKQQ RLEP LYNRY EEPNAWRISR AFRRR

+
分子 #28: U2 small nuclear ribonucleoprotein A'

分子名称: U2 small nuclear ribonucleoprotein A' / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 18.69773 KDa
配列文字列:
VKLTAELIEQ AAQYTNAVRD RELDLRGYKI PVIENLGATL DQFDAIDFSD NEIRKLDGFP LLRRLKTLLV NNNRICRIGE GLDQALPCL TELILTNNSL VELGDLDPLA SLKSLTYLSI LRNPVTNKKH YRLYVIYKVP QVRVLDFQKV KLKERQEAEK M FK

+
分子 #29: U2 small nuclear ribonucleoprotein B''

分子名称: U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 10.688563 KDa
配列文字列:
IRPNHTIYIN NMNDKIKKEE LKRSLYALFS QFGHVVDIVA LKTMKMRGQA FVIFKELGSS TNALRQLQGF PFYGKPMRIQ YAKTDSDII SKM

+
分子 #30: NF-kappa-B-activating protein

分子名称: NF-kappa-B-activating protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 3.321766 KDa
配列文字列:
KRIPRRGEIG LTSEEIASFE CSGYVMSGSR

+
分子 #31: Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B'

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B'
タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 9.551284 KDa
配列文字列:
SSKMLQHIDY RMRCILQDGR IFIGTFKAFD KHMNLILCDC DEFRKIKPKN SKQAEREEKR VLGLVLLRGE NLVSMTVEGP PP

+
分子 #32: Pre-mRNA-splicing factor SLU7

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 68.510844 KDa
配列文字列: MSATVVDAVN AAPLSGSKEM SLEEPKKMTR EDWRKKKELE EQRKLGNAPA EVDEEGKDIN PHIPQYISSV PWYIDPSKRP TLKHQRPQP EKQKQFSSSG EWYKRGVKEN SIITKYRKGA CENCGAMTHK KKDCFERPRR VGAKFTGTNI APDEHVQPQL M FDYDGKRD ...文字列:
MSATVVDAVN AAPLSGSKEM SLEEPKKMTR EDWRKKKELE EQRKLGNAPA EVDEEGKDIN PHIPQYISSV PWYIDPSKRP TLKHQRPQP EKQKQFSSSG EWYKRGVKEN SIITKYRKGA CENCGAMTHK KKDCFERPRR VGAKFTGTNI APDEHVQPQL M FDYDGKRD RWNGYNPEEH MKIVEEYAKV DLAKRTLKAQ KLQEELASGK LVEQANSPKH QWGEEEPNSQ MEKDHNSEDE DE DKYADDI DMPGQNFDSK RRITVRNLRI REDIAKYLRN LDPNSAYYDP KTRAMRENPY ANAGKNPDEV SYAGDNFVRY TGD TISMAQ TQLFAWEAYD KGSEVHLQAD PTKLELLYKS FKVKKEDFKE QQKESILEKY GGQEHLDAPP AELLLAQTED YVEY SRHGT VIKGQERAVA CSKYEEDVKI HNHTHIWGSY WKEGRWGYKC CHSFFKYSYC TGEAGKEIVN SEECIINEIT GEESV KKPQ TLMELHQEKL KEEKKKKKKK KKKHRKSSSD SDDEEKKHEK LKKALNAEEA RLLHVKETMQ IDERKRPYNS MYETRE PTE EEMEAYRMKR QRPDDPMASF LGQ

+
分子 #33: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 9.460979 KDa
配列文字列:
SIGVPIKVLH EAEGHIVTCE TNTGEVYRGK LIEAEDNMNC QMSNITVTYR DGRVAQLEQV YIRGSKIRFL ILPDMLKNAP MLKS

+
分子 #34: Small nuclear ribonucleoprotein E

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 9.582185 KDa
配列文字列:
QKVMVQPINL IFRYLQNRSR IQVWLYEQVN MRIEGCIIGF DEYMNLVLDD AEEIHSKTKS RKQLGRIMLK GDNITLLQSV S

+
分子 #35: Small nuclear ribonucleoprotein F

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein F / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 8.038415 KDa
配列文字列:
PLNPKPFLNG LTGKPVMVKL KWGMEYKGYL VSVDGYMNMQ LANTEEYIDG ALSGHLGEVL IRCNNVLYIR GV

+
分子 #36: Small nuclear ribonucleoprotein G

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein G / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 8.160629 KDa
配列文字列:
AHPPELKKFM DKKLSLKLNG GRHVQGILRG FDPFMNLVID ECVEMATSGQ QNNIGMVVIR GNSIIMLEAL ERV

+
分子 #37: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 9.086731 KDa
配列文字列:
MKLVRFLMKL SHETVTIELK NGTQVHGTIT GVDVSMNTHL KAVKMTLKNR EPVQLETLSI RGNNIRYFIL PDSLPLDTLL

+
分子 #38: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1

分子名称: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: プロリルイソメラーゼ
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 18.055529 KDa
配列文字列:
AIPPDSWQPP NVYLETSMGI IVLELYWKHA PKTCKNFAEL ARRGYYNGTK FHRIIKDFMI QGGDPTGTGR GGASIYGKQF EDELHPDLK FTGAGILAMA NAGPDTNGSQ FFVTLAPTQW LDGKHTIFGR VCQGIGMVNR VGMVETNSQD RPVDDVKIIK A YPSG

+
分子 #39: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 13.551928 KDa
配列文字列:
MSLLNKPKSE MTPEELQKRE EEEFNTGPLS VLTQSVKNNT QVLINCRNNK KLLGRVKAFD RHCNMVLENV KEMWTEVPKS GKGKKKSKP VNKDRYISKM FLRGDSVIVV LRNPLIAGK

+
分子 #40: Pre-mRNA-processing factor 17

分子名称: Pre-mRNA-processing factor 17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 59.116055 KDa
配列文字列: ETGVHLDPAV KEVQYNPTYE TMFAPEFGPE NPFRTQQMAA PRNMLSGYAE PAHINDFMFE QQRRTFATYG YALDPSLDNH QVSAKYIGS VEEAEKNQGL TVFETGQKKT EKRKKFKEND ASNIDGFLGP WAKYVDEKDV AKPSEEEQKE LDEITAKRQK K GKQEEEKP ...文字列:
ETGVHLDPAV KEVQYNPTYE TMFAPEFGPE NPFRTQQMAA PRNMLSGYAE PAHINDFMFE QQRRTFATYG YALDPSLDNH QVSAKYIGS VEEAEKNQGL TVFETGQKKT EKRKKFKEND ASNIDGFLGP WAKYVDEKDV AKPSEEEQKE LDEITAKRQK K GKQEEEKP GEEKTILHVK EMYDYQGRSY LHIPQDVGVN LRSTMPPEKC YLPKKQIHVW SGHTKGVSAV RLFPLSGHLL LS CSMDCKI KLWEVYGERR CLRTFIGHSK AVRDICFNTA GTQFLSAAYD RYLKLWDTET GQCISRFTNR KVPYCVKFNP DED KQNLFV AGMSDKKIVQ WDIRSGEIVQ EYDRHLGAVN TIVFVDENRR FVSTSDDKSL RVWEWDIPVD FKYIAEPSMH SMPA VTLSP NGKWLACQSM DNQILIFGAQ NRFRLNKKKI FKGHMVAGYA CQVDFSPDMS YVISGDGNGK LNIWDWKTTK LYSRF KAHD KVCIGAVWHP HETSKVITCG WDGLIKLWD

+
分子 #41: Pre-mRNA-splicing factor SPF27

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 26.16342 KDa
配列文字列: MAGTGLVAGE VVVDALPYFD QGYEAPGVRE AAAALVEEET RRYRPTKNYL SYLTAPDYSA FETDIMRNEF ERLAARQPIE LLSMKRYEL PAPSSGQKND ITAWQECVNN SMAQLEHQAV RIENLELMSQ HGCNAWKVYN ENLVHMIEHA QKELQKLRKH I QDLNWQRK ...文字列:
MAGTGLVAGE VVVDALPYFD QGYEAPGVRE AAAALVEEET RRYRPTKNYL SYLTAPDYSA FETDIMRNEF ERLAARQPIE LLSMKRYEL PAPSSGQKND ITAWQECVNN SMAQLEHQAV RIENLELMSQ HGCNAWKVYN ENLVHMIEHA QKELQKLRKH I QDLNWQRK NMQLTAGSKL REMESNWVSL VSKNYEIERT IVQLENEIYQ IKQQHGEANK ENIRQDF

+
分子 #42: Pre-mRNA-processing factor 19

分子名称: Pre-mRNA-processing factor 19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO / EC番号: RING-type E3 ubiquitin transferase
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 55.245547 KDa
配列文字列: MSLICSISNE VPEHPCVSPV SNHVYERRLI EKYIAENGTD PINNQPLSEE QLIDIKVAHP IRPKPPSATS IPAILKALQD EWDAVMLHS FTLRQQLQTT RQELSHALYQ HDAACRVIAR LTKEVTAARE ALATLKPQAG LIVPQAVPSS QPSVVGAGEP M DLGELVGM ...文字列:
MSLICSISNE VPEHPCVSPV SNHVYERRLI EKYIAENGTD PINNQPLSEE QLIDIKVAHP IRPKPPSATS IPAILKALQD EWDAVMLHS FTLRQQLQTT RQELSHALYQ HDAACRVIAR LTKEVTAARE ALATLKPQAG LIVPQAVPSS QPSVVGAGEP M DLGELVGM TPEIIQKLQD KATVLTTERK KRGKTVPEEL VKPEELSKYR QVASHVGLHS ASIPGILALD LCPSDTNKIL TG GADKNVV VFDKSSEQIL ATLKGHTKKV TSVVFHPSQD LVFSASPDAT IRIWSVPNAS CVQVVRAHES AVTGLSLHAT GDY LLSSSD DQYWAFSDIQ TGRVLTKVTD ETSGCSLTCA QFHPDGLIFG TGTMDSQIKI WDLKERTNVA NFPGHSGPIT SIAF SENGY YLATAADDSS VKLWDLRKLK NFKTLQLDNN FEVKSLIFDQ SGTYLALGGT DVQIYICKQW TEILHFTEHS GLTTG VAFG HHAKFIASTG MDRSLKFYSL

+
分子 #43: Pre-mRNA-splicing factor SYF2

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SYF2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 17.302371 KDa
配列文字列:
LLEISAEDAE RWERKKKRKN PDLGFSDYAA AQLRQYHRLT KQIKPDMETY ERLREKHGEE FFPTSNSLLH GTHVPSTEEI DRMVIDLEK QIEKRDKYSR RRPYNDDADI DYINERNAKF NKKAERFYGK YTAEIKQNLE RGTAV

+
分子 #44: Replication stress response regulator SDE2

分子名称: Replication stress response regulator SDE2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 4.036538 KDa
配列文字列:
EKTTNREACR DLSGRRLRDV NHEKAMAEWV KQQA

+
分子 #45: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 7 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #46: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 1 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #47: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 1 / 式: ATP
分子量理論値: 507.181 Da
Chemical component information

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン三リン酸

+
分子 #48: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 1 / 式: GTP
分子量理論値: 523.18 Da
Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM / グアノシン三リン酸

+
分子 #49: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 7 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #50: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE

分子名称: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 1 / 式: IHP
分子量理論値: 660.035 Da
Chemical component information

ChemComp-IHP:
INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE / フィチン酸 / フィチン酸

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.3 mg/mL
緩衝液pH: 7.9
構成要素:
濃度名称式
20.0 mMHEPES
100.0 mMKCl
0.2 mMEDTAエチレンジアミン四酢酸
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 7.0 nm / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 雰囲気: AIR
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK III
詳細: 3 uL sample was applied to the grid, left for 25s, then blotted for 2.5-3.5s and immediately plunged into liquid ethane..

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 倍率（公称値）: 135000
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-40 / 撮影したグリッド数: 2 / 実像数: 6200 / 平均露光時間: 10.0 sec. / 平均電子線量: 53.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0) / 使用した粒子像数: 103860
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

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お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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