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- EMDB-4093: Entire ovine respiratory complex I, Combined Map -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4093
タイトルEntire ovine respiratory complex I, Combined Map
マップデータ
試料
  • 複合体: Mitochondrial complex INADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
    • タンパク質・ペプチド: x 44種
  • リガンド: x 10種
機能・相同性
機能・相同性情報


Complex I biogenesis / Respiratory electron transport / mitochondrial respirasome / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / electron transport coupled proton transport / mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport / NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型) / mitochondrial respiratory chain complex I ...Complex I biogenesis / Respiratory electron transport / mitochondrial respirasome / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / electron transport coupled proton transport / mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport / NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型) / mitochondrial respiratory chain complex I / apoptotic mitochondrial changes / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / 電子伝達系 / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / respirasome / 細胞呼吸 / ATP metabolic process / reactive oxygen species metabolic process / respiratory electron transport chain / regulation of mitochondrial membrane potential / apoptotic signaling pathway / ミトコンドリア / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / negative regulation of cell growth / 概日リズム / fatty acid biosynthetic process / NAD binding / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / ミトコンドリア内膜 / membrane => GO:0016020 / oxidoreductase activity / ミトコンドリアマトリックス / negative regulation of DNA-templated transcription / protein-containing complex binding / ミトコンドリア / 核質 / metal ion binding / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Complex1_LYR-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial ...Complex1_LYR-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / Soluble ligand binding domain / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a (Complex I-B14.5a) / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex subunit 3 / SLBB domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, NDUC2 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NDUFB4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit b14.5b (NDUFC2) / NADH-ubiquinone oxidoreductase B15 subunit (NDUFB4) / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB6/B17 subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase chain 4, N-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus / NADH dehydrogenase subunit 2 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / GRIM-19 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NDUFA6, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NDUFB9, LYR domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / Deoxynucleoside kinase domain / デオキシヌクレオシドキナーゼ / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2. / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH dehydrogenase, subunit C / NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit / Complex 1 LYR protein domain / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / Complex 1 protein (LYR family) / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1. / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus
類似検索 - ドメイン・相同性
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial ...NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / Complex I-PDSW / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Ovis aries (ヒツジ) / Sheep (ヒツジ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.9 Å
データ登録者Fiedorczuk K / Letts JA / Sazanov LA
資金援助 英国, 1件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_U105674180 英国
引用ジャーナル: Nature / 年: 2016
タイトル: Atomic structure of the entire mammalian mitochondrial complex I.
著者: Karol Fiedorczuk / James A Letts / Gianluca Degliesposti / Karol Kaszuba / Mark Skehel / Leonid A Sazanov /
要旨: Mitochondrial complex I (also known as NADH:ubiquinone oxidoreductase) contributes to cellular energy production by transferring electrons from NADH to ubiquinone coupled to proton translocation ...Mitochondrial complex I (also known as NADH:ubiquinone oxidoreductase) contributes to cellular energy production by transferring electrons from NADH to ubiquinone coupled to proton translocation across the membrane. It is the largest protein assembly of the respiratory chain with a total mass of 970 kilodaltons. Here we present a nearly complete atomic structure of ovine (Ovis aries) mitochondrial complex I at 3.9 Å resolution, solved by cryo-electron microscopy with cross-linking and mass-spectrometry mapping experiments. All 14 conserved core subunits and 31 mitochondria-specific supernumerary subunits are resolved within the L-shaped molecule. The hydrophilic matrix arm comprises flavin mononucleotide and 8 iron-sulfur clusters involved in electron transfer, and the membrane arm contains 78 transmembrane helices, mostly contributed by antiporter-like subunits involved in proton translocation. Supernumerary subunits form an interlinked, stabilizing shell around the conserved core. Tightly bound lipids (including cardiolipins) further stabilize interactions between the hydrophobic subunits. Subunits with possible regulatory roles contain additional cofactors, NADPH and two phosphopantetheine molecules, which are shown to be involved in inter-subunit interactions. We observe two different conformations of the complex, which may be related to the conformationally driven coupling mechanism and to the active-deactive transition of the enzyme. Our structure provides insight into the mechanism, assembly, maturation and dysfunction of mitochondrial complex I, and allows detailed molecular analysis of disease-causing mutations.
履歴
登録2016年10月28日-
ヘッダ(付随情報) 公開2016年11月23日-
マップ公開2016年11月23日-
更新2021年6月2日-
現状2021年6月2日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.15
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-5lnk
  • 表面レベル: 0.15
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4093.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4093.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 14.5 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.39 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.15 / ムービー #1: 0.15
最小 - 最大-0.5494037 - 1.3139707
平均 (標準偏差)0.0089633055 (±0.05093917)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ141209129
Spacing129141209
セルA: 179.31 Å / B: 195.99 Å / C: 290.51 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.391.391.39
M x/y/z129141209
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z179.310195.990290.510
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ129141209
MAP C/R/S321
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS209141129
D min/max/mean-0.5491.3140.009

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Mitochondrial complex I

全体名称: Mitochondrial complex INADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
要素
  • 複合体: Mitochondrial complex INADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 51 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 75 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 30 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, PSST subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, TYKY subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ND1 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ND2 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ND3 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ND4 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ND4L subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ND5 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ND6 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 18 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 39 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B8 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B13 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B14 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B14.5a subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B17.2 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 42 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 15 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B9 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B12 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B14.5b subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B15 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B16.6 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B17 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B18 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B22 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, AGGG subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ESSS subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, KFYI subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, MNLL subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, MWFE subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, PDSW subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, PGIV subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, SGDH subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B14.7 subunit
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER鉄・硫黄クラスター
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDEフラビンモノヌクレオチド
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
  • リガンド: 4'-PHOSPHOPANTETHEINEPhosphopantetheine

+
超分子 #1: Mitochondrial complex I

超分子名称: Mitochondrial complex I / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#44
由来(天然)生物種: Ovis aries (ヒツジ)
分子量実験値: 970 KDa

+
分子 #1: Mitochondrial complex I, 51 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 51 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 48.678281 KDa
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+
分子 #2: Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 23.840428 KDa
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+
分子 #3: Mitochondrial complex I, 75 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 75 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 77.031156 KDa
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TATAASNLIE VFVDGQSVMV EPGTTVLQAC EKVGMQIPRF CYHERLSVAG NCRMCLVEIE KAPKVVAACA MPVMKGWNIL TNSEKTKKA REGVMEFLLA NHPLDCPICD QGGECDLQDQ SMMFGSDRSR FLEGKRAVED KNIGPLVKTI MTRCIQCTRC I RFASEIAG VDDLGTTGRG NDMQVGTYIE KMFMSELSGN IIDICPVGAL TSKPYAFTAR PWETRKTESI DVMDAVGSNI VV STRTGEV MRILPRMHED INEEWISDKT RFAYDGLKRQ RLTEPMVRNE KGLLTHTTWE DALSRVAGML QSCQGNDVAA IAG GLVDAE ALIALKDLLN RVDSDTLCTE EVFPTAGAGT DLRSNYLLNT TIAGVEEADV VLLVGTNPRF EAPLFNARIR KSWL HNDLK VALIGSPVDL TYRYDHLGDS PKILQDIASG SHPFSQVLQE AKKPMVVLGS SALQRNDGAA ILAAVSNIAQ KIRTS SGVT GDWKVMNILH RIASQVAALD LGYKPGVEAI RKNPPKMLFL LGADGGCVTR QDLPKDCFIV YQGHHGDVGA PIADVI LPG AAYTEKSATY VNTEGRAQQT KVAVMPPGLA REDWKIIRAL SEIAGMTLPY DTLDQVRNRL EEVSPNLVRY DDVEGAN YF QQASELSKLV NQQLLADPLV PPQLTIKDFY MTDSISRASQ TMAKCVKAVT EGAHAVEEPS IC

+
分子 #4: Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 47.120078 KDa
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MYPTKETAHW KPPPWNDVDP PKDTLVSNLT LNFGPQHPAA HGVLRLVMEL SGEMVRKCDP HIGLLHRGTE KLIEYKTYLQ ALPYFDRLD YVSMMCNEQA YSLAVEKLLN IQPPPRAQWI RVLFGEITRL LNHIMAVTTH ALDIGAMTPF FWMFEEREKM F EFYERVSG ARMHAAYVRP GGVHQDLPLG LMDDIYEFSK NFSLRIDELE EMLTNNRIWR NRTVDIGVVT AEDALNYGFS GV MLRGSGI QWDLRKTQPY DVYDQVEFDV PIGSRGDCYD RYLCRVEEMR QSIRIISQCL NKMPPGEIKV DDAKVSPPKR AEM KTSMES LIHHFKLYTE GYQVPPGATY TAIEAPKGEF GVYLVSDGSS RPYRCKIKAP GFAHLAGLDK MSKGHMLADV VAII GTQDI VFGEVDR

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分子 #5: Mitochondrial complex I, 30 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 30 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 26.441793 KDa
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分子 #6: Mitochondrial complex I, PSST subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, PSST subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / 詳細: NCBIProt XP_012033846.2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 20.104531 KDa
配列文字列:
PSSTQPAVSQ ARAVVPKPAA LPSSRGEYVV AKLDDLINWA RRSSLWPMTF GLACCAVEMM HMAAPRYDMD RFGVVFRASP RQSDVMIVA GTLTNKMAPA LRKVYDQMPE PRYVVSMGSC ANGGGYYHYS YSVVRGCDRI VPVDIYVPGC PPTAEALLYG I LQLQKKIK REKRLRIWYR R

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分子 #7: Mitochondrial complex I, TYKY subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, TYKY subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / 詳細: NCBIprot XP_011972879.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 20.219947 KDa
配列文字列:
TYKYVNLREP SMDMKSVTDR AAQTLLWTEL IRGLGMTLSY LFREPATINY PFEKGPLSPR FRGEHALRRY PSGEERCIAC KLCEAVCPA QAITIEAEPR ADGSRRTTRY DIDMTKCIYC GFCQEACPVD AIVEGPNFEF STETHEELLY NKEKLLNNGD K WEAEIAAN IQADYLYR

+
分子 #8: Mitochondrial complex I, ND1 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ND1 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 35.884902 KDa
配列文字列: MFMINVLTLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQFRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSISM FILAPILALT LALTMWIPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLMNGS F TLSTLIIT ...文字列:
MFMINVLTLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQFRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSISM FILAPILALT LALTMWIPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLMNGS F TLSTLIIT QEQVWLIFPA WPLAMMWFIS TLAETNRAPF DLTEGESELV SGFNVEYAAG PFALFFMAEY ANIIMMNIFT TT LFLGAFH NPYMPELYTI NFTIKSLLLS ITFLWIRASY PRFRYDQLMH LLWKNFLPLT LALCMWHVSL PILLSSIPPQ T

+
分子 #9: Mitochondrial complex I, ND2 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ND2 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 39.149805 KDa
配列文字列: MNPIILIIIL MTVMLGTIIV MISTHWLLIW IGFEMNMLAI IPIMMKKHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAIIINLMF SGQWTVMKL FNPMASMLMT MALAMKLGMA PFHFWVPEVT QGIPLSSGLI LLTWQKLAPM SVLYQILPSI NLDLILTLSI L SITIGGWG ...文字列:
MNPIILIIIL MTVMLGTIIV MISTHWLLIW IGFEMNMLAI IPIMMKKHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAIIINLMF SGQWTVMKL FNPMASMLMT MALAMKLGMA PFHFWVPEVT QGIPLSSGLI LLTWQKLAPM SVLYQILPSI NLDLILTLSI L SITIGGWG GLNQTQLRKI MAYSSIAHMG WMTAVLLYNP TMTLLNLIIY IIMTSTMFTL FMANSTTTTL SLSHTWNKAP IM TILVLIT LLSMGGLPPL SGFMPKWMII QEMTKNDSII LPTLMAITAL LNLYFYMRLT YSTALTMFPS TNNMKMKWQF PTT KRMTLL PTMTVLSTML LPLTPILSIL E

+
分子 #10: Mitochondrial complex I, ND3 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ND3 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 13.10652 KDa
配列文字列:
MNLMITLLTN FTLATLLVTI AFWLPQLNVY SEKTSPYECG FDPMGSARLP FSMKFFLVAI TFLLFDLEIA LLLPLPWASQ TTNLNTMLT MALLLIFLLA VSLAYEWTQK GLEWTE

+
分子 #11: Mitochondrial complex I, ND4 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ND4 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 52.058734 KDa
配列文字列: MLKYIIPTMM LMPLTWLSKN SMIWINTTLH SLLISLTSLL LLNQFGDNSL NFSLTFFSDS LSTPLLILTM WLLPLMLMAS QHHLSKENL ARKKLFISML ILLQLFLIMT FTATELIFFY IMFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAGSLP L LVALIYIQ ...文字列:
MLKYIIPTMM LMPLTWLSKN SMIWINTTLH SLLISLTSLL LLNQFGDNSL NFSLTFFSDS LSTPLLILTM WLLPLMLMAS QHHLSKENL ARKKLFISML ILLQLFLIMT FTATELIFFY IMFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAGSLP L LVALIYIQ NTMGSLNFLI LQYWVQPMPN SWSNTFMWLA CMMAFMVKMP LYGLHLWLPK AHVEAPIAGS MVLAAILLKL GG YGMMRIT LLLNPITDFM AYPFIMLSLW GMIMTSSICL RQTDLKSLIA YSSVSHMALV IVAILIQTPW SYMGATALMI AHG LTSSML FCLANSNYER VHSRTMILAR GLQTLLPLMA AWWLLASLTN LALPPSINLI GELFVVMSTF SWSNITIILM GLNM VITAL YSLYMLITTQ RGKHTHHINN ILPSFTRENA LMSLHMLPLL LLSLNPKIIL GPLY

+
分子 #12: Mitochondrial complex I, ND4L subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ND4L subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 10.840228 KDa
配列文字列:
MSLVYMNIMM AFTVSLTGLL MYRSHLMSSL LCLEGMMLSL FILATLMILN SHFTLASMMP IILLVFAACE AALGLSLLVM VSNTYGTDY VQNLNLLQC

+
分子 #13: Mitochondrial complex I, ND5 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ND5 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 67.554945 KDa
配列文字列: MNLFSSLTLV TLILLTMPIA AINFNTHKFT NYPLYVKTTI SCAFITSMIP TMMFIHTGQE MIISNWHWLT IQTLKLSLSF KMDFFSMMF VPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPNINQFFK YLLLFLITML ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIGWWY G RTDANTAA ...文字列:
MNLFSSLTLV TLILLTMPIA AINFNTHKFT NYPLYVKTTI SCAFITSMIP TMMFIHTGQE MIISNWHWLT IQTLKLSLSF KMDFFSMMF VPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPNINQFFK YLLLFLITML ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIGWWY G RTDANTAA LQAILYNRIG DIGFILAMAW FLINLNTWDL QQIFMLNPND SNLPLMGLIL AATGKSAQFG LHPWLPSAME GP TPVSALL HSSTMVVAGI FLLIRFYPLT ENNKFGQSIM LCLGAMTTLF TAMCALTQND IKKIIAFSTS SQLGLMMVTI GIN QPHLAF LHICTHAFFK AMLFMCSGSI IHSLNDEQDI RKMGGLFKAM PFTTTALIIG SLALTGMPFL TGFYSKDLII ESAN TSYTN AWALLMTLVA TSFTAIYSTR IIFFALLGQP RFPTLININE NNPFLINSIK RLLIGSLFAG FIISNNIPPM TIPQM TMPH YLKMTALTVT ILGFILALEI SNTTHYLKFN YPSNTFKFSN LLGYYPTIMH RLTPYMNLTM SQKSASSLLD LIWLET ILP KTISLAQMKM STTITSQKGL IKLYFLSFLI TILIST

+
分子 #14: Mitochondrial complex I, ND6 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ND6 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 19.126619 KDa
配列文字列:
MMTYIVFILS IIFVMGFVGF SSKPSPIYGG LGLIVSGGVG CGIVLNFGGS FLGLMVFLIY LGGMMVVFGY TTAMATEQYP EVWVSNKVV LGTFITGLLM EFLMVYYVLK DKEVEIVFKF NGMGDWVIYD TGDSGFFSEE AMGIAALYSY GTWLVIVTGW S LLIGVVVI MEITRGN

+
分子 #15: Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / 詳細: NCBIprot XP_011991231.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 8.423314 KDa
配列文字列:
SAESGKNEKG LPPNPKKQSP PKKPASAAPT EPFDNTTYKN LQHHDYSTYT FLDLNLDLSK FRMPQPSSGR ESPRH

+
分子 #16: Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / 詳細: NCBIprot XP_011980592.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 10.651796 KDa
配列文字列:
GVRTSPTGEK VTHTGQVYDD EDYRRVRFVG RQKEVNENFA IDLIAEQPVS QVGSRVISCD GGGGALGHPR VYINLDKETK TGTCGYCGL QFRQQHH

+
分子 #17: Mitochondrial complex I, 18 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 18 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / 詳細: NCBIprot XP_004017046.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 15.3753 KDa
配列文字列:
AQDQTRDTQL ITVDEKLDIT TLTGVPEEHI KTRKARIFVP ARNNMQSGVN NTKKWKMEFD TRERWENPLM GWASTADPLS NLVLTFSTK EDAIAFAEKN GWSYDVEERK VPKPKSKSYG ANFSWNKRTR VSTK

+
分子 #18: Mitochondrial complex I, 39 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 39 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 38.660488 KDa
配列文字列: LHHAVIPHGK GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVNHLGR MGSQVIVPYR CEPYDTMHLR PMGDLGQIIF MDWNGRDKDS IRRAVEHSN VVINLVGREW ETKNFDFEDV FVKIPQAIAQ VSKEAGVEKF IHISHLNADI KSSSKYLRNK AVGEKEVRET F PEATIIKP ...文字列:
LHHAVIPHGK GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVNHLGR MGSQVIVPYR CEPYDTMHLR PMGDLGQIIF MDWNGRDKDS IRRAVEHSN VVINLVGREW ETKNFDFEDV FVKIPQAIAQ VSKEAGVEKF IHISHLNADI KSSSKYLRNK AVGEKEVRET F PEATIIKP ADIFGREDRF LNYFANIRWF GGVPLISLGK KTVKQPVYIV DVTKGIINAI KDPDARGKTF AFVGPNRYLL FD LVQYVFA VAHRPFLPYP MPHFAYRWIG RLFEISPFEP WTTRDKVERI HTTDRTLPHL PGLEDLGVQA TPLELKAIEV LRR HRTYRW LSSEIEDVQP AK

+
分子 #19: Mitochondrial complex I, B8 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B8 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 10.966627 KDa
配列文字列:
AAAAAIRGVR GKLGLREIRI HLCQRSPGSQ GVRDFIEKRY VELKKANPDL PILIRECSDV QPKLWARYAF GQEKNVSLNN FSADQVTRA LENVLSSKA

+
分子 #20: Mitochondrial complex I, B13 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B13 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / 詳細: NCBIprot XP_004005022.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 13.156311 KDa
配列文字列:
AGLLKKTTGL VGLAVCETPH ERLKILYTKI LDVLGHIPKN AAYRKYTEQI TNEKLSIVKA EPDVKKLEEQ LQGGQIEEVI LQAENELSL ARKMIQWKPW EPLVEEPPAS QWKWPI

+
分子 #21: Mitochondrial complex I, B14 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B14 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 14.923245 KDa
配列文字列:
AASGLRQAAV AASTSVKPIF SRDMNEAKRR VRELYRAWYR EVPNTVHLFQ LDISVKQGRD KVREMFKKNA HVTDPRVVDL LVIKGKMEL EETINVWKQR THVMRFFHET EAPRPKDFLS KFYVGHDP

+
分子 #22: Mitochondrial complex I, B14.5a subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B14.5a subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / 詳細: NCBIprot XP_004008614.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 12.399201 KDa
配列文字列:
ASATRLIQGL RNWASGRDLQ AKLQLRYQEI SKRTQPPPKL PVGPSHRLSN NYYCARDGRR EAMPPSIVMS SQKVLVAGKP AESSAVAAS EKKAVSPAPP IKRWELSQDE PYL

+
分子 #23: Mitochondrial complex I, B17.2 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B17.2 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 17.115508 KDa
配列文字列:
MELLQVLKRG LQQVSGHGGL RGYLRVLFRA NDVRVGTLVG EDKYGNKYYE DNKQFFGRHR WVIYTTEMNG KNTFWDVDGS MVPPEWHRW LHCMTDDPPT VKPPTARKFI WTNHKFNLSG TPQQYVPYST TRKKIQEWVP PSTPYK

+
分子 #24: Acyl carrier protein

分子名称: Acyl carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 10.119541 KDa
配列文字列:
SDAPPLTLEG IKDRVLYVLK LYDKIDPEKL SVNSHFMKDL GLDSLDQVEI IMAMEDEFGF EIPDIDAEKL MCPQEIVDYI ADKKDVYE

+
分子 #25: Mitochondrial complex I, 42 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 42 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 36.803762 KDa
配列文字列: LQYGPLAYIL GEKTTKKMTE NSKLITVDGN ICSGKSKLAK EVAEKLGLKH FPEAGIHYAD STTGDGKPLP VRFSGNCSLE KFYDDPKSN DGNSYRLQAW LYASRLLQYA DALEHLLSTG QGVVLERSIY SDFVFLEAMY RQGFIRKQCV DHYNQVKKVT V CEYLPPHV ...文字列:
LQYGPLAYIL GEKTTKKMTE NSKLITVDGN ICSGKSKLAK EVAEKLGLKH FPEAGIHYAD STTGDGKPLP VRFSGNCSLE KFYDDPKSN DGNSYRLQAW LYASRLLQYA DALEHLLSTG QGVVLERSIY SDFVFLEAMY RQGFIRKQCV DHYNQVKKVT V CEYLPPHV VIYVDVPVSE VQSRIQKKGN PHEMKITSAY LQDIENVYKG TFLPEMSEKC EVLQYSAWEA EDAEKVVEDI QY LKYDKGP WLDQDDRKLH NLRMLVQDKL EVLNYTSIPV FLPEVTIGAH QSDRVFQEFT ELPGRKYRAG YNEDVGDKWI WLK

+
分子 #26: Mitochondrial complex I, 15 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 15 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / 詳細: NCBIprot XP_004001873.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 12.474397 KDa
配列文字列:
PFFDVQKKLG VDLDHWMTIQ SAEQPHRIPA RCHAFEKEWI ECAHGIGSIR AEKECKIEFE DFRECLLRQK TMKRLNAIKR QRDKLIKEG KYTPPPHHSG QEDLRP

+
分子 #27: Mitochondrial complex I, B9 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B9 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 9.194655 KDa
配列文字列:
APRVAAFLKN VWAKEPVLVA SFAIAGLAVI LPTLSPYTKY SLMINRATPY NYPVPLRDDG NMPDVPSHPQ DPQGPSLEWL KRL

+
分子 #28: Mitochondrial complex I, B12 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B12 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 11.015482 KDa
配列文字列:
AHGHGHEHGP SKMELPDYKQ WKIEGTPLET VQEKLAARGL RDPWGRNEAW RYMGGFANNV SFVGALLKGF KWGFAAFVVA VGAEYYLES QKKDKKHH

+
分子 #29: Mitochondrial complex I, B14.5b subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B14.5b subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / 詳細: NCBIprot XP_004019479.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 14.23142 KDa
配列文字列:
MMTGRQARAP LQFLPDEARS LPPPKLTDPR LAYIGFLGYC SGLIDNAIRR RPVLSAGLHR QFLYITSFVF VGYYLLKRQD YMYAVRDHD MFSYIKSHPE DFPEKDKKTY REVFEEFHPV R

+
分子 #30: Mitochondrial complex I, B15 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B15 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / 詳細: NCBIprot XP_004003003.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 14.975999 KDa
配列文字列:
SFPKYEPSRL ASLPTTLDPA EYDISSETRK AQAERLAIRS RLKREYQLQY NDPSRRGVVE DPALIRWTCA RSANVYPNFR PNTKTSLLG ALFGIGPLIF WYYVFKTDRD RKEKLIQEGK LDRTFNISY

+
分子 #31: Mitochondrial complex I, B16.6 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B16.6 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / 詳細: NCBIprot XP_004008450.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 16.635264 KDa
配列文字列:
AASKVKQDMP PVGGYGPIDY KRNLPRRGLS GYSMFAVGIG ALLFGYWSMM RWNRERRRLQ IEDFEARIAL MPLLQAEKDR RVLQMLREN LEEEATIMKD VPGWKVGESV FHTTRWVTPM MGELYGLRTG EEILSSTYGF IWYT

+
分子 #32: Mitochondrial complex I, B17 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B17 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 15.433929 KDa
配列文字列:
SGYTPDEKLR LQQLRELRRR WLKDQELSPR EPVLPPRRVS PVERFWNKFL QDGALWKNVI YKTYRHSIFA FTHVLIPVWI IHYYLKYHV TTKPYTIVEK KPRIFPGDTI LETGEVIPPM KEFPDQHH

+
分子 #33: Mitochondrial complex I, B18 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B18 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 16.28261 KDa
配列文字列:
GAHLARRYLG DASVEPEPLR MPTFPPDYGF PERKEREMVA TQQEMNDAQL VLQQRDYCAH YLIRFLKCKR DSFPNFLACK HEQHDWDYC EHLDYVKRMK EFERERRLLQ RKKRREQREA DMAKGLGPGE VAPEVAL

+
分子 #34: Mitochondrial complex I, B22 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B22 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 21.648715 KDa
配列文字列:
AFLPSAAYLT HQQKVLQLYK RALRHLESRC VHRDKYRYFA CLLRARFDEH KNEKDMVKAT QLLREAEKEF WHGQHPQPYI FPESPGGTS YERYECYKVP EWCLDDWHPS EKAMYPDYFA KREQWKKLRR ESWEREVKQL QEETPVGGPR TEALPPARKQ G DLPPLWWH IVTRPRERPM

+
分子 #35: Mitochondrial complex I, AGGG subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, AGGG subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 8.500289 KDa
配列文字列:
AGGGAHIEPR YRQFPQLTRS QVIQAEFFSA TMWFWILWRF WHDSDAVLGH FPYPDPSQWT DEELGIPPDD ED

+
分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 18.81807 KDa
配列文字列:
ASHITKDMLP GPYPKTPEER AAAAKKYNMR VEDYEPYPDD GMGYGDYPKL PDRSQQERDP WYDWDHPDLR LNWGEPMHWD LDMYIRNRV DTSPTPVNWN LMCKHLFGFV AFMLFMFWVG ETYPTYQPVG PKQYPYNNLY LERGGDPNKE PEPVVHYEI

+
分子 #37: Mitochondrial complex I, ESSS subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ESSS subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 14.455033 KDa
配列文字列:
ESSSSRAVIA PSTLAGKRPS EPTLRWQEDP EPEDENLYEK NPDSHGYDKD PAVDVWNMRV VFFFGFSIVL VLGSTFVAYL PDYRMQEWA RREAERLVKY REAHGLPLME SNCFDPSKIQ LPEDED

+
分子 #38: Mitochondrial complex I, KFYI subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, KFYI subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / 詳細: NCBIprot XP_004017292.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 5.808645 KDa
配列文字列:
KFYIQEPPHG SPNWLKVGLT LGTSAFLWIY LIKQHNEDVL EYKRRNGLE

+
分子 #39: Mitochondrial complex I, MNLL subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, MNLL subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / 詳細: NCBIprot XP_004018002.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 6.930083 KDa
配列文字列:
MNLLQVVRDH WIHVLVPVGF VFGYYLDRKN DEKLAAFRNK SLLYKRELKP NEEVTWK

+
分子 #40: Mitochondrial complex I, MWFE subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, MWFE subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / 詳細: NCBIprot NP_001305903.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 8.211519 KDa
配列文字列:
MWFEVLPGIA VMGVCLFIPG MATARIHRFS NGGREKRVAH YSYQWYLMER DRRVSGVNRY YVSKGLENID

+
分子 #41: Mitochondrial complex I, PDSW subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, PDSW subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / 詳細: NCBIprot XP_011999786.1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 20.880752 KDa
配列文字列:
PDSWDKDVYP EPPRRTPAPS PQTSLPNPIT YLTKAFDLLV DRPVTLVREF IERQHAKNKY YYYHREFRRV PDITECHEKD VLCMFEAEM QWKRDYKVDQ EIVNIIQERL KACQQREGES HRQNCAKELQ QFTQVVKAYQ DRYHDLGAHY SARKCLAKQK Q RMLAERKA TKEAAAA

+
分子 #42: Mitochondrial complex I, PGIV subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, PGIV subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 20.008014 KDa
配列文字列:
PGIVELPSLE DLKVQEVKVS SSVLKAAAHH YGAQCDKPNK EFMLCRWEEK DPRRCLEEGK LVNQCALEFF RQIKRHCAEP FTEYWTCID YSGLQLFRRC RKEQAQFDKC VLDKLGWVRP DLGELSKVTK VKTDRPLPEN PYHSRARPEP NPEVEGDLKP A RHGSRLFF WTM

+
分子 #43: Mitochondrial complex I, SGDH subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, SGDH subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 16.714369 KDa
配列文字列:
SGDHGKRLFI IKPSGFYDKR FLKLLRFYIL LTGIPVVIGI TLINVFIGEA ELAEIPEGYV PEHWEYFKHP ISRWIARTFF DAPEKNYER TMAILQIESE KAELRLKELE VRRLMRAKGD GPWFQYPTID KALIDHSPKA TPDN

+
分子 #44: Mitochondrial complex I, B14.7 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B14.7 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / 詳細: UniProt W5PAR2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 10.145497 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #45: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄 / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #46: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN / フラビンモノヌクレオチド

+
分子 #47: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #48: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 4 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da

+
分子 #49: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 4 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM / ホスファチジルコリン

+
分子 #50: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 4 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM / Cardiolipin

+
分子 #51: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #52: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH / ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸

+
分子 #53: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

分子名称: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 1 / 式: ZMP
分子量理論値: 568.704 Da
Chemical component information

ChemComp-ZMP:
S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate

+
分子 #54: 4'-PHOSPHOPANTETHEINE

分子名称: 4'-PHOSPHOPANTETHEINE / タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 1 / 式: PNS
分子量理論値: 358.348 Da
Chemical component information

ChemComp-PNS:
4'-PHOSPHOPANTETHEINE / パンテテイン4′-りん酸 / Phosphopantetheine

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度5 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
構成要素:
濃度式名称
100.0 mMNaCl塩化ナトリウムSodium Chloride塩化ナトリウム
20.0 mMHEPES
2.0 mMEDTAエチレンジアミン四酢酸
1.5 %Glycerolグリセリン
0.2 %Brij-35
グリッドモデル: Quantifoil R0.6/1 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 雰囲気: AIR
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 90 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 詳細: 34s blotting.

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系倍率（補正後）: 100720 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 59000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / デジタル化 - サンプリング間隔: 14.0 µm / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-7 / 撮影したグリッド数: 2 / 実像数: 2600 / 平均露光時間: 1.0 sec. / 平均電子線量: 26.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 241000
CTF補正ソフトウェア - 名称: Gctf
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

2676

初期 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
最終 3次元分類ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4) / 使用した粒子像数: 82000

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

4hea


詳細: For the fourteen core subunits we used as a starting point our previous structure from T. thermophilus (PDB 4HEA) with sequence adjusted to ovine and side-chains rebuilt in SQWRL4. These are ...詳細: For the fourteen core subunits we used as a starting point our previous structure from T. thermophilus (PDB 4HEA) with sequence adjusted to ovine and side-chains rebuilt in SQWRL4. These are chains 1, 2, 3, 4, 5, 6, 9, H, A, J, K, N, M and L (with the same chain IDs as in 4HEA). For the remaining supernumerary subunits it was mostly de novo building with some help from homology modeling, which in most cases was not very useful due to low sequence homology. In few cases models produced by Phyre2 server were useful and were used as a starting point, due to the presence of templates with high coverage and confidence: 42kDa (chain k) - PDB ID 1P6X (xray) 39kDa (chain d) - PDB ID 3WJ7 (xray) SDAPs (chains j and X) - PDB ID 2DNW (NMR) B8 (chain e) - PDB ID 1S3A (NMR)
精密化空間: REAL / プロトコル: AB INITIO MODEL
得られたモデル

PDB-5lnk:
Entire ovine respiratory complex I

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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