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- EMDB-12610: Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-12610
タイトルHuman Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex
マップデータ
試料
  • 複合体: Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex
    • 複合体: Pol Complex and Mediator of RNA polymerase II transcription
      • タンパク質・ペプチド: x 34種
    • 複合体: DNA-directed RNA polymeraseポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: x 12種
    • 複合体: NT and Template
      • DNA: x 2種
    • 複合体: unassigned peptides (MED29 or MED30)
      • タンパク質・ペプチド: x 2種
    • 複合体: Transcription initiation factors
      • タンパク質・ペプチド: x 8種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


negative regulation of smooth muscle cell differentiation / MMXD complex / core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex / positive regulation of DNA helicase activity / negative regulation of DNA helicase activity / Cytosolic iron-sulfur cluster assembly / nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding / central nervous system myelin formation / positive regulation of mitotic recombination / core mediator complex ...negative regulation of smooth muscle cell differentiation / MMXD complex / core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex / positive regulation of DNA helicase activity / negative regulation of DNA helicase activity / Cytosolic iron-sulfur cluster assembly / nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding / central nervous system myelin formation / positive regulation of mitotic recombination / core mediator complex / positive regulation of core promoter binding / meiotic sister chromatid cohesion / RNA polymerase II core complex assembly / hair cell differentiation / ventricular system development / hair follicle maturation / cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex / RNA polymerase transcription factor SL1 complex / snRNA transcription by RNA polymerase II / nucleotide-excision repair factor 3 complex / transcription factor TFIIE complex / nucleotide-excision repair, preincision complex assembly / phosphatase activator activity / 紫外線 / CAK-ERCC2 complex / transcription factor TFIIK complex / RNA polymerase III general transcription initiation factor activity / embryonic cleavage / transcription open complex formation at RNA polymerase II promoter / TFIIF-class transcription factor complex binding / transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter / mediator complex / B-WICH complex positively regulates rRNA expression / RNA Polymerase I Transcription Initiation / RNA Polymerase I Promoter Escape / RNA Polymerase I Transcription Termination / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter / Formation of RNA Pol II elongation complex / Formation of the Early Elongation Complex / Transcriptional regulation by small RNAs / RNA Polymerase II Pre-transcription Events / TP53 Regulates Transcription of DNA Repair Genes / FGFR2 alternative splicing / RNA polymerase II transcribes snRNA genes / mRNA Capping / mRNA Splicing - Major Pathway / mRNA Splicing - Minor Pathway / Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA / RNA Polymerase II Promoter Escape / RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening / RNA Polymerase II Transcription Initiation / RNA Polymerase II Transcription Elongation / RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance / RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE / Estrogen-dependent gene expression / RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter / transcription factor TFIIF complex / 5'-3' DNA helicase activity / Formation of TC-NER Pre-Incision Complex / Dual incision in TC-NER / Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER / Generic Transcription Pathway / adult heart development / RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation / transcription factor TFIIA complex / G protein-coupled receptor internalization / : / female germ cell nucleus / transcription factor TFIIH holo complex / transcription factor TFIIH core complex / male pronucleus / female pronucleus / cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity / nuclear vitamin D receptor binding / Abortive elongation of HIV-1 transcript in the absence of Tat / FGFR2 alternative splicing / 卵母細胞 / [RNA-polymerase]-subunit kinase / RNA polymerase II general transcription initiation factor binding / limb development / 3'-5' DNA helicase activity / nuclear thyroid hormone receptor binding / 転写開始前複合体 / RNA Polymerase I Transcription Termination / regulation of mitotic cell cycle phase transition / cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity / : / positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening / Viral Messenger RNA Synthesis / hematopoietic stem cell proliferation / Signaling by FGFR2 IIIa TM / termination of RNA polymerase II transcription / cell division site / cortical actin cytoskeleton / RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE during HIV infection / RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE
類似検索 - 分子機能
Mediator complex subunit 28 / Mediator complex, subunit Med6, metazoa/plant / Mediator complex, subunit Med19, metazoa / Mediator complex, subunit Med30, metazoa / Mediator complex, subunit Med28 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, metazoan / Mediator of RNA pol II transcription subunit 19 / Mediator complex subunit 30 / Mediator complex, subunit Med27 / Mediator complex subunit 27 ...Mediator complex subunit 28 / Mediator complex, subunit Med6, metazoa/plant / Mediator complex, subunit Med19, metazoa / Mediator complex, subunit Med30, metazoa / Mediator complex, subunit Med28 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, metazoan / Mediator of RNA pol II transcription subunit 19 / Mediator complex subunit 30 / Mediator complex, subunit Med27 / Mediator complex subunit 27 / Mediator complex, subunit Med10 / Transcription factor subunit Med10 of Mediator complex / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9 / RNA polymerase II transcription mediator complex subunit 9 / Mediator complex, subunit Med4 / Vitamin-D-receptor interacting Mediator subunit 4 / Mediator complex, subunit Med7 superfmaily / Mediator complex, subunit Med31 / Mediator complex, subunit Med21 / Mediator of RNA polymerase II, subunit Med31 superfamily / SOH1 / Subunit 21 of Mediator complex / Mediator complex, subunit Med7 / Mediator complex, subunit Med7/Med21-like / MED7 protein / Mediator complex, subunit Med20 / Mediator complex, subunit Med14 / TATA-binding related factor (TRF) of subunit 20 of Mediator complex / Mediator complex subunit MED14 / Mediator complex, subunit Med6 / Mediator complex, subunit Med17 / Mediator complex, subunit Med6 superfamily / MED6 mediator sub complex component / Subunit 17 of Mediator complex / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22 / Mediator complex, subunit Med8, fungi/metazoa / Mediator complex, subunit Med11 / Surfeit locus protein 5 subunit 22 of Mediator complex / Mediator of RNA polymerase II transcription complex subunit 8 / Mediator complex protein / Mediator complex, subunit Med18 / Med18 protein / Transcription factor TFIIE alpha subunit, C-terminal / C-terminal general transcription factor TFIIE alpha / CyclinH/Ccl1 / Cyclin-dependent kinase 7 / TFIIH subunit Tfb4/GTF2H3 / Transcription factor Tfb4 / TFIIH C1-like domain / Ssl1-like / TFIIH subunit Ssl1/p44 / Ssl1-like / TFIIH C1-like domain / TFIIH C1-like domain / TFIIH p62 subunit, N-terminal / TFIIH subunit Tfb1/GTF2H1 / TFIIH p62 subunit, N-terminal domain / BSD domain / BSD domain superfamily / BSD domain / BSD domain profile. / domain in transcription factors and synapse-associated proteins / RAD3/XPD family / Helicase XPB/Ssl2 / Helical and beta-bridge domain / ERCC3/RAD25/XPB helicase, C-terminal domain / Helicase XPB/Ssl2, N-terminal domain / Helical and beta-bridge domain / Helicase conserved C-terminal domain / ERCC3/RAD25/XPB C-terminal helicase / Transcription factor TFIIH subunit p52/Tfb2 / ATP-dependent helicase Rad3/Chl1-like / Transcription factor Tfb2, C-terminal domain / Transcription factor Tfb2 / Transcription factor Tfb2 (p52) C-terminal domain / Transcription factor TFIIE beta subunit, DNA-binding domain / Transcription initiation factor TFIIE, beta subunit / TFA2, Winged helix domain 2 / TFIIE beta subunit core domain / TFA2 Winged helix domain 2 / TFIIE beta central core DNA-binding domain profile. / TFIIH subunit TTDA/Tfb5 / TFB5-like superfamily / Transcription factor TFIIH complex subunit Tfb5 / Transcription factor TFIIH complex subunit Tfb5 / Cdk-activating kinase assembly factor MAT1/Tfb3 / Cdk-activating kinase assembly factor MAT1, centre / CDK-activating kinase assembly factor MAT1 / Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) / Helicase superfamily 1/2, DinG/Rad3-like / Helicase-like, DEXD box c2 type / ATP-dependent helicase, C-terminal / DEAD2 / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain, DinG/Rad3-type / Cyclin, C-terminal domain 2 / DEAD_2 / Helicase C-terminal domain / Cyclin C-terminal domain / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-2 domain profile. / DEXDc2
類似検索 - ドメイン・相同性
RNA polymerase II subunit D / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / DNA-directed RNA polymerase subunit beta / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 / RNA polymerase II, I and III subunit K ...RNA polymerase II subunit D / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / DNA-directed RNA polymerase subunit beta / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 / RNA polymerase II, I and III subunit K / DNA-directed RNA polymerase II subunit E / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6 / General transcription factor IIF subunit 2 / General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD / General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB / TATA-box-binding protein / General transcription factor IIE subunit 1 / Transcription initiation factor IIE subunit beta / General transcription factor IIH subunit 1 / General transcription factor IIF subunit 1 / Cyclin-dependent kinase 7 / Cyclin-H / CDK-activating kinase assembly factor MAT1 / Transcription initiation factor IIA subunit 1 / Transcription initiation factor IIA subunit 2 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 / Transcription initiation factor IIB / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21 / General transcription factor IIH subunit 2 / General transcription factor IIH subunit 3 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27 / General transcription factor IIH subunit 5 / General transcription factor IIH subunit 4 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11 / Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / Sus scrofa (ブタ) / Human mastadenovirus C (ウイルス) / Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / Pig (ブタ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.5 Å
データ登録者Rengachari S / Schilbach S / Aibara S / Cramer P
資金援助 ドイツ, European Union, 5件
OrganizationGrant number国
German Research Foundation (DFG)EXC 2067/1 39072994 ドイツ
German Research Foundation (DFG)SFB860 ドイツ
German Research Foundation (DFG)SPP2191 ドイツ
European Research Council (ERC)882357European Union
H2020 Marie Curie Actions of the European Commission894862European Union
引用ジャーナル: Nature / 年: 2021
タイトル: Structures of mammalian RNA polymerase II pre-initiation complexes.
著者: Shintaro Aibara / Sandra Schilbach / Patrick Cramer /
要旨: The initiation of transcription is a focal point for the regulation of gene activity during mammalian cell differentiation and development. To initiate transcription, RNA polymerase II (Pol II) ...The initiation of transcription is a focal point for the regulation of gene activity during mammalian cell differentiation and development. To initiate transcription, RNA polymerase II (Pol II) assembles with general transcription factors into a pre-initiation complex (PIC) that opens promoter DNA. Previous work provided the molecular architecture of the yeast and human PIC and a topological model for DNA opening by the general transcription factor TFIIH. Here we report the high-resolution cryo-electron microscopy structure of PIC comprising human general factors and Sus scrofa domesticus Pol II, which is 99.9% identical to human Pol II. We determine the structures of PIC with closed and opened promoter DNA at 2.5-2.8 Å resolution, and resolve the structure of TFIIH at 2.9-4.0 Å resolution. We capture the TFIIH translocase XPB in the pre- and post-translocation states, and show that XPB induces and propagates a DNA twist to initiate the opening of DNA approximately 30 base pairs downstream of the TATA box. We also provide evidence that DNA opening occurs in two steps and leads to the detachment of TFIIH from the core PIC, which may stop DNA twisting and enable RNA chain initiation.
履歴
登録2021年3月15日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年5月5日-
マップ公開2021年5月5日-
更新2021年6月16日-
現状2021年6月16日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 3
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-7nvr
  • 表面レベル: 3
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_12610.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_12610.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 282.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.05 Å
密度
表面レベル登録者による: 3.0 / ムービー #1: 3
最小 - 最大-17.335718 - 40.087654
平均 (標準偏差)-3.3155442e-12 (±1.0)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ420420420
Spacing420420420
セルA=B=C: 440.99997 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.051.051.05
M x/y/z420420420
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z441.000441.000441.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ420420420
MAP C/R/S321
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS420420420
D min/max/mean-17.33640.088-0.000

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_12610_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: #1

ファイルemd_12610_additional_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_12610_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_12610_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex

全体名称: Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex
要素
  • 複合体: Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex
    • 複合体: Pol Complex and Mediator of RNA polymerase II transcription
      • タンパク質・ペプチド: TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIH subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIH subunit 4
      • タンパク質・ペプチド: CDK-activating kinase assembly factor MAT1
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIH subunit 3
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIH subunit 5
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIH subunit 2
      • タンパク質・ペプチド: General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB
      • タンパク質・ペプチド: Cyclin-dependent kinase 7
      • タンパク質・ペプチド: Cyclin-H
      • タンパク質・ペプチド: TATA-box-binding protein
      • タンパク質・ペプチド: Unassigned peptide, likely XPB
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28
      • タンパク質・ペプチド: unassigned peptide (MED29 or MED30)
      • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30
      • タンパク質・ペプチド: unassigned peptide (MED14)
      • タンパク質・ペプチド: unassigned peptide (MED6)
      • タンパク質・ペプチド: unassigned peptide (MED17)
    • 複合体: DNA-directed RNA polymeraseポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase subunitポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase subunit betaポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3ポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: RPOL4c domain-containing protein
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit Eポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit Fポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7ポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3RNAポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9ポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5RNAポリメラーゼ
      • タンパク質・ペプチド: RNA_pol_L_2 domain-containing protein
      • タンパク質・ペプチド: RNA polymerase II subunit KRNAポリメラーゼII
    • 複合体: NT and Template
      • DNA: NT
      • DNA: TEMPLATE
    • 複合体: unassigned peptides (MED29 or MED30)
      • タンパク質・ペプチド: unassigned peptide (MED29 or MED30)
      • タンパク質・ペプチド: unassigned peptide (MED29 or MED30)
    • 複合体: Transcription initiation factors
      • タンパク質・ペプチド: Transcription initiation factor IIB
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIF subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIF subunit 2
      • タンパク質・ペプチド: Transcription initiation factor IIA subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: Transcription initiation factor IIA subunit 2
      • タンパク質・ペプチド: General transcription factor IIE subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: Transcription initiation factor IIE subunit beta
      • タンパク質・ペプチド: Unassigned peptide, likely TFIIE-beta
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER鉄・硫黄クラスター
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION

+
超分子 #1: Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex

超分子名称: Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#58

+
超分子 #2: Pol Complex and Mediator of RNA polymerase II transcription

超分子名称: Pol Complex and Mediator of RNA polymerase II transcription
タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#10, #25, #34-#56
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)

+
超分子 #3: DNA-directed RNA polymerase

超分子名称: DNA-directed RNA polymerase / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #11-#22
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)

+
超分子 #4: NT and Template

超分子名称: NT and Template / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #24, #28
由来(天然)生物種: Human mastadenovirus C (ウイルス)
組換発現生物種: synthetic construct (人工物)

+
超分子 #5: unassigned peptides (MED29 or MED30)

超分子名称: unassigned peptides (MED29 or MED30) / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #57-#58
由来(天然)生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)

+
超分子 #6: Transcription initiation factors

超分子名称: Transcription initiation factors / タイプ: complex / ID: 6 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #23, #26-#27, #29-#33
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
分子 #1: TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit

分子名称: TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 87.021078 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MKLNVDGLLV YFPYDYIYPE QFSYMRELKR TLDAKGHGVL EMPSGTGKTV SLLALIMAYQ RAYPLEVTKL IYCSRTVPEI EKVIEELRK LLNFYEKQEG EKLPFLGLAL SSRKNLCIHP EVTPLRFGKD VDGKCHSLTA SYVRAQYQHD TSLPHCRFYE E FDAHGREV ...文字列:
MKLNVDGLLV YFPYDYIYPE QFSYMRELKR TLDAKGHGVL EMPSGTGKTV SLLALIMAYQ RAYPLEVTKL IYCSRTVPEI EKVIEELRK LLNFYEKQEG EKLPFLGLAL SSRKNLCIHP EVTPLRFGKD VDGKCHSLTA SYVRAQYQHD TSLPHCRFYE E FDAHGREV PLPAGIYNLD DLKALGRRQG WCPYFLARYS ILHANVVVYS YHYLLDPKIA DLVSKELARK AVVVFDEAHN ID NVCIDSM SVNLTRRTLD RCQGNLETLQ KTVLRIKETD EQRLRDEYRR LVEGLREASA ARETDAHLAN PVLPDEVLQE AVP GSIRTA EHFLGFLRRL LEYVKWRLRV QHVVQESPPA FLSGLAQRVC IQRKPLRFCA ERLRSLLHTL EITDLADFSP LTLL ANFAT LVSTYAKGFT IIIEPFDDRT PTIANPILHF SCMDASLAIK PVFERFQSVI ITSGTLSPLD IYPKILDFHP VTMAT FTMT LARVCLCPMI IGRGNDQVAI SSKFETREDI AVIRNYGNLL LEMSAVVPDG IVAFFTSYQY MESTVASWYE QGILEN IQR NKLLFIETQD GAETSVALEK YQEACENGRG AILLSVARGK VSEGIDFVHH YGRAVIMFGV PYVYTQSRIL KARLEYL RD QFQIRENDFL TFDAMRHAAQ CVGRAIRGKT DYGLMVFADK RFARGDKRGK LPRWIQEHLT DANLNLTVDE GVQVAKYF L RQMAQPFHRE DQLGLSLLSL EQLESEETLK RIEQIAQQL

+
分子 #2: General transcription factor IIH subunit 1

分子名称: General transcription factor IIH subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 62.116492 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MATSSEEVLL IVKKVRQKKQ DGALYLMAER IAWAPEGKDR FTISHMYADI KCQKISPEGK AKIQLQLVLH AGDTTNFHFS NESTAVKER DAVKDLLQQL LPKFKRKANK ELEEKNRMLQ EDPVLFQLYK DLVVSQVISA EEFWANRLNV NATDSSSTSN H KQDVGISA ...文字列:
MATSSEEVLL IVKKVRQKKQ DGALYLMAER IAWAPEGKDR FTISHMYADI KCQKISPEGK AKIQLQLVLH AGDTTNFHFS NESTAVKER DAVKDLLQQL LPKFKRKANK ELEEKNRMLQ EDPVLFQLYK DLVVSQVISA EEFWANRLNV NATDSSSTSN H KQDVGISA AFLADVRPQT DGCNGLRYNL TSDIIESIFR TYPAVKMKYA ENVPHNMTEK EFWTRFFQSH YFHRDRLNTG SK DLFAECA KIDEKGLKTM VSLGVKNPLL DLTALEDKPL DEGYGISSVP SASNSKSIKE NSNAAIIKRF NHHSAMVLAA GLR KQEAQN EQTSEPSNMD GNSGDADCFQ PAVKRAKLQE SIEYEDLGKN NSVKTIALNL KKSDRYYHGP TPIQSLQYAT SQDI INSFQ SIRQEMEAYT PKLTQVLSSS AASSTITALS PGGALMQGGT QQAINQMVPN DIQSELKHLY VAVGELLRHF WSCFP VNTP FLEEKVVKMK SNLERFQVTK LCPFQEKIRR QYLSTNLVSH IEEMLQTAYN KLHTWQSRRL MKKT

+
分子 #3: General transcription factor IIH subunit 4

分子名称: General transcription factor IIH subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 52.245156 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MESTPSRGLN RVHLQCRNLQ EFLGGLSPGV LDRLYGHPAT CLAVFRELPS LAKNWVMRML FLEQPLPQAA VALWVKKEFS KAQEESTGL LSGLRIWHTQ LLPGGLQGLI LNPIFRQNLR IALLGGGKAW SDDTSQLGPD KHARDVPSLD KYAEERWEVV L HFMVGSPS ...文字列:
MESTPSRGLN RVHLQCRNLQ EFLGGLSPGV LDRLYGHPAT CLAVFRELPS LAKNWVMRML FLEQPLPQAA VALWVKKEFS KAQEESTGL LSGLRIWHTQ LLPGGLQGLI LNPIFRQNLR IALLGGGKAW SDDTSQLGPD KHARDVPSLD KYAEERWEVV L HFMVGSPS AAVSQDLAQL LSQAGLMKST EPGEPPCITS AGFQFLLLDT PAQLWYFMLQ YLQTAQSRGM DLVEILSFLF QL SFSTLGK DYSVEGMSDS LLNFLQHLRE FGLVFQRKRK SRRYYPTRLA INLSSGVSGA GGTVHQPGFI VVETNYRLYA YTE SELQIA LIALFSEMLY RFPNMVVAQV TRESVQQAIA SGITAQQIIH FLRTRAHPVM LKQTPVLPPT ITDQIRLWEL ERDR LRFTE GVLYNQFLSQ VDFELLLAHA RELGVLVFEN SAKRLMVVTP AGHSDVKRFW KRQKHSS

+
分子 #4: CDK-activating kinase assembly factor MAT1

分子名称: CDK-activating kinase assembly factor MAT1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 35.873965 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MDDQGCPRCK TTKYRNPSLK LMVNVCGHTL CESCVDLLFV RGAGNCPECG TPLRKSNFRV QLFEDPTVDK EVEIRKKVLK IYNKREEDF PSLREYNDFL EEVEEIVFNL TNNVDLDNTK KKMEIYQKEN KDVIQKNKLK LTREQEELEE ALEVERQENE Q RRLFIQKE ...文字列:
MDDQGCPRCK TTKYRNPSLK LMVNVCGHTL CESCVDLLFV RGAGNCPECG TPLRKSNFRV QLFEDPTVDK EVEIRKKVLK IYNKREEDF PSLREYNDFL EEVEEIVFNL TNNVDLDNTK KKMEIYQKEN KDVIQKNKLK LTREQEELEE ALEVERQENE Q RRLFIQKE EQLQQILKRK NKQAFLDELE SSDLPVALLL AQHKDRSTQL EMQLEKPKPV KPVTFSTGIK MGQHISLAPI HK LEEALYE YQPLQIETYG PHVPELEMLG RLGYLNHVRA ASPQDLAGGY TSSLACHRAL QDAFSGLFWQ PS

+
分子 #5: General transcription factor IIH subunit 3

分子名称: General transcription factor IIH subunit 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 34.416008 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MVSDEDELNL LVIVVDANPI WWGKQALKES QFTLSKCIDA VMVLGNSHLF MNRSNKLAVI ASHIQESRFL YPGKNGRLGD FFGDPGNPP EFNPSGSKDG KYELLTSANE VIVEEIKDLM TKSDIKGQHT ETLLAGSLAK ALCYIHRMNK EVKDNQEMKS R ILVIKAAE ...文字列:
MVSDEDELNL LVIVVDANPI WWGKQALKES QFTLSKCIDA VMVLGNSHLF MNRSNKLAVI ASHIQESRFL YPGKNGRLGD FFGDPGNPP EFNPSGSKDG KYELLTSANE VIVEEIKDLM TKSDIKGQHT ETLLAGSLAK ALCYIHRMNK EVKDNQEMKS R ILVIKAAE DSALQYMNFM NVIFAAQKQN ILIDACVLDS DSGLLQQACD ITGGLYLKVP QMPSLLQYLL WVFLPDQDQR SQ LILPPPV HVDYRAACFC HRNLIEIGYV CSVCLSIFCN FSPICTTCET AFKISLPPVL KAKKKKLKVS A

+
分子 #6: General transcription factor IIH subunit 5

分子名称: General transcription factor IIH subunit 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 8.060362 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MVNVLKGVLI ECDPAMKQFL LYLDESNALG KKFIIQDIDD THVFVIAELV NVLQERVGEL MDQNAFSLTQ K

+
分子 #7: General transcription factor IIH subunit 2

分子名称: General transcription factor IIH subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 44.481996 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MDEEPERTKR WEGGYERTWE ILKEDESGSL KATIEDILFK AKRKRVFEHH GQVRLGMMRH LYVVVDGSRT MEDQDLKPNR LTCTLKLLE YFVEEYFDQN PISQIGIIVT KSKRAEKLTE LSGNPRKHIT SLKKAVDMTC HGEPSLYNSL SIAMQTLKHM P GHTSREVL ...文字列:
MDEEPERTKR WEGGYERTWE ILKEDESGSL KATIEDILFK AKRKRVFEHH GQVRLGMMRH LYVVVDGSRT MEDQDLKPNR LTCTLKLLE YFVEEYFDQN PISQIGIIVT KSKRAEKLTE LSGNPRKHIT SLKKAVDMTC HGEPSLYNSL SIAMQTLKHM P GHTSREVL IIFSSLTTCD PSNIYDLIKT LKAAKIRVSV IGLSAEVRVC TVLARETGGT YHVILDESHY KELLTHHVSP PP ASSSSEC SLIRMGFPQH TIASLSDQDA KPSFSMAHLD GNTEPGLTLG GYFCPQCRAK YCELPVECKI CGLTLVSAPH LAR SYHHLF PLDAFQEIPL EEYNGERFCY GCQGELKDQH VYVCAVCQNV FCVDCDVFVH DSLHCCPGCI HKIPAPSGV

+
分子 #8: General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB

分子名称: General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 89.404734 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MGKRDRADRD KKKSRKRHYE DEEDDEEDAP GNDPQEAVPS AAGKQVDESG TKVDEYGAKD YRLQMPLKDD HTSRPLWVAP DGHIFLEAF SPVYKYAQDF LVAIAEPVCR PTHVHEYKLT AYSLYAAVSV GLQTSDITEY LRKLSKTGVP DGIMQFIKLC T VSYGKVKL ...文字列:
MGKRDRADRD KKKSRKRHYE DEEDDEEDAP GNDPQEAVPS AAGKQVDESG TKVDEYGAKD YRLQMPLKDD HTSRPLWVAP DGHIFLEAF SPVYKYAQDF LVAIAEPVCR PTHVHEYKLT AYSLYAAVSV GLQTSDITEY LRKLSKTGVP DGIMQFIKLC T VSYGKVKL VLKHNRYFVE SCHPDVIQHL LQDPVIRECR LRNSEGEATE LITETFTSKS AISKTAESSG GPSTSRVTDP QG KSDIPMD LFDFYEQMDK DEEEEEETQT VSFEVKQEMI EELQKRCIHL EYPLLAEYDF RNDSVNPDIN IDLKPTAVLR PYQ EKSLRK MFGNGRARSG VIVLPCGAGK SLVGVTAACT VRKRCLVLGN SAVSVEQWKA QFKMWSTIDD SQICRFTSDA KDKP IGCSV AISTYSMLGH TTKRSWEAER VMEWLKTQEW GLMILDEVHT IPAKMFRRVL TIVQAHCKLG LTATLVREDD KIVDL NFLI GPKLYEANWM ELQNNGYIAK VQCAEVWCPM SPEFYREYVA IKTKKRILLY TMNPNKFRAC QFLIKFHERR NDKIIV FAD NVFALKEYAI RLNKPYIYGP TSQGERMQIL QNFKHNPKIN TIFISKVGDT SFDLPEANVL IQISSHGGSR RQEAQRL GR VLRAKKGMVA EEYNAFFYSL VSQDTQEMAY STKRQRFLVD QGYSFKVITK LAGMEEEDLA FSTKEEQQQL LQKVLAAT D LDAEEEVVAG EFGSRSSQAS RRFGTMSSMS GADDTVYMEY HSSRSKAPSK HVHPLFKRFR K

+
分子 #9: Cyclin-dependent kinase 7

分子名称: Cyclin-dependent kinase 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: サイクリン依存性キナーゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 39.090344 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MALDVKSRAK RYEKLDFLGE GQFATVYKAR DKNTNQIVAI KKIKLGHRSE AKDGINRTAL REIKLLQELS HPNIIGLLDA FGHKSNISL VFDFMETDLE VIIKDNSLVL TPSHIKAYML MTLQGLEYLH QHWILHRDLK PNNLLLDENG VLKLADFGLA K SFGSPNRA ...文字列:
MALDVKSRAK RYEKLDFLGE GQFATVYKAR DKNTNQIVAI KKIKLGHRSE AKDGINRTAL REIKLLQELS HPNIIGLLDA FGHKSNISL VFDFMETDLE VIIKDNSLVL TPSHIKAYML MTLQGLEYLH QHWILHRDLK PNNLLLDENG VLKLADFGLA K SFGSPNRA YTHQVVTRWY RAPELLFGAR MYGVGVDMWA VGCILAELLL RVPFLPGDSD LDQLTRIFET LGTPTEEQWP DM CSLPDYV TFKSFPGIPL HHIFSAAGDD LLDLIQGLFL FNPCARITAT QALKMKYFSN RPGPTPGCQL PRPNCPVETL KEQ SNPALA IKRKRTEALE QGGLPKKLIF

+
分子 #10: Cyclin-H

分子名称: Cyclin-H / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 37.695473 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MYHNSSQKRH WTFSSEEQLA RLRADANRKF RCKAVANGKV LPNDPVFLEP HEEMTLCKYY EKRLLEFCSV FKPAMPRSVV GTACMYFKR FYLNNSVMEY HPRIIMLTCA FLACKVDEFN VSSPQFVGNL RESPLGQEKA LEQILEYELL LIQQLNFHLI V HNPYRPFE ...文字列:
MYHNSSQKRH WTFSSEEQLA RLRADANRKF RCKAVANGKV LPNDPVFLEP HEEMTLCKYY EKRLLEFCSV FKPAMPRSVV GTACMYFKR FYLNNSVMEY HPRIIMLTCA FLACKVDEFN VSSPQFVGNL RESPLGQEKA LEQILEYELL LIQQLNFHLI V HNPYRPFE GFLIDLKTRY PILENPEILR KTADDFLNRI ALTDAYLLYT PSQIALTAIL SSASRAGITM ESYLSESLML KE NRTCLSQ LLDIMKSMRN LVKKYEPPRS EEVAVLKQKL ERCHSAELAL NVITKKRKGY EDDDYVSKKS KHEEEEWTDD DLV ESL

+
分子 #11: DNA-directed RNA polymerase subunit

分子名称: DNA-directed RNA polymerase subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ポリメラーゼ
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 217.450078 KDa
配列文字列: MHGGGPPSGD SACPLRTIKR VQFGVLSPDE LKRMSVTEGG IKYPETTEGG RPKLGGLMDP RQGVIERTGR CQTCAGNMTE CPGHFGHIE LAKPVFHVGF LVKTMKVLRC VCFFCSKLLV DSNNPKIKDI LAKSKGQPKK RLTHVYDLCK GKNICEGGEE M DNKFGVEQ ...文字列:
MHGGGPPSGD SACPLRTIKR VQFGVLSPDE LKRMSVTEGG IKYPETTEGG RPKLGGLMDP RQGVIERTGR CQTCAGNMTE CPGHFGHIE LAKPVFHVGF LVKTMKVLRC VCFFCSKLLV DSNNPKIKDI LAKSKGQPKK RLTHVYDLCK GKNICEGGEE M DNKFGVEQ PEGDEDLTKE KGHGGCGRYQ PRIRRSGLEL YAEWKHVNED SQEKKILLSP ERVHEIFKRI SDEECFVLGM EP RYARPEW MIVTVLPVPP LSVRPAVVMQ GSARNQDDLT HKLADIVKIN NQLRRNEQNG AAAHVIAEDV KLLQFHVATM VDN ELPGLP RAMQKSGRPL KSLKQRLKGK EGRVRGNLMG KRVDFSARTV ITPDPNLSID QVGVPRSIAA NMTFAEIVTP FNID RLQEL VRRGNSQYPG AKYIIRDNGD RIDLRFHPKP SDLHLQTGYK VERHMCDGDI VIFNRQPTLH KMSMMGHRVR ILPWS TFRL NLSVTTPYNA DFDGDEMNLH LPQSLETRAE IQELAMVPRM IVTPQSNRPV MGIVQDTLTA VRKFTKRDVF LERGEV MNL LMFLSTWDGK VPQPAILKPR PLWTGKQIFS LIIPGHINCI RTHSTHPDDE DSGPYKHISP GDTKVVVENG ELIMGIL CK KSLGTSAGSL VHISYLEMGH DITRLFYSNI QTVINNWLLI EGHTIGIGDS IADSKTYQDI QNTIKKAKQD VIEVIEKA H NNELEPTPGN TLRQTFENQV NRILNDARDK TGSSAQKSLS EYNNFKSMVV SGAKGSKINI SQVIAVVGQQ NVEGKRIPF GFKHRTLPHF IKDDYGPESR GFVENSYLAG LTPTEFFFHA MGGREGLIDT AVKTAETGYI QRRLIKSMES VMVKYDATVR NSINQVVQL RYGEDGLAGE SVEFQNLATL KPSNKAFEKK FRFDYTNERA LRRTLQEDLV KDVLSNAHIQ NELEREFERM R EDREVLRV IFPTGDSKVV LPCNLLRMIW NAQKIFHINP RLPSDLHPIK VVEGVKELSK KLVIVNGDDP LSRQAQENAT LL FNIHLRS TLCSRRMAEE FRLSGEAFDW LLGEIESKFN QAIAHPGEMV GALAAQSLGE PATQMTLNTF HYAGVSAKNV TLG VPRLKE LINISKKPKT PSLTVFLLGQ SARDAERAKD ILCRLEHTTL RKVTANTAIY YDPNPQSTVV AEDQEWVNVY YEMP DFDVA RISPWLLRVE LDRKHMTDRK LTMEQIAEKI NAGFGDDLNC IFNDDNAEKL VLRIRIMNSD ENKMQEEEEV VDKMD DDVF LRCIESNMLT DMTLQGIEQI SKVYMHLPQT DNKKKIIITE DGEFKALQEW ILETDGVSLM RVLSEKDVDP VRTTSN DIV EIFTVLGIEA VRKALERELY HVISFDGSYV NYRHLALLCD TMTCRGHLMA ITRHGVNRQD TGPLMKCSFE ETVDVLM EA AAHGESDPMK GVSENIMLGQ LAPAGTGCFD LLLDAEKCKY GMEIPTNIPG LGAAGPTGMF FGSAPSPMGG ISPAMTPW N QGATPAYGAW SPSVGSGMTP GAAGFSPSAA SDASGFSPGY SPAWSPTPGS PGSPGPSSPY IPSPGGAMSP SYSPTSPAY EPRSPGGYTP QSPSYSPTSP SYSPTSPSYS PTSPNYSPTS PSYSPTSPSY SPTSPSYSPT SPSYSPTSPS YSPTSPSYSP TSPSYSPTS PSYSPTSPSY SPTSPSYSPT SPSYSPTSPS YSPTSPSYSP TSPSYSPTSP SYSPTSPNYS PTSPNYTPTS P SYSPTSPS YSPTSPNYTP TSPNYSPTSP SYSPTSPSYS PTSPSYSPSS PRYTPQSPTY TPSSPSYSPS SPSYSPTSPK YT PTSPSYS PSSPEYTPTS PKYSPTSPKY SPTSPKYSPT SPTYSPTTPK YSPTSPTYSP TSPVYTPTSP KYSPTSPTYS PTS PKYSPT SPTYSPTSPK GSTYSPTSPG YSPTSPTYSL TSPAISPDDS DEEN

+
分子 #12: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

分子名称: DNA-directed RNA polymerase subunit beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ポリメラーゼ
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 134.041422 KDa
配列文字列: MYDADEDMQY DEDDDEITPD LWQEACWIVI SSYFDEKGLV RQQLDSFDEF IQMSVQRIVE DAPPIDLQAE AQHASGEVEE PPRYLLKFE QIYLSKPTHW ERDGAPSPMM PNEARLRNLT YSAPLYVDIT KTVIKEGEEQ LQTQHQKTFI GKIPIMLRST Y CLLNGLTD ...文字列:
MYDADEDMQY DEDDDEITPD LWQEACWIVI SSYFDEKGLV RQQLDSFDEF IQMSVQRIVE DAPPIDLQAE AQHASGEVEE PPRYLLKFE QIYLSKPTHW ERDGAPSPMM PNEARLRNLT YSAPLYVDIT KTVIKEGEEQ LQTQHQKTFI GKIPIMLRST Y CLLNGLTD RDLCELNECP LDPGGYFIIN GSEKVLIAQE KMATNTVYVF AKKDSKYAYT GECRSCLENS SRPTSTIWVS ML ARGGQGA KKSAIGQRIV ATLPYIKQEV PIIIVFRALG FVSDRDILEH IIYDFEDPEM MEMVKPSLDE AFVIQEQNVA LNF IGSRGA KPGVTKEKRI KYAKEVLQKE MLPHVGVSDF CETKKAYFLG YMVHRLLLAA LGRRELDDRD HYGNKRLDLA GPLL AFLFR GMFKNLLKEV RIYAQKFIDR GKDFNLELAI KTRIISDGLK YSLATGNWGD QKKAHQARAG VSQVLNRLTF ASTLS HLRR LNSPIGRDGK LAKPRQLHNT LWGMVCPAET PEGHAVGLVK NLALMAYISV GSQPSPILEF LEEWSMENLE EISPAA IAD ATKIFVNGCW VGIHKDPEQL MNTLRKLRRQ MDIIVSEVSM IRDIREREIR IYTDAGRICR PLLIVEKQKL LLKKRHI DQ LKEREYNNYS WQDLVASGVV EYIDTLEEET VMLAMTPDDL QEKEVAYCST YTHCEIHPSM ILGVCASIIP FPDHNQSP R NTYQSAMGKQ AMGVYITNFH VRMDTLAHVL YYPQKPLVTT RSMEYLRFRE LPAGINSIVA IASYTGYNQE DSVIMNRSA VDRGFFRSVF YRSYKEQESK KGFDQEEVFE KPTRETCQGM RHAIYDKLDD DGLIAPGVRV SGDDVIIGKT VTLPENEDEL EGTNRRYTK RDCSTFLRTS ETGIVDQVMV TLNQEGYKFC KIRVRSVRIP QIGDKFASRH GQKGTCGIQY RQEDMPFTCE G ITPDIIIN PHAIPSRMTI GHLIECLQGK VSANKGEIGD ATPFNDAVNV QKISNLLSDY GYHLRGNEVL YNGFTGRKIT SQ IFIGPTY YQRLKHMVDD KIHSRARGPI QILNRQPMEG RSRDGGLRFG EMERDCQIAH GAAQFLRERL FEASDPYQVH VCN LCGIMA IANTRTHTYE CRGCRNKTQI SLVRMPYACK LLFQELMSMS IAPRMMSV

+
分子 #13: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 31.439074 KDa
配列文字列: MPYANQPTVR ITELTDENVK FIIENTDLAV ANSIRRVFIA EVPIIAIDWV QIDANSSVLH DEFIAHRLGL IPLTSDDIVD KLQYSRDCT CEEFCPECSV EFTLDVRCNE DQTRHVTSRD LISNSPRVIP VTSRNRDNDP SDYVEQDDIL IVKLRKGQEL R LRAYAKKG ...文字列:
MPYANQPTVR ITELTDENVK FIIENTDLAV ANSIRRVFIA EVPIIAIDWV QIDANSSVLH DEFIAHRLGL IPLTSDDIVD KLQYSRDCT CEEFCPECSV EFTLDVRCNE DQTRHVTSRD LISNSPRVIP VTSRNRDNDP SDYVEQDDIL IVKLRKGQEL R LRAYAKKG FGKEHAKWNP TAGVAFEYDP DNALRHTVYP KPEEWPKSEY SELDEDESQA PYDPNGKPER FYYNVESCGS LR PETIVLS ALSGLKKKLS DLQTQLSHEI QSDVLTIN

+
分子 #14: RPOL4c domain-containing protein

分子名称: RPOL4c domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 16.331255 KDa
配列文字列:
MAAGGSDPRA GDVEEDASQL IFPKEFETAE TLLNSEVHML LEHRKQQNES AEDEQELSEV FMKTLNYTAR FSRFKNRETI ASVRSLLLQ KKLHKFELAC LANLCPETAE ESKALIPSLE GRFEDEELQQ ILDDIQTKRS FQY

+
分子 #15: DNA-directed RNA polymerase II subunit E

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 24.644318 KDa
配列文字列: MDDEEETYRL WKIRKTIMQL CHDRGYLVTQ DELDQTLEEF KAQFGDKPSE GRPRRTDLTV LVAHNDDPTD QMFVFFPEEP KVGIKTIKV YCQRMQEENI TRALIVVQQG MTPSAKQSLV DMAPKYILEQ FLQQELLINI TEHELVPEHV VMTKEEVTEL L ARYKLREN ...文字列:
MDDEEETYRL WKIRKTIMQL CHDRGYLVTQ DELDQTLEEF KAQFGDKPSE GRPRRTDLTV LVAHNDDPTD QMFVFFPEEP KVGIKTIKV YCQRMQEENI TRALIVVQQG MTPSAKQSLV DMAPKYILEQ FLQQELLINI TEHELVPEHV VMTKEEVTEL L ARYKLREN QLPRIQAGDP VARYFGIKRG QVVKIIRPSE TAGRYITYRL VQ

+
分子 #16: DNA-directed RNA polymerase II subunit F

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit F / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 14.477001 KDa
配列文字列:
MSDNEDNFDG DDFDDVEEDE GLDDLENAEE EGQENVEILP SGERPQANQK RITTPYMTKY ERARVLGTRA LQIAMCAPVM VELEGETDP LLIAMKELKA RKIPIIIRRY LPDGSYEDWG VDELIISD

+
分子 #17: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 19.314283 KDa
配列文字列:
MFYHISLEHE ILLHPRYFGP NLLNTVKQKL FTEVEGTCTG KYGFVIAVTT IDNIGAGVIQ PGRGFVLYPV KYKAIVFRPF KGEVVDAVV TQVNKVGLFT EIGPMSCFIS RHSIPSEMEF DPNSNPPCYK TMDEDIVIQQ DDEIRLKIVG TRVDKNDIFA I GSLMDDYL GLVS

+
分子 #18: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

分子名称: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 17.162273 KDa
配列文字列:
MAGILFEDIF DVKDIDPEGK KFDRVSRLHC ESESFKMDLI LDVNIQIYPV DLGDKFRLVI ASTLYEDGTL DDGEYNPTDD RPSRADQFE YVMYGKVYRI EGDETSTEAA TRLSAYVSYG GLLMRLQGDA NNLHGFEVDS RVYLLMKKLA F

+
分子 #19: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 14.541221 KDa
配列文字列:
MEPDGTYEPG FVGIRFCQEC NNMLYPKEDK ENRILLYACR NCDYQQEADN SCIYVNKITH EVDELTQIIA DVSQDPTLPR TEDHPCQKC GHKEAVFFQS HSARAEDAMR LYYVCTAPHC GHRWTE

+
分子 #20: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

分子名称: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 7.655123 KDa
配列文字列:
MIIPVRCFTC GKIVGNKWEA YLGLLQAEYT EGDALDALGL KRYCCRRMLL AHVDLIEKLL NYAPLEK

+
分子 #21: RNA_pol_L_2 domain-containing protein

分子名称: RNA_pol_L_2 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 13.310284 KDa
配列文字列:
MNAPPAFESF LLFEGEKKIT INKDTKVPNA CLFTINKEDH TLGNIIKSQL LKDPQVLFAG YKVPHPLEHK IIIRVQTTPD YSPQEAFTN AITDLISELS LLEERFRVAI KDKQEGIE

+
分子 #22: RNA polymerase II subunit K

分子名称: RNA polymerase II subunit K / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 7.018244 KDa
配列文字列:
MDTQKDVQPP KQQPMIYICG ECHTENEIKS RDPIRCRECG YRIMYKKRTK RLVVFDAR

+
分子 #23: Transcription initiation factor IIB

分子名称: Transcription initiation factor IIB / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: ヒストンアセチルトランスフェラーゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 34.877949 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MASTSRLDAL PRVTCPNHPD AILVEDYRAG DMICPECGLV VGDRVIDVGS EWRTFSNDKA TKDPSRVGDS QNPLLSDGDL STMIGKGTG AASFDEFGNS KYQNRRTMSS SDRAMMNAFK EITTMADRIN LPRNIVDRTN NLFKQVYEQK SLKGRANDAI A SACLYIAC ...文字列:
MASTSRLDAL PRVTCPNHPD AILVEDYRAG DMICPECGLV VGDRVIDVGS EWRTFSNDKA TKDPSRVGDS QNPLLSDGDL STMIGKGTG AASFDEFGNS KYQNRRTMSS SDRAMMNAFK EITTMADRIN LPRNIVDRTN NLFKQVYEQK SLKGRANDAI A SACLYIAC RQEGVPRTFK EICAVSRISK KEIGRCFKLI LKALETSVDL ITTGDFMSRF CSNLCLPKQV QMAATHIARK AV ELDLVPG RSPISVAAAA IYMASQASAE KRTQKEIGDI AGVADVTIRQ SYRLIYPRAP DLFPTDFKFD TPVDKLPQL

+
分子 #25: TATA-box-binding protein

分子名称: TATA-box-binding protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 37.729938 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MDQNNSLPPY AQGLASPQGA MTPGIPIFSP MMPYGTGLTP QPIQNTNSLS ILEEQQRQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQ QQQQQQAVAA AAVQQSTSQQ ATQGTSGQAP QLFHSQTLTT APLPGTTPLY PSPMTPMTPI TPATPASESS G IVPQLQNI ...文字列:
MDQNNSLPPY AQGLASPQGA MTPGIPIFSP MMPYGTGLTP QPIQNTNSLS ILEEQQRQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQ QQQQQQAVAA AAVQQSTSQQ ATQGTSGQAP QLFHSQTLTT APLPGTTPLY PSPMTPMTPI TPATPASESS G IVPQLQNI VSTVNLGCKL DLKTIALRAR NAEYNPKRFA AVIMRIREPR TTALIFSSGK MVCTGAKSEE QSRLAARKYA RV VQKLGFP AKFLDFKIQN MVGSCDVKFP IRLEGLVLTH QQFSSYEPEL FPGLIYRMIK PRIVLLIFVS GKVVLTGAKV RAE IYEAFE NIYPILKGFR KTT

+
分子 #26: General transcription factor IIF subunit 1

分子名称: General transcription factor IIF subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 58.343578 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MAALGPSSQN VTEYVVRVPK NTTKKYNIMA FNAADKVNFA TWNQARLERD LSNKKIYQEE EMPESGAGSE FNRKLREEAR RKKYGIVLK EFRPEDQPWL LRVNGKSGRK FKGIKKGGVT ENTSYYIFTQ CPDGAFEAFP VHNWYNFTPL ARHRTLTAEE A EEEWERRN ...文字列:
MAALGPSSQN VTEYVVRVPK NTTKKYNIMA FNAADKVNFA TWNQARLERD LSNKKIYQEE EMPESGAGSE FNRKLREEAR RKKYGIVLK EFRPEDQPWL LRVNGKSGRK FKGIKKGGVT ENTSYYIFTQ CPDGAFEAFP VHNWYNFTPL ARHRTLTAEE A EEEWERRN KVLNHFSIMQ QRRLKDQDQD EDEEEKEKRG RRKASELRIH DLEDDLEMSS DASDASGEEG GRVPKAKKKA PL AKGGRKK KKKKGSDDEA FEDSDDGDFE GQEVDYMSDG SSSSQEEPES KAKAPQQEEG PKGVDEQSDS SEESEEEKPP EED KEEEEE KKAPTPQEKK RRKDSSEESD SSEESDIDSE ASSALFMAKK KTPPKRERKP SGGSSRGNSR PGTPSAEGGS TSST LRAAA SKLEQGKRVS EMPAAKRLRL DTGPQSLSGK STPQPPSGKT TPNSGDVQVT EDAVRRYLTR KPMTTKDLLK KFQTK KTGL SSEQTVNVLA QILKRLNPER KMINDKMHFS LKE

+
分子 #27: General transcription factor IIF subunit 2

分子名称: General transcription factor IIF subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 28.427309 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MAERGELDLT GAKQNTGVWL VKVPKYLSQQ WAKASGRGEV GKLRIAKTQG RTEVSFTLNE DLANIHDIGG KPASVSAPRE HPFVLQSVG GQTLTVFTES SSDKLSLEGI VVQRAECRPA ASENYMRLKR LQIEESSKPV RLSQQLDKVV TTNYKPVANH Q YNIEYERK ...文字列:
MAERGELDLT GAKQNTGVWL VKVPKYLSQQ WAKASGRGEV GKLRIAKTQG RTEVSFTLNE DLANIHDIGG KPASVSAPRE HPFVLQSVG GQTLTVFTES SSDKLSLEGI VVQRAECRPA ASENYMRLKR LQIEESSKPV RLSQQLDKVV TTNYKPVANH Q YNIEYERK KKEDGKRARA DKQHVLDMLF SAFEKHQYYN LKDLVDITKQ PVVYLKEILK EIGVQNVKGI HKNTWELKPE YR HYQGEEK SD

+
分子 #29: Transcription initiation factor IIA subunit 1

分子名称: Transcription initiation factor IIA subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 41.544551 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MANSANTNTV PKLYRSVIED VINDVRDIFL DDGVDEQVLM ELKTLWENKL MQSRAVDGFH SEEQQLLLQV QQQHQPQQQQ HHHHHHHQQ AQPQQTVPQQ AQTQQVLIPA SQQATAPQVI VPDSKLIQHM NASNMSAAAT AATLALPAGV TPVQQILTNS G QLLQVVRA ...文字列:
MANSANTNTV PKLYRSVIED VINDVRDIFL DDGVDEQVLM ELKTLWENKL MQSRAVDGFH SEEQQLLLQV QQQHQPQQQQ HHHHHHHQQ AQPQQTVPQQ AQTQQVLIPA SQQATAPQVI VPDSKLIQHM NASNMSAAAT AATLALPAGV TPVQQILTNS G QLLQVVRA ANGAQYIFQP QQSVVLQQQV IPQMQPGGVQ APVIQQVLAP LPGGISPQTG VIIQPQQILF TGNKTQVIPT TV AAPTPAQ AQITATGQQQ PQAQPAQTQA PLVLQVDGTG DTSSEEDEDE EEDYDDDEEE DKEKDGAEDG QVEEEPLNSE DDV SDEEGQ ELFDTENVVV CQYDKIHRSK NKWKFHLKDG IMNLNGRDYI FSKAIGDAEW

+
分子 #30: Transcription initiation factor IIA subunit 2

分子名称: Transcription initiation factor IIA subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 12.469091 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MAYQLYRNTT LGNSLQESLD ELIQSQQITP QLALQVLLQF DKAINAALAQ RVRNRVNFRG SLNTYRFCDN VWTFVLNDVE FREVTELIK VDKVKIVACD GKNTGSNTTE

+
分子 #31: General transcription factor IIE subunit 1

分子名称: General transcription factor IIE subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 49.516094 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MADPDVLTEV PAALKRLAKY VIRGFYGIEH ALALDILIRN SCVKEEDMLE LLKFDRKQLR SVLNNLKGDK FIKCRMRVET AADGKTTRH NYYFINYRTL VNVVKYKLDH MRRRIETDER DSTNRASFKC PVCSSTFTDL EANQLFDPMT GTFRCTFCHT E VEEDESAM ...文字列:
MADPDVLTEV PAALKRLAKY VIRGFYGIEH ALALDILIRN SCVKEEDMLE LLKFDRKQLR SVLNNLKGDK FIKCRMRVET AADGKTTRH NYYFINYRTL VNVVKYKLDH MRRRIETDER DSTNRASFKC PVCSSTFTDL EANQLFDPMT GTFRCTFCHT E VEEDESAM PKKDARTLLA RFNEQIEPIY ALLRETEDVN LAYEILEPEP TEIPALKQSK DHAATTAGAA SLAGGHHREA WA TKGPSYE DLYTQNVVIN MDDQEDLHRA SLEGKSAKER PIWLRESTVQ GAYGSEDMKE GGIDMDAFQE REEGHAGPDD NEE VMRALL IHEKKTSSAM AGSVGAAAPV TAANGSDSES ETSESDDDSP PRPAAVAVHK REEDEEEDDE FEEVADDPIV MVAG RPFSY SEVSQRPELV AQMTPEEKEA YIAMGQRMFE DLFE

+
分子 #32: Transcription initiation factor IIE subunit beta

分子名称: Transcription initiation factor IIE subunit beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 33.106824 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MDPSLLRERE LFKKRALSTP VVEKRSASSE SSSSSSKKKK TKVEHGGSSG SKQNSDHSNG SFNLKALSGS SGYKFGVLAK IVNYMKTRH QRGDTHPLTL DEILDETQHL DIGLKQKQWL MTEALVNNPK IEVIDGKYAF KPKYNVRDKK ALLRLLDQHD Q RGLGGILL ...文字列:
MDPSLLRERE LFKKRALSTP VVEKRSASSE SSSSSSKKKK TKVEHGGSSG SKQNSDHSNG SFNLKALSGS SGYKFGVLAK IVNYMKTRH QRGDTHPLTL DEILDETQHL DIGLKQKQWL MTEALVNNPK IEVIDGKYAF KPKYNVRDKK ALLRLLDQHD Q RGLGGILL EDIEEALPNS QKAVKALGDQ ILFVNRPDKK KILFFNDKSC QFSVDEEFQK LWRSVTVDSM DEEKIEEYLK RQ GISSMQE SGPKKVAPIQ RRKKPASQKK RRFKTHNEHL AGVLKDYSDI TSSK

+
分子 #33: Unassigned peptide, likely TFIIE-beta

分子名称: Unassigned peptide, likely TFIIE-beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.635006 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #34: Unassigned peptide, likely XPB

分子名称: Unassigned peptide, likely XPB / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 698.854 Da
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #35: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 28.464627 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MAAVDIRDNL LGISWVDSSW IPILNSGSVL DYFSERSNPF YDRTCNNEVV KMQRLTLEHL NQMVGIEYIL LHAQEPILFI IRKQQRQSP AQVIPLADYY IIAGVIYQAP DLGSVINSRV LTAVHGIQSA FDEAMSYCRY HPSKGYWWHF KDHEEQDKVR P KAKRKEEP ...文字列:
MAAVDIRDNL LGISWVDSSW IPILNSGSVL DYFSERSNPF YDRTCNNEVV KMQRLTLEHL NQMVGIEYIL LHAQEPILFI IRKQQRQSP AQVIPLADYY IIAGVIYQAP DLGSVINSRV LTAVHGIQSA FDEAMSYCRY HPSKGYWWHF KDHEEQDKVR P KAKRKEEP SSIFQRQRVD ALLLDLRQKF PPKFVQLKPG EKPVPVDQTK KEAEPIPETV KPEEKETTKN VQQTVSAKGP PE KRMRLQ

+
分子 #36: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.112906 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MQREEKQLEA SLDALLSQVA DLKNSLGSFI CKLENEYGRL TWPSVLDSFA LLSGQLNTLN KVLKHEKTPL FRNQVIIPLV LSPDRDEDL MRQTEGRVPV FSHEVVPDHL RTKPDPEVEE QEKQLTTDAA RIGADAAQKQ IQSLNKMCSN LLEKISKEER E SESGGLRP ...文字列:
MQREEKQLEA SLDALLSQVA DLKNSLGSFI CKLENEYGRL TWPSVLDSFA LLSGQLNTLN KVLKHEKTPL FRNQVIIPLV LSPDRDEDL MRQTEGRVPV FSHEVVPDHL RTKPDPEVEE QEKQLTTDAA RIGADAAQKQ IQSLNKMCSN LLEKISKEER E SESGGLRP NKQTFNPTDT NALVAAVAFG KGLSNWRPSG SSGPGQAGQP GAGTILAGTS GLQQVQMAGA PSQQQPMLSG VQ MAQAGQP GKMPSGIKTN IKSASMHPYQ R

+
分子 #37: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11
タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 13.145829 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MATYSLANER LRALEDIERE IGAILQNAGT VILELSKEKT NERLLDRQAA AFTASVQHVE AELSAQIRYL TQVATGQPHE GSSYSSRKD CQMALKRVDY ARLKLSDVAR TCEQMLEN

+
分子 #38: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 72.984047 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MSGVRAVRIS IESACEKQVH EVGLDGTETY LPPLSMSQNL ARLAQRIDFS QGSGSEEEEA AGTEGDAQEW PGAGSSADQD DEEGVVKFQ PSLWPWDSVR NNLRSALTEM CVLYDVLSIV RDKKFMTLDP VSQDALPPKQ NPQTLQLISK KKSLAGAAQI L LKGAERLT ...文字列:
MSGVRAVRIS IESACEKQVH EVGLDGTETY LPPLSMSQNL ARLAQRIDFS QGSGSEEEEA AGTEGDAQEW PGAGSSADQD DEEGVVKFQ PSLWPWDSVR NNLRSALTEM CVLYDVLSIV RDKKFMTLDP VSQDALPPKQ NPQTLQLISK KKSLAGAAQI L LKGAERLT KSVTENQENK LQRDFNSELL RLRQHWKLRK VGDKILGDLS YRSAGSLFPH HGTFEVIKNT DLDLDKKIPE DY CPLDVQI PSDLEGSAYI KVSIQKQAPD IGDLGTVNLF KRPLPKSKPG SPHWQTKLEA AQNVLLCKEI FAQLSREAVQ IKS QVPHIV VKNQIISQPF PSLQLSISLC HSSNDKKSQK FATEKQCPED HLYVLEHNLH LLIREFHKQT LSSIMMPHPA SAPF GHKRM RLSGPQAFDK NEINSLQSSE GLLEKIIKQA KHIFLRSRAA ATIDSLASRI EDPQIQAHWS NINDVYESSV KVLIT SQGY EQICKSIQLQ LNIGVEQIRV VHRDGRVITL SYQEQELQDF LLSQMSQHQV HAVQQLAKVM GWQVLSFSNH VGLGPI ESI GNASAITVAS PSGDYAISVR NGPESGSKIM VQFPRNQCKD LPKSDVLQDN KWSHLRGPFK EVQWNKMEGR NFVYKME LL MSALSPCLL

+
分子 #39: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.69373 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MEAPPVTMMP VTGGTINMME YLLQGSVLDH SLESLIHRLR GLCDNMEPET FLDHEMVFLL KGQQASPFVL RARRSMDRAG APWHLRYLG QPEMGDKNRH ALVRNCVDIA TSENLTDFLM EMGFRMDHEF VAKGHLFRKG IMKIMVYKIF RILVPGNTDS T EALSLSYL ...文字列:
MEAPPVTMMP VTGGTINMME YLLQGSVLDH SLESLIHRLR GLCDNMEPET FLDHEMVFLL KGQQASPFVL RARRSMDRAG APWHLRYLG QPEMGDKNRH ALVRNCVDIA TSENLTDFLM EMGFRMDHEF VAKGHLFRKG IMKIMVYKIF RILVPGNTDS T EALSLSYL VELSVVAPAG QDMVSDDMKN FAEQLKPLVH LEKIDPKRLM

+
分子 #40: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.243762 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MGVTCVSQMP VAEGKSVQQT VELLTRKLEM LGAEKQGTFC VDCETYHTAA STLGSQGQTG KLMYVMHNSE YPLSCFALFE NGPCLIADT NFDVLMVKLK GFFQSAKASK IETRGTRYQY CDFLVKVGTV TMGPSARGIS VEVEYGPCVV ASDCWSLLLE F LQSFLGSH ...文字列:
MGVTCVSQMP VAEGKSVQQT VELLTRKLEM LGAEKQGTFC VDCETYHTAA STLGSQGQTG KLMYVMHNSE YPLSCFALFE NGPCLIADT NFDVLMVKLK GFFQSAKASK IETRGTRYQY CDFLVKVGTV TMGPSARGIS VEVEYGPCVV ASDCWSLLLE F LQSFLGSH TPGAPAVFGN RHDAVYGPAD TMVQYMELFN KIRKQQQVPV AGIR

+
分子 #41: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.243713 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MAQQRALPQS KETLLQSYNK RLKDDIKSIM DNFTEIIKTA KIEDETQVSR ATQGEQDNYE MHVRAANIVR AGESLMKLVS DLKQFLILN DFPSVNEAID QRNQQLRTLQ EECDRKLITL RDEISIDLYE LEEEYYSSSS SLCEANDLPL CEAYGRLDLD T DSADGLSA ...文字列:
MAQQRALPQS KETLLQSYNK RLKDDIKSIM DNFTEIIKTA KIEDETQVSR ATQGEQDNYE MHVRAANIVR AGESLMKLVS DLKQFLILN DFPSVNEAID QRNQQLRTLQ EECDRKLITL RDEISIDLYE LEEEYYSSSS SLCEANDLPL CEAYGRLDLD T DSADGLSA PLLASPEPSA GPLQVAAPAH SHAGGPGPTE HA

+
分子 #42: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.781424 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MAASSSGEKE KERLGGGLGV AGGNSTRERL LSALEDLEVL SRELIEMLAI SRNQKLLQAG EENQVLELLI HRDGEFQELM KLALNQGKI HHEMQVLEKE VEKRDSDIQQ LQKQLKEAEQ ILATAVYQAK EKLKSIEKAR KGAISSEEII KYAHRISASN A VCAPLTWV ...文字列:
MAASSSGEKE KERLGGGLGV AGGNSTRERL LSALEDLEVL SRELIEMLAI SRNQKLLQAG EENQVLELLI HRDGEFQELM KLALNQGKI HHEMQVLEKE VEKRDSDIQQ LQKQLKEAEQ ILATAVYQAK EKLKSIEKAR KGAISSEEII KYAHRISASN A VCAPLTWV PGDPRRPYPT DLEMRSGLLG QMNNPSTNGV NGHLPGDALA AGRLPDVLAP QYPWQSNDMS MNMLPPNHSS DF LLEPPGH NKENEDDVEI MSTDSSSSSS ESD

+
分子 #43: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 27.285281 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MGEPQQVSAL PPPPMQYIKE YTDENIQEGL APKPPPPIKD SYMMFGNQFQ CDDLIIRPLE SQGIERLHPM QFDHKKELRK LNMSILINF LDLLDILIRS PGSIKREEKL EDLKLLFVHV HHLINEYRPH QARETLRVMM EVQKRQRLET AERFQKHLER V IEMIQNCL ...文字列:
MGEPQQVSAL PPPPMQYIKE YTDENIQEGL APKPPPPIKD SYMMFGNQFQ CDDLIIRPLE SQGIERLHPM QFDHKKELRK LNMSILINF LDLLDILIRS PGSIKREEKL EDLKLLFVHV HHLINEYRPH QARETLRVMM EVQKRQRLET AERFQKHLER V IEMIQNCL ASLPDDLPHS EAGMRVKTEP MDADDSNNCT GQNEHQRENS GHRRDQIIEK DAALCVLIDE MNERP

+
分子 #44: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 16.42275 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MASAGVAAGR QAEDVLPPTS DQPLPDTKPL PPPQPPPVPA PQPQQSPAPR PQSPARAREE ENYSFLPLVH NIIKCMDKDS PEVHQDLNA LKSKFQEMRK LISTMPGIHL SPEQQQQQLQ SLREQVRTKN ELLQKYKSLC MFEIPKE

+
分子 #45: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10
タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.710969 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MAEKFDHLEE HLEKFVENIR QLGIIVSDFQ PSSQAGLNQK LNFIVTGLQD IDKCRQQLHD ITVPLEVFEY IDQGRNPQLY TKECLERAL AKNEQVKGKI DTMKKFKSLL IQELSKVFPE DMAKYRSIRG EDHPPS

+
分子 #46: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 160.787594 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MAPVQLENHQ LVPPGGGGGG SGGPPSAPAP PPPGAAVAAA AAAAASPGYR LSTLIEFLLH RAYSELMVLT DLLPRKSDVE RKIEIVQFA SRTRQLFVRL LALVKWANNA GKVEKCAMIS SFLDQQAILF VDTADRLASL ARDALVHARL PSFAIPYAID V LTTGSYPR ...文字列:
MAPVQLENHQ LVPPGGGGGG SGGPPSAPAP PPPGAAVAAA AAAAASPGYR LSTLIEFLLH RAYSELMVLT DLLPRKSDVE RKIEIVQFA SRTRQLFVRL LALVKWANNA GKVEKCAMIS SFLDQQAILF VDTADRLASL ARDALVHARL PSFAIPYAID V LTTGSYPR LPTCIRDKII PPDPITKIEK QATLHQLNQI LRHRLVTTDL PPQLANLTVA NGRVKFRVEG EFEATLTVMG DD PDVPWRL LKLEILVEDK ETGDGRALVH SMQISFIHQL VQSRLFADEK PLQDMYNCLH SFCLSLQLEV LHSQTLMLIR ERW GDLVQV ERYHAGKCLS LSVWNQQVLG RKTGTASVHK VTIKIDENDV SKPLQIFHDP PLPASDSKLV ERAMKIDHLS IEKL LIDSV HARAHQKLQE LKAILRGFNA NENSSIETAL PALVVPILEP CGNSECLHIF VDLHSGMFQL MLYGLDQATL DDMEK SVND DMKRIIPWIQ QLKFWLGQQR CKQSIKHLPT ISSETLQLSN YSTHPIGNLS KNKLFIKLTR LPQYYIVVEM LEVPNK PTQ LSYKYYFMSV NAADREDSPA MALLLQQFKE NIQDLVFRTK TGKQTRTNAK RKLSDDPCPV ESKKTKRAGE MCAFNKV LA HFVAMCDTNM PFVGLRLELS NLEIPHQGVQ VEGDGFSHAI RLLKIPPCKG ITEETQKALD RSLLDCTFRL QGRNNRTW V AELVFANCPL NGTSTREQGP SRHVYLTYEN LLSEPVGGRK VVEMFLNDWN SIARLYECVL EFARSLPDIP AHLNIFSEV RVYNYRKLIL CYGTTKGSSI SIQWNSIHQK FHISLGTVGP NSGCSNCHNT ILHQLQEMFN KTPNVVQLLQ VLFDTQAPLN AINKLPTVP MLGLTQRTNT AYQCFSILPQ SSTHIRLAFR NMYCIDIYCR SRGVVAIRDG AYSLFDNSKL VEGFYPAPGL K TFLNMFVD SNQDARRRSV NEDDNPPSPI GGDMMDSLIS QLQPPPQQQP FPKQPGTSGA YPLTSPPTSY HSTVNQSPSM MH TQSPGNL HAASSPSGAL RAPSPASFVP TPPPSSHGIS IGPGASFASP HGTLDPSSPY TMVSPSGRAG NWPGSPQVSG PSP AARMPG MSPANPSLHS PVPDASHSPR AGTSSQTMPT NMPPPRKLPQ RSWAASIPTI LTHSALNILL LPSPTPGLVP GLAG SYLCS PLERFLGSVI MRRHLQRIIQ QETLQLINSN EPGVIMFKTD ALKCRVALSP KTNQTLQLKV TPENAGQWKP DELQV LEKF FETRVAGPPF KANTLIAFTK LLGAPTHILR DCVHIMKLEL FPDQATQLKW NVQFCLTIPP SAPPIAPPGT PAVVLK SKM LFFLQLTQKT SVPPQEPVSI IVPIIYDMAS GTTQQADIPR QQNSSVAAPM MVSNILKRFA EMNPPRQGEC TIFAAVR DL MANLTLPPGG RP

+
分子 #47: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19
タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 26.321146 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MENFTALFGA QADPPPPPTA LGFGPGKPPP PPPPPAGGGP GTAPPPTAAT APPGADKSGA GCGPFYLMRE LPGSTELTGS TNLITHYNL EQAYNKFCGK KVKEKLSNFL PDLPGMIDLP GSHDNSSLRS LIEKPPILSS SFNPITGTML AGFRLHTGPL P EQCRLMHI ...文字列:
MENFTALFGA QADPPPPPTA LGFGPGKPPP PPPPPAGGGP GTAPPPTAAT APPGADKSGA GCGPFYLMRE LPGSTELTGS TNLITHYNL EQAYNKFCGK KVKEKLSNFL PDLPGMIDLP GSHDNSSLRS LIEKPPILSS SFNPITGTML AGFRLHTGPL P EQCRLMHI QPPKKKNKHK HKQSRTQDPV PPETPSDSDH KKKKKKKEED PDRKRKKKEK KKKKNRHSPD HPGMGSSQAS SS SSLR

+
分子 #48: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21
タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.575234 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MADRLTQLQD AVNSLADQFC NAIGVLQQCG PPASFNNIQT AINKDQPANP TEEYAQLFAA LIARTAKDID VLIDSLPSEE STAALQAAS LYKLEEENHE AATCLEDVVY RGDMLLEKIQ SALADIAQSQ LKTRSGTHSQ SLPDS

+
分子 #49: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.826116 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MAAAVAMETD DAGNRLRFQL ELEFVQCLAN PNYLNFLAQR GYFKDKAFVN YLKYLLYWKD PEYAKYLKYP QCLHMLELLQ YEHFRKELV NAQCAKFIDE QQILHWQHYS RKRMRLQQAL AEQQQQNNTS GK

+
分子 #50: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27
タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 35.478742 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MADVINVSVN LEAFSQAISA IQALRSSVSR VFDCLKDGMR NKETLEGREK AFIAHFQDNL HSVNRDLNEL ERLSNLVGKP SENHPLHNS GLLSLDPVQD KTPLYSQLLQ AYKWSNKLQY HAGLASGLLN QQSLKRSANQ MGVSAKRRPK AQPTTLVLPP Q YVDDVISR ...文字列:
MADVINVSVN LEAFSQAISA IQALRSSVSR VFDCLKDGMR NKETLEGREK AFIAHFQDNL HSVNRDLNEL ERLSNLVGKP SENHPLHNS GLLSLDPVQD KTPLYSQLLQ AYKWSNKLQY HAGLASGLLN QQSLKRSANQ MGVSAKRRPK AQPTTLVLPP Q YVDDVISR IDRMFPEMSI HLSRPNGTSA MLLVTLGKVL KVIVVMRSLF IDRTIVKGYN ENVYTEDGKL DIWSKSNYQV FQ KVTDHAT TALLHYQLPQ MPDVVVRSFM TWLRSYIKLF QAPCQRCGKF LQDGLPPTWR DFRTLEAFHD TCRQ

+
分子 #51: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28
タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 19.540107 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MAAPLGGMFS GQPPGPPQAP PGLPGQASLL QAAPGAPRPS SSTLVDELES SFEACFASLV SQDYVNGTDQ EEIRTGVDQC IQKFLDIAR QTECFFLQKR LQLSVQKPEQ VIKEDVSELR NELQRKDALV QKHLTKLRHW QQVLEDINVQ HKKPADIPQG S LAYLEQAS ANIPAPLKPT

+
分子 #52: unassigned peptide (MED29 or MED30)

分子名称: unassigned peptide (MED29 or MED30) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.720111 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #53: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30
タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 20.301229 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
MSTPPLAASG MAPGPFAGPQ AQQAAREVNT ASLCRIGQET VQDIVYRTME IFQLLRNMQL PNGVTYHTGT YQDRLTKLQD NLRQLSVLF RKLRLVYDKC NENCGGMDPI PVEQLIPYVE EDGSKNDDRA GPPRFASEER REIAEVNKKL KQKNQQLKQI M DQLRNLIW DINAMLAMRN

+
分子 #54: unassigned peptide (MED14)

分子名称: unassigned peptide (MED14) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.890321 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #55: unassigned peptide (MED6)

分子名称: unassigned peptide (MED6) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.379692 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #56: unassigned peptide (MED17)

分子名称: unassigned peptide (MED17) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 954.168 Da
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #57: unassigned peptide (MED29 or MED30)

分子名称: unassigned peptide (MED29 or MED30) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
分子量理論値: 1.549902 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)

+
分子 #58: unassigned peptide (MED29 or MED30)

分子名称: unassigned peptide (MED29 or MED30) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
分子量理論値: 1.975426 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #24: NT

分子名称: NT / タイプ: dna / ID: 24 / コピー数: 1 / 分類: DNA
由来(天然)生物種: Human mastadenovirus C (ウイルス)
分子量理論値: 32.911859 KDa
配列文字列: (DC)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DC) (DT)(DG)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG) (DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG) (DG)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG) (DC) (DG)(DC)(DG)(DT)(DT) ...文字列:
(DC)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DC) (DT)(DG)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG) (DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG) (DG)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG) (DC) (DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DC)(DG)(DT) (DC)(DC)(DT)(DC)(DA)(DC)(DT)(DC)(DT)(DC) (DT)(DT) (DC)(DC)(DG)(DC)(DA)(DT)(DC) (DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DG) (DA)(DG)(DG) (DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC) (DT)(DG)(DT)(DT)(DG)(DG)(DG)(DG)(DT)(DG) (DA)(DG)(DT)(DA) (DC)(DT)(DC)(DC)(DC) (DT)

+
分子 #28: TEMPLATE

分子名称: TEMPLATE / タイプ: dna / ID: 28 / コピー数: 1 / 分類: DNA
由来(天然)生物種: Human mastadenovirus C (ウイルス)
分子量理論値: 32.508752 KDa
配列文字列: (DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DT) (DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DA)(DC)(DA) (DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT) (DC)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC) (DG) (DA)(DT)(DG)(DC)(DG) ...文字列:
(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DT) (DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DA)(DC)(DA) (DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT) (DC)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC) (DG) (DA)(DT)(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA) (DG)(DA)(DG)(DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG) (DA)(DC) (DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG) (DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC) (DC)(DT)(DT) (DT)(DT)(DA)(DT)(DA)(DG) (DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA) (DG)(DG)(DA)(DA) (DC)(DA)(DC)(DC)(DC) (DG)

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分子 #59: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 1 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄 / 鉄・硫黄クラスター

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分子 #60: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 18 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #61: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 58.56 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 25967
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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