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万見
- EMDB-4782: Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4782
タイトルCryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6-fold symmetrised
マップデータCryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6-fold symmetrised
試料
  • 複合体: Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6-fold symmetrised
    • タンパク質・ペプチド: Afp1
    • タンパク質・ペプチド: Afp2
    • タンパク質・ペプチド: Afp3
    • タンパク質・ペプチド: Afp5
    • タンパク質・ペプチド: Afp9
    • タンパク質・ペプチド: Afp4
    • タンパク質・ペプチド: Afp7
    • タンパク質・ペプチド: Afp11
    • タンパク質・ペプチド: Afp12
機能・相同性
機能・相同性情報


virus tail / structural molecule activity
類似検索 - 分子機能
: / Contractile injection system tube protein, N-terminal domain / Contractile injection system tube protein / IraD/Gp25-like / Baseplate wedge protein gp25 / Conserved hypothetical protein CHP02241 / Bacteriophage T4, Gp19, tail tube / T4-like virus tail tube protein gp19 / Tail sheath protein, subtilisin-like domain / Phage tail sheath protein subtilisin-like domain ...: / Contractile injection system tube protein, N-terminal domain / Contractile injection system tube protein / IraD/Gp25-like / Baseplate wedge protein gp25 / Conserved hypothetical protein CHP02241 / Bacteriophage T4, Gp19, tail tube / T4-like virus tail tube protein gp19 / Tail sheath protein, subtilisin-like domain / Phage tail sheath protein subtilisin-like domain / Tail sheath protein, C-terminal domain / Phage tail sheath C-terminal domain
類似検索 - ドメイン・相同性
Afp12 / Afp11 / Afp9 / Afp7 / Afp5 / Afp4 / Afp3 / Afp2 / Afp1
類似検索 - 構成要素
生物種Serratia entomophila (バクテリア)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.1 Å
データ登録者Desfosses A
引用ジャーナル: Nat Microbiol / 年: 2019
タイトル: Atomic structures of an entire contractile injection system in both the extended and contracted states.
著者: Ambroise Desfosses / Hariprasad Venugopal / Tapan Joshi / Jan Felix / Matthew Jessop / Hyengseop Jeong / Jaekyung Hyun / J Bernard Heymann / Mark R H Hurst / Irina Gutsche / Alok K Mitra /
要旨: Contractile injection systems are sophisticated multiprotein nanomachines that puncture target cell membranes. Although the number of atomic-resolution insights into contractile bacteriophage tails, ...Contractile injection systems are sophisticated multiprotein nanomachines that puncture target cell membranes. Although the number of atomic-resolution insights into contractile bacteriophage tails, bacterial type six secretion systems and R-pyocins is rapidly increasing, structural information on the contraction of bacterial phage-like protein-translocation structures directed towards eukaryotic hosts is scarce. Here, we characterize the antifeeding prophage AFP from Serratia entomophila by cryo-electron microscopy. We present the high-resolution structure of the entire AFP particle in the extended state, trace 11 protein chains de novo from the apical cap to the needle tip, describe localization variants and perform specific structural comparisons with related systems. We analyse inter-subunit interactions and highlight their universal conservation within contractile injection systems while revealing the specificities of AFP. Furthermore, we provide the structure of the AFP sheath-baseplate complex in a contracted state. This study reveals atomic details of interaction networks that accompany and define the contraction mechanism of toxin-delivery tailocins, offering a comprehensive framework for understanding their mode of action and for their possible adaptation as biocontrol agents.
履歴
登録2019年4月6日-
ヘッダ(付随情報) 公開2019年4月17日-
マップ公開2019年4月17日-
更新2020年12月2日-
現状2020年12月2日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.1
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（円筒半径に従い着色）
  • 表面レベル: 0.1
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6rao
  • 表面レベル: 0.1
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 単純化した表面モデル + あてはめた原子モデル
  • 原子モデルPDB-6rao
  • Jmolによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4782.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4782.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 178 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6-fold symmetrised
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.35 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.1 / ムービー #1: 0.1
最小 - 最大-0.36811557 - 0.52417195
平均 (標準偏差)0.0010271558 (±0.016190868)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin-180-180-180
サイズ360360360
Spacing360360360
セルA=B=C: 486.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.351.351.35
M x/y/z360360360
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z486.000486.000486.000
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS-180-180-180
NC/NR/NS360360360
D min/max/mean-0.3680.5240.001

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添付データ

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ハーフマップ: None

ファイルemd_4782_half_map_1.map
注釈None
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: None

ファイルemd_4782_half_map_2.map
注釈None
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6...

全体名称: Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6-fold symmetrised
要素
  • 複合体: Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6-fold symmetrised
    • タンパク質・ペプチド: Afp1
    • タンパク質・ペプチド: Afp2
    • タンパク質・ペプチド: Afp3
    • タンパク質・ペプチド: Afp5
    • タンパク質・ペプチド: Afp9
    • タンパク質・ペプチド: Afp4
    • タンパク質・ペプチド: Afp7
    • タンパク質・ペプチド: Afp11
    • タンパク質・ペプチド: Afp12

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超分子 #1: Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6...

超分子名称: Cryo-EM structure of the anti-feeding prophage (AFP) baseplate, 6-fold symmetrised
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
詳細: Note that the needle is not resolved here because of 6-fold symmetry imposition
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)

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分子 #1: Afp1

分子名称: Afp1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 16.449449 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MAITADDIAV QYPIPTYRFI VTLGDEQVPF TSASGLDINF DTIEYRDGTG NWFKMPGQRQ APNITLSKGV FPGKNAMYEW INAIQLNQV EKKDIMISLT NEAGTEVLVS WNVSNAFPTS LTSPSFDATS NEIAVQQITL MADRVTIQTA

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分子 #2: Afp2

分子名称: Afp2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 38.784355 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MTVTTTYPGV YLSEDAVSSF SVNSAATAVP LFAYDSENTN TINKPIQVFR NWAEFTVEYP TPLEDAFYTS LSLWFMHGGG KCYLVNEAN IADAVAQYDD ITLIVAAGTD TTTYTAFTTV VGQGYRIFGL FDGPKEKIAG TAKPDEVMEE YPTSPFGAVF Y PWGTLASG ...文字列:
MTVTTTYPGV YLSEDAVSSF SVNSAATAVP LFAYDSENTN TINKPIQVFR NWAEFTVEYP TPLEDAFYTS LSLWFMHGGG KCYLVNEAN IADAVAQYDD ITLIVAAGTD TTTYTAFTTV VGQGYRIFGL FDGPKEKIAG TAKPDEVMEE YPTSPFGAVF Y PWGTLASG AAVPPSAIAA ASITQTDRTR GVWKAPANQA VNGVTPAFAV SDDFQGKYNQ GKALNMIRTF SGQGTVVWGA RT LEDSDNW RYIPVRRLFN AVERDIQKSL NKLVFEPNSQ PTWQRVKAAV DSYLHSLWQQ GALAGNTPAD AWFVQVGKDL TMT QEEINQ GKMIIKIGLA AVRPAEFIIL QFSQDIAQ

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分子 #3: Afp3

分子名称: Afp3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 48.777566 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MATVTSVPGV YIEEDASPAM SVSASATAVP LFVARFTPLK PELAGVITRI GSWLDYTILF DSNVPSSARV TVSSTAVEPS PEFDALETA SSKATTTYTY QIDDTEVVDP TASVALRLYF QNGGGPCYLY PLEKADDNGP LAALPDLIDE VGEITLLASP D PDETYRTA ...文字列:
MATVTSVPGV YIEEDASPAM SVSASATAVP LFVARFTPLK PELAGVITRI GSWLDYTILF DSNVPSSARV TVSSTAVEPS PEFDALETA SSKATTTYTY QIDDTEVVDP TASVALRLYF QNGGGPCYLY PLEKADDNGP LAALPDLIDE VGEITLLASP D PDETYRTA VYGALAASLD QHKGYFLLAD SVNGDAPSAV GGSAQVAVYY PNVEVPHTRK LDDAEVAIDG YLDDEGKAVT TL AALRVVN TEFAGEIAQS LSGDLSAPLS LPPSALIAGV YGKTDGERGV WKAPANVVLN GVSDVSVRVT NEQQAELNPK GIN VIRHFS DRGLVVWGSR TQKDDDDWRY IPVRRLFDAA ERDIKKALQP MVFEPNSQLT WKRVQTAIDN YLYRLWQQGA LAGN KAEEA YFVRVGKGIT MTQDEINQGK MIIQVGMAAV RPAEFIILKF TQDMSQ

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分子 #4: Afp5

分子名称: Afp5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 17.026539 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MSTPAVSHRF LVNFLFNNIP NPFDIAFQRI SGLSRTLEVS QHREGGENVR NLWLAEQVNH GSLVLERGVM NASPLTLQFD RVLRRESTQ WANVVIMLLN ELSLPVTTWT LSHALPVRWQ MGDLDAGSNQ VLINTLELRY QDMRMLGVKL

+
分子 #5: Afp9

分子名称: Afp9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 15.693884 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MSNDILKATL GQCWAFPPRF SPDTGVSLTA GVEAVMQSLR VLFMTEPGER IMRESYGGGM HDFIFENITD ELLANIHNRI EESILRHEP RALLKDVIIQ PDKQEASRLR AQITVYLAGS DLVETVDGTL NIHDGQTLRL L

+
分子 #6: Afp4

分子名称: Afp4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 45.565633 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MTMVLPGVSY NETLLTQASN DDPVTMPLFI GYTPPDTAIP VTVMQPVSVG SLTQANSLFG QRGTLAYSLR HFFENGGLQC YVLPLGPGK GEPAARLQEL IAALQTPQML ETLLADDKTG LVLVPELSEL NEVSSTSLSA EGVDAAEVDA DALWYQGWQV L LTLCRQAP ...文字列:
MTMVLPGVSY NETLLTQASN DDPVTMPLFI GYTPPDTAIP VTVMQPVSVG SLTQANSLFG QRGTLAYSLR HFFENGGLQC YVLPLGPGK GEPAARLQEL IAALQTPQML ETLLADDKTG LVLVPELSEL NEVSSTSLSA EGVDAAEVDA DALWYQGWQV L LTLCRQAP QRFALLELPE DPASAVTLTQ QSFSADQCQR GAAWWPRLET SYQDESSAPV VLSPLPAVAA AIQRSAHDNG VW KAPANIA LAKTRRPTQS ILTSQALLDN QGVSCNLIRS FVGKGVRLWG CRTLLNEENT AWRYIQIRLL VSSVEHYLSK LAR AYLFEP NTAPTWMKLK GQVWTWLRQQ WLAGAFFGTV EDEAFSLSIG LDETMTEDDI RHGKMILQVR LALLAPAEFI AISL TLDLR DGTASAQTGG QS

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分子 #7: Afp7

分子名称: Afp7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 25.259434 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MSLLERGLSK LTLNAWKDRE GKIPAGSMSA MYNPETIQLD YQTRFDTEDT INTASQSNRY VISEPVGLNL TLLFDSQMPG NTTPIETQL AMLKSLCAVD AATGSPYFLR ITWGKMRWEN KGWFAGRARD LSVTYTLFDR DATPLRATVQ LSLVADESFV I QQSLKTQS ...文字列:
MSLLERGLSK LTLNAWKDRE GKIPAGSMSA MYNPETIQLD YQTRFDTEDT INTASQSNRY VISEPVGLNL TLLFDSQMPG NTTPIETQL AMLKSLCAVD AATGSPYFLR ITWGKMRWEN KGWFAGRARD LSVTYTLFDR DATPLRATVQ LSLVADESFV I QQSLKTQS APDRALVSVP DLASLPLLAL SAGGVLASSV DYLSLAWDND LDNLDDFQTG DFLRATKGEE V

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分子 #8: Afp11

分子名称: Afp11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 67.327516 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MSDLEQLKQI LGNGLTDQTF LLEPRTGKGL LNLMAKYTEA VPFAGHTDAD WKDFWMAGCT LEALSDIYQY PGLAEKKLPV QQAFLLALL HLLETPRAML NTVPARHRSL YYRDLLGFAP RAPQPDSVAV SFTLQRNSSP YALPAGSLLD GGQDSAGNSI T YQTDDSLL ...文字列:
MSDLEQLKQI LGNGLTDQTF LLEPRTGKGL LNLMAKYTEA VPFAGHTDAD WKDFWMAGCT LEALSDIYQY PGLAEKKLPV QQAFLLALL HLLETPRAML NTVPARHRSL YYRDLLGFAP RAPQPDSVAV SFTLQRNSSP YALPAGSLLD GGQDSAGNSI T YQTDDSLL ITGQQLEQLC WTAQVGETWK RYTAIDSATG VTLPAEGLRL FTATGQGTDT KEKAPELYLG FSGTSAQDTL SL YWSVRAS SALDVTWWYY QGTKWASLDA ELQDNTASLS VSNLWRARLP ADSQPGSGLP QDDEPLEAGY YWIKGTLKEN KEA KDENSP AEAMPQLQAV LANAMTATLN VAQAIDDSHF SQPLPANTIN QLVTPVAAIS DVRQPLPSVG GQPRETEMAM LQRA APRIA HRQRAITWNN MRSLLMEHYP EIFDVRFPDV DKLSRLPALE VQSLMVIPDG RYGDNDDALR PALSNGRLSR MAQWL SQYT SLWAAPTLKN PKYIDVTARY RVTFVVGIRP DYGYRQLAAQ LQHDYMPWAT DRRQAVTPGN QVDYYQLLAT LQQSPL VQS VNALVLSHDV IDETGKPTSM ETQSTVTARD DEVLILCPEG ETHV

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分子 #9: Afp12

分子名称: Afp12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Serratia entomophila (バクテリア)
分子量理論値: 106.905594 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MSKENALFPA VKDAIVFDAL WQQAHEKVTA LSGEIWTDTG DHDPGVTLLQ SATWNCSDLS YRASLSLNDL LTHQDQSTLF PEEFGPEQV LTCNTVTAED YRRALLDVHS SDIQALDTPE QDFLFSDVSL TQEPKEHRFH WWYNAEKREY SFRKPTDSGE V NELKLRGN ...文字列:
MSKENALFPA VKDAIVFDAL WQQAHEKVTA LSGEIWTDTG DHDPGVTLLQ SATWNCSDLS YRASLSLNDL LTHQDQSTLF PEEFGPEQV LTCNTVTAED YRRALLDVHS SDIQALDTPE QDFLFSDVSL TQEPKEHRFH WWYNAEKREY SFRKPTDSGE V NELKLRGN LWLSLVPTRY TQSLSPENLA AVEQCLAEFL AAHRNLGEVV SRITWLQPAT FSPRMTIELA DNIGDINQVA AQ IYQVTDA FLRPAVARYT TEQRRALGDA DDAIFEGPRL KHGWQQTAPS QITSGGYVLN LGPLVNLLLA IPGVASLSTL SVD KGDGHI TAVTGDNLRW QVADGYYPLL WGAPPLSLLA GDDSPLTLVS KGGIRNTLES EAMAGYLTQA DLIVTTPTVL PAGR FRDQT LYIPIGQRQP ECYALQQPDT VIDDQTRAVH QFLLPVDQLL ADGTAELAQL PTLLAFKNRG DAIRGTRWPY TNAMV QQAI HQPYAKTLEA IAQQDAAIFT QDKQPVGGNY ARELDFLQYL LGYFGTQRAA LPLTLDLPDF LATQRAYLAQ QPALGY DRI NIRIDQVSAL QKRIAARIGL DSICFADNPD LGQLPFYLIE HRQLLPQTPD STFDSEQTPS GFAVAEPDIT LTQAGSV GK VVQGQLIDLI AIEGGSRLHV SRLLVIKAEG DSFTVSTENS QQLHNTLSRL ETAWASHNLR WQNSNVWLQD MDYRLNYA E AKLQPANPQQ RLLASNAQSP YPAMVSVGDG IVLRPAGLQF YMPGANATRA ATLDADWQLA ATVKAVDPIA GTLLIEKAA GSTEDFPSAE SSFRYQWAFS QANYATTDRF SFVVSAVLNR RLIENPNIVP EQLVAWIQET IMAEFPAHVS LINHWLDDAT FNNFGVTYS RWQNSGMPLG DDAFALMQIL TLGHLPVTQL DIGLMRIATE EQRTEVIGDG SQWHEDVILR EELFYVPKDV Q TTL

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 20.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C6 (6回回転対称) / アルゴリズム: BACK PROJECTION / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 46991
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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