登録情報 データベース : PDB / ID : 5jov 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Bacteroides ovatus Xyloglucan PUL GH31 with bound 5FIdoF 要素Alpha-xylosidase BoGH31A 詳細 キーワード HYDROLASE / Glycoside hydrolase / GH31機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
alpha-D-xyloside xylohydrolase / alpha-D-xyloside xylohydrolase / symbiotic process benefiting host / xyloglucan catabolic process / hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds / carbohydrate binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 Alpha-glucosidase, N-terminal / Jelly Rolls - #380 / : / Domain of unknown function DUF5110 / Domain of unknown function (DUF5110) / glycosyl hydrolase (family 31) / PA14/GLEYA domain / PA14 domain profile. / Glycoside hydrolase family 31 / Glycosyl hydrolases family 31 TIM-barrel domain ... Alpha-glucosidase, N-terminal / Jelly Rolls - #380 / : / Domain of unknown function DUF5110 / Domain of unknown function (DUF5110) / glycosyl hydrolase (family 31) / PA14/GLEYA domain / PA14 domain profile. / Glycoside hydrolase family 31 / Glycosyl hydrolases family 31 TIM-barrel domain / Galactose mutarotase-like domain superfamily / Golgi alpha-mannosidase II / Glycosyl hydrolase, all-beta / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / Jelly Rolls / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 5-fluoro-alpha-L-idopyranose / NICKEL (II) ION / Alpha-xylosidase BoGH31A 類似検索 - 構成要素生物種 Bacteroides ovatus (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.5 Å 詳細データ登録者 Thompson, A.J. / Hemsworth, G.R. / Stepper, J. / Sobala, L.F. / Coyle, T. / Larsbrink, J. / Spadiut, O. / Stubbs, K.A. / Brumer, H. / Davies, G.J. 資金援助 英国, 3件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Biotechnology and Biological Sciences Research Council BB/K00591X/1 英国 Biotechnology and Biological Sciences Research Council BB/I014802/1 英国 European Research Council 322942 英国
引用ジャーナル : Open Biology / 年 : 2016タイトル : Structural dissection of a complex Bacteroides ovatus gene locus conferring xyloglucan metabolism in the human gut.著者 : Hemsworth, G.R. / Thompson, A.J. / Stepper, J. / Sobala, F. / Coyle, T. / Larsbrink, J. / Spadiut, O. / Goddard-Borger, E.D. / Stubbs, K.A. / Brumer, H. / Davies, G.J. 履歴 登録 2016年5月3日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2016年8月10日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年8月30日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Derived calculations / Structure summaryカテゴリ : atom_site / atom_site_anisotrop ... atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ... _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry / _struct_conn_type.id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2024年1月10日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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