登録情報 | データベース: PDB / ID: 4k6o |
---|
タイトル | X-ray structure uridine phosphorylase from Vibrio cholerae in complex with 6-methyluracil at 1.17 A resolution |
---|
要素 | Uridine phosphorylase |
---|
キーワード | TRANSFERASE / Rossmann Fold |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
uridine catabolic process / uridine phosphorylase / nucleotide catabolic process / uridine phosphorylase activity / UMP salvage / purine nucleoside catabolic process / purine-nucleoside phosphorylase activity / metal ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 Uridine phosphorylase / Nucleoside phosphorylase, conserved site / Purine and other phosphorylases family 1 signature. / Nucleoside phosphorylase domain / Nucleoside phosphorylase domain / Phosphorylase superfamily / Nucleoside phosphorylase superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 6-methylpyrimidine-2,4-diol / ETHANOL / Uridine phosphorylase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Vibrio cholerae (コレラ菌) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.17 Å |
---|
データ登録者 | Prokofev, I.I. / Lashkov, A.A. / Gabdoulkhakov, A.G. / Betzel, C. / Mikhailov, A.M. |
---|
引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.F / 年: 2014 タイトル: Crystallization and preliminary X-ray study of Vibrio cholerae uridine phosphorylase in complex with 6-methyluracil. 著者: Prokofev, I.I. / Lashkov, A.A. / Gabdulkhakov, A.G. / Dontsova, M.V. / Seregina, T.A. / Mironov, A.S. / Betzel, C. / Mikhailov, A.M. |
---|
履歴 | 登録 | 2013年4月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
---|
改定 1.0 | 2014年5月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2014年5月14日 | Group: Data collection / Database references |
---|
改定 1.2 | 2019年12月18日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author / diffrn_source Item: _citation.country / _citation.journal_id_ASTM ..._citation.country / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.name / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _diffrn_source.pdbx_wavelength / _diffrn_source.pdbx_wavelength_list |
---|
改定 1.3 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
|
---|