PDB-4g2s: Crystal structure of a Salmonella type III secretion system protein

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4g2s

タイトル

Crystal structure of a Salmonella type III secretion system protein

要素

Protein prgH

キーワード

CELL INVASION / FHA domain

機能・相同性

Type III secretion system, PrgH/EprH / Type III secretion system, PrgH/EprH-like / Type III secretion system protein PrgH-EprH (PrgH) / Tumour Suppressor Smad4 - #20 / Tumour Suppressor Smad4 / Sandwich / Mainly Beta / plasma membrane / Protein PrgH

機能・相同性情報

生物種

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (サルモネラ菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

多波長異常分散 / 解像度: 1.858 Å

データ登録者

Worrall, L.J. / Vuckovic, M. / Strynadka, N.C.J.

引用

ジャーナル: PLoS Pathog / 年: 2013
タイトル: A refined model of the prototypical Salmonella SPI-1 T3SS basal body reveals the molecular basis for its assembly.
著者: Julien R C Bergeron / Liam J Worrall / Nikolaos G Sgourakis / Frank DiMaio / Richard A Pfuetzner / Heather B Felise / Marija Vuckovic / Angel C Yu / Samuel I Miller / David Baker / Natalie C J Strynadka /

要旨: The T3SS injectisome is a syringe-shaped macromolecular assembly found in pathogenic Gram-negative bacteria that allows for the direct delivery of virulence effectors into host cells. It is composed ...

履歴

登録	2012年7月12日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年5月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb4g2s.ent.gz	216.4 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4g2s_validation.pdf.gz	476.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4g2s_full_validation.pdf.gz	498.3 KB	表示
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CIF形式データ	4g2s_validation.cif.gz	34.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g2/4g2s ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g2/4g2s	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3j1vC 3j1wC 3j1xC 4g08C 4g1iC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1yqf-1 1yqf-2 6j0l-3 2ppy-2 3noj-2 1x9g-1 3qv0-1 4f8b-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Protein prgH

B: Protein prgH

C: Protein prgH

D: Protein prgH

E: Protein prgH

F: Protein prgH

ヘテロ分子

72.1 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	33.940, 120.580, 78.280
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 96.700, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Refine code: 1

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	GLY	GLY	ASP	ASP	A	A	41 - 58	33 - 50
2	1	GLY	GLY	ASP	ASP	B	B	41 - 58	33 - 50
3	1	GLY	GLY	ASP	ASP	C	C	41 - 58	33 - 50
4	1	GLY	GLY	ASP	ASP	D	D	41 - 58	33 - 50
5	1	GLY	GLY	ASP	ASP	E	E	41 - 58	33 - 50
6	1	GLY	GLY	ASP	ASP	F	F	41 - 58	33 - 50
1	2	PRO	PRO	GLY	GLY	A	A	63 - 68	55 - 60
2	2	PRO	PRO	GLY	GLY	B	B	63 - 68	55 - 60
3	2	PRO	PRO	GLY	GLY	C	C	63 - 68	55 - 60
4	2	PRO	PRO	GLY	GLY	D	D	63 - 68	55 - 60
5	2	PRO	PRO	GLY	GLY	E	E	63 - 68	55 - 60
6	2	PRO	PRO	GLY	GLY	F	F	63 - 68	55 - 60
1	3	LYS	LYS	GLU	GLU	A	A	88 - 93	80 - 85
2	3	LYS	LYS	GLU	GLU	B	B	88 - 93	80 - 85
3	3	LYS	LYS	GLU	GLU	C	C	88 - 93	80 - 85
4	3	LYS	LYS	GLU	GLU	D	D	88 - 93	80 - 85
5	3	LYS	LYS	GLU	GLU	E	E	88 - 93	80 - 85
6	3	LYS	LYS	GLU	GLU	F	F	88 - 93	80 - 85
1	4	ASP	ASP	GLU	GLU	B	B	76 - 81	68 - 73
2	4	ASP	ASP	GLU	GLU	A	A	76 - 81	68 - 73
3	4	ASP	ASP	GLU	GLU	C	C	76 - 81	68 - 73
4	4	ASP	ASP	GLU	GLU	D	D	76 - 81	68 - 73
5	4	ASP	ASP	GLU	GLU	E	E	76 - 81	68 - 73
6	4	ASP	ASP	GLU	GLU	F	F	76 - 81	68 - 73
1	5	LEU	LEU	GLY	GLY	B	B	31 - 34	23 - 26
2	5	LEU	LEU	GLY	GLY	A	A	31 - 34	23 - 26
3	5	LEU	LEU	GLY	GLY	C	C	31 - 34	23 - 26
4	5	LEU	LEU	GLY	GLY	D	D	31 - 34	23 - 26
5	5	LEU	LEU	GLY	GLY	E	E	31 - 34	23 - 26
6	5	LEU	LEU	GLY	GLY	F	F	31 - 34	23 - 26

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5

#1: タンパク質	Protein prgH 分子量: 12007.406 Da / 分子数: 6 / 断片: UNP residues 11-119 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (サルモネラ菌) 遺伝子: prgH, STM2874 / プラスミド: pET28a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P41783
#2: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 57 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.21 Å³/Da / 溶媒含有率: 44.3 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 15-20% PEG6000, 0.02 M calcium chloride, 0.1 M HEPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

CLSI

/ ビームライン: 08ID-1 / 波長: 0.9789 Å

検出器

タイプ: RAYONIX MX300HE / 検出器: CCD / 日付: 2010年8月3日 / 詳細: mirrors

放射

モノクロメーター: double crystal Si(111) / プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9789 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.858→77.745 Å / Num. all: 50809 / Num. obs: 50809 / % possible obs: 96.8 % / 冗長度: 2.2 % / R_sym value: 0.042 / Net I/σ(I): 10.7

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured all	Num. unique all	R_sym value	% possible all
1.858-1.96	2.2	0.227	3.3	14720	6832	0.227	89.4
1.96-2.08	2.2	0.136	5.4	15410	7043	0.136	97.4
2.08-2.22	2.2	0.091	7.8	14507	6627	0.091	97.5
2.22-2.4	2.2	0.064	10.8	13536	6192	0.064	97.6
2.4-2.63	2.2	0.056	11.6	12546	5738	0.056	97.8
2.63-2.94	2.2	0.044	12.7	11352	5189	0.044	99
2.94-3.39	2.2	0.041	13.3	10088	4639	0.041	98.8
3.39-4.15	2.2	0.039	12.1	8530	3915	0.039	99.6
4.15-5.88	2.2	0.03	16.6	6531	3029	0.03	99.4
5.88-47.643	2.1	0.032	15	3367	1605	0.032	94.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
MOSFLM		データ削減
SCALA	3.3.16	データスケーリング
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
MxDC		データ収集
SHARP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

多波長異常分散 / 解像度: 1.858→47.69 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.938 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.925 / WR_factor R_free: 0.2767 / WR_factor R_work: 0.2472 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / FOM work R set: 0.8264 / SU B: 7.859 / SU ML: 0.115 / SU R Cruickshank DPI: 0.184 / SU R_free: 0.158 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.184 / ESU R Free: 0.158 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2571	2592	5.1 %	RANDOM
R_work	0.2294	-	-	-
obs	0.2308	50748	96.57 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 180.5 Å² / B_iso mean: 49.8735 Å² / B_iso min: 14.06 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	2.53 Å²	-0 Å²	0.09 Å²
2-	-	-1.77 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-0.74 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.858→47.69 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4914	0	1	57	4972

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.017	0.019	5016
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.002	0.02	4782
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.836	1.982	6846
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.924	3	11040
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.31	5	630
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	27.487	25.526	228
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.759	15	810
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	25.196	15	24
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.104	0.2	810
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.008	0.021	5682
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.002	0.02	1062

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: TIGHT THERMAL / Weight position: 0.5

LS精密化シェル

解像度: 1.858→1.906 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.325	155	-
R_work	0.273	2990	-
all	-	3145	-
obs	-	-	81.22 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	9.7492	-4.496	-1.6416	7.2807	1.718	4.3143	-0.0095	-0.0764	-0.1497	-0.2529	0.1065	0.1791	-0.2134	-0.1915	-0.097	0.0919	0.0287	-0.0028	0.0759	0.0126	0.0102	-2.699	17.841	-27.915
2	31.2032	-9.5388	5.3835	9.6818	5.856	9.2595	0.2351	-1.249	-0.0439	0.8528	-0.4119	0.2249	1.0539	-1.1337	0.1768	0.1877	-0.012	0.0367	0.3589	0.0688	0.227	-11.564	19.419	-17.016
3	10.2773	0.2295	-2.1358	6.2588	-1.4757	7.1206	-0.1329	-0.2278	-0.7128	0.0966	-0.0941	-0.4951	1.0221	0.3783	0.2269	0.1678	0.0363	-0.0001	0.1637	-0.0096	0.0929	2.33	9.442	-15.693
4	10.6199	-9.8605	6.1463	9.1842	-5.6871	3.5707	-0.0362	-0.1919	-0.1366	0.0983	0.0808	0.189	0.0232	-0.1825	-0.0446	0.4819	-0.0512	0.0422	0.5971	0.0035	0.5225	-10.39	6.299	-15.388
5	46.215	-3.1641	-7.992	7.6755	-0.506	6.2228	-0.2403	-0.0455	-0.1789	0.0629	0.1033	0.2065	0.5152	0.0722	0.1369	0.0874	0.0029	0.0031	0.0716	-0.0303	0.0345	-0.928	11.745	-19.441
6	13.4116	-6.7619	0.056	9.487	0.7899	5.3561	0.1119	0.1433	0.3669	0.0398	-0.0048	-0.2448	0.0857	0.1432	-0.1072	0.0338	-0.0089	-0.0154	0.0461	0.0011	0.0223	1.176	19.37	-16.193
7	19.8782	-1.6776	12.9974	3.8026	-8.2279	22.5034	-0.4283	0.5634	2.2456	-0.4187	-0.1228	0.3316	0.447	0.349	0.5511	0.7128	0.1091	0.0541	0.5213	-0.0449	0.6928	-15.272	30.393	-18.704
8	6.5901	-2.7382	2.2553	9.5446	-1.0385	7.0611	-0.0174	0.0492	0.4305	0.2397	-0.18	-0.4831	-0.5209	0.3408	0.1973	0.1125	-0.0232	0.033	0.0948	-0.029	0.1368	-0.09	25.821	-11.376
9	3.3861	-3.707	3.0297	8.164	-2.3101	7.3234	-0.0731	0.174	0.6697	-0.1604	-0.0852	-0.5905	-0.8636	0.3872	0.1583	0.1761	-0.0429	0.0717	0.109	0.0065	0.1959	1.909	25.957	-24.089
10	9.7946	-1.0766	-1.5512	6.3791	-0.4704	9.4075	0.0014	0.8076	-0.0341	-0.509	-0.1432	0.4708	-0.3555	-0.5106	0.1417	0.2617	0.0779	-0.0522	0.1618	0.0247	0.16	-7.728	24.516	-32.413
11	8.8142	-4.0401	2.1174	10.3207	-2.8223	5.0951	-0.058	-0.3146	-0.2392	0.2722	0.0144	-0.0285	-0.0156	-0.1351	0.0435	0.1052	-0.0097	-0.0035	0.0156	0.0078	0.0642	-0.339	0.231	-43.664
12	16.107	-7.2669	7.3679	12.0068	-0.6704	13.5078	-0.1108	-0.2499	0.1785	0.0921	0.1239	0.4238	-0.1057	-0.6521	-0.0131	0.0723	0.0148	0.031	0.0579	0.0234	0.0514	-3.945	10.291	-37.828
13	1.6299	-0.9835	3.9621	0.6594	-2.4755	9.7488	-0.01	-0.1461	0.0121	-0.1927	0.1237	0.1178	0.2573	-0.3635	-0.1137	0.8743	-0.0276	0.0176	0.7436	0.0407	0.8679	4.587	4.88	-25.691
14	50.7608	41.0664	-11.2715	33.275	-9.0775	2.5361	0.6278	-0.6748	-0.2981	0.5625	-0.7782	-0.1483	-0.0956	-0.0351	0.1504	1.0026	-0.0184	0.0498	1.1496	-0.2932	0.8602	-10.537	5.648	-29.486
15	9.9175	6.5392	-9.1112	25.915	14.6939	28.2419	-0.5085	-0.065	-0.5833	0.7661	-0.1769	-0.1651	1.4814	-0.1054	0.6855	0.3836	0.0076	0.0441	0.1575	0.1935	0.2814	-1.06	5.06	-33.887
16	5.7171	1.2056	1.9676	19.2606	6.4036	6.2065	-0.087	-0.0164	-0.1612	-1.0083	-0.1982	-0.4082	0.5692	0.5304	0.2852	0.4927	0.0419	-0.0972	0.4866	0.0121	0.4492	12.75	3.948	-35.253
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58	23.5393	-10.1597	-6.0069	6.4777	-0.4846	6.4528	-0.1367	-0.3418	0.0192	0.4996	-0.01	0.0314	-0.3827	0.1245	0.1467	0.2708	-0.1272	0.0915	0.1717	-0.099	0.1585	-4.029	5.608	9.867
59	9.4163	-12.7936	1.0898	18.8592	-0.432	1.9021	0.0035	-0.0976	0.0999	0.3304	0.0292	-0.6466	0.3373	0.4435	-0.0326	0.4247	-0.0277	-0.0006	0.4119	0.0778	0.3883	1.066	4.106	12.736
60	4.5915	-1.9325	-0.441	5.1831	-0.0841	4.6247	0.0478	-0.2187	0.482	0.1697	-0.0466	0.1005	-0.4464	-0.2178	-0.0012	0.1315	-0.0357	0.0007	0.0803	-0.0262	0.1071	-5.9	16.484	1.898

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	14 - 30
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	31 - 36
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	37 - 48
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	49 - 57
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	58 - 64
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	65 - 75
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	76 - 81
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	82 - 96
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	97 - 111
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	112 - 119
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	14 - 31
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	32 - 40
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	41 - 51
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	52 - 57
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	58 - 62
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	63 - 68
17	X-RAY DIFFRACTION	17	B	69 - 74
18	X-RAY DIFFRACTION	18	B	75 - 87
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	88 - 93
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	94 - 119
21	X-RAY DIFFRACTION	21	C	14 - 32
22	X-RAY DIFFRACTION	22	C	33 - 42
23	X-RAY DIFFRACTION	23	C	43 - 51
24	X-RAY DIFFRACTION	24	C	52 - 57
25	X-RAY DIFFRACTION	25	C	58 - 75
26	X-RAY DIFFRACTION	26	C	76 - 81
27	X-RAY DIFFRACTION	27	C	82 - 87
28	X-RAY DIFFRACTION	28	C	88 - 96
29	X-RAY DIFFRACTION	29	C	97 - 113
30	X-RAY DIFFRACTION	30	C	114 - 119
31	X-RAY DIFFRACTION	31	D	14 - 31
32	X-RAY DIFFRACTION	32	D	32 - 37
33	X-RAY DIFFRACTION	33	D	38 - 43
34	X-RAY DIFFRACTION	34	D	44 - 51
35	X-RAY DIFFRACTION	35	D	52 - 57
36	X-RAY DIFFRACTION	36	D	58 - 72
37	X-RAY DIFFRACTION	37	D	73 - 81
38	X-RAY DIFFRACTION	38	D	82 - 91
39	X-RAY DIFFRACTION	39	D	92 - 97
40	X-RAY DIFFRACTION	40	D	98 - 119
41	X-RAY DIFFRACTION	41	E	14 - 31
42	X-RAY DIFFRACTION	42	E	32 - 37
43	X-RAY DIFFRACTION	43	E	38 - 44
44	X-RAY DIFFRACTION	44	E	45 - 51
45	X-RAY DIFFRACTION	45	E	52 - 57
46	X-RAY DIFFRACTION	46	E	58 - 75
47	X-RAY DIFFRACTION	47	E	76 - 85
48	X-RAY DIFFRACTION	48	E	86 - 91
49	X-RAY DIFFRACTION	49	E	92 - 98
50	X-RAY DIFFRACTION	50	E	99 - 119
51	X-RAY DIFFRACTION	51	F	14 - 35
52	X-RAY DIFFRACTION	52	F	36 - 44
53	X-RAY DIFFRACTION	53	F	45 - 51
54	X-RAY DIFFRACTION	54	F	52 - 57
55	X-RAY DIFFRACTION	55	F	58 - 66
56	X-RAY DIFFRACTION	56	F	67 - 75
57	X-RAY DIFFRACTION	57	F	76 - 81
58	X-RAY DIFFRACTION	58	F	82 - 87
59	X-RAY DIFFRACTION	59	F	88 - 97
60	X-RAY DIFFRACTION	60	F	98 - 119

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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