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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3kjg | ||||||
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タイトル | ADP-bound state of CooC1 | ||||||
![]() | CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase complex, accessory protein CooC | ||||||
![]() | HYDROLASE / METAL BINDING PROTEIN / ADP-bound dimer / nickel binding protein / ATPase | ||||||
機能・相同性 | ![]() negative regulation of cell division / cytoplasmic side of plasma membrane / ATP hydrolysis activity / ATP binding / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Jeoung, J.-H. / Dobbek, H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of the ATP-Dependent Maturation Factor of Ni,Fe-Containing Carbon Monoxide Dehydrogenases 著者: Jeoung, J.H. / Giese, T. / Grunwald, M. / Dobbek, H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 114.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 89 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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詳細 | Biological oligomeric state is monomer and dimer equilibrium |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 27996.701 Da / 分子数: 2 / 断片: CooC1 ATPase / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: Z-2901 / 遺伝子: CHY_1220, cooC1 / プラスミド: pET11a / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.88 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.27 % |
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結晶化 | 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.4 詳細: 0.2 M lithium citrate tribasic, 14% PEG3350, 5% Glycerol, 1 mM ADP, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2008年3月11日 / 詳細: osmic mirrors |
放射 | モノクロメーター: mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→20 Å / Num. obs: 29710 / % possible obs: 99.5 % / Observed criterion σ(F): 2 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.4 Å / % possible all: 99.8 |
-位相決定
位相決定 | 手法: ![]() |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | Bsol: 45.289 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 157.37 Å2 / Biso mean: 49.622 Å2 / Biso min: 15.25 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→19.64 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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