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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2zqj | ||||||
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タイトル | Substrate-Free Form of Cytochrome P450BSbeta | ||||||
![]() | Cytochrome P450 152A1 | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / Peroxigenese / Heme protein / Substrate-free form / Heme / Iron / Metal-binding / Monooxygenase | ||||||
機能・相同性 | ![]() fatty-acid peroxygenase / oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen / monooxygenase activity / iron ion binding / heme binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Shoji, O. / Fujishiro, T. / Nagano, S. / Hirose, T. / Shiro, Y. / Watanabe, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Understanding substrate misrecognition of hydrogen peroxide dependent cytochrome P450 from Bacillus subtilis. 著者: Shoji, O. / Fujishiro, T. / Nagano, S. / Tanaka, S. / Hirose, T. / Shiro, Y. / Watanabe, Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 254.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 208.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 48181.066 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: O31440, 酸化還元酵素; 電子対供与作用を持つ; 分子酸素を取り込むないしは分子酸素を還元する #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.79 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.88 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.1 詳細: 12.5%(w/v) PEG3350, 50mM Tris-HCl, 0.1M MgCl2, 20% glycerol, pH8.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2007年10月3日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.9→50 Å / Num. obs: 34186 / % possible obs: 95.1 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 7.2 % / Biso Wilson estimate: 71.4 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.088 / Net I/σ(I): 28.32 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1IZO 解像度: 2.9→46.6 Å / σ(F): 0
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原子変位パラメータ | Biso mean: 47 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→46.6 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.37→2.52 Å / Rfactor Rwork: 0.286 |