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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7zqd | |||||||||||||||
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タイトル | Dimeric PSI of Chlamydomonas reinhardtii at 2.97 A resolution | |||||||||||||||
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![]() | PHOTOSYNTHESIS / green algae / dimeric PSI | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() photosynthesis, light harvesting / chloroplast thylakoid lumen / photosynthesis, light harvesting in photosystem I / photosystem I reaction center / photosystem I / photosystem I / photosystem II / chlorophyll binding / photosynthetic electron transport in photosystem I / chloroplast thylakoid membrane ...photosynthesis, light harvesting / chloroplast thylakoid lumen / photosynthesis, light harvesting in photosystem I / photosystem I reaction center / photosystem I / photosystem I / photosystem II / chlorophyll binding / photosynthetic electron transport in photosystem I / chloroplast thylakoid membrane / response to light stimulus / photosynthesis / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / oxidoreductase activity / electron transfer activity / magnesium ion binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.97 Å | |||||||||||||||
![]() | Naschberger, A. / Amunts, A. | |||||||||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Algal photosystem I dimer and high-resolution model of PSI-plastocyanin complex. 著者: Andreas Naschberger / Laura Mosebach / Victor Tobiasson / Sebastian Kuhlgert / Martin Scholz / Annemarie Perez-Boerema / Thi Thu Hoai Ho / André Vidal-Meireles / Yuichiro Takahashi / Michael ...著者: Andreas Naschberger / Laura Mosebach / Victor Tobiasson / Sebastian Kuhlgert / Martin Scholz / Annemarie Perez-Boerema / Thi Thu Hoai Ho / André Vidal-Meireles / Yuichiro Takahashi / Michael Hippler / Alexey Amunts / ![]() ![]() ![]() ![]() 要旨: Photosystem I (PSI) enables photo-electron transfer and regulates photosynthesis in the bioenergetic membranes of cyanobacteria and chloroplasts. Being a multi-subunit complex, its macromolecular ...Photosystem I (PSI) enables photo-electron transfer and regulates photosynthesis in the bioenergetic membranes of cyanobacteria and chloroplasts. Being a multi-subunit complex, its macromolecular organization affects the dynamics of photosynthetic membranes. Here we reveal a chloroplast PSI from the green alga Chlamydomonas reinhardtii that is organized as a homodimer, comprising 40 protein subunits with 118 transmembrane helices that provide scaffold for 568 pigments. Cryogenic electron microscopy identified that the absence of PsaH and Lhca2 gives rise to a head-to-head relative orientation of the PSI-light-harvesting complex I monomers in a way that is essentially different from the oligomer formation in cyanobacteria. The light-harvesting protein Lhca9 is the key element for mediating this dimerization. The interface between the monomers is lacking PsaH and thus partially overlaps with the surface area that would bind one of the light-harvesting complex II complexes in state transitions. We also define the most accurate available PSI-light-harvesting complex I model at 2.3 Å resolution, including a flexibly bound electron donor plastocyanin, and assign correct identities and orientations to all the pigments, as well as 621 water molecules that affect energy transfer pathways. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 4 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 表示 | ![]() | |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
-Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein ... , 2種, 4分子 AA2BB2
#1: タンパク質 | 分子量: 83239.203 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P12154, photosystem I #2: タンパク質 | 分子量: 82184.266 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P09144, photosystem I |
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-タンパク質 , 2種, 4分子 CC2LL2
#3: タンパク質 | 分子量: 8869.325 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q00914, photosystem I #10: タンパク質 | 分子量: 20300.539 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A8IL32 |
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-Photosystem I reaction center subunit ... , 7種, 14分子 DD2EE2FF2GG2II2JJ2KK2
#4: タンパク質 | 分子量: 21372.887 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q39615 #5: タンパク質 | 分子量: 10786.395 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P12352 #6: タンパク質 | 分子量: 24088.936 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P12356 #7: タンパク質 | 分子量: 13236.007 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P14224 #8: タンパク質 | 分子量: 10586.388 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A8IFG7 #9: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4645.372 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P59777 #11: タンパク質 | 分子量: 11214.084 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: P14225 |
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-Chlorophyll a-b binding protein, ... , 8種, 18分子 1Z12Z2332772882442552662992
#12: タンパク質 | 分子量: 23923.205 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q05093 #13: タンパク質 | 分子量: 32629.486 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A8JF10 #14: タンパク質 | 分子量: 26248.869 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q84Y02 #15: タンパク質 | 分子量: 25948.812 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q75VY7 #16: タンパク質 | 分子量: 28729.822 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q75VZ0 #17: タンパク質 | 分子量: 28257.555 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q75VY8 #18: タンパク質 | 分子量: 27812.373 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q75VY6 #19: タンパク質 | 分子量: 22867.277 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() ![]() 参照: UniProt: A8ITV3 |
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-糖 , 2種, 68分子 ![](data/chem/img/LMU.gif)
![](data/chem/img/DGD.gif)
![](data/chem/img/DGD.gif)
#26: 糖 | ChemComp-LMU / #29: 糖 | |
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-非ポリマー , 12種, 798分子 ![](data/chem/img/CL0.gif)
![](data/chem/img/CLA.gif)
![](data/chem/img/PQN.gif)
![](data/chem/img/LHG.gif)
![](data/chem/img/BCR.gif)
![](data/chem/img/SF4.gif)
![](data/chem/img/LMG.gif)
![](data/chem/img/LUT.gif)
![](data/chem/img/CHL.gif)
![](data/chem/img/XAT.gif)
![](data/chem/img/NEX.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/CLA.gif)
![](data/chem/img/PQN.gif)
![](data/chem/img/LHG.gif)
![](data/chem/img/BCR.gif)
![](data/chem/img/SF4.gif)
![](data/chem/img/LMG.gif)
![](data/chem/img/LUT.gif)
![](data/chem/img/CHL.gif)
![](data/chem/img/XAT.gif)
![](data/chem/img/NEX.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#20: 化合物 | #21: 化合物 | ChemComp-CLA / #22: 化合物 | ChemComp-PQN / #23: 化合物 | ChemComp-LHG / #24: 化合物 | ChemComp-BCR / #25: 化合物 | ChemComp-SF4 / #27: 化合物 | ChemComp-LMG / #28: 化合物 | ChemComp-LUT / ( #30: 化合物 | ChemComp-CHL / #31: 化合物 | ChemComp-XAT / ( #32: 化合物 | ChemComp-NEX / ( |
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