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- EMDB-24235: Cycloheximide bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-24235
タイトルCycloheximide bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A
マップデータComposite maps
試料
  • 複合体: composite map of Cyclohimide bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A
    • 複合体: 60S subunit
      • RNA: x 3種
      • タンパク質・ペプチド: x 30種
    • 複合体: 40S subunit
      • タンパク質・ペプチド: x 34種
      • RNA: x 1種
    • 複合体: 80S subunit
      • タンパク質・ペプチド: x 11種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


triplex DNA binding / ribosome hibernation / translation elongation factor binding / regulation of translational initiation in response to stress / Platelet degranulation / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, LSU-rRNA,5S) / negative regulation of glucose mediated signaling pathway / negative regulation of translational frameshifting / Negative regulators of DDX58/IFIH1 signaling / positive regulation of translational fidelity ...triplex DNA binding / ribosome hibernation / translation elongation factor binding / regulation of translational initiation in response to stress / Platelet degranulation / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, LSU-rRNA,5S) / negative regulation of glucose mediated signaling pathway / negative regulation of translational frameshifting / Negative regulators of DDX58/IFIH1 signaling / positive regulation of translational fidelity / Protein methylation / RMTs methylate histone arginines / mTORC1-mediated signalling / Protein hydroxylation / ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process / GDP-dissociation inhibitor activity / nonfunctional rRNA decay / pre-mRNA 5'-splice site binding / positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / Translation initiation complex formation / Ribosomal scanning and start codon recognition / cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / preribosome, small subunit precursor / response to cycloheximide / telomeric DNA binding / mRNA destabilization / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / Formation of a pool of free 40S subunits / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) / negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / regulation of cellular amino acid metabolic process / preribosome, large subunit precursor / translational elongation / ribosomal large subunit export from nucleus / G-protein alpha-subunit binding / TOR signaling / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / 90S preribosome / positive regulation of protein kinase activity / protein-RNA complex assembly / regulation of translational fidelity / Ub-specific processing proteases / ribosomal subunit export from nucleus / translation regulator activity / ribosomal small subunit export from nucleus / translational termination / translation repressor activity / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / maturation of LSU-rRNA / telomere maintenance / cellular response to amino acid starvation / rescue of stalled ribosome / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / ribosome assembly / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / ribosomal large subunit biogenesis / maturation of SSU-rRNA / small-subunit processome / translational initiation / macroautophagy / protein kinase C binding / maintenance of translational fidelity / modification-dependent protein catabolic process / cytoplasmic stress granule / rRNA processing / protein tag activity / ribosome biogenesis / ribosome binding / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / rRNA binding / negative regulation of translation / ribosome / protein ubiquitination / structural constituent of ribosome / translation / positive regulation of protein phosphorylation / G protein-coupled receptor signaling pathway / negative regulation of gene expression / response to antibiotic / mRNA binding / ubiquitin protein ligase binding / negative regulation of apoptotic process / nucleolus / perinuclear region of cytoplasm / mitochondrion / DNA binding
類似検索 - 分子機能
Stm1-like, N-terminal / Stm1 / Hyaluronan/mRNA-binding protein / Hyaluronan / mRNA binding family / : / : / Ribosomal protein S26e signature. / : / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 ...Stm1-like, N-terminal / Stm1 / Hyaluronan/mRNA-binding protein / Hyaluronan / mRNA binding family / : / : / Ribosomal protein S26e signature. / : / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein L13e, conserved site / Ribosomal protein L13e signature. / S27a-like superfamily / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal L22e protein family / Ribosomal protein L38e / Ribosomal protein L38e superfamily / Ribosomal L38e protein family / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / : / : / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein L10e / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L19, eukaryotic / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / 60S ribosomal protein L18a/ L20, eukaryotes / : / : / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein L19/L19e conserved site / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L19e signature. / Ribosomal protein S4e signature. / Ribosomal protein L34e, conserved site / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein L6e signature. / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / Ribosomal L40e family / Ribosomal protein L30e signature 1. / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal_L40e / Ribosomal protein L40e / Ribosomal protein L40e superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein uS4A / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein eS17A / Large ribosomal subunit protein eL24A / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein uL30A / Large ribosomal subunit protein uL6A / Large ribosomal subunit protein uL22A / Large ribosomal subunit protein uL24A ...Small ribosomal subunit protein uS4A / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein eS17A / Large ribosomal subunit protein eL24A / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein uL30A / Large ribosomal subunit protein uL6A / Large ribosomal subunit protein uL22A / Large ribosomal subunit protein uL24A / Large ribosomal subunit protein eL33A / Large ribosomal subunit protein eL36A / Large ribosomal subunit protein eL29 / Large ribosomal subunit protein eL15A / Large ribosomal subunit protein eL22A / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Small ribosomal subunit protein uS11A / Small ribosomal subunit protein eS19A / Small ribosomal subunit protein eS21A / Small ribosomal subunit protein uS8A / Large ribosomal subunit protein uL5A / Large ribosomal subunit protein eL27A / Large ribosomal subunit protein eL31A / Ubiquitin-ribosomal protein eL40A fusion protein / Large ribosomal subunit protein eL20A / Large ribosomal subunit protein eL43A / Large ribosomal subunit protein eL42A / Small ribosomal subunit protein uS12A / Small ribosomal subunit protein eS24A / Small ribosomal subunit protein eS30A / Small ribosomal subunit protein eS4A / Small ribosomal subunit protein eS6A / Small ribosomal subunit protein eS8A / Large ribosomal subunit protein uL14A / Large ribosomal subunit protein uL2A / Small ribosomal subunit protein uS17A / Large ribosomal subunit protein eL18A / Small ribosomal subunit protein uS9A / Small ribosomal subunit protein uS13A / Large ribosomal subunit protein eL19A / Large ribosomal subunit protein uL29A / Small ribosomal subunit protein eS32A / Large ribosomal subunit protein uL4A / Large ribosomal subunit protein eL30 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein eL8A / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein uL13A / Small ribosomal subunit protein eS7A / Small ribosomal subunit protein uS2A / Small ribosomal subunit protein eS1A / Small ribosomal subunit protein eS27A / Large ribosomal subunit protein eL14A / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Suppressor protein STM1 / Small ribosomal subunit protein eS26B / Small ribosomal subunit protein uS14A / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL37A / Large ribosomal subunit protein eL38 / Large ribosomal subunit protein eL34A / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein eL6A / Large ribosomal subunit protein eL21A / Small ribosomal subunit protein eS10A / Large ribosomal subunit protein eL13A / Small ribosomal subunit protein eS25A / Small ribosomal subunit protein eS28A
類似検索 - 構成要素
生物種Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) / Baker's Yeast (パン酵母) / Baker's yeast (パン酵母)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.05 Å
データ登録者Rai J / Zhao Y / Li H
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)GM124622 米国
引用ジャーナル: Structure / 年: 2022
タイトル: CryoEM structures of pseudouridine-free ribosome suggest impacts of chemical modifications on ribosome conformations.
著者: Yu Zhao / Jay Rai / Hongguo Yu / Hong Li /
要旨: Pseudouridine, the most abundant form of RNA modification, is known to play important roles in ribosome function. Mutations in human DKC1, the pseudouridine synthase responsible for catalyzing the ...Pseudouridine, the most abundant form of RNA modification, is known to play important roles in ribosome function. Mutations in human DKC1, the pseudouridine synthase responsible for catalyzing the ribosome RNA modification, cause translation deficiencies and are associated with a complex cancer predisposition. The structural basis for how pseudouridine impacts ribosome function remains uncharacterized. Here, we characterized structures and conformations of a fully modified and a pseudouridine-free ribosome from Saccharomyces cerevisiae in the absence of ligands or when bound with translocation inhibitor cycloheximide by electron cryomicroscopy. In the modified ribosome, the rearranged N1 atom of pseudouridine is observed to stabilize key functional motifs by establishing predominately water-mediated close contacts with the phosphate backbone. The pseudouridine-free ribosome, however, is devoid of such interactions and displays conformations reflective of abnormal inter-subunit movements. The erroneous motions of the pseudouridine-free ribosome may explain its observed deficiencies in translation.
履歴
登録2021年6月14日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年5月11日-
マップ公開2022年5月11日-
更新2022年7月20日-
現状2022年7月20日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_24235.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_24235.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 307.5 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Composite maps
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.055 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.02
最小 - 最大-0.019745117 - 0.23251857
平均 (標準偏差)0.0033827375 (±0.007930936)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ432432432
Spacing432432432
セルA=B=C: 455.75998 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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追加マップ: 40S-head map from 178,990 particles

ファイルemd_24235_additional_1.map
注釈40S-head map from 178,990 particles
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: 40S-body map from 178,990 particles

ファイルemd_24235_additional_2.map
注釈40S-body map from 178,990 particles
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: 60S subunits map from 181,871 particles

ファイルemd_24235_additional_3.map
注釈60S subunits map from 181,871 particles
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : composite map of Cyclohimide bound vacant 80S structure isolated ...

全体名称: composite map of Cyclohimide bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A
要素
  • 複合体: composite map of Cyclohimide bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A
    • 複合体: 60S subunit
      • RNA: 25S
      • RNA: 5S
      • RNA: 5.8S
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L2-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L4-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L14-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L15-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L16-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L20-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L24-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L25
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L26-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L28
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L32
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L33-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34-A
    • 複合体: 40S subunit
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S0-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S1-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S22-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26-B
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S31
      • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
      • タンパク質・ペプチド: Suppressor protein STM1
      • RNA: 18S RIBOSOMAL RNA
    • 複合体: 80S subunit
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L37-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L40-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L41-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L42-A
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L43-A
  • リガンド: 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: composite map of Cyclohimide bound vacant 80S structure isolated ...

超分子名称: composite map of Cyclohimide bound vacant 80S structure isolated from cbf5-D95A
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#79
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

+
超分子 #2: 60S subunit

超分子名称: 60S subunit / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#10, #12-#29, #31-#35
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

+
超分子 #3: 40S subunit

超分子名称: 40S subunit / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #45-#79
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

+
超分子 #4: 80S subunit

超分子名称: 80S subunit / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#79
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

+
分子 #1: 25S

分子名称: 25S / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Baker's Yeast (パン酵母)
分子量理論値: 1.020571062 MDa
配列文字列: UUGACCUCAA AUCAGGUAGG AGUACCCGCU GAACUUAAGC AUAUCAAUAA GCGGAGGAAA AGAAACCAAC CGGGAUUGCC UUAGUAACG GCGAGUGAAG CGGCAAAAGC UCAAAUUUGA AAUCUGGUAC CUUCGGUGCC CGAGUUGUAA UUUGGAGAGG G CAACUUUG ...文字列:
UUGACCUCAA AUCAGGUAGG AGUACCCGCU GAACUUAAGC AUAUCAAUAA GCGGAGGAAA AGAAACCAAC CGGGAUUGCC UUAGUAACG GCGAGUGAAG CGGCAAAAGC UCAAAUUUGA AAUCUGGUAC CUUCGGUGCC CGAGUUGUAA UUUGGAGAGG G CAACUUUG GGGCCGUUCC UUGUCUAUGU UCCUUGGAAC AGGACGUCAU AGAGGGUGAG AAUCCCGUGU GGCGAGGAGU GC GGUUCUU UGUAAAGUGC CUUCGAAGAG UCGAGUUGUU UGGGAAUGCA GCUCUAAGUG GGUGGUAAAU UCCAUCUAAA GCU AAAUAU UGGCGAGAGA CCGAUAGCGA ACAAGUACAG UGAUGGAAAG AUGAAAAGAA CUUUGAAAAG AGAGUGAAAA AGUA CGUGA AAUUGUUGAA AGGGAAGGGC AUUUGAUCAG ACAUGGUGUU UUGUAUUUCA CUGGCCAGCA UCAGUUUUGG UGGCA GGAU AAAUCCAUAG GAAUGUAGCU UGCCUCGGUA AGUAUUAUAG CCUGUGGGAA UACUGCCAGC UGGGACUGAG GACUGC GAC GUAAGUCAAG GAUGCUGGCA UAAUGGUUAU AUGCCGCCCG UCUUG(1MA)AAC(A2M) (OMC)GGACCAAGG AGU (OMC)UAACG UCUAUGCGAG UGUUUGGGUG UAAAACCCAU ACGCGUAAUG AAAGUGAACG UAGGUUGGGG CCUCGCAAGA GGUGCACAA UCGACCGAUC CUGAUGUCUU CGGAUGGAUU UGAGUAAGAG CAUAGCUGUU GGGACCC(OMG)A(A2M) AGA UGGUGA (A2M)CUAUGCCUG AAUAGGGUGA AGCCAGAGGA AACUCUGGUG GAGGCUCGUA (OMG)CGGUUCUG(A2M) CG UGCAAAU CGAUCGUCGA AU(OMU)UGGGUAU AG(OMG)GGCGAAA GACUAAUCGA ACCAUCUAGU AGCUGGUUCC UGCCG AAGU UUCCCUCAGG AUAGCAGAAG CUCGUAUCAG UUUUAUGAGG UAAAGCGAAU GAUUAGAGGU UCCGGGGUCA CCUUGA CCU AUUCUCAAAC UUUAAAUAUG UAAGAAGUCC UUGUUACUUA AUUGAACGUG GACAUUUGAA UGAAGAGCUU UUAGUGG GC CAUUUUUGGU AAGC(A2M)GAACU GGCGAUGCGG GAUGAACCGA ACGUAGAGUU AAGGUGCCGG AAUACACGCU CAUC AGACA CCACAAAAGG UGUUAGUUCA UCUAGACAGC CGGACGGUGG CCAUGGAAGU CGGAAUAGGA GUGUGUAACA ACUCA CCGG CCGAAUGAAC UAGCCCUGAA AAUGGAUGGC GCUCAAGCGU GUUACCUAUA CUCUACCGUC AGGGUUGAUA UGAUGC CCU GACGAGUAGG CAGGCGUGGA GGUCAGUGAC GAAGCCUAGA CCGUAAGGUC GGGUCGAACG GCCUCUAGUG CAGAU (OMC)UUG GUGGUAGU(A2M)(OMG) CAAAUAUUCA AAUGAGAACU UUGAAGACUG AAGUGGGGAA AGGUUCCACG UCAA CAGCA GUUGGACGUG GGUUAGUCGA UCCUAAGAGA UGGGGAAGCU CCGUUUCAAA GGCCUGAUUU UAUGCAGGCC ACCAU CGAA AGGGAAUCCG GUUAAGAUUC CGGAACCUGG AUAUGGAUUC UUCACGGUAA CGUAACUGAA UGUGGAGACG UCGGCG CGA GCCCUGGGAG GAGUUAUCUU UUCUUCUUAA CAGCUUAUCA CCCCGGAAUU GGUUUAUCCG GAGAUGGGGU CUUAUGG CU GGAAGAGGCC AGCACCUUUG CUGGCUCCGG UGCGCUUGUG ACGGCCCGUG AAAAUCCACA GGAAGGAAUA GUUUUCAU G CCAGGUCGUA CUGAUAACCG CAGCAGGUCU CCAAGGUGAA CAGCCUCUAG UUGAUAGAAU AA(OMU)GUAGAUA AGGGA AGUC GGCAAAAUAG AUCCGUAACU UCGGGAUAAG GAUUGGCUCU AAGGGUCGGG UACGAUCAAC UUAGAACUGG UACGGA CAA GGGGAAUCUG ACUGUCUAAU U(1MA)AAACAUAG CAUUGCGAUG GUCAGAAAGU GAUGUUGACG CAAUGUGAUU UCU GCC(OMC)AG UGCUCUGAAU GUCAAAGUGA (A2M)GAAAUUCAA CCAAGCGCGG GUAAACGGCG GGAGUAACUA UGACUC UCU UAAGGUAGC(5MC) A(A2M)(A2M)UGCCUC(OMG) UCAUCUAAUU AGUGACGCGC AUGAAUGGAU UAACGAGAUU C CCACUGU(OMC) CCUAUCUAC(OMU) AUCUAGCGAA ACCACAGCCA AGGGAACGGG CUUGGCAGAA UCAGCGGGGA AAGA AGACC CUGUUGAGCU (OMU)GAC(OMU)CUAGU UUGACAUUGU GAAGAGACAU AGUUUCUUUA CUUAUUCAAU GAAGCGG AG CUGGAAUUCA UUUUCCACGU UCUAGCAUUC AAGGUCCCAU UCGGGGCUGA UCCGGGUUGA AGACAUUGUC AGGUGGGG A GUUUGGCUG(OMG) GGCGGCACAU CUGU(UR3)AAACG (A2M)UAACGCAGA UGUCCUAAGG GGGGCUCAUG GAGAACA GA AAUCUCCAGU AGAACAAAAG GGUAAAAGCC CCCUUGAUUU UGAUU(OMU)UCAG (OMU)GUGAAUACA AACCAUGAAA GUGUGGCCU AUCGAUCCUU UAGUCCCUCG GAAUUUGAGG CUA(OMG)A(OMG)GUGC CAGAAAAGUU ACCACAG(OMG)G AUAACUGGCU UGUGGCAGUC AAGCGUUCAU AGCGACAUUG CUUUUUGAUU CUU(5MC)GAUGUC GGCUCUUCCU AUCAUA CCG AAGCAGAAUU CGGUAAGCGU UGGAU(OMU)(OMG)UUC ACCCACUAAU AGGGAACGUG (A2M)G(OMC)UGGGUUU A GA(OMC)CGUCG UGAGACAGGU UAGUUUUACC CUACUGAUGA AUGUUACCGC AAUAGUAAUU GAACUUAGUA CGAGAGGA A CAGUUCAUUC GGAUAAUUGG UUUUUGCGGC UGUCUGAUCA GGCAUUGCCG CGAAGCUACC AUCCGCUGGA UUAUGGCUG AACGCCUCUA AGUCAGAAUC CAUGCUAGAA CGCGGUGAUU UCUUUGCUCC ACACAAUAUA GAUGGAUACG AAUAAGGCGU CCUUGUGGC GUCGCUGAAC CAUAGCAGGC UAGCAACGGU GCACUUGGCG GAAAGGCCUU GGGUGCUUGC UGGCGAAUUG C AAUGUCAU UUUGCGUGGG GAUAAAUCAU UUGUAUACGA CUUAGAUGUA CAACGGGGUA UUGUAAGCAG UAGAGUAGCC UU GUUGUUA CGAUCUGCUG AGAUUAAGCC UUUGUUGUCU GAUUUGU

+
分子 #2: 5S

分子名称: 5S / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Baker's Yeast (パン酵母)
分子量理論値: 38.951105 KDa
配列文字列:
GGUUGCGGCC AUAUCUACCA GAAAGCACCG UUUCCCGUCC GAUCAACUGU AGUUAAGCUG GUAAGAGCCU GACCGAGUAG UGUAGUGGG UGACCAUACG CGAAACUCAG GUGCUGCAAU CU

+
分子 #3: 5.8S

分子名称: 5.8S / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Baker's Yeast (パン酵母)
分子量理論値: 50.682922 KDa
配列文字列:
AAACUUUCAA CAACGGAUCU CUUGGUUCUC GCAUCGAUGA AGAACGCAGC GAAAUGCGAU ACGUAAUGUG AAUUGCAGAA UUCCGUGAA UCAUCGAAUC UUUGAACGCA CAUUGCGCCC CUUGGUAUUC CAGGGGGCAU GCCUGUUUGA GCGUCAUUU

+
分子 #79: 18S RIBOSOMAL RNA

分子名称: 18S RIBOSOMAL RNA / タイプ: rna / ID: 79 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 574.905312 KDa
配列文字列: UAUCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAU(A2M)UG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUUA UAC AGUGAAACUG CGAAUGGCUC (A2M)UUAAAUCAG UUAUCGUUUA UUUGAUAGUU CCUUUACUAC AUGGUAUAAC UGU GGUAAU ...文字列:
UAUCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAU(A2M)UG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUUA UAC AGUGAAACUG CGAAUGGCUC (A2M)UUAAAUCAG UUAUCGUUUA UUUGAUAGUU CCUUUACUAC AUGGUAUAAC UGU GGUAAU UCUAGAGCUA AUACAUGCUU AAAAUCUCGA CCCUUUGGAA GAGAUGUAUU UAUUAGAUAA AAAAUCAAUG UCUU CGGAC UCUUUGAUGA UUCAUAAUAA CUUUUCGAAU CGCAUGGCCU UGUGCUGGCG AUGGUUCAUU CAAAUUUCUG CCCUA UCAA CUUUCGAUGG UAGGAUAGUG GCCUACCAUG GUUUCAACGG GUAACGGGGA AUAAGGGUUC GAUUCCGGAG AGGGAG CCU GAGAAACGGC UACCACAU(OMC)C AAGG(A2M)AGGCA GCAGGCGCGC (A2M)AAUUACCCA AUCCUAAUUC AGGGA GGUA GUGACAAUAA AUAACGAUAC AGGGCCCAUU CGGGUCUUGU AAUUGGAAUG AGUACAAUGU AAAUACCUUA ACGAGG (A2M)AC AAUUGGAGGG CAAGUCUG(OMG)U GCCAGCAGCC GCGG(OMU)AAUUC CAGCUCCAAU AGCGUAUAUU AAAGU UGUU GCAGUU(A2M)AAA AGCUCGUAGU UGAACUUUGG GCCCGGUUGG CCGGUCGGAU UUCCAACGGG GCCUUUCCUU CU GGCUAAC CUUGAGUCCU UGUGGCUCUU GGCGAACCAG GACUUUUACU UUGAAAAAAU UAGAGUGUUC AAAGCAGGCG UAU UGCUCG AAUAUAUU(A2M)G CAUGGAAUAA UAGAAUAGGA CGUUUGGUUC UAUUUUGUUG GUUUCUAGGA CCAUCGUAAU GAUUAAUAG GGACGGUCGG GGGCAUCAGU AUUCAAUUGU CAGAGGUGAA AUUCUUGGAU UUAUUGAAGA CUAACUACUG C GAAAGCAU UUGCCAAGGA CGUUUUCAUU AAUCAAGA(A2M)C GAAAGUUAGG GGAUCGAAGA UGAUCAGAUA C(OMC)GU CGUAG UCUUAACCAU AAACUAUGCC GACUAGGGAU CGGGUGGUGU UUUUUUAAUG ACCCACUCGG CACCUUACGA GAAAU CAAA GUCUUUGGGU UCUGGGGGGA GUAUGGUCGC AA(OMG)GCUGAAA CUUAAAGGAA UUGACGGAAG GGCACCACCA GG AGUGGAG CCUGCGGCUU AAUUUGAC(3AU)C AACACGGGGA AACUCACCAG GUCCAGACAC AAUAAGGAUU GACAGAUUG AGAGCUCUUU CUUGAUUUUG UGGGUGG(OMU)G(OMG) UGCAUGGC(4AC)G UUCUUAGUUG GUGGAGUGAU UUGUCUGC U UAAUUGCGAU AACGAACGAG ACCUUAACCU ACUAAAUAGU GGUGCUAGCA UUUGCUGGUU AUCCACUUCU UAGAGGGAC UAUCGGUUUC AAGCCGAUGG AAGUUUGAGG CAAUAACA(OMG)G UCUGUGAUGC CCUUAGACGU UCUGGGCCGC ACGCGC GCU ACACUGACGG AGCCAGCGAG UCUAACCUUG GCCGAGAGGU CUUGGUAAUC UUGUGAAACU CCGUCGUGCU GGGGAUA GA GCAUUGUAAU UAUUGCUCUU CAAC(OMG)AG(G7M)AA UUCCUAGUAA GCGCAAGUCA UCAGCUUGCG UUGAUUACGU CCCUGCCCU UUGUACACAC CG(OMC)CCGUCGC UAGUACCGAU UGAAUGGCUU AGUGAGGCCU CAGGAUCUGC UUAGAGA AG GGGGCAACUC CAUCUCAGAG CGGAGAAUUU GGACAAACUU GGUCAUUUAG AGGAACUAAA AGUCGUAACA AGGUUUC (4AC)G UAGGUG(MA6)(MA6)CC UGCGGAAGGA UCAUUA

+
分子 #4: 60S ribosomal protein L2-A

分子名称: 60S ribosomal protein L2-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 26.643668 KDa
配列文字列: GRVIRNQRKG AGSIFTSHTR LRQGAAKLRT LDYAERHGYI RGIVKQIVHD SGRGAPLAKV VFRDPYKYRL REEIFIANEG VHTGQFIYA GKKASLNVGN VLPLGSVPEG TIVSNVEEKP GDRGALARAS GNYVIIIGHN PDENKTRVRL PSGAKKVISS D ARGVIGVI ...文字列:
GRVIRNQRKG AGSIFTSHTR LRQGAAKLRT LDYAERHGYI RGIVKQIVHD SGRGAPLAKV VFRDPYKYRL REEIFIANEG VHTGQFIYA GKKASLNVGN VLPLGSVPEG TIVSNVEEKP GDRGALARAS GNYVIIIGHN PDENKTRVRL PSGAKKVISS D ARGVIGVI AGGGRVDKPL LKAGRAFHKY RLKRNSWPKT RGVAMNPVDH PHGGGNHQHI GKASTISRGA VSGQKAGLIA AR RTGLLRG

+
分子 #5: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 43.732617 KDa
配列文字列: SHRKYEAPRH GHLGFLPRKR AASIRARVKA FPKDDRSKPV ALTSFLGYKA GMTTIVRDLD RPGSKFHKRE VVEAVTVVDT PPVVVVGVV GYVETPRGLR SLTTVWAEHL SDEVKRRFYK NWYKSKKKAF TKYSAKYAQD GAGIERELAR IKKYASVVRV L VHTQIRKT ...文字列:
SHRKYEAPRH GHLGFLPRKR AASIRARVKA FPKDDRSKPV ALTSFLGYKA GMTTIVRDLD RPGSKFHKRE VVEAVTVVDT PPVVVVGVV GYVETPRGLR SLTTVWAEHL SDEVKRRFYK NWYKSKKKAF TKYSAKYAQD GAGIERELAR IKKYASVVRV L VHTQIRKT PLAQKKAHLA EIQLNGGSIS EKVDWAREHF EKTVAVDSVF EQNEMIDAIA VTKGHGFEGV THRWGTKKLP RK T(HIC)RGLRK VACIGAWHPA HVMWSVARAG QRGYHSRTSI NHKIYRVGKG DDEANGATSF DRTKKTITPM GGFVHYGEI KNDFIMVKGC IPGNRKRIVT LRKSLYTNTS RKALEEVSLK WIDTASKFGK GRFQTPAEKH AFMGTLKKDL

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L4-A

分子名称: 60S ribosomal protein L4-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 39.027926 KDa
配列文字列: SRPQVTVHSL TGEATANALP LPAVFSAPIR PDIVHTVFTS VNKNKRQAYA VSEKAGHQTS AESWGTGRAV ARIPRVGGGG TGRSGQGAF GNMCRGGRMF APTKTWRKWN VKVNHNEKRY ATASAIAATA VASLVLARGH RVEKIPEIPL VVSTDLESIQ K TKEAVAAL ...文字列:
SRPQVTVHSL TGEATANALP LPAVFSAPIR PDIVHTVFTS VNKNKRQAYA VSEKAGHQTS AESWGTGRAV ARIPRVGGGG TGRSGQGAF GNMCRGGRMF APTKTWRKWN VKVNHNEKRY ATASAIAATA VASLVLARGH RVEKIPEIPL VVSTDLESIQ K TKEAVAAL KAVGAHSDLL KVLKSKKLRA GKGKYRNRRW TQRRGPLVVY AEDNGIVKAL RNVPGVETAN VASLNLLQLA PG AHLGRFV IWTEAAFTKL DQVWGSETVA SSKVGYTLPS HIISTSDVTR IINSSEIQSA IRPAGQATQK RTHVLKKNPL KNK QVLLRL NPYAKVFAAE KLGSKKAEKT GTKPAAVFTE TLKHD

+
分子 #7: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 33.158082 KDa
配列文字列: DAKSSAYSSR FQTPFRRRRE GKTDYYQRKR LVTQHKAKYN TPKYRLVVRF TNKDIICQII SSTITGDVVL AAAYSHELPR YGITHGLTN WAAAYATGLL IARRTLQKLG LDETYKGVEE VEGEYELTEA VEDGPRPFKV FLDIGLQRTT TGARVFGALK G ASDGGLYV ...文字列:
DAKSSAYSSR FQTPFRRRRE GKTDYYQRKR LVTQHKAKYN TPKYRLVVRF TNKDIICQII SSTITGDVVL AAAYSHELPR YGITHGLTN WAAAYATGLL IARRTLQKLG LDETYKGVEE VEGEYELTEA VEDGPRPFKV FLDIGLQRTT TGARVFGALK G ASDGGLYV PHSENRFPGW DFETEEIDPE LLRSYIFGGH VSQYMEELAD DDEERFSELF KGYLADDIDA DSLEDIYTSA HE AIRADPA FKPTEKKFTK EQYAAESKKY RQTKLSKEER AARVAAKIAA LAGQQ

+
分子 #8: 60S ribosomal protein L6-A

分子名称: 60S ribosomal protein L6-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 17.579693 KDa
配列文字列:
SAQKAPKWYP SEDVAALKKT RKAARPQKLR ASLVPGTVLI LLAGRFRGKR VVYLKHLEDN TLLISGPFKV NGVPLRRVNA RYVIATSTK VSVEGVNVEK FNVEYFAKEE IKAERVEDQK VVDKALIAEI KKTPLLKQYL SASFSLKNGD KPHMLKF

+
分子 #9: 60S ribosomal protein L7-A

分子名称: 60S ribosomal protein L7-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 25.240377 KDa
配列文字列: AEQVAAERAA RKAANKEKRA IILERNAAYQ KEYETAERNI IQAKRDAKAA GSYYVEAQHK LVFVVRIKGI NKIPPKPRKV LQLLRLTRI NSGTFVKVTK ATLELLKLIE PYVAYGYPSY STIRQLVYKR GFGKINKQRV PLSDNAIIEA NLGKYGILSI D DLIHEIIT ...文字列:
AEQVAAERAA RKAANKEKRA IILERNAAYQ KEYETAERNI IQAKRDAKAA GSYYVEAQHK LVFVVRIKGI NKIPPKPRKV LQLLRLTRI NSGTFVKVTK ATLELLKLIE PYVAYGYPSY STIRQLVYKR GFGKINKQRV PLSDNAIIEA NLGKYGILSI D DLIHEIIT VGPHFKQANN FLWPFKLSNP SGGWGVPRKF KHFIQGGSFG NREEFINKLV KSMN

+
分子 #10: 60S ribosomal protein L8-A

分子名称: 60S ribosomal protein L8-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 25.541752 KDa
配列文字列: NPLTHSTPKN FGIGQAVQPK RNLSRYVKWP EYVRVQRQKK ILSIRLKVPP TIAQFQYTLD RNTAAETFKL FNKYRPETAA EKKERLTKE AAAVAEGKSK QDASPKPYAV KYGLNHVVAL IENKKAKLVL IANDVDPIEL VVFLPALCKK MGVPYAIVKG K ARLGTLVN ...文字列:
NPLTHSTPKN FGIGQAVQPK RNLSRYVKWP EYVRVQRQKK ILSIRLKVPP TIAQFQYTLD RNTAAETFKL FNKYRPETAA EKKERLTKE AAAVAEGKSK QDASPKPYAV KYGLNHVVAL IENKKAKLVL IANDVDPIEL VVFLPALCKK MGVPYAIVKG K ARLGTLVN QKTSAVAALT EVRAEDEAAL AKLVSTIDAN FADKYDEVKK HWGGGILGNK AQAKMDKRAK NS

+
分子 #11: 60S ribosomal protein L9-A

分子名称: 60S ribosomal protein L9-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.491902 KDa
配列文字列: MKYIQTEQQI EVPEGVTVSI KSRIVKVVGP RGTLTKNLKH IDVTFTKVNN QLIKVAVHNG GRKHVAALRT VKSLVDNMIT GVTKGYKYK MRYVYAHFPI NVNIVEKDGA KFIEVRNFLG DKKIRNVPVR DGVTIEFSTN VKDEIVLSGN SVEDVSQNAA D LQQICRVR ...文字列:
MKYIQTEQQI EVPEGVTVSI KSRIVKVVGP RGTLTKNLKH IDVTFTKVNN QLIKVAVHNG GRKHVAALRT VKSLVDNMIT GVTKGYKYK MRYVYAHFPI NVNIVEKDGA KFIEVRNFLG DKKIRNVPVR DGVTIEFSTN VKDEIVLSGN SVEDVSQNAA D LQQICRVR NKDIRKFLDG IYVSHKGFIT ED

+
分子 #12: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 23.7335 KDa
配列文字列: ARRPARCYRY QKNKPYPKSR YNRAVPDSKI RIYDLGKKKA TVDEFPLCVH LVSNELEQLS SEALEAARIC ANKYMTTVSG RDAFHLRVR VHPFHVLRIN KGMRGAWGKP HGLAARVDIG QIIFSVRTKD SNKDVVVEGL RRARYKFPGQ QKIILSKKWG F TNLDRPEY ...文字列:
ARRPARCYRY QKNKPYPKSR YNRAVPDSKI RIYDLGKKKA TVDEFPLCVH LVSNELEQLS SEALEAARIC ANKYMTTVSG RDAFHLRVR VHPFHVLRIN KGMRGAWGKP HGLAARVDIG QIIFSVRTKD SNKDVVVEGL RRARYKFPGQ QKIILSKKWG F TNLDRPEY LKKREAGEVK DDGAFVKFLS KKGSLENNIR EFPEYFA

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L11-A

分子名称: 60S ribosomal protein L11-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 19.266082 KDa
配列文字列:
QNPMRDLKIE KLVLNISVGE SGDRLTRASK VLEQLSGQTP VQSKARYTVR TFGIRRNEKI AVHVTVRGPK AEEILERGLK VKEYQLRDR NFSATGNFGF GIDEHIDLGI KYDPSIGIFG MDFYVVMNRP GARVTRRKRC KGTVGNSHKT TKEDTVSWFK Q KYDADVLD K

+
分子 #14: 60S ribosomal protein L13-A

分子名称: 60S ribosomal protein L13-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.885234 KDa
配列文字列: AISKNLPILK NHFRKHWQER VKVHFDQAGK KVSRRNARAT RAAKIAPRPL DLLRPVVRAP TVKYNRKVRA GRGFTLAEVK AAGLTAAYA RTIGIAVDHR RQNRNQEIFD ANVQRLKEYQ SKIIVFPRNG KAPEAEQVLS AAATFPIAQP ATDVEARAVQ D NGESAFRT ...文字列:
AISKNLPILK NHFRKHWQER VKVHFDQAGK KVSRRNARAT RAAKIAPRPL DLLRPVVRAP TVKYNRKVRA GRGFTLAEVK AAGLTAAYA RTIGIAVDHR RQNRNQEIFD ANVQRLKEYQ SKIIVFPRNG KAPEAEQVLS AAATFPIAQP ATDVEARAVQ D NGESAFRT LRLARSEKKF RGIREKRARE KAEAE

+
分子 #15: 60S ribosomal protein L14-A

分子名称: 60S ribosomal protein L14-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.976794 KDa
配列文字列:
TDSIVKASNW RLVEVGRVVL IKKGQSAGKL AAIVEIIDQK KVLIDGPKAG VPRQAINLGQ VVLTPLTFAL PRGARTATVS KKWAAAAVC EKWAASSWAK KIAQRERRAA LTDFERFQVM VLRKQKRYTV KKALAKA

+
分子 #16: 60S ribosomal protein L15-A

分子名称: 60S ribosomal protein L15-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.351162 KDa
配列文字列: GAYKYLEELQ RKKQSDVLRF LQRVRVWEYR QKNVIHRAAR PTRPDKARRL GYKAKQGFVI YRVRVRRGNR KRPVPKGATY GKPTNQGVN ELKYQRSLRA TAEERVGRRA ANLRVLNSYW VNQDSTYKYF EVILVDPQHK AIRRDARYNW ICDPVHKHRE A RGLTATGK ...文字列:
GAYKYLEELQ RKKQSDVLRF LQRVRVWEYR QKNVIHRAAR PTRPDKARRL GYKAKQGFVI YRVRVRRGNR KRPVPKGATY GKPTNQGVN ELKYQRSLRA TAEERVGRRA ANLRVLNSYW VNQDSTYKYF EVILVDPQHK AIRRDARYNW ICDPVHKHRE A RGLTATGK KSRGINKGHK FNNTKAGRRK TWKRQNTLSL WRYRK

+
分子 #17: 60S ribosomal protein L16-A

分子名称: 60S ribosomal protein L16-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 22.028951 KDa
配列文字列: VEPVVVIDGK GHLVGRLASV VAKQLLNGQK IVVVRAEELN ISGEFFRNKL KYHDFLRKAT AFNKTRGPFH FRAPSRIFYK ALRGMVSHK TARGKAALER LKVFEGIPPP YDKKKRVVVP QALRVLRLKP GRKYTTLGKL STSVGWKYED VVAKLEAKRK V SSAEYYAK ...文字列:
VEPVVVIDGK GHLVGRLASV VAKQLLNGQK IVVVRAEELN ISGEFFRNKL KYHDFLRKAT AFNKTRGPFH FRAPSRIFYK ALRGMVSHK TARGKAALER LKVFEGIPPP YDKKKRVVVP QALRVLRLKP GRKYTTLGKL STSVGWKYED VVAKLEAKRK V SSAEYYAK KRAFTKKVAS ANATAAESDV AKQLAALGY

+
分子 #18: 60S ribosomal protein L17-A

分子名称: 60S ribosomal protein L17-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 19.687402 KDa
配列文字列:
ARYGATSTNP AKSASARGSY LRVSFKNTRE TAQAINGWEL TKAQKYLEQV LDHQRAIPFR RFNSSIGRTA QGKEFGVTKA RWPAKSVKF VQGLLQNAAA NAEAKGLDAT KLYVSHIQVN QAPKQRRRTY RAHGRINKYE SSPSHIELVV TEKEEKVVRL T SRQRGRIA AQKRIAA

+
分子 #19: 60S ribosomal protein L18-A

分子名称: 60S ribosomal protein L18-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 20.478059 KDa
配列文字列:
GIDHTSKQHK RSGHRTAPKS DNVYLKLLVK LYTFLARRTD APFNKVVLKA LFLSKINRPP VSVSRIARAL KQEGAANKTV VVVGTVTDD ARIFEFPKTT VAALRFTAGA RAKIVKAGGE CITLDQLAVR APKGQNTLIL RGPRNSREAV RHFGMGPHKG K APRILSTG RKFERARGRR RSKGFKV

+
分子 #20: 60S ribosomal protein L19-A

分子名称: 60S ribosomal protein L19-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.631121 KDa
配列文字列:
ANLRTQKRLA ASVVGVGKRK VWLDPNETSE IAQANSRNAI RKLVKNGTIV KKAVTVHSKS RTRAHAQSKR EGRHSGYGKR KGTREARLP SQVVWIRRLR VLRRLLAKYR DAGKIDKHLY HVLYKESKGN AFKHKRALVE HIIQAKADAQ REKALNEEAE A RRLKNRAA RDRRAQRVAE KRDALLKEDA

+
分子 #21: 60S ribosomal protein L20-A

分子名称: 60S ribosomal protein L20-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 20.478852 KDa
配列文字列:
MAHFKEYQVI GRRLPTESVP EPKLFRMRIF ASNEVIAKSR YWYFLQKLHK VKKASGEIVS INQINEAHPT KVKNFGVWVR YDSRSGTHN MYKEIRDVSR VAAVETLYQD MAARHRARFR SIHILKVAEI EKTADVKRQY VKQFLTKDLK FPLPHRVQKS T KTFSYKRP STFY

+
分子 #22: 60S ribosomal protein L21-A

分子名称: 60S ribosomal protein L21-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 18.148066 KDa
配列文字列:
GKSHGYRSRT RYMFQRDFRK HGAVHLSTYL KVYKVGDIVD IKANGSIQKG MPHKFYQGKT GVVYNVTKSS VGVIINKMVG NRYLEKRLN LRVEHIKHSK CRQEFLERVK ANAAKRAEAK AQGVAVQLKR QPAQPRESRI VSTEGNVPQT LAPVPYETFI

+
分子 #23: 60S ribosomal protein L22-A

分子名称: 60S ribosomal protein L22-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.263863 KDa
配列文字列:
QKIAKTFTVD VSSPTENGVF DPASYAKYLI DHIKVEGAVG NLGNAVTVTE DGTVVTVVST AKFSGKYLKY LTKKYLKKNQ LRDWIRFVS TKTNEYRLAF Y

+
分子 #24: 60S ribosomal protein L23-A

分子名称: 60S ribosomal protein L23-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.362755 KDa
配列文字列:
SGNGAQGTKF RISLGLPVGA IMNCADNSGA RNLYIIAVKG SGSRLNRLPA ASLGDMVMAT VKKGKPELRK KVMPAIVVRQ AKSWRRRDG VFLYFEDNAG VIANPKGEMK GSAITGPVGK ECADLWPRVA SNSGVVV

+
分子 #25: 60S ribosomal protein L24-A

分子名称: 60S ribosomal protein L24-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 7.384708 KDa
配列文字列:
MKVEIDSFSG AKIYPGRGTL FVRGDSKIFR FQNSKSASLF KQRKNPRRIA WTVLFRKHHK KGI

+
分子 #26: 60S ribosomal protein L25

分子名称: 60S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.771176 KDa
配列文字列:
KALKVRTSAT FRLPKTLKLA RAPKYASKAV PHYNRLDSYK VIEQPITSET AMKKVEDGNI LVFQVSMKAN KYQIKKAVKE LYEVDVLKV NTLVRPNGTK KAYVRLTADY DALDIANRIG YI

+
分子 #27: 60S ribosomal protein L26-A

分子名称: 60S ribosomal protein L26-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.134588 KDa
配列文字列:
AKQSLDVSSD RRKARKAYFT APSSQRRVLL SAPLSKELRA QYGIKALPIR RDDEVLVVRG SKKGQEGKIS SVYRLKFAVQ VDKVTKEKV NGASVPINLH PSKLVITKLH LDKDRKALIQ RKGGKLE

+
分子 #28: 60S ribosomal protein L27-A

分子名称: 60S ribosomal protein L27-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.437166 KDa
配列文字列:
AKFLKAGKVA VVVRGRYAGK KVVIVKPHDE GSKSHPFGHA LVAGIERYPL KVTKKHGAKK VAKRTKIKPF IKVVNYNHLL PTRYTLDVE AFKSVVSTET FEQPSQREEA KKVVKKAFEE RHQAGKNQWF FSKLRF

+
分子 #29: 60S ribosomal protein L28

分子名称: 60S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 16.630471 KDa
配列文字列:
PSRFTKTRKH RGHVSAGKGR IGKHRKHPGG RGMAGGQHHH RINMDKYHPG YFGKVGMRYF HKQQAHFWKP VLNLDKLWTL IPEDKRDQY LKSASKETAP VIDTLAAGYG KILGKGRIPN VPVIVKARFV SKLAEEKIRA AGGVVELIA

+
分子 #30: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.560688 KDa
配列文字列:
AKSKNHTAHN QTRKAHRNGI KKPKTYKYPS LKGVDPKFRR NHKHALHGTA KALAAAKK

+
分子 #31: 60S ribosomal protein L30

分子名称: 60S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 10.558344 KDa
配列文字列:
SINQKLALVI KSGKYTLGYK STVKSLRQGK SKLIIIAANT PVLRKSELEY YAMLSKTKVY YFQGGNNELG TAVGKLFRVG VVSILEAGD SDILTTLA

+
分子 #32: 60S ribosomal protein L31-A

分子名称: 60S ribosomal protein L31-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.649754 KDa
配列文字列:
LKDVVTREYT INLHKRLHGV SFKKRAPRAV KEIKKFAKLH MGTDDVRLAP ELNQAIWKRG VKGVEYRLRL RISRKRNEEE DAKNPLFSY VEPVLVASAK GLQTVVVEED

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L32

分子名称: 60S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.478054 KDa
配列文字列:
ASLPHPKIVK KHTKKFKRHH SDRYHRVAEN WRKQKGIDSV VRRRFRGNIS QPKIGYGSNK KTKFLSPSGH KTFLVANVKD LETLTMHTK TYAAEIAHNI SAKNRVVILA RAKALGIKVT NPKGRLAL

+
分子 #34: 60S ribosomal protein L33-A

分子名称: 60S ribosomal protein L33-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.045935 KDa
配列文字列:
AESHRLYVKG KHLSYQRSKR VNNPNVSLIK IEGVATPQDA QFYLGKRIAY VYRASKEVRG SKIRVMWGKV TRTHGNSGVV RATFRNNLP AKTFGASVRI FLYPSNI

+
分子 #35: 60S ribosomal protein L34-A

分子名称: 60S ribosomal protein L34-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.608831 KDa
配列文字列:
AQRVTFRRRN PYNTRSNKIK VVKTPGGILR AQHVKKLATR PKCGDCGSAL QGISTLRPRQ YATVSKTHKT VSRAYGGSRC ANCVKERII RAFLIEEQKI VKKVVKEQTE AAK

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L35-A

分子名称: 60S ribosomal protein L35-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.811444 KDa
配列文字列:
AGVKAYELRT KSKEQLASQL VDLKKELAEL KVQKLSRPSL PKIKTVRKSI ACVLTVINEQ QREAVRQLYK GKKYQPKDLR AKKTRALRR ALTKFEASQV TEKQRKKQIA FPQRKYAIKA

+
分子 #37: 60S ribosomal protein L36-A

分子名称: 60S ribosomal protein L36-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.020063 KDa
配列文字列:
TVKTGIAIGL NKGKKVTSMT PAPKISYKKG AASNRTKFVR SLVREIAGLS PYERRLIDLI RNSGEKRARK VAKKRLGSFT RAKAKVEEM NNIIAASRRH

+
分子 #38: 60S ribosomal protein L37-A

分子名称: 60S ribosomal protein L37-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 9.746199 KDa
配列文字列:
GKGTPSFGKR HNKSHTLCNR CGRRSFHVQK KTCSSCGYPA AKTRSYNWGA KAKRRHTTGT GRMRYLKHVS RRFKNGFQTG SASKASA

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 8.714363 KDa
配列文字列:
AREITDIKQF LELTRRADVK TATVKINKKL NKAGKPFRQT KFKVRGSSSL YTLVINDAGK AKKLIQSLPP TLKVNRL

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L39

分子名称: 60S ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.227444 KDa
配列文字列:
AAQKSFRIKQ KMAKAKKQNR PLPQWIRLRT NNTIRYNAKR RNWRRTKMNI

+
分子 #41: 60S ribosomal protein L40-A

分子名称: 60S ribosomal protein L40-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.032321 KDa
配列文字列:
IIEPSLKALA SKYNCDKSVC RKCYARLPPR ATNCRKRKCG HTNQLRPKKK LK

+
分子 #42: 60S ribosomal protein L41-A

分子名称: 60S ribosomal protein L41-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 3.354243 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRT RRLKRKRRKV RARSK

+
分子 #43: 60S ribosomal protein L42-A

分子名称: 60S ribosomal protein L42-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.115462 KDa
配列文字列:
VNVPKTRKTY CKGKTCRKHT QHKVTQYKAG KASLFAQGKR RYDRKQSGFG GQTKPVFHKK AKTTKKVVLR LECVKCKTRA QLTLKRCKH FELGGEKKQK GQALQF

+
分子 #44: 60S ribosomal protein L43-A

分子名称: 60S ribosomal protein L43-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 9.981756 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIT GKYGVRYGSS LRRQVKKLEI QQHARYDCSF CGKKTVKRGA AGIWTCSCCK KTVAGGAYTV STAAAATVRS TIRRLREMV EA

+
分子 #45: 40S ribosomal protein S0-A

分子名称: 40S ribosomal protein S0-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 22.811074 KDa
配列文字列: SLPATFDLTP EDAQLLLAAN THLGARNVQV HQEPYVFNAR PDGVHVINVG KTWEKLVLAA RIIAAIPNPE DVVAISSRTF GQRAVLKFA AHTGATPIAG RFTPGSFTNY ITRSFKEPRL VIVTDPRSDA QAIKEASYVN IPVIALTDLD SPSEFVDVAI P CNNRGKHS ...文字列:
SLPATFDLTP EDAQLLLAAN THLGARNVQV HQEPYVFNAR PDGVHVINVG KTWEKLVLAA RIIAAIPNPE DVVAISSRTF GQRAVLKFA AHTGATPIAG RFTPGSFTNY ITRSFKEPRL VIVTDPRSDA QAIKEASYVN IPVIALTDLD SPSEFVDVAI P CNNRGKHS IGLIWYLLAR EVLRLRGALV DRTQPWSIMP DLYFYRDP

+
分子 #46: 40S ribosomal protein S1-A

分子名称: 40S ribosomal protein S1-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.312199 KDa
配列文字列: VVDPFTRKEW FDIKAPSTFE NRNVGKTLVN KSTGLKSASD ALKGRVVEVC LADLQGSEDH SFRKIKLRVD EVQGKNLLTN FHGMDFTTD KLRSMVRKWQ TLIEANVTVK TSDDYVLRIF AIAFTRKQAN QVKRHSYAQS SHIRAIRKVI SEILTKEVQG S TLAQLTSK ...文字列:
VVDPFTRKEW FDIKAPSTFE NRNVGKTLVN KSTGLKSASD ALKGRVVEVC LADLQGSEDH SFRKIKLRVD EVQGKNLLTN FHGMDFTTD KLRSMVRKWQ TLIEANVTVK TSDDYVLRIF AIAFTRKQAN QVKRHSYAQS SHIRAIRKVI SEILTKEVQG S TLAQLTSK LIPEVINKEI ENATKDIFPL QNIHVRKVKL LKQPKFDVGA LMALHG

+
分子 #47: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 23.212979 KDa
配列文字列: GWVPVTKLGR LVKAGKITTI EEIFLHSLPV KEFQIIDTLL PGLQDEVMNI KPVQKQTRAG QRTRFKAVVV VGDSNGHVGL GIKTAKEVA GAIRAGIIIA KLSVIPIRRG YWGTNLGQPH SLATKTTGKC GSVTVRLIPA PRGSGIVASP AVKKLLQLAG V EDVYTQSN ...文字列:
GWVPVTKLGR LVKAGKITTI EEIFLHSLPV KEFQIIDTLL PGLQDEVMNI KPVQKQTRAG QRTRFKAVVV VGDSNGHVGL GIKTAKEVA GAIRAGIIIA KLSVIPIRRG YWGTNLGQPH SLATKTTGKC GSVTVRLIPA PRGSGIVASP AVKKLLQLAG V EDVYTQSN GKTRTLENTL KAAFVAIGNT YGFLTPNLWA EQPLPVSPLD IYSDEASAQ

+
分子 #48: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 24.702791 KDa
配列文字列: ALISKKRKLV ADGVFYAELN EFFTRELAEE GYSGVEVRVT PTKTEVIIRA TRTQDVLGEN GRRINELTLL VQKRFKYAPG TIVLYAERV QDRGLSAVAQ AESMKFKLLN GLAIRRAAYG VVRYVMESGA KGCEVVVSGK LRAARAKAMK FADGFLIHSG Q PVNDFIDT ...文字列:
ALISKKRKLV ADGVFYAELN EFFTRELAEE GYSGVEVRVT PTKTEVIIRA TRTQDVLGEN GRRINELTLL VQKRFKYAPG TIVLYAERV QDRGLSAVAQ AESMKFKLLN GLAIRRAAYG VVRYVMESGA KGCEVVVSGK LRAARAKAMK FADGFLIHSG Q PVNDFIDT ATRHVLMRQG VLGIKVKIMR DPAKSRTGPK ALPDAVTIIE PKEEEPILAP SVKDY

+
分子 #49: 40S ribosomal protein S4-A

分子名称: 40S ribosomal protein S4-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 29.338133 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR LAAPHHWLLD KLSGCYAPRP SAGPHKLRES LPLIVFLRNR LKYALNGREV KAILMQRHVK VDGKVRTDTT YPAGFMDVI TLDATNENFR LVYDVKGRFA VHRITDEEAS YKLGKVKKVQ LGKKGVPYVV THDGRTIRYP DPNIKVNDTV K IDLASGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR LAAPHHWLLD KLSGCYAPRP SAGPHKLRES LPLIVFLRNR LKYALNGREV KAILMQRHVK VDGKVRTDTT YPAGFMDVI TLDATNENFR LVYDVKGRFA VHRITDEEAS YKLGKVKKVQ LGKKGVPYVV THDGRTIRYP DPNIKVNDTV K IDLASGKI TDFIKFDAGK LVYVTGGRNL GRIGTIVHKE RHDGGFDLVH IKDSLDNTFV TRLNNVFVIG EQGKPYISLP KG KGIKLSI AEERDRRRAQ QGL

+
分子 #50: 40S ribosomal protein S5

分子名称: 40S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 22.908338 KDa
配列文字列: FTPVVLATPI PEEVQQAQTE IKLFNKWSFE EVEVKDASLV DYVQVRQPIF VAHTAGRYAN KRFRKAQCPI IERLTNSLMM NGRNNGKKL KAVRIIKHTL DIINVLTDQN PIQVVVDAIT NTGPREDTTR VGGGGAARRQ AVDVSPLRRV NQAIALLTIG A REAAFRNI ...文字列:
FTPVVLATPI PEEVQQAQTE IKLFNKWSFE EVEVKDASLV DYVQVRQPIF VAHTAGRYAN KRFRKAQCPI IERLTNSLMM NGRNNGKKL KAVRIIKHTL DIINVLTDQN PIQVVVDAIT NTGPREDTTR VGGGGAARRQ AVDVSPLRRV NQAIALLTIG A REAAFRNI KTIAETLAEE LINAAKGSST SYAIKKKDEL ERVAKSNR

+
分子 #51: 40S ribosomal protein S6-A

分子名称: 40S ribosomal protein S6-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 25.895072 KDa
配列文字列: MKLNISYPVN GSQKTFEIDD EHRIRVFFDK RIGQEVDGEA VGDEFKGYVF KISGGNDKQG FPMKQGVLLP TRIKLLLTKN VSCYRPRRD GERKRKSVRG AIVGPDLAVL ALVIVKKGEQ ELEGLTDTTV PKRLGPKRAN NIRKFFGLSK EDDVRDFVIR R EVTKGEKT ...文字列:
MKLNISYPVN GSQKTFEIDD EHRIRVFFDK RIGQEVDGEA VGDEFKGYVF KISGGNDKQG FPMKQGVLLP TRIKLLLTKN VSCYRPRRD GERKRKSVRG AIVGPDLAVL ALVIVKKGEQ ELEGLTDTTV PKRLGPKRAN NIRKFFGLSK EDDVRDFVIR R EVTKGEKT YTKAPKIQRL VTPQRLQRKR HQRALKVRNA QAQREAAAEY AQLLAKRLSE RKAEKAEI

+
分子 #52: 40S ribosomal protein S7-A

分子名称: 40S ribosomal protein S7-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.000492 KDa
配列文字列:
PQAKILSQAP TELELQVAQA FVELENSSPE LKAELRPLQF KSIREIDVAG GKKALAIFVP VPSLAGFHKV QTKLTRELEK KFQDRHVIF LAERRILPKP SRTSRQVQKR PRSRTLTAVH DKILEDLVFP TEIVGKRVRY LVGGNKIQKV LLDSKDVQQI D YKLESFQA VYNKLTGKQI VFEIPS

+
分子 #53: 40S ribosomal protein S8-A

分子名称: 40S ribosomal protein S8-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.14718 KDa
配列文字列:
GISRDSRHKR SATGAKRAQF RKKRKFELGR QPANTKIGAK RIHSVRTRGG NKKYRALRIE TGNFSWASEG ISKKTRIAGV VYHPSNNEL VRTNTLTKAA IVQIDATPFR QWFEAHYGQT LGKKSKNAER KWAARAASAK IESSVESQFS AGRLYACISS R PGQSGRCD GYILEGEELA FYLRRLTAKK

+
分子 #54: 40S ribosomal protein S9-A

分子名称: 40S ribosomal protein S9-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 21.210662 KDa
配列文字列:
PRAPRTYSKT YSTPKRPYES SRLDAELKLA GEFGLKNKKE IYRISFQLSK IRRAARDLLT RDEKDPKRLF EGNALIRRLV RVGVLSEDK KKLDYVLALK VEDFLERRLQ TQVYKLGLAK SVHHARVLIT QRHIAVGKQI VNIPSFMVRL DSEKHIDFAP T SPFGGARP GRVARRNAAR KAEASGE

+
分子 #55: 40S ribosomal protein S10-A

分子名称: 40S ribosomal protein S10-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.5711 KDa
配列文字列:
MLMPKEDRNK IHQYLFQEGV VVAKKDFNQA KHEEIDTKNL YVIKALQSLT SKGYVKTQFS WQYYYYTLTE EGVEYLREYL NLPEHIVPG TYIQERN

+
分子 #56: 40S ribosomal protein S11-A

分子名称: 40S ribosomal protein S11-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 17.654738 KDa
配列文字列:
STELTVQSER AFQKQPHIFN NPKVKTSKRT KRWYKNAGLG FKTPKTAIEG SYIDKKCPFT GLVSIRGKIL TGTVVSTKMH RTIVIRRAY LHYIPKYNRY EKRHKNVPVH VSPAFRVQVG DIVTVGQCRP ISKTVRFNVV KVSAAAGKAN KQFAKF

+
分子 #57: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.028008 KDa
配列文字列:
TIEDALKVVL RTALVHDGLA RGLRESTKAL TRGEALLVVL VSSVTEANII KLVEGLANDP ENKVPLIKVA DAKQLGEWAG LGKIDREGN ARKVVGASVV VVKNWGAETD ELSMIMEHFS QQ

+
分子 #58: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 16.928748 KDa
配列文字列:
GRMHSAGKGI SSSAIPYSRN APAWFKLSSE SVIEQIVKYA RKGLTPSQIG VLLRDAHGVT QARVITGNKI MRILKSNGLA PEIPEDLYY LIKKAVSVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYR TVAVLPPNWK YESATASALV N

+
分子 #59: 40S ribosomal protein S14-A

分子名称: 40S ribosomal protein S14-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.446426 KDa
配列文字列:
SQVFGVARIY ASFNDTFVHV TDLSGKETIA RVTGGMKVKA DRDESSPYAA MLAAQDVAAK CKEVGITAVH VKIRATGGTR TKTPGPGGQ AALRALARSG LRIGRIEDVT PVPSDSTRKK GGRRGRRL

+
分子 #60: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.15572 KDa
配列文字列:
KKRVFKTHSY RGVDLEKLLE MSTEDFVKLA PARVRRRFAR GMTSKPAGFM KKLRAAKLAA PENEKPAPVR THMRNMIIVP EMIGSVVGI YNGKAFNQVE IRPEMLGHYL GEFSITYTPV RHGRA

+
分子 #61: 40S ribosomal protein S16-A

分子名称: 40S ribosomal protein S16-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.659216 KDa
配列文字列:
AVPSVQTFGK KKSATAVAHV KAGKGLIKVN GSPITLVEPE ILRFKVYEPL LLVGLDKFSN IDIRVRVTGG GHVSQVYAIR QAIAKGLVA YHQKYVDEQS KNELKKAFTS YDRTLLIADS RRPEPKKFGG KGARSRFQKS YR

+
分子 #62: 40S ribosomal protein S17-A

分子名称: 40S ribosomal protein S17-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 13.911179 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKR ASKALIERYY PKLTLDFQTN KRLCDEIATI QSKRLRNKIA GYTTHLMKRI QKGPVRGISF KLQEEERERK DQYVPEVSA LDLSRLNVDN QTSDLVKSLG LKLPLSVINV SA

+
分子 #63: 40S ribosomal protein S18-A

分子名称: 40S ribosomal protein S18-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 16.940443 KDa
配列文字列:
SLVVQEQGSF QHILRLLNTN VDGNIKIVYA LTTIKGVGRR YSNLVCKKAD VDLHKRAGEL TQEELERIVQ IMQNPTHYKI PAWFLNRQN DITDGKDYHT LANNVESKLR DDLERLKKIR AHRGIRHFWG LRVRGQHTKT TGRRRA

+
分子 #64: 40S ribosomal protein S19-A

分子名称: 40S ribosomal protein S19-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.566728 KDa
配列文字列:
PGVSVRDVAA QDFINAYASF LQRQGKLEVP GYVDIVKTSS GNEMPPQDAE GWFYKRAASV ARHIYMRKQV GVGKLNKLYG GAKSRGVRP YKHIDASGSI NRKVLQALEK IGIVEISPKG GRRISENGQR DLDRIAAQTL EE

+
分子 #65: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 12.190175 KDa
配列文字列:
QQQQIIKIRI TLTSTKVKQL ENVSSNIVKN AEQHNLVKKG PVRLPTKVLK ISTRKTPNGE GSKTWETYEM RIHKRYIDLE APVQIVKRI TQITIEPGVD VEVVVASN

+
分子 #66: 40S ribosomal protein S21-A

分子名称: 40S ribosomal protein S21-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 9.758829 KDa
配列文字列:
MENDKGQLVE LYVPRKCSAT NRIIKADDHA SVQINVAKVD EEGRAIPGEY VTYALSGYVR SRGESDDSLN RLAQNDGLLK NVWSYSR

+
分子 #67: 40S ribosomal protein S22-A

分子名称: 40S ribosomal protein S22-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 14.518867 KDa
配列文字列:
TRSSVLADAL NAINNAEKTG KRQVLIRPSS KVIIKFLQVM QKHGYIGEFE YIDDHRSGKI VVQLNGRLNK CGVISPRFNV KIGDIEKWT ANLLPARQFG YVILTTSAGI MDHEEARRKH VSGKILGFVY

+
分子 #68: 40S ribosomal protein S23-A

分子名称: 40S ribosomal protein S23-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.942699 KDa
配列文字列:
GKGKPRGLNS ARKLRVHRRN NRWAENNYKK RLLGTAFKSS PFGGSSHAKG IVLEKLGIES KQPNSAIRKC VRVQLIKNGK KVTAFVPND GCLNFVDEND EVLLAGFGRK GKAKGDIPGV RFKVVKVSGV SLLALWKEKK EKPRS

+
分子 #69: 40S ribosomal protein S24-A

分子名称: 40S ribosomal protein S24-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 15.23165 KDa
配列文字列:
SDAVTIRTRK VISNPLLARK QFVVDVLHPN RANVSKDELR EKLAEVYKAE KDAVSVFGFR TQFGGGKSVG FGLVYNSVAE AKKFEPTYR LVRYGLAEKV EKASRQQRKQ KKNRDKKIFG TGKRLAKKVA RRNAD

+
分子 #70: 40S ribosomal protein S25-A

分子名称: 40S ribosomal protein S25-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 7.930299 KDa
配列文字列:
QHAVILDQEK YDRILKEVPT YRYVSVSVLV DRLKIGGSLA RIALRHLEKE GIIKPISKHS KQAIYTRAT

+
分子 #71: 40S ribosomal protein S26-B

分子名称: 40S ribosomal protein S26-B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 11.022989 KDa
配列文字列:
PKKRASNGRN KKGRGHVKPV RCVNCSKSIP KDKAIKRMAI RNIVEAAAVR DLSEASVYPE YALPKTYNKL HYCVSCAIHA RIVRVRSRE DRKNRAPP

+
分子 #72: 40S ribosomal protein S27-A

分子名称: 40S ribosomal protein S27-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 8.762195 KDa
配列文字列:
VLVQDLLHPT AASEARKHKL KTLVQGPRSY FLDVKCPGCL NITTVFSHAQ TAVTCESCST ILCTPTGGKA KLSEGTSFRR K

+
分子 #73: 40S ribosomal protein S28-A

分子名称: 40S ribosomal protein S28-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 7.116281 KDa
配列文字列:
TPVTLAKVIK VLGRTGSRGG VTQVRVEFLE DTSRTIVRNV KGPVRENDIL VLMESEREAR RLR

+
分子 #74: 40S ribosomal protein S29-A

分子名称: 40S ribosomal protein S29-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.335303 KDa
配列文字列:
ENVWFSHPRR YGKGSRQCRV CSSHTGLIRK YGLNICRQCF REKANDIGFN KFR

+
分子 #75: 40S ribosomal protein S30-A

分子名称: 40S ribosomal protein S30-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.779086 KDa
配列文字列:
AKVHGSLARA GKVKSQTPKV EKTEKPKKPK GRAYKRLLYT RRFVNVTLVN GKRRMNPGPS

+
分子 #76: 40S ribosomal protein S31

分子名称: 40S ribosomal protein S31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 6.491615 KDa
配列文字列:
HKHKAVKLAV LSYYKVDAEG KVTKLRRECS NPTGVFLANH KDRLYCGKCH SVYKVNA

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分子 #77: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 34.151484 KDa
配列文字列: EVLVLRGTLE GHNGWVTSLA TSAGQPNLLL SASRDKTLIS WKLTGDDQKF GVPVRSFKGH SHIVQDCTLT ADGAYALSAS WDKTLRLWD VATGETYQRF VGHKSDVMSV DIDKKASMII SGSRDKTIKV WTIKGQCLAT LLGHNDWVSQ VRVVPNEKAD D DSVTIISA ...文字列:
EVLVLRGTLE GHNGWVTSLA TSAGQPNLLL SASRDKTLIS WKLTGDDQKF GVPVRSFKGH SHIVQDCTLT ADGAYALSAS WDKTLRLWD VATGETYQRF VGHKSDVMSV DIDKKASMII SGSRDKTIKV WTIKGQCLAT LLGHNDWVSQ VRVVPNEKAD D DSVTIISA GNDKMVKAWN LNQFQIEADF IGHNSNINTL TASPDGTLIA SAGKDGEIML WNLAAKKAMY TLSAQDEVFS LA FSPNRYW LAAATATGIK VFSLDPQYLV DDLRPEFAGY SKAAEPHAVS LAWSADGQTL FAGYTDNVIR VWQVM

+
分子 #78: Suppressor protein STM1

分子名称: Suppressor protein STM1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Baker's yeast (パン酵母)
分子量理論値: 9.664376 KDa
配列文字列:
RPSGNEGAIR DKTAGRRNNR SKDVTDSATT KKSNTRRATD RHSRTGKTDT KKKVNQGWGD DKKELSAEKE AQADAAAEIA EDAAEAEDA

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分子 #80: 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethy...

分子名称: 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione
タイプ: ligand / ID: 80 / コピー数: 1 / 式: 3HE
分子量理論値: 281.347 Da
Chemical component information

ChemComp-3HE:
4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione / シクロヘキシミド

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分子 #81: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 81 / コピー数: 374 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #82: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 82 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 61.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.05 Å / 解像度の算出法: OTHER
詳細: This is the composite map. Head and body are reconstructed with 178,990 particles while 60S is reconstructed with 181,871 particles
使用した粒子像数: 178990
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る