登録情報 | データベース: PDB / ID: 4k6u |
---|
タイトル | Crystal structure of Ad37 fiber knob in complex with trivalent sialic acid inhibitor ME0386 |
---|
要素 | Fiber protein |
---|
キーワード | VIRAL PROTEIN / adenovirus / fiber knob / protein carbohydrate interaction / carbohydrate mimic / multivalent ligand |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
adhesion receptor-mediated virion attachment to host cell / viral capsid / cell adhesion / symbiont entry into host cell / host cell nucleus / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Adenovirus pIV-related, attachment domain / Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain) / Adenoviral fibre protein, knob / Adenoviral fibre protein (knob domain) / Adenoviral fibre protein, repeat/shaft region / Adenoviral fibre protein (repeat/shaft region) / Adenovirus fibre protein / Attachment protein shaft domain superfamily / Adenovirus pIV-like, attachment domain / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-1P4 / ACETATE ION / N-acetyl-alpha-neuraminic acid / Fiber類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Human adenovirus 37 (ヒトアデノウイルス) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.9 Å |
---|
データ登録者 | Stehle, T. / Bauer, J. |
---|
引用 | ジャーナル: Org.Biomol.Chem. / 年: 2015 タイトル: Triazole linker-based trivalent sialic acid inhibitors of adenovirus type 37 infection of human corneal epithelial cells. 著者: Caraballo, R. / Saleeb, M. / Bauer, J. / Liaci, A.M. / Chandra, N. / Storm, R.J. / Frangsmyr, L. / Qian, W. / Stehle, T. / Arnberg, N. / Elofsson, M. |
---|
履歴 | 登録 | 2013年4月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2014年10月22日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2015年7月29日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2015年9月9日 | Group: Database references |
---|
改定 1.3 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.name |
---|
改定 1.4 | 2020年7月29日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
---|
改定 1.5 | 2024年2月28日 | Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
---|
改定 1.6 | 2024年4月3日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
---|
|
---|