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Structure paper

タイトルStructural basis for mechanotransduction in a potassium-dependent mechanosensitive ion channel.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 13, Issue 1, Page 6904, Year 2022
掲載日2022年11月12日
著者Jonathan Mount / Grigory Maksaev / Brock T Summers / James A J Fitzpatrick / Peng Yuan /
PubMed 要旨Mechanosensitive channels of small conductance, found in many living organisms, open under elevated membrane tension and thus play crucial roles in biological response to mechanical stress. Amongst ...Mechanosensitive channels of small conductance, found in many living organisms, open under elevated membrane tension and thus play crucial roles in biological response to mechanical stress. Amongst these channels, MscK is unique in that its activation also requires external potassium ions. To better understand this dual gating mechanism by force and ligand, we elucidate distinct structures of MscK along the gating cycle using cryo-electron microscopy. The heptameric channel comprises three layers: a cytoplasmic domain, a periplasmic gating ring, and a markedly curved transmembrane domain that flattens and expands upon channel opening, which is accompanied by dilation of the periplasmic ring. Furthermore, our results support a potentially unifying mechanotransduction mechanism in ion channels depicted as flattening and expansion of the transmembrane domain.
リンクNat Commun / PubMed:36371466 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.41 - 4.97 Å
構造データ

EMDB-26823, PDB-7uw5:
EcMscK G924S mutant in a closed conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.84 Å

EMDB-26845, PDB-7ux1:
EcMscK in an Open Conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.48 Å

EMDB-26851: WT EcMscK in a closed conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.48 Å

EMDB-26854: EcMscK in an intermediate conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.97 Å

EMDB-26872: Locally refined core of EcMscK in a closed conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.42 Å

EMDB-26875: Locally refined core of EcMscK G924S in a closed conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.54 Å

EMDB-26876: Locally refined core of EcMscK G924S in an intermediate conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.85 Å

EMDB-26877: Locally refined core of EcMscK in an open conformation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.41 Å

由来
  • escherichia coli k-12 (大腸菌)
キーワードTRANSPORT PROTEIN (運搬体タンパク質) / MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) / MECHANOSENSATION / ION CHANNEL (イオンチャネル)

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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