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タイトルAn ultra-stable gold-coordinated protein cage displaying reversible assembly.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 569, Issue 7756, Page 438-442, Year 2019
掲載日2019年5月8日
著者Ali D Malay / Naoyuki Miyazaki / Artur Biela / Soumyananda Chakraborti / Karolina Majsterkiewicz / Izabela Stupka / Craig S Kaplan / Agnieszka Kowalczyk / Bernard M A G Piette / Georg K A Hochberg / Di Wu / Tomasz P Wrobel / Adam Fineberg / Manish S Kushwah / Mitja Kelemen / Primož Vavpetič / Primož Pelicon / Philipp Kukura / Justin L P Benesch / Kenji Iwasaki / Jonathan G Heddle /
PubMed 要旨Symmetrical protein cages have evolved to fulfil diverse roles in nature, including compartmentalization and cargo delivery, and have inspired synthetic biologists to create novel protein assemblies ...Symmetrical protein cages have evolved to fulfil diverse roles in nature, including compartmentalization and cargo delivery, and have inspired synthetic biologists to create novel protein assemblies via the precise manipulation of protein-protein interfaces. Despite the impressive array of protein cages produced in the laboratory, the design of inducible assemblies remains challenging. Here we demonstrate an ultra-stable artificial protein cage, the assembly and disassembly of which can be controlled by metal coordination at the protein-protein interfaces. The addition of a gold (I)-triphenylphosphine compound to a cysteine-substituted, 11-mer protein ring triggers supramolecular self-assembly, which generates monodisperse cage structures with masses greater than 2 MDa. The geometry of these structures is based on the Archimedean snub cube and is, to our knowledge, unprecedented. Cryo-electron microscopy confirms that the assemblies are held together by 120 S-Au-S staples between the protein oligomers, and exist in two chiral forms. The cage shows extreme chemical and thermal stability, yet it readily disassembles upon exposure to reducing agents. As well as gold, mercury(II) is also found to enable formation of the protein cage. This work establishes an approach for linking protein components into robust, higher-order structures, and expands the design space available for supramolecular assemblies to include previously unexplored geometries.
リンクNature / PubMed:31068697
手法EM (単粒子)
解像度3.7 - 5.9 Å
構造データ

EMDB-4443, PDB-6rvv:
Structure of left-handed protein cage consisting of 24 eleven-membered ring proteins held together by gold (I) bridges.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-4444, PDB-6rvw:
Structure of right-handed protein cage consisting of 24 eleven-membered ring proteins held together by gold (I) bridges.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-6966:
Structure of protein cage consisting of 24 eleven-membered ring proteins induced by addition of gold nanoparticle (GNP)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.9 Å

化合物

ChemComp-AU:
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由来
  • geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus)
キーワードRNA BINDING PROTEIN (RNA結合タンパク質) / TRAP; protein cage; gold binding; snub cube

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

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EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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