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タイトルUnexpected Receptor Functional Mimicry Elucidates Activation of Coronavirus Fusion.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 176, Issue 5, Page 1026-1039.e15, Year 2019
掲載日2019年2月21日
著者Alexandra C Walls / Xiaoli Xiong / Young-Jun Park / M Alejandra Tortorici / Joost Snijder / Joel Quispe / Elisabetta Cameroni / Robin Gopal / Mian Dai / Antonio Lanzavecchia / Maria Zambon / Félix A Rey / Davide Corti / David Veesler /
PubMed 要旨Recent outbreaks of severe acute respiratory syndrome and Middle East respiratory syndrome, along with the threat of a future coronavirus-mediated pandemic, underscore the importance of finding ways ...Recent outbreaks of severe acute respiratory syndrome and Middle East respiratory syndrome, along with the threat of a future coronavirus-mediated pandemic, underscore the importance of finding ways to combat these viruses. The trimeric spike transmembrane glycoprotein S mediates entry into host cells and is the major target of neutralizing antibodies. To understand the humoral immune response elicited upon natural infections with coronaviruses, we structurally characterized the SARS-CoV and MERS-CoV S glycoproteins in complex with neutralizing antibodies isolated from human survivors. Although the two antibodies studied blocked attachment to the host cell receptor, only the anti-SARS-CoV S antibody triggered fusogenic conformational changes via receptor functional mimicry. These results provide a structural framework for understanding coronavirus neutralization by human antibodies and shed light on activation of coronavirus membrane fusion, which takes place through a receptor-driven ratcheting mechanism.
リンクCell / PubMed:30712865 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度1.5 - 4.5 Å
構造データ

EMDB-0401, PDB-6nb3:
MERS-CoV complex with human neutralizing LCA60 antibody Fab fragment (state 1)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-0402, PDB-6nb4:
MERS-CoV S complex with human neutralizing LCA60 antibody Fab fragment (state 2)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-0403, PDB-6nb6:
SARS-CoV complex with human neutralizing S230 antibody Fab fragment (state 1)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.2 Å

EMDB-0404, PDB-6nb7:
SARS-CoV complex with human neutralizing S230 antibody Fab fragment (state 2)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.5 Å

PDB-6nb5:
Crystal structure of anti- MERS-CoV human neutralizing LCA60 antibody Fab fragment
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.0 Å

PDB-6nb8:
Crystal structure of anti- SARS-CoV human neutralizing S230 antibody Fab fragment
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.5 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン / N-アセチルグルコサミン

ChemComp-HOH:
WATER /

由来
  • middle east respiratory syndrome coronavirus (MERSコロナウイルス)
  • middle east respiratory syndrome-related coronavirus (MERSコロナウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • sars coronavirus (SARS コロナウイルス)
キーワードVIRUS (ウイルス) / coronavirus spike glycoprotein / MERS-CoV (MERSコロナウイルス) / SARS-CoV (SARSコロナウイルス) / human neutralizing antibodies (中和抗体) / Structural Genomics (構造ゲノミクス) / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease / SSGCID / IMMUNE SYSTEM (免疫系) / Fab / Coronavirus (オルトコロナウイルス亜科) / Glycoprotein (糖タンパク質) / SARS (重症急性呼吸器症候群)

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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