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タイトルStructure and assembly of the Ebola virus nucleocapsid.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 551, Issue 7680, Page 394-397, Year 2017
掲載日2017年11月16日
著者William Wan / Larissa Kolesnikova / Mairi Clarke / Alexander Koehler / Takeshi Noda / Stephan Becker / John A G Briggs /
PubMed 要旨Ebola and Marburg viruses are filoviruses: filamentous, enveloped viruses that cause haemorrhagic fever. Filoviruses are within the order Mononegavirales, which also includes rabies virus, measles ...Ebola and Marburg viruses are filoviruses: filamentous, enveloped viruses that cause haemorrhagic fever. Filoviruses are within the order Mononegavirales, which also includes rabies virus, measles virus, and respiratory syncytial virus. Mononegaviruses have non-segmented, single-stranded negative-sense RNA genomes that are encapsidated by nucleoprotein and other viral proteins to form a helical nucleocapsid. The nucleocapsid acts as a scaffold for virus assembly and as a template for genome transcription and replication. Insights into nucleoprotein-nucleoprotein interactions have been derived from structural studies of oligomerized, RNA-encapsidating nucleoprotein, and cryo-electron microscopy of nucleocapsid or nucleocapsid-like structures. There have been no high-resolution reconstructions of complete mononegavirus nucleocapsids. Here we apply cryo-electron tomography and subtomogram averaging to determine the structure of Ebola virus nucleocapsid within intact viruses and recombinant nucleocapsid-like assemblies. These structures reveal the identity and arrangement of the nucleocapsid components, and suggest that the formation of an extended α-helix from the disordered carboxy-terminal region of nucleoprotein-core links nucleoprotein oligomerization, nucleocapsid condensation, RNA encapsidation, and accessory protein recruitment.
リンクNature / PubMed:29144446 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均) / EM (トモグラフィー)
解像度6.6 - 9.1 Å
構造データ

EMDB-3869: The structure of Ebola virus nucleoprotein (residues 1-450) in nucleocapsid-like assemblies
PDB-6ehl: Model of the Ebola virus nucleoprotein in recombinant nucleocapsid-like assemblies
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 6.6 Å

EMDB-3870:
Cryo-electron tomogram of Ebola virus nucleoprotein, residues 1-450
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-3871: The structure of Ebola virus nucleocapsid-like assemblies from recombinant virus-like particles (nucleoprotein, VP24,VP35,VP40)
PDB-6ehm: Model of the Ebola virus nucleocapsid subunit from recombinant virus-like particles
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 7.3 Å

EMDB-3872:
Cryo-electron tomogram of Ebola virus virus-like particles
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-3873:
The structure of Ebola virus nucleocapsid from virions
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 9.1 Å

EMDB-3874:
Cryo-electron tomogram of Ebola virus
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-3875:
The structure of Marburg virus nucleocapsid from virions
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 9.1 Å

EMDB-3876:
Cryo-electron tomogram of Marburg virus
手法: EM (トモグラフィー)

由来
  • zaire ebolavirus (strain mayinga-76) (エボラウイルス)
  • Ebola virus - Mayinga, Zaire, 1976 (エボラウイルス)
  • Marburg virus - Musoke, Kenya, 1980 (ウイルス)
  • Marburg virus - Angola (ウイルス)
キーワードVIRUS LIKE PARTICLE (ウイルス様粒子) / nucleocapsid (カプシド) / virus-like particle (ウイルス様粒子)

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

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EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
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