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タイトルLis1 Has Two Opposing Modes of Regulating Cytoplasmic Dynein.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 170, Issue 6, Page 1197-1208.e12, Year 2017
掲載日2017年9月7日
著者Morgan E DeSantis / Michael A Cianfrocco / Zaw Min Htet / Phuoc Tien Tran / Samara L Reck-Peterson / Andres E Leschziner
External linksPubMed:28886386 / Publisher's page
手法EM (単粒子)
分解能7.7 - 10.5 A
構造データ

EMDB-8673:
Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic dynein-1 with Lis1 and ATP

EMDB-8706:
Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic dynein with Walker B mutation at AAA3 in presence of ATP-VO4

PDB-5vh9:
Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic dynein-1 with Lis1 and ATP

PDB-5vlj:
Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic dynein with Walker B mutation at AAA3 in presence of ATP-VO4

由来Saccharomyces cerevisiae / 酵母 / サッカロミセス・セレビシエ /
キーワード1-Alkyl-2-acetylglycerophosphocholine Esterase / Adenosine Triphosphate / Amino Acid Sequence / Cryoelectron Microscopy / Dyneins / Humans / KIP2 protein, S cerevisiae / Microtubule-Associated Proteins / Models, Molecular / Molecular Motor Proteins / PAFAH1B1 protein, S cerevisiae / PAFAH1B1 protein, human / Protein Domains / Saccharomyces cerevisiae / Saccharomyces cerevisiae Proteins / Sequence Alignment / MOTOR PROTEIN / cytoplasmic dynein / lis1

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EMN文献について

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お知らせ

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2017年10月4日: この分野の3人の先駆者が、ノーベル化学賞を受賞しました

この分野の3人の先駆者が、ノーベル化学賞を受賞しました

  • Jacques Dubochet (University of Lausanne, Switzerland)は、電子顕微鏡試料の氷包埋法(いわゆるクライオ電顕法)を開発しました。EMDBやPDBにある電子顕微鏡のエントリの大多数がこの方法を利用しています。
  • Joachim Frank (Columbia University, New York, USA)は、単粒子解析法を開拓しました。EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリの大多数がこの解析法によるものです。また、広く利用されている画像解析ソフトェア「Spider」の開発者でもあります。EM Navigatorでもマップデータの画像作成などにSpiderを利用しています。
  • Richard Henderson (MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, UK)は電子顕微鏡による生体分子の立体構造解析の始祖です。電子顕微鏡による最初のPDBエントリであるPDB-1brdは、彼によるものです。

外部リンク: The 2017 Nobel Prize in Chemistry - Press Release

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。詳細は下記のリンクをご覧ください。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク: wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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2017年6月16日: Omokage検索で絞り込み

Omokage検索で絞り込み

  • Omokage検索の結果をキーワードとデータベースの種類で絞り込むことができるようになりました。

関連情報: Omokage検索

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2016年9月15日: 新しくなったEM Navigatorと万見

新しくなったEM Navigatorと万見

  • EM Navigatorと万見を刷新しました

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点 / EM Navigator (旧版) / 万見 (旧版)

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2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見

新しいEM Navigatorと万見

  • これまで開発版として公開していたEM Navigatorと万見が、9月15日から正式版となります。
  • 現行版も「旧版」としてしばらく公開を継続します。

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点 / EM Navigator / 万見 (Yorodumi) / EM Navigator (旧版) / 万見 (旧版)

すべてのお知らせ

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報: EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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