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検索結果

検索(著者・登録者: c. & y. & he)の結果、122件中、1から50件目までを表示しています

PDB-6b3q:
Cryo-EM structure of human insulin degrading enzyme in complex with insulin

PDB-6b7y:
Cryo-EM structure of human insulin degrading enzyme

PDB-5yhq:
Cryo-EM Structure of CVA6 VLP

PDB-6b7n:
Cryo-electron microscopy structure of porcine delta coronavirus spike protein in the pre-fusion state

PDB-5w3s:
Cryo-electron microscopy structure of a TRPML3 ion channel

PDB-5m50:
Mechanism of microtubule minus-end recognition and protection by CAMSAP proteins

PDB-5m54:
Mechanism of microtubule minus-end recognition and protection by CAMSAP proteins

PDB-5m5c:
Mechanism of microtubule minus-end recognition and protection by CAMSAP proteins

PDB-5nd2:
Microtubule-bound MKLP2 motor domain in the presence of ADP

PDB-5nd3:
Microtubule-bound MKLP2 motor domain in the with no nucleotide

PDB-5nd4:
Microtubule-bound MKLP2 motor domain in the presence of ADP.AlFx

PDB-5nd7:
Microtubule-bound MKLP2 motor domain in the presence of AMPPNP

PDB-5v93:
Cryo-EM structure of the 70S ribosome from Mycobacterium tuberculosis bound with Capreomycin

PDB-5nl2:
cryo-EM structure of the mTMEM16A ion channel at 6.6 A resolution.

PDB-5no3:
RsgA-GDPNP bound to the 30S ribosomal subunit (RsgA assembly intermediate without uS3)

PDB-5no4:
RsgA-GDPNP bound to the 30S ribosomal subunit (RsgA assembly intermediate with uS3)

PDB-5ujz:
CryoEM structure of an influenza virus receptor-binding site antibody-antigen interface - Class 1

PDB-5uk0:
CryoEM structure of an influenza virus receptor-binding site antibody-antigen interface - Class 2

PDB-5uk1:
CryoEM structure of an influenza virus receptor-binding site antibody-antigen interface - Class 3

PDB-5uk2:
CryoEM structure of an influenza virus receptor-binding site antibody-antigen interface - Class 4

PDB-5no2:
RsgA-GDPNP bound to the 30S ribosomal subunit (RsgA assembly intermediate)

PDB-5h4p:
Structural snapshot of cytoplasmic pre-60S ribosomal particles bound with Nmd3, Lsg1, Tif6 and Reh1

PDB-5h5u:
Mechanistic insights into the alternative translation termination by ArfA and RF2

PDB-5h64:
Cryo-EM structure of mTORC1

PDB-5u4i:
Structural Basis of Co-translational Quality Control by ArfA and RF2 Bound to Ribosome

PDB-5u4j:
Structural Basis of Co-translational Quality Control by ArfA and RF2 Bound to Ribosome

PDB-3jbz:
Crystal structure of mTOR docked into EM map of dimeric ATM kinase

PDB-5kc2:
Negative stain structure of Vps15/Vps34 complex

PDB-5t0v:
Architecture of the Yeast Mitochondrial Iron-Sulfur Cluster Assembly Machinery: the Sub-Complex Formed by the Iron Donor, Yfh1, and the Scaffold, Isu1

PDB-5jzg:
CryoEM structure of the native empty particle of a human rhinovirus C

PDB-5k0u:
CryoEM structure of the full virion of a human rhinovirus C

PDB-5kk2:
Architecture of fully occupied GluA2 AMPA receptor - TARP complex elucidated by single particle cryo-electron microscopy

PDB-5g06:
Cryo-EM structure of yeast cytoplasmic exosome

PDB-3jct:
Cryo-em structure of eukaryotic pre-60S ribosomal subunits

PDB-5ivw:
Human core TFIIH bound to DNA within the PIC

PDB-5iy6:
Human holo-PIC in the closed state

PDB-5iy7:
Human holo-PIC in the open state

PDB-5iy8:
Human holo-PIC in the initial transcribing state

PDB-5iy9:
Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS)

PDB-5iya:
Human core-PIC in the closed state

PDB-5iyb:
Human core-PIC in the open state

PDB-5iyc:
Human core-PIC in the initial transcribing state

PDB-5iyd:
Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS)

PDB-3jd6:
Double octamer structure of retinoschisin, a cell-cell adhesion protein of the retina

PDB-5fvm:
Cryo electron microscopy of a complex of Tor and Lst8

PDB-3jcm:
Cryo-EM structure of the spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP

PDB-3jau:
The cryoEM map of EV71 mature viron in complex with the Fab fragment of antibody D5

PDB-5foj:
Electron cryo-microscopy of Grapevine Fanleaf Virus complex with Nanobody

PDB-5a32:
Electron cryo-microscopy of Cowpea Mosaic Virus containing RNA-1 (CPMVb)

PDB-5a33:
Electron cryo-microscopy of Cowpea Mosaic Virus (CPMV) empty virus like particle (eVLP)

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EMN検索について

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お知らせ

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2017年10月4日: この分野の3人の先駆者が、ノーベル化学賞を受賞しました

この分野の3人の先駆者が、ノーベル化学賞を受賞しました

  • Jacques Dubochet (University of Lausanne, Switzerland)は、電子顕微鏡試料の氷包埋法(いわゆるクライオ電顕法)を開発しました。EMDBやPDBにある電子顕微鏡のエントリの大多数がこの方法を利用しています。
  • Joachim Frank (Columbia University, New York, USA)は、単粒子解析法を開拓しました。EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリの大多数がこの解析法によるものです。また、広く利用されている画像解析ソフトェア「Spider」の開発者でもあります。EM Navigatorでもマップデータの画像作成などにSpiderを利用しています。
  • Richard Henderson (MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, UK)は電子顕微鏡による生体分子の立体構造解析の始祖です。電子顕微鏡による最初のPDBエントリであるPDB-1brdは、彼によるものです。

外部リンク: The 2017 Nobel Prize in Chemistry - Press Release

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。詳細は下記のリンクをご覧ください。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク: wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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2017年6月16日: Omokage検索で絞り込み

Omokage検索で絞り込み

  • Omokage検索の結果をキーワードとデータベースの種類で絞り込むことができるようになりました。

関連情報: Omokage検索

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2016年9月15日: 新しくなったEM Navigatorと万見

新しくなったEM Navigatorと万見

  • EM Navigatorと万見を刷新しました

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点 / EM Navigator (旧版) / 万見 (旧版)

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2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見

新しいEM Navigatorと万見

  • これまで開発版として公開していたEM Navigatorと万見が、9月15日から正式版となります。
  • 現行版も「旧版」としてしばらく公開を継続します。

関連情報: 新しいEM Navigatorと万見の変更点 / EM Navigator / 万見 (Yorodumi) / EM Navigator (旧版) / 万見 (旧版)

すべてのお知らせ

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