eF-site ID 6iw2-ABCDEFGHIJKLMNOPQR PDB Code 6iw2 Chain A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R Title Crystal structure of 5A ScFv in complex with YFV-17D sE in prefusion state Classification VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM Compound Envelope protein E Source (6IW2) Sequence A:  AHCIGITDRDFIEGVHGGTWVSATLEQDKCVTVMAPDKPS LDISLETVAIDRPAEVRKVCYNAVLTHVKINDKCPSTGEA HLAEENEGDNACKRTYSDRGWGNGCGLFGKGSIVACAKFT CAKSMSLFEVDQTKIQYVIRAQLHVGAKQENWNTDIKTLK FDAGSQEVEFIGYGKATLECQVQTAVDFGNSYIAEMETES WIVDRQWAQDLTLPWQSGSGGVWREMHHLVEFEPPHAATI RVLALGNQEGSLKTALTGAMRVTKDTLYKLHGGHVSCRVK LSALTLKGTSYKICTDKMFFVKNPTDTGHGTVVMQVKVSK GAPCRIPVIVADDLTAAINKGILVTVNPIASTNDDEVLIE VNPPFGDSYIIVGRGDSRLTYQWHKE B:  EVQLVESGPRLVKPSETLSLTCTVSGGSTYNHHWSWIRQP PGRGLEWIGYISYSGKSNYNPSLKSRVTISLEPSTTQFSL KLNSLTAADTAVYYCAREYRDDTNYYYYSLDVWGPGTMVT C:  QIVMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSIGSWLAWYQQKP GKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQP EDFATYYCQQYNNYSYTFGPGTKLEIK D:  AHCIGITDRDFIEGVHGGTWVSATLEQDKCVTVMAPDKPS LDISLETVAIDRPAEVRKVCYNAVLTHVKINDKCPSTGEA HLAEENEGDNACKRTYSDRGWGNGCGLFGKGSIVACAKFT CAKSMSLFEVDQTKIQYVIRAQLHVGAKQENWNTDIKTLK FDALSGSQEVEFIGYGKATLECQVQTAVDFGNSYIAEMET ESWIVDRQWAQDLTLPWQSGSGGVWREMHHLVEFEPPHAA TIRVLALGNQEGSLKTALTGAMRVTKDTLYKLHGGHVSCR VKLSALTLKGTSYKICTDKMFFVKNPTDTGHGTVVMQVKV SKGAPCRIPVIVADDLTAAINKGILVTVNPIASTNDDEVL IEVNPPFGDSYIIVGRGDSRLTYQWHKE E:  EVQLVESGPRLVKPSETLSLTCTVSGGSTYNHHWSWIRQP PGRGLEWIGYISYSGKSNYNPSLKSRVTISLEPSTTQFSL KLNSLTAADTAVYYCAREYRDDTNYYYYSLDVWGPGTMVT F:  QIVMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSIGSWLAWYQQKP GKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQP EDFATYYCQQYNNYSYTFGPGTKLEIK G:  AHCIGITDRDFIEGVHGGTWVSATLEQDKCVTVMAPDKPS LDISLETVAIDRPAEVRKVCYNAVLTHVKINDKCPSTGEA HLAEENEGDNACKRTYSDRGWGNGCGLFGKGSIVACAKFT CAKSMSLFEVDQTKIQYVIRAQLHVGAKQENWNTDIKTLK FDALSGSQEVEFIGYGKATLECQVQTAVDFGNSYIAEMET ESWIVDRQWAQDLTLPWQSGSGGVWREMHHLVEFEPPHAA TIRVLALGNQEGSLKTALTGAMRVTKDTLYKLHGGHVSCR VKLSALTLKGTSYKICTDKMFFVKNPTDTGHGTVVMQVKV SKGAPCRIPVIVADDLTAAINKGILVTVNPIASTNDDEVL IEVNPPFGDSYIIVGRGDSRLTYQWHKE H:  EVQLVESGPRLVKPSETLSLTCTVSGGSTYNHHWSWIRQP PGRGLEWIGYISYSGKSNYNPSLKSRVTISLEPSTTQFSL KLNSLTAADTAVYYCAREYRDDTNYYYYSLDVWGPGTMVT I:  QIVMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSIGSWLAWYQQKP GKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQP EDFATYYCQQYNNYSYTFGPGTKLEIK J:  AHCIGITDRDFIEGVHGGTWVSATLEQDKCVTVMAPDKPS LDISLETVAIDRPAEVRKVCYNAVLTHVKINDKCPSTGEA HLAEENEGDNACKRTYSDRGWGNGCGLFGKGSIVACAKFT CAKSMSLFEVDQTKIQYVIRAQLHVGAKQENWNTDIKTLK FDALSGSQEVEFIGYGKATLECQVQTAVDFGNSYIAEMET ESWIVDRQWAQDLTLPWQSGSGGVWREMHHLVEFEPPHAA TIRVLALGNQEGSLKTALTGAMRVTKDLYKLHGGHVSCRV KLSALTLKGTSYKICTDKMFFVKNPTDTGHGTVVMQVKVS KGAPCRIPVIVADDLTAAINKGILVTVNPIASTNDDEVLI EVNPPFGDSYIIVGRGDSRLTYQWHKE K:  EVQLVESGPRLVKPSETLSLTCTVSGGSTYNHHWSWIRQP PGRGLEWIGYISYSGKSNYNPSLKSRVTISLEPSTTQFSL KLNSLTAADTAVYYCAREYRDDTNYYYYSLDVWGPGTMVT L:  IVMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSIGSWLAWYQQKPG KAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPE DFATYYCQQYNNYSYTFGPGTKLEIK M:  AHCIGITDRDFIEGVHGGTWVSATLEQDKCVTVMAPDKPS LDISLETVAIDRPAEVRKVCYNAVLTHVKINDKCPSTGEA HLAEENEGDNACKRTYSDRGWGNGCGLFGKGSIVACAKFT CAKSMSLFEVDQTKIQYVIRAQLHVGAKQENWNTDIKTLK FDALSGSQEVEFIGYGKATLECQVQTAVDFGNSYIAEMET ESWIVDRQWAQDLTLPWQSGSGGVWREMHHLVEFEPPHAA TIRVLALGNQEGSLKTALTGAMRVTKDLYKLHGGHVSCRV KLSALTLKGTSYKICTDKMFFVKNPTDTGHGTVVMQVKVS KGAPCRIPVIVADDLTAAINKGILVTVNPIASTNDDEVLI EVNPPFGDSYIIVGRGDSRLTYQWHKE N:  EVQLVESGPRLVKPSETLSLTCTVSGGSTYNHHWSWIRQP PGRGLEWIGYISYSGKSNYNPSLKSRVTISLEPSTTQFSL KLNSLTAADTAVYYCAREYRDDTNYYYYSLDVWGPGTMVT O:  QIVMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSIGSWLAWYQQKP GKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQP EDFATYYCQQYNNYSYTFGPGTKLEIK P:  AHCIGITDRDFIEGVHGGTWVSATLEQDKCVTVMAPDKPS LDISLETVAIDRPAEVRKVCYNAVLTHVKINDKCPSTGEA HLAEENEGDNACKRTYSDRGWGNGCGLFGKGSIVACAKFT CAKSMSLFEVDQTKIQYVIRAQLHVGAKQENWNTDIKTLK FDALSGSQEVEFIGYGKATLECQVQTAVDFGNSYIAEMET ESWIVDRQWAQDLTLPWQSGSGGVWREMHHLVEFEPPHAA TIRVLALGNQEGSLKTALTGAMRVTKDLYKLHGGHVSCRV KLSALTLKGTSYKICTDKMFFVKNPTDTGHGTVVMQVKVS KGAPCRIPVIVADDLTAAINKGILVTVNPIASTNDDEVLI EVNPPFGDSYIIVGRGDSRLTYQWHKE Q:  EVQLVESGPRLVKPSETLSLTCTVSGGSTYNHHWSWIRQP PGRGLEWIGYISYSGKSNYNPSLKSRVTISLEPSTTQFSL KLNSLTAADTAVYYCAREYRDDTNYYYYSLDVWGPGTMVT R:  QIVMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSIGSWLAWYQQKP GKAPKLLIYKASSLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQP EDFATYYCQQYNNYSYTFGPGTKLEIK Description (1)  Envelope protein E, Heavy chain of monoclonal antibody 5A, Light chain of monoclonal antibody 5A Functional site 1) chain A residue 135-146 type prosite sequence IQYVIRAQLHVG description RIBOSOMAL_S2_1 Ribosomal protein S2 signature 1. IqYVIRAQLHVG source prosite : PS00962

Display surface Download Links