eF-site ID 4j4q-AB
PDB Code 4j4q
Chain A, B

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Title Crystal structure of active conformation of GPCR opsin stabilized by octylglucoside
Classification SIGNALING PROTEIN
Compound Rhodopsin
Source ORGANISM_COMMON: bovine; ORGANISM_SCIENTIFIC: Bos taurus;
Sequence A:  MNGTEGPNFYVPFSNKTGVVRSPFEAPQYYLAEPWQFSML
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WVMALACAAPPLVGWSRYIPEGMQCSCGIDYYTPHEETNN
ESFVIYMFVVHFIIPLIVIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQES
ATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWLPYAGVAFYIFTHQG
SDFGPIFMTIPAFFAKTSAVYNPVIYIMMNKQFRNCMVTT
LCCGKN
B:  ILENLKDVGLF
Description


Functional site

1) chain A
residue 201
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sequence E
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3) chain A
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6) chain A
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sequence M
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7) chain A
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8) chain A
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9) chain A
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10) chain A
residue 37-61
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11) chain A
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12) chain A
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sequence ERYVVVCKPMSNFRFGENH
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13) chain A
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14) chain A
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15) chain A
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16) chain A
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17) chain A
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18) chain A
residue 253-274
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sequence MVIIMVIAFLICWLPYAGVAFY
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19) chain A
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source Swiss-Prot : SWS_FT_FI9

20) chain A
residue 123-139
type prosite
sequence IALWSLVVLAIERYVVV
description G_PROTEIN_RECEP_F1_1 G-protein coupled receptors family 1 signature. IALwSLVVLAIERYVvV
source prosite : PS00237

21) chain A
residue 290-306
type prosite
sequence IPAFFAKTSAVYNPVIY
description OPSIN Visual pigments (opsins) retinal binding site. IPaFfAKTSAvyNPviY
source prosite : PS00238

22) chain A
residue 1-36
type TOPO_DOM
sequence MNGTEGPNFYVPFSNKTGVVRSPFEAPQYYLAEPWQ
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23) chain A
residue 97-110
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sequence TSLHGYFVFGPTGC
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source Swiss-Prot : SWS_FT_FI1

24) chain A
residue 174-202
type TOPO_DOM
sequence GWSRYIPEGMQCSCGIDYYTPHEETNNES
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source Swiss-Prot : SWS_FT_FI1

25) chain A
residue 275-286
type TOPO_DOM
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source Swiss-Prot : SWS_FT_FI1


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