|
eF-site ID
|
3i0l-A |
PDB Code
|
3i0l |
Chain
|
A |
|
click to enlarge
|
|
Title
|
Crystal structure of GTB C80S/C196S/C209S + DA + UDP-Gal |
Classification
|
TRANSFERASE |
Compound
|
ABO glycosyltransferase |
Source
|
Homo sapiens (Human) (Q70V26_HUMAN) |
|
Sequence
|
A: |
MVYPQPKVLTPSRKDVLVVTPWLAPIVWEGTFNIDILNEQ
FRLQNTTIGLTVFAIKKYVAFLKLFLETAEKHFMVGHRVH
YYVFTDQPAAVPRVTLGTGRQLSVLEVGDVSMRRMEMISD
FSERRFLSEVDYLVSVDVDMEFRDHVGVEILTPLFGTLHP
SFYGSSREAFTYERRPQSQAYIPKDEGDFYYMGAFFGGSV
QEVQRLTRACHQAMMVDQANGIEAVWHDESHLNKYLLRHK
PTKVLSPEYLWDQQLLGWPAVLRKLRFTAVPK
|
|
Description
|
|
Functional site
|
|
1)
|
chain |
A |
residue |
303 |
type |
ACT_SITE |
sequence |
E
|
description |
Nucleophile => ECO:0000250|UniProtKB:P14769
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI1
|
|
2)
|
chain |
A |
residue |
121 |
type |
BINDING |
sequence |
F
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZI, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R7Y, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1R81, ECO:0007744|PDB:1R82, ECO:0007744|PDB:1WT3, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJO, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2A8W, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:2Y7A, ECO:0007744|PDB:3I0D, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0I, ECO:0007744|PDB:3I0K, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI2
|
|
3)
|
chain |
A |
residue |
126 |
type |
BINDING |
sequence |
Y
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZI, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R7Y, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1R81, ECO:0007744|PDB:1R82, ECO:0007744|PDB:1WT1, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1WT3, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJO, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2A8W, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:2Y7A, ECO:0007744|PDB:3I0D, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0I, ECO:0007744|PDB:3I0K, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI3
|
|
4)
|
chain |
A |
residue |
211 |
type |
BINDING |
sequence |
D
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI4
|
|
5)
|
chain |
A |
residue |
213 |
type |
BINDING |
sequence |
D
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI4
|
|
6)
|
chain |
A |
residue |
233 |
type |
BINDING |
sequence |
H
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI5
|
|
7)
|
chain |
A |
residue |
245 |
type |
BINDING |
sequence |
T
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1R7U, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZIZ, ECO:0007744|PDB:1ZJ0, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI6
|
|
8)
|
chain |
A |
residue |
303 |
type |
BINDING |
sequence |
E
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1R7U, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZIZ, ECO:0007744|PDB:1ZJ0, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI7
|
|
9)
|
chain |
A |
residue |
326 |
type |
BINDING |
sequence |
D
|
description |
BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI8
|
|
10)
|
chain |
A |
residue |
113 |
type |
CARBOHYD |
sequence |
N
|
description |
N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000255
|
source |
Swiss-Prot : SWS_FT_FI9
|
|
|
|