Title
|
Crystal structure of TtgV in complex with its DNA operator |
Classification
|
DNA-BINDING PROTEIN/DNA |
Compound
|
HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGV |
Source
|
Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (2XRO) |
|
Sequence
|
A: |
QVIARAASIMRALGSHPHGLSLAAIAQLVGLPRSTVQRII
NALEEEFLVEALGPAGGFRLGPALGQLINQAQTDILSLVK
PYLRSLAEELDESVSLASLAGDKIYVLDRIVSERELRVVF
PIGINVPAAATAAGKVLLAALPDETLQAALGEQLPVLTSN
TLGRKALVKQLSEVRQSGVASDLDEHIDGVSSFATLLDTY
LGYYSLAIVMPSSRASKQSDLIKKALLQSKLNIERAIGR
|
B: |
IQVIARAASIMRALGSHPHGLSLAAIAQLVGLPRSTVQRI
INALEEEFLVEALGPAGGFRLGPALGQLINQAQTDILSLV
KPYLRSLAEELDESVSLASLAGDKIYVLDRIVSERELRVV
FPIGINVPAAATAAGKVLLAALPDETLQAALGEQLPVLTS
NTLGRKALVKQLSEVRQSGVASDLDEHIDGVSSFATLLDT
YLGYYSLAIVMPSSRASKQSDLIKKALLQSKLNIERAIGR
|
E: |
QVIARAASIMRALGSHPHGLSLAAIAQLVGLPRSTVQRII
NALEEEFLVEALGPAGGFRLGPALGQLINQAQTDILSLVK
PYLRSLAEELDESVSLASLAGDKIYVLDRIVSERELRVVF
PIGINVPAAATAAGKVLLAALPDETLQAALGEQLPVLTSN
TLGRKALVKQLSEVRQSGVASDLDEHIDGVSSFATLLDTY
LGYYSLAIVMPSSRASKQSDLIKKALLQSKLNIERAIGR
|
F: |
IQVIARAASIMRALGSHPHGLSLAAIAQLVGLPRSTVQRI
INALEEEFLVEALGPAGGFRLGPALGQLINQAQTDILSLV
KPYLRSLAEELDESVSLASLAGDKIYVLDRIVSERELRVV
FPIGINVPAAATAAGKVLLAALPDETLQAALGEQLPVLTS
NTLGRKALVKQLSEVRQSGVASDLDEHIDGVSSFATLLDT
YLGYYSLAIVMPSSRASKQSDLIKKALLQSKLNIERAIGR
|
X: |
GAGTATCACATAATGCTACACTCTACCGCATTACGATTCA
GC
|
Y: |
GCTGAATCGTAATGCGGTAGAGTGTAGCATTATGTGATAC
TCT
|
|
Description
|